MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015221	CTGA	2	8	402	409	25 %	25 %	25 %	25 %	325980817
2	NC_015221	CACT	2	8	737	744	25 %	25 %	0 %	50 %	325980818
3	NC_015221	CATT	2	8	1495	1502	25 %	50 %	0 %	25 %	325980818
4	NC_015221	TTCT	2	8	1891	1898	0 %	75 %	0 %	25 %	325980819
5	NC_015221	CCTC	2	8	2770	2777	0 %	25 %	0 %	75 %	325980821
6	NC_015221	GCTG	2	8	3265	3272	0 %	25 %	50 %	25 %	325980822
7	NC_015221	GCCA	2	8	3314	3321	25 %	0 %	25 %	50 %	325980822
8	NC_015221	CCAC	2	8	3998	4005	25 %	0 %	0 %	75 %	325980823
9	NC_015221	GTGC	2	8	4553	4560	0 %	25 %	50 %	25 %	325980823
10	NC_015221	CCGG	2	8	4581	4588	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
11	NC_015221	CGGC	2	8	4698	4705	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
12	NC_015221	CGGC	2	8	4746	4753	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
13	NC_015221	GCCG	2	8	4810	4817	0 %	0 %	50 %	50 %	325980823
14	NC_015221	GCCA	2	8	6844	6851	25 %	0 %	25 %	50 %	325980826
15	NC_015221	CTAT	2	8	7202	7209	25 %	50 %	0 %	25 %	325980826
16	NC_015221	TTCT	2	8	7784	7791	0 %	75 %	0 %	25 %	325980827
17	NC_015221	ATTG	2	8	8141	8148	25 %	50 %	25 %	0 %	325980828
18	NC_015221	TGAT	2	8	8587	8594	25 %	50 %	25 %	0 %	325980828
19	NC_015221	ATTG	2	8	8664	8671	25 %	50 %	25 %	0 %	325980828
20	NC_015221	ACCC	2	8	9071	9078	25 %	0 %	0 %	75 %	325980829
21	NC_015221	ATCT	2	8	9572	9579	25 %	50 %	0 %	25 %	325980829
22	NC_015221	TGAC	2	8	10317	10324	25 %	25 %	25 %	25 %	325980830
23	NC_015221	CCTT	2	8	10820	10827	0 %	50 %	0 %	50 %	325980831
24	NC_015221	CCAG	2	8	11241	11248	25 %	0 %	25 %	50 %	325980831
25	NC_015221	ATCC	2	8	11370	11377	25 %	25 %	0 %	50 %	325980831
26	NC_015221	CTGC	2	8	11412	11419	0 %	25 %	25 %	50 %	325980831
27	NC_015221	CCAG	2	8	11780	11787	25 %	0 %	25 %	50 %	325980832
28	NC_015221	ATGC	2	8	12023	12030	25 %	25 %	25 %	25 %	325980832
29	NC_015221	CAAT	2	8	12170	12177	50 %	25 %	0 %	25 %	325980832
30	NC_015221	TTTG	2	8	12326	12333	0 %	75 %	25 %	0 %	325980832
31	NC_015221	CAAA	2	8	13205	13212	75 %	0 %	0 %	25 %	325980833
32	NC_015221	CCAC	2	8	13311	13318	25 %	0 %	0 %	75 %	325980833
33	NC_015221	CATC	2	8	13675	13682	25 %	25 %	0 %	50 %	325980833
34	NC_015221	GTAA	2	8	15006	15013	50 %	25 %	25 %	0 %	325980834
35	NC_015221	GATG	2	8	15121	15128	25 %	25 %	50 %	0 %	325980834
36	NC_015221	CCAG	2	8	15522	15529	25 %	0 %	25 %	50 %	325980835
37	NC_015221	TTGC	2	8	15564	15571	0 %	50 %	25 %	25 %	325980835
38	NC_015221	CAAG	2	8	16670	16677	50 %	0 %	25 %	25 %	325980836
