MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 chromosome

Total Repeats: 51477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015222	TGG	3	9	29456	29464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980907
502	NC_015222	TAT	2	6	29494	29499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980907
503	NC_015222	GCCGG	3	15	29560	29574	0 %	0 %	60 %	40 %	325980907
504	NC_015222	AAG	2	6	29662	29667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980907
505	NC_015222	AAT	2	6	29759	29764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980907
506	NC_015222	CAAA	2	8	29923	29930	75 %	0 %	0 %	25 %	325980908
507	NC_015222	AGA	2	6	30153	30158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980908
508	NC_015222	GCG	2	6	30190	30195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980908
509	NC_015222	ATG	2	6	30226	30231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980908
510	NC_015222	TGA	2	6	30233	30238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980908
511	NC_015222	CG	4	8	30300	30307	0 %	0 %	50 %	50 %	325980908
512	NC_015222	A	6	6	30317	30322	100 %	0 %	0 %	0 %	325980908
513	NC_015222	ATT	2	6	30373	30378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980908
514	NC_015222	GTT	2	6	30393	30398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980908
515	NC_015222	GCGCAT	2	12	30415	30426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325980908
516	NC_015222	ATG	2	6	30521	30526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980908
517	NC_015222	TG	3	6	30608	30613	0 %	50 %	50 %	0 %	325980908
518	NC_015222	TGG	2	6	30656	30661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980908
519	NC_015222	TGC	2	6	30722	30727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980908
520	NC_015222	GAA	2	6	30763	30768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980908
521	NC_015222	A	7	7	30867	30873	100 %	0 %	0 %	0 %	325980908
522	NC_015222	GC	3	6	30964	30969	0 %	0 %	50 %	50 %	325980908
523	NC_015222	AAT	2	6	31113	31118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980909
524	NC_015222	GTTCA	2	10	31171	31180	20 %	40 %	20 %	20 %	325980909
525	NC_015222	ATT	2	6	31231	31236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980909
526	NC_015222	ATTG	2	8	31314	31321	25 %	50 %	25 %	0 %	325980909
527	NC_015222	T	6	6	31380	31385	0 %	100 %	0 %	0 %	325980909
528	NC_015222	TAC	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980909
529	NC_015222	GAT	2	6	31419	31424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980909
530	NC_015222	ACA	2	6	31465	31470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980909
531	NC_015222	ATT	2	6	31603	31608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980909
532	NC_015222	GTGG	2	8	31642	31649	0 %	25 %	75 %	0 %	325980909
533	NC_015222	GGC	2	6	31666	31671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980909
534	NC_015222	CTT	2	6	31730	31735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980909
535	NC_015222	GCT	2	6	31840	31845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980909
536	NC_015222	AAC	2	6	31846	31851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980909
537	NC_015222	TTG	2	6	32006	32011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980909
538	NC_015222	TCCAGC	2	12	32043	32054	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325980909
539	NC_015222	TTG	2	6	32077	32082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980909
540	NC_015222	ATC	2	6	32097	32102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980909
541	NC_015222	TGCAT	2	10	32345	32354	20 %	40 %	20 %	20 %	325980910
542	NC_015222	CAAG	2	8	32360	32367	50 %	0 %	25 %	25 %	325980910
543	NC_015222	AT	3	6	32424	32429	50 %	50 %	0 %	0 %	325980910
544	NC_015222	TGA	2	6	32456	32461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980910
545	NC_015222	CG	3	6	32714	32719	0 %	0 %	50 %	50 %	325980910
546	NC_015222	ATC	2	6	32746	32751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980910
547	NC_015222	CTT	2	6	32826	32831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980910
548	NC_015222	TCAA	2	8	32843	32850	50 %	25 %	0 %	25 %	325980910
549	NC_015222	GTA	2	6	32883	32888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980910
550	NC_015222	GTT	2	6	33009	33014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980910
551	NC_015222	TTG	2	6	33024	33029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980910
552	NC_015222	ATGA	2	8	33219	33226	50 %	25 %	25 %	0 %	325980911
553	NC_015222	TTG	2	6	33240	33245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980911
554	NC_015222	TGA	2	6	33250	33255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980911
555	NC_015222	GTT	2	6	33267	33272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980911
556	NC_015222	T	6	6	33308	33313	0 %	100 %	0 %	0 %	325980911
557	NC_015222	GGTG	2	8	33323	33330	0 %	25 %	75 %	0 %	325980911
558	NC_015222	TTG	2	6	33375	33380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980911
559	NC_015222	GCA	2	6	33431	33436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980911
560	NC_015222	TATT	2	8	33491	33498	25 %	75 %	0 %	0 %	325980911
561	NC_015222	TTG	2	6	33537	33542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980911
562	NC_015222	TGC	2	6	33569	33574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980911
563	NC_015222	CTT	2	6	33613	33618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980911
564	NC_015222	AGATT	2	10	33683	33692	40 %	40 %	20 %	0 %	325980911
565	NC_015222	ATT	2	6	34021	34026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980912
