MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 51477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015222	CG	3	6	57612	57617	0 %	0 %	50 %	50 %	325980933
1002	NC_015222	CG	3	6	57624	57629	0 %	0 %	50 %	50 %	325980933
1003	NC_015222	CAG	2	6	57638	57643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980933
1004	NC_015222	CAATC	2	10	57709	57718	40 %	20 %	0 %	40 %	325980933
1005	NC_015222	GGC	2	6	57720	57725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980933
1006	NC_015222	GCA	2	6	57733	57738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980933
1007	NC_015222	TGCA	2	8	57743	57750	25 %	25 %	25 %	25 %	325980933
1008	NC_015222	CAG	2	6	57781	57786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980933
1009	NC_015222	CAA	2	6	57859	57864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980933
1010	NC_015222	TGCATA	2	12	57906	57917	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325980933
1011	NC_015222	GC	3	6	57931	57936	0 %	0 %	50 %	50 %	325980933
1012	NC_015222	CAA	2	6	58006	58011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980933
1013	NC_015222	GCG	2	6	58057	58062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980933
1014	NC_015222	GGA	2	6	58218	58223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980933
1015	NC_015222	CAT	2	6	58296	58301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980933
1016	NC_015222	TGC	2	6	58328	58333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980933
1017	NC_015222	GGCT	2	8	58436	58443	0 %	25 %	50 %	25 %	325980933
1018	NC_015222	AGC	2	6	58472	58477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980933
1019	NC_015222	TGA	2	6	58513	58518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980933
1020	NC_015222	CAT	2	6	58728	58733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980934
1021	NC_015222	AAGC	2	8	58746	58753	50 %	0 %	25 %	25 %	325980934
1022	NC_015222	AGCC	2	8	58781	58788	25 %	0 %	25 %	50 %	325980934
1023	NC_015222	CGA	2	6	58796	58801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980934
1024	NC_015222	CTC	2	6	58860	58865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980934
1025	NC_015222	TGT	2	6	58877	58882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980934
1026	NC_015222	CGT	2	6	58906	58911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980934
1027	NC_015222	AGC	2	6	58921	58926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980934
1028	NC_015222	TCC	2	6	58934	58939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980934
1029	NC_015222	CT	3	6	58941	58946	0 %	50 %	0 %	50 %	325980934
1030	NC_015222	CTA	2	6	59280	59285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980935
1031	NC_015222	GGC	2	6	59377	59382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980935
1032	NC_015222	ACA	2	6	59383	59388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980935
1033	NC_015222	GCG	2	6	59399	59404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980935
1034	NC_015222	CAA	2	6	59405	59410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980935
1035	NC_015222	GAT	2	6	59435	59440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980935
1036	NC_015222	GTCT	2	8	59523	59530	0 %	50 %	25 %	25 %	325980935
1037	NC_015222	GCCT	2	8	59535	59542	0 %	25 %	25 %	50 %	325980935
1038	NC_015222	GAA	2	6	59738	59743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980935
1039	NC_015222	GCTGGA	2	12	59821	59832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325980935
1040	NC_015222	AGC	2	6	59838	59843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980935
1041	NC_015222	GC	3	6	59866	59871	0 %	0 %	50 %	50 %	325980935
1042	NC_015222	GCA	2	6	59880	59885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980935
1043	NC_015222	TGC	2	6	59949	59954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980935
1044	NC_015222	AGG	2	6	59958	59963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980935
1045	NC_015222	TGC	2	6	59967	59972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980935
1046	NC_015222	TTG	2	6	59984	59989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980935
1047	NC_015222	GC	3	6	60008	60013	0 %	0 %	50 %	50 %	325980935
1048	NC_015222	CGC	2	6	60038	60043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980935
1049	NC_015222	ACA	2	6	60090	60095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980935
1050	NC_015222	GCA	2	6	60265	60270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980935
1051	NC_015222	ATCA	2	8	60298	60305	50 %	25 %	0 %	25 %	325980935
1052	NC_015222	ACC	2	6	60317	60322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980935
1053	NC_015222	GCT	2	6	60397	60402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980935
1054	NC_015222	ACA	2	6	60462	60467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980935
1055	NC_015222	GATT	2	8	60481	60488	25 %	50 %	25 %	0 %	325980935
1056	NC_015222	TGG	2	6	60492	60497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980935
1057	NC_015222	TGG	2	6	60600	60605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980936
1058	NC_015222	ACAGCA	2	12	60639	60650	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325980936
1059	NC_015222	A	6	6	60723	60728	100 %	0 %	0 %	0 %	325980936
1060	NC_015222	GGAT	2	8	60739	60746	25 %	25 %	50 %	0 %	325980936
1061	NC_015222	TGA	2	6	60767	60772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980936
1062	NC_015222	GCGT	2	8	60829	60836	0 %	25 %	50 %	25 %	325980936
1063	NC_015222	CGG	2	6	60844	60849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980936
1064	NC_015222	GC	3	6	60875	60880	0 %	0 %	50 %	50 %	325980936
1065	NC_015222	GCAA	2	8	60907	60914	50 %	0 %	25 %	25 %	325980936
1066	NC_015222	GATG	2	8	61001	61008	25 %	25 %	50 %	0 %	325980936
1067	NC_015222	CTGAT	2	10	61018	61027	20 %	40 %	20 %	20 %	325980936