39	NC_015221	CAAG	2	8	16724	16731	50 %	0 %	25 %	25 %	325980836
40	NC_015221	CATA	2	8	17175	17182	50 %	25 %	0 %	25 %	325980836
41	NC_015221	ACTC	2	8	17995	18002	25 %	25 %	0 %	50 %	325980837
42	NC_015221	TGTT	2	8	18265	18272	0 %	75 %	25 %	0 %	325980837
43	NC_015221	GTTT	2	8	18334	18341	0 %	75 %	25 %	0 %	325980838
44	NC_015221	AAGA	2	8	18725	18732	75 %	0 %	25 %	0 %	325980839
45	NC_015221	GACA	2	8	19229	19236	50 %	0 %	25 %	25 %	325980839
46	NC_015221	AAGA	2	8	19725	19732	75 %	0 %	25 %	0 %	325980839
47	NC_015221	ATTA	2	8	19858	19865	50 %	50 %	0 %	0 %	325980840
48	NC_015221	ATTT	2	8	19904	19911	25 %	75 %	0 %	0 %	325980840
49	NC_015221	CAAG	2	8	19969	19976	50 %	0 %	25 %	25 %	325980840
50	NC_015221	ATCA	2	8	20750	20757	50 %	25 %	0 %	25 %	325980841
51	NC_015221	ATCT	2	8	21064	21071	25 %	50 %	0 %	25 %	325980841
52	NC_015221	CATC	2	8	21285	21292	25 %	25 %	0 %	50 %	325980842
53	NC_015221	TTAA	2	8	21966	21973	50 %	50 %	0 %	0 %	325980843
54	NC_015221	GCCA	2	8	22114	22121	25 %	0 %	25 %	50 %	325980843
55	NC_015221	TTTA	2	8	22674	22681	25 %	75 %	0 %	0 %	325980844
56	NC_015221	GATC	2	8	24250	24257	25 %	25 %	25 %	25 %	325980846
57	NC_015221	CTTT	2	8	26990	26997	0 %	75 %	0 %	25 %	325980848
58	NC_015221	CGTT	2	8	26999	27006	0 %	50 %	25 %	25 %	325980848
59	NC_015221	CTTT	2	8	27063	27070	0 %	75 %	0 %	25 %	325980848
60	NC_015221	GATT	2	8	27168	27175	25 %	50 %	25 %	0 %	325980848
61	NC_015221	CTGT	2	8	27238	27245	0 %	50 %	25 %	25 %	325980848
62	NC_015221	ATTT	2	8	27906	27913	25 %	75 %	0 %	0 %	325980848
63	NC_015221	ATGC	2	8	27918	27925	25 %	25 %	25 %	25 %	325980848
64	NC_015221	ATTA	2	8	27937	27944	50 %	50 %	0 %	0 %	325980848
65	NC_015221	CAAG	2	8	28323	28330	50 %	0 %	25 %	25 %	325980849
66	NC_015221	TCCA	2	8	28686	28693	25 %	25 %	0 %	50 %	325980850
67	NC_015221	TCAA	2	8	28951	28958	50 %	25 %	0 %	25 %	325980850
68	NC_015221	ACGA	2	8	29200	29207	50 %	0 %	25 %	25 %	325980851
69	NC_015221	TTCG	2	8	29491	29498	0 %	50 %	25 %	25 %	325980851
70	NC_015221	CTGA	2	8	30320	30327	25 %	25 %	25 %	25 %	325980853
71	NC_015221	TCAG	2	8	30351	30358	25 %	25 %	25 %	25 %	325980853
72	NC_015221	CACT	2	8	30822	30829	25 %	25 %	0 %	50 %	325980853
73	NC_015221	GGAT	2	8	31083	31090	25 %	25 %	50 %	0 %	325980853
74	NC_015221	AATC	2	8	31545	31552	50 %	25 %	0 %	25 %	325980853
75	NC_015221	CAAT	2	8	31698	31705	50 %	25 %	0 %	25 %	325980853
76	NC_015221	AAAT	2	8	32088	32095	75 %	25 %	0 %	0 %	325980854