566	NC_015222	AG	3	6	34086	34091	50 %	0 %	50 %	0 %	325980912
567	NC_015222	CGAT	2	8	34119	34126	25 %	25 %	25 %	25 %	325980912
568	NC_015222	GCG	2	6	34130	34135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980912
569	NC_015222	CAG	2	6	34149	34154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980912
570	NC_015222	GGTGT	2	10	34271	34280	0 %	40 %	60 %	0 %	325980912
571	NC_015222	C	6	6	34281	34286	0 %	0 %	0 %	100 %	325980912
572	NC_015222	TGG	2	6	34382	34387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980912
573	NC_015222	TTC	2	6	34399	34404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980912
574	NC_015222	TTA	2	6	34436	34441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980912
575	NC_015222	ATA	2	6	34469	34474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980912
576	NC_015222	AATGG	2	10	34516	34525	40 %	20 %	40 %	0 %	325980912
577	NC_015222	CTGT	2	8	34559	34566	0 %	50 %	25 %	25 %	325980912
578	NC_015222	GCA	2	6	34571	34576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980912
579	NC_015222	TA	3	6	34579	34584	50 %	50 %	0 %	0 %	325980912
580	NC_015222	CGA	2	6	34592	34597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980912
581	NC_015222	ATA	2	6	34606	34611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980912
582	NC_015222	TAT	2	6	34830	34835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980913
583	NC_015222	AG	3	6	34882	34887	50 %	0 %	50 %	0 %	325980913
584	NC_015222	TGC	2	6	34899	34904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980913
585	NC_015222	GAA	2	6	34954	34959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980913
586	NC_015222	GAA	2	6	35005	35010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980913
587	NC_015222	AAG	2	6	35056	35061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980913
588	NC_015222	AGAA	2	8	35078	35085	75 %	0 %	25 %	0 %	325980913
589	NC_015222	A	7	7	35230	35236	100 %	0 %	0 %	0 %	325980913
590	NC_015222	ATTTG	2	10	35259	35268	20 %	60 %	20 %	0 %	325980913
591	NC_015222	CAT	2	6	35460	35465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980914
592	NC_015222	CGG	2	6	35531	35536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980914
593	NC_015222	TGC	2	6	35551	35556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980914
594	NC_015222	GTT	2	6	35642	35647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980914
595	NC_015222	CTG	2	6	35709	35714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980914
596	NC_015222	GAT	2	6	35754	35759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980914
597	NC_015222	TGGAAG	2	12	35803	35814	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	325980914
598	NC_015222	CTGC	2	8	35865	35872	0 %	25 %	25 %	50 %	325980914
599	NC_015222	TTGA	2	8	35880	35887	25 %	50 %	25 %	0 %	325980914
600	NC_015222	GGT	2	6	35898	35903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980914
601	NC_015222	A	6	6	35907	35912	100 %	0 %	0 %	0 %	325980914
602	NC_015222	CCA	2	6	35971	35976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980914
603	NC_015222	TTC	2	6	35990	35995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325980914
604	NC_015222	ATT	2	6	36014	36019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980914
605	NC_015222	TATT	2	8	36043	36050	25 %	75 %	0 %	0 %	325980914
606	NC_015222	TCG	2	6	36059	36064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980914
607	NC_015222	T	6	6	36065	36070	0 %	100 %	0 %	0 %	325980914
608	NC_015222	CAA	2	6	36189	36194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980914
609	NC_015222	AGG	2	6	36217	36222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980914
610	NC_015222	ACG	2	6	36251	36256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980914
611	NC_015222	GCA	2	6	36309	36314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980914
612	NC_015222	AGA	2	6	36315	36320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980914
613	NC_015222	AAT	2	6	36419	36424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980914
614	NC_015222	ATT	2	6	36470	36475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980914
615	NC_015222	AATT	2	8	36511	36518	50 %	50 %	0 %	0 %	325980914
616	NC_015222	CAA	2	6	36552	36557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980914
617	NC_015222	GCT	2	6	36573	36578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980914
618	NC_015222	TGA	2	6	36605	36610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980914
619	NC_015222	TCA	2	6	36682	36687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980914
620	NC_015222	GGA	2	6	36695	36700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980914
621	NC_015222	T	6	6	36701	36706	0 %	100 %	0 %	0 %	325980914
622	NC_015222	TCC	2	6	36710	36715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325980914
623	NC_015222	CGG	2	6	36749	36754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980914
624	NC_015222	ATT	2	6	36782	36787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980914
625	NC_015222	CCA	2	6	36823	36828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980914
626	NC_015222	TGC	2	6	36868	36873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980914
627	NC_015222	GTT	2	6	36890	36895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980914
628	NC_015222	GTCA	2	8	36900	36907	25 %	25 %	25 %	25 %	325980914
629	NC_015222	CA	3	6	36935	36940	50 %	0 %	0 %	50 %	325980914
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1000	NC_015222	TAG	2	6	57570	57575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980933

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