1068	NC_015222	GC	3	6	61097	61102	0 %	0 %	50 %	50 %	325980936
1069	NC_015222	AAGTG	2	10	61163	61172	40 %	20 %	40 %	0 %	325980936
1070	NC_015222	CAA	2	6	61182	61187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980936
1071	NC_015222	GTG	2	6	61236	61241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980936
1072	NC_015222	AAAG	2	8	61247	61254	75 %	0 %	25 %	0 %	325980936
1073	NC_015222	ATTC	2	8	61359	61366	25 %	50 %	0 %	25 %	325980936
1074	NC_015222	TTA	2	6	61432	61437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980936
1075	NC_015222	GGT	2	6	61442	61447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980936
1076	NC_015222	CCG	2	6	61604	61609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980936
1077	NC_015222	TGG	2	6	61618	61623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980936
1078	NC_015222	GCAT	2	8	61666	61673	25 %	25 %	25 %	25 %	325980936
1079	NC_015222	GTG	2	6	61722	61727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980936
1080	NC_015222	TGAT	2	8	61744	61751	25 %	50 %	25 %	0 %	325980936
1081	NC_015222	GC	3	6	61771	61776	0 %	0 %	50 %	50 %	325980936
1082	NC_015222	CAG	2	6	61778	61783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980936
1083	NC_015222	ACG	2	6	61794	61799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980936
1084	NC_015222	TAT	2	6	61800	61805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980936
1085	NC_015222	CGG	2	6	61840	61845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980936
1086	NC_015222	TAT	2	6	61846	61851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980936
1087	NC_015222	ACT	2	6	61994	61999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980936
1088	NC_015222	GAA	2	6	62043	62048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980936
1089	NC_015222	CGG	2	6	62050	62055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980936
1090	NC_015222	TCAG	2	8	62078	62085	25 %	25 %	25 %	25 %	325980936
1091	NC_015222	TCG	2	6	62187	62192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1092	NC_015222	TCA	2	6	62259	62264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980937
1093	NC_015222	CAC	2	6	62326	62331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980937
1094	NC_015222	GTG	2	6	62360	62365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1095	NC_015222	CG	3	6	62442	62447	0 %	0 %	50 %	50 %	325980937
1096	NC_015222	ACC	2	6	62618	62623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980937
1097	NC_015222	GGC	2	6	62654	62659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980937
1098	NC_015222	CGC	2	6	62693	62698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980937
1099	NC_015222	CGC	2	6	62743	62748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980937
1100	NC_015222	CGG	2	6	62764	62769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980937
1101	NC_015222	TGG	2	6	62850	62855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1102	NC_015222	TGC	2	6	62883	62888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1103	NC_015222	GC	3	6	62981	62986	0 %	0 %	50 %	50 %	325980937
1104	NC_015222	GA	3	6	63124	63129	50 %	0 %	50 %	0 %	325980937
1105	NC_015222	ATC	3	9	63146	63154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980937
1106	NC_015222	GT	3	6	63164	63169	0 %	50 %	50 %	0 %	325980937
1107	NC_015222	GC	3	6	63195	63200	0 %	0 %	50 %	50 %	325980937
1108	NC_015222	TGG	2	6	63201	63206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1109	NC_015222	TGC	2	6	63216	63221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1110	NC_015222	CAT	2	6	63277	63282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980937
1111	NC_015222	GCC	2	6	63326	63331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980937
1112	NC_015222	TGG	2	6	63339	63344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1113	NC_015222	CGC	2	6	63406	63411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980937
1114	NC_015222	CTG	2	6	63446	63451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1115	NC_015222	ATC	2	6	63452	63457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980937
1116	NC_015222	TTC	2	6	63468	63473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980937
1117	NC_015222	TTG	2	6	63593	63598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980937
1118	NC_015222	CTG	2	6	63632	63637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1119	NC_015222	GAA	2	6	63691	63696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980937
1120	NC_015222	ATA	2	6	63701	63706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980937
1121	NC_015222	CTG	2	6	63794	63799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1122	NC_015222	GCG	2	6	63839	63844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980937
1123	NC_015222	CAT	2	6	63964	63969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980937
1124	NC_015222	AAT	2	6	64148	64153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980937
1125	NC_015222	GGT	2	6	64192	64197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1126	NC_015222	TAT	2	6	64250	64255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980937
1127	NC_015222	GC	3	6	64286	64291	0 %	0 %	50 %	50 %	325980937
1128	NC_015222	GGTG	2	8	64303	64310	0 %	25 %	75 %	0 %	325980937
1129	NC_015222	TGGG	2	8	64338	64345	0 %	25 %	75 %	0 %	325980937
1130	NC_015222	CAC	3	9	64354	64362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980937
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1132	NC_015222	GGC	2	6	64463	64468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980937
1133	NC_015222	GCT	2	6	64543	64548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1134	NC_015222	CCGCGA	2	12	64573	64584	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325980937
1135	NC_015222	GGT	2	6	64589	64594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1136	NC_015222	CAA	2	6	64610	64615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980937