77	NC_015221	CACT	2	8	32501	32508	25 %	25 %	0 %	50 %	325980854
78	NC_015221	CCAG	2	8	32699	32706	25 %	0 %	25 %	50 %	325980854
79	NC_015221	TGGA	2	8	32827	32834	25 %	25 %	50 %	0 %	325980854
80	NC_015221	CCAA	2	8	33771	33778	50 %	0 %	0 %	50 %	325980855
81	NC_015221	GATC	2	8	33975	33982	25 %	25 %	25 %	25 %	325980855
82	NC_015221	GATC	2	8	34064	34071	25 %	25 %	25 %	25 %	325980855
83	NC_015221	AGGC	2	8	34072	34079	25 %	0 %	50 %	25 %	325980855
84	NC_015221	TAAT	2	8	34295	34302	50 %	50 %	0 %	0 %	325980855
85	NC_015221	GGCT	2	8	34517	34524	0 %	25 %	50 %	25 %	325980856
86	NC_015221	GTTG	2	8	34724	34731	0 %	50 %	50 %	0 %	325980857
87	NC_015221	AATA	2	8	35775	35782	75 %	25 %	0 %	0 %	325980857
88	NC_015221	CAAG	2	8	35856	35863	50 %	0 %	25 %	25 %	325980857
89	NC_015221	GATG	2	8	36321	36328	25 %	25 %	50 %	0 %	325980857
90	NC_015221	CTTA	2	8	36623	36630	25 %	50 %	0 %	25 %	325980857
91	NC_015221	CGAG	2	8	37211	37218	25 %	0 %	50 %	25 %	325980857
92	NC_015221	GAAG	2	8	38506	38513	50 %	0 %	50 %	0 %	325980858
93	NC_015221	GTAG	2	8	38550	38557	25 %	25 %	50 %	0 %	325980858
94	NC_015221	TGAT	2	8	38745	38752	25 %	50 %	25 %	0 %	325980859
95	NC_015221	CCAA	2	8	38785	38792	50 %	0 %	0 %	50 %	325980859
96	NC_015221	TTGA	2	8	38906	38913	25 %	50 %	25 %	0 %	325980859
97	NC_015221	TCTT	2	8	40364	40371	0 %	75 %	0 %	25 %	325980860
98	NC_015221	TTTA	2	8	40378	40385	25 %	75 %	0 %	0 %	325980860
99	NC_015221	TTAT	2	8	40734	40741	25 %	75 %	0 %	0 %	325980860
100	NC_015221	ATTG	2	8	41021	41028	25 %	50 %	25 %	0 %	325980861
101	NC_015221	GCAG	2	8	41210	41217	25 %	0 %	50 %	25 %	325980861
102	NC_015221	TTGA	2	8	41841	41848	25 %	50 %	25 %	0 %	325980862
103	NC_015221	CATC	2	8	42209	42216	25 %	25 %	0 %	50 %	325980863
104	NC_015221	CCGG	2	8	42481	42488	0 %	0 %	50 %	50 %	325980863
105	NC_015221	ATGC	2	8	42990	42997	25 %	25 %	25 %	25 %	325980864
106	NC_015221	TTGA	2	8	43032	43039	25 %	50 %	25 %	0 %	325980864
107	NC_015221	ATGT	2	8	43363	43370	25 %	50 %	25 %	0 %	325980864
108	NC_015221	CAAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	0 %	25 %	325980864
109	NC_015221	ATCG	2	8	43583	43590	25 %	25 %	25 %	25 %	325980864
110	NC_015221	GAGC	2	8	43679	43686	25 %	0 %	50 %	25 %	325980864
111	NC_015221	GAGC	2	8	43812	43819	25 %	0 %	50 %	25 %	325980864
112	NC_015221	AAAC	2	8	43926	43933	75 %	0 %	0 %	25 %	325980864
113	NC_015221	ATTT	2	8	43999	44006	25 %	75 %	0 %	0 %	325980864
114	NC_015221	TCCC	2	8	44050	44057	0 %	25 %	0 %	75 %	325980864
115	NC_015221	TTGA	2	8	44479	44486	25 %	50 %	25 %	0 %	325980864
116	NC_015221	TTTC	2	8	44814	44821	0 %	75 %	0 %	25 %	325980865
117	NC_015221	GCAC	2	8	45960	45967	25 %	0 %	25 %	50 %	325980866
118	NC_015221	ATTG	2	8	46000	46007	25 %	50 %	25 %	0 %	325980866
119	NC_015221	GACC	2	8	46311	46318	25 %	0 %	25 %	50 %	325980866
120	NC_015221	TTGG	2	8	46795	46802	0 %	50 %	50 %	0 %	325980866
121	NC_015221	CGCA	2	8	46849	46856	25 %	0 %	25 %	50 %	325980866
122	NC_015221	CCAA	2	8	47080	47087	50 %	0 %	0 %	50 %	325980866
123	NC_015221	TCAG	2	8	48666	48673	25 %	25 %	25 %	25 %	325980868
124	NC_015221	CCAA	2	8	48812	48819	50 %	0 %	0 %	50 %	325980868
125	NC_015221	CCAC	2	8	48898	48905	25 %	0 %	0 %	75 %	325980868
126	NC_015221	TCGC	2	8	49196	49203	0 %	25 %	25 %	50 %	325980868
127	NC_015221	TCGG	2	8	49308	49315	0 %	25 %	50 %	25 %	325980869
128	NC_015221	CGAT	2	8	49515	49522	25 %	25 %	25 %	25 %	325980869
129	NC_015221	TCGC	2	8	49578	49585	0 %	25 %	25 %	50 %	325980869
130	NC_015221	ATTT	2	8	52377	52384	25 %	75 %	0 %	0 %	325980870
131	NC_015221	TGAA	2	8	52610	52617	50 %	25 %	25 %	0 %	325980870
132	NC_015221	CAAT	2	8	52704	52711	50 %	25 %	0 %	25 %	325980870
133	NC_015221	ATTG	2	8	52877	52884	25 %	50 %	25 %	0 %	325980870
134	NC_015221	TGCT	2	8	53160	53167	0 %	50 %	25 %	25 %	325980871
135	NC_015221	TGCT	2	8	53283	53290	0 %	50 %	25 %	25 %	325980871
136	NC_015221	GTTT	2	8	53362	53369	0 %	75 %	25 %	0 %	325980871
137	NC_015221	TTCA	2	8	55037	55044	25 %	50 %	0 %	25 %	325980872
138	NC_015221	TCCT	2	8	55322	55329	0 %	50 %	0 %	50 %	325980872
139	NC_015221	CATG	2	8	55636	55643	25 %	25 %	25 %	25 %	325980872
140	NC_015221	GCAT	2	8	57157	57164	25 %	25 %	25 %	25 %	325980873
141	NC_015221	TTTG	2	8	57423	57430	0 %	75 %	25 %	0 %	325980873
142	NC_015221	CATC	2	8	57824	57831	25 %	25 %	0 %	50 %	325980873
143	NC_015221	TCAG	2	8	57991	57998	25 %	25 %	25 %	25 %	325980873
144	NC_015221	GCCA	2	8	58338	58345	25 %	0 %	25 %	50 %	325980874
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146	NC_015221	CCAT	2	8	58732	58739	25 %	25 %	0 %	50 %	325980874
147	NC_015221	AGCA	2	8	59652	59659	50 %	0 %	25 %	25 %	325980874
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149	NC_015221	ATTT	2	8	59864	59871	25 %	75 %	0 %	0 %	325980875
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157	NC_015221	TTCT	2	8	63438	63445	0 %	75 %	0 %	25 %	325980880
158	NC_015221	GCTT	2	8	63490	63497	0 %	50 %	25 %	25 %	325980880

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.