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1138	NC_015222	GC	3	6	64687	64692	0 %	0 %	50 %	50 %	325980937
1139	NC_015222	CTG	2	6	64742	64747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1140	NC_015222	CGG	2	6	64816	64821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980937
1141	NC_015222	GGT	2	6	64867	64872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980937
1142	NC_015222	CGC	2	6	64897	64902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980937
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1145	NC_015222	ACG	2	6	65004	65009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980937
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1147	NC_015222	TCCG	2	8	65037	65044	0 %	25 %	25 %	50 %	325980937
1148	NC_015222	ATG	2	6	65048	65053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980937
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1152	NC_015222	CGA	2	6	65163	65168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980937
1153	NC_015222	GCG	2	6	65224	65229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980937
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1157	NC_015222	TCA	2	6	66076	66081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980938
1158	NC_015222	GAC	2	6	66147	66152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980938
1159	NC_015222	CAA	2	6	66162	66167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980938
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1162	NC_015222	GTGC	2	8	66364	66371	0 %	25 %	50 %	25 %	325980938
1163	NC_015222	TGA	3	9	66600	66608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980938
1164	NC_015222	GAT	2	6	66625	66630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980938
1165	NC_015222	GATA	2	8	66639	66646	50 %	25 %	25 %	0 %	325980938
1166	NC_015222	AAT	2	6	66724	66729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980938
1167	NC_015222	TGGTTT	2	12	66795	66806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980938
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1184	NC_015222	TTG	2	6	67730	67735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980938
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1192	NC_015222	GAACA	2	10	68173	68182	60 %	0 %	20 %	20 %	325980938
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1196	NC_015222	GGT	2	6	68422	68427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980938
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1201	NC_015222	GGGTT	2	10	68700	68709	0 %	40 %	60 %	0 %	325980939
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1219	NC_015222	AAT	2	6	69561	69566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980940
1220	NC_015222	TTGTT	2	10	69609	69618	0 %	80 %	20 %	0 %	325980940
1221	NC_015222	A	6	6	69624	69629	100 %	0 %	0 %	0 %	325980940
1222	NC_015222	AAAG	2	8	69665	69672	75 %	0 %	25 %	0 %	325980940
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1232	NC_015222	CCA	2	6	70079	70084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980940
1233	NC_015222	GCA	2	6	70178	70183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980940
1234	NC_015222	GTTT	2	8	70186	70193	0 %	75 %	25 %	0 %	325980940
1235	NC_015222	GCA	2	6	70240	70245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980940
1236	NC_015222	GT	3	6	70295	70300	0 %	50 %	50 %	0 %	325980940
1237	NC_015222	GGC	2	6	70335	70340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980940
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1241	NC_015222	CGA	2	6	70397	70402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980940
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1243	NC_015222	TGC	2	6	70476	70481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980940
1244	NC_015222	AATC	2	8	70524	70531	50 %	25 %	0 %	25 %	325980940
1245	NC_015222	ATT	2	6	70585	70590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980940
1246	NC_015222	CA	4	8	70631	70638	50 %	0 %	0 %	50 %	325980940
1247	NC_015222	TCA	2	6	70675	70680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980940
1248	NC_015222	TCT	2	6	70689	70694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980940
1249	NC_015222	AAC	2	6	70695	70700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980940
1250	NC_015222	TAT	2	6	70742	70747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980940
1251	NC_015222	TTC	2	6	70769	70774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980940
1252	NC_015222	TAAA	2	8	70787	70794	75 %	25 %	0 %	0 %	325980940
1253	NC_015222	GGC	2	6	70858	70863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980940
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1260	NC_015222	G	6	6	71266	71271	0 %	0 %	100 %	0 %	325980941
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1294	NC_015222	GAC	2	6	73095	73100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980942
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1370	NC_015222	GTTT	2	8	77491	77498	0 %	75 %	25 %	0 %	325980945
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1489	NC_015222	GAAA	2	8	83631	83638	75 %	0 %	25 %	0 %	325980951
1490	NC_015222	ATC	2	6	83680	83685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980951
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1495	NC_015222	ATT	2	6	84028	84033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980951
1496	NC_015222	GGC	4	12	84177	84188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980951
1497	NC_015222	A	6	6	84211	84216	100 %	0 %	0 %	0 %	325980951
1498	NC_015222	TTG	2	6	84224	84229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980951
1499	NC_015222	A	8	8	84269	84276	100 %	0 %	0 %	0 %	325980951
1500	NC_015222	CAT	2	6	84286	84291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980951

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