MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 1029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015221	ATA	2	6	30582	30587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980853
502	NC_015221	CAA	2	6	30616	30621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980853
503	NC_015221	TAT	2	6	30656	30661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980853
504	NC_015221	TTA	2	6	30666	30671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980853
505	NC_015221	CACT	2	8	30822	30829	25 %	25 %	0 %	50 %	325980853
506	NC_015221	CAA	2	6	30928	30933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980853
507	NC_015221	GGAT	2	8	31083	31090	25 %	25 %	50 %	0 %	325980853
508	NC_015221	TGC	2	6	31164	31169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980853
509	NC_015221	A	6	6	31262	31267	100 %	0 %	0 %	0 %	325980853
510	NC_015221	TCA	2	6	31285	31290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980853
511	NC_015221	ACA	2	6	31301	31306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980853
512	NC_015221	ATT	2	6	31313	31318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980853
513	NC_015221	AGA	2	6	31442	31447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980853
514	NC_015221	TTA	2	6	31524	31529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980853
515	NC_015221	AATC	2	8	31545	31552	50 %	25 %	0 %	25 %	325980853
516	NC_015221	ACC	2	6	31589	31594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980853
517	NC_015221	GAA	2	6	31675	31680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980853
518	NC_015221	CAAT	2	8	31698	31705	50 %	25 %	0 %	25 %	325980853
519	NC_015221	GCA	2	6	31742	31747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980853
520	NC_015221	TGA	2	6	31771	31776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980853
521	NC_015221	CAG	2	6	31799	31804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980853
522	NC_015221	TGA	2	6	31886	31891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980853
523	NC_015221	AAC	2	6	31894	31899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980854
524	NC_015221	CAG	2	6	31917	31922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980854
525	NC_015221	AC	3	6	31937	31942	50 %	0 %	0 %	50 %	325980854
526	NC_015221	TG	3	6	31965	31970	0 %	50 %	50 %	0 %	325980854
527	NC_015221	TTG	2	6	31973	31978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980854
528	NC_015221	CAATT	2	10	32014	32023	40 %	40 %	0 %	20 %	325980854
529	NC_015221	AAAT	2	8	32088	32095	75 %	25 %	0 %	0 %	325980854
530	NC_015221	CAT	2	6	32115	32120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980854
531	NC_015221	GGC	2	6	32127	32132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980854
532	NC_015221	ATTTT	2	10	32143	32152	20 %	80 %	0 %	0 %	325980854
533	NC_015221	CGG	2	6	32328	32333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325980854
534	NC_015221	TGT	2	6	32390	32395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980854
535	NC_015221	CACT	2	8	32501	32508	25 %	25 %	0 %	50 %	325980854
536	NC_015221	CAT	2	6	32524	32529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980854
537	NC_015221	TGC	2	6	32543	32548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980854
538	NC_015221	TGA	2	6	32567	32572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980854
539	NC_015221	ACC	2	6	32644	32649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980854
540	NC_015221	CCAG	2	8	32699	32706	25 %	0 %	25 %	50 %	325980854
541	NC_015221	TGG	2	6	32714	32719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980854
542	NC_015221	CT	3	6	32794	32799	0 %	50 %	0 %	50 %	325980854
543	NC_015221	TGGA	2	8	32827	32834	25 %	25 %	50 %	0 %	325980854
544	NC_015221	GC	3	6	32890	32895	0 %	0 %	50 %	50 %	325980854
545	NC_015221	GGA	2	6	32913	32918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980854
546	NC_015221	TAT	2	6	32933	32938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980854
547	NC_015221	CGATC	2	10	32970	32979	20 %	20 %	20 %	40 %	325980854
548	NC_015221	CAA	2	6	32985	32990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980854
549	NC_015221	GC	3	6	33167	33172	0 %	0 %	50 %	50 %	325980854
550	NC_015221	GCT	2	6	33186	33191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980854
551	NC_015221	ATCTG	2	10	33281	33290	20 %	40 %	20 %	20 %	325980854
552	NC_015221	ATG	2	6	33335	33340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980854
553	NC_015221	TCA	2	6	33437	33442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980854
554	NC_015221	ACC	2	6	33454	33459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980854
555	NC_015221	GCC	2	6	33464	33469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980854
556	NC_015221	GAT	2	6	33477	33482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980854
557	NC_015221	CG	3	6	33520	33525	0 %	0 %	50 %	50 %	325980854
558	NC_015221	TTA	2	6	33526	33531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325980854
559	NC_015221	A	6	6	33765	33770	100 %	0 %	0 %	0 %	325980855
560	NC_015221	CCAA	2	8	33771	33778	50 %	0 %	0 %	50 %	325980855
561	NC_015221	TTCTG	2	10	33791	33800	0 %	60 %	20 %	20 %	325980855
562	NC_015221	TGA	2	6	33902	33907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980855
563	NC_015221	GAA	2	6	33947	33952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980855
564	NC_015221	GATC	2	8	33975	33982	25 %	25 %	25 %	25 %	325980855
565	NC_015221	GAG	2	6	33994	33999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980855
566	NC_015221	TTG	2	6	34020	34025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980855
567	NC_015221	GT	3	6	34033	34038	0 %	50 %	50 %	0 %	325980855
568	NC_015221	GATC	2	8	34064	34071	25 %	25 %	25 %	25 %	325980855
569	NC_015221	AGGC	2	8	34072	34079	25 %	0 %	50 %	25 %	325980855
570	NC_015221	GAT	2	6	34176	34181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980855
571	NC_015221	CTG	2	6	34191	34196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980855
572	NC_015221	GC	3	6	34227	34232	0 %	0 %	50 %	50 %	325980855
573	NC_015221	TAAT	2	8	34295	34302	50 %	50 %	0 %	0 %	325980855
574	NC_015221	ACC	2	6	34328	34333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980856
575	NC_015221	TAG	2	6	34498	34503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980856
576	NC_015221	GGCT	2	8	34517	34524	0 %	25 %	50 %	25 %	325980856
577	NC_015221	AAG	2	6	34537	34542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980856
578	NC_015221	A	6	6	34585	34590	100 %	0 %	0 %	0 %	325980857
579	NC_015221	CTG	2	6	34630	34635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980857
580	NC_015221	TGA	2	6	34697	34702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980857
581	NC_015221	GTTG	2	8	34724	34731	0 %	50 %	50 %	0 %	325980857
582	NC_015221	A	6	6	34778	34783	100 %	0 %	0 %	0 %	325980857
583	NC_015221	GAG	2	6	34813	34818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980857
584	NC_015221	A	6	6	34825	34830	100 %	0 %	0 %	0 %	325980857
585	NC_015221	GAT	2	6	34831	34836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980857
586	NC_015221	AAT	2	6	34855	34860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980857
587	NC_015221	GCA	2	6	34932	34937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
588	NC_015221	GC	3	6	34992	34997	0 %	0 %	50 %	50 %	325980857
589	NC_015221	CTA	2	6	35121	35126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980857
590	NC_015221	AGA	2	6	35223	35228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980857
591	NC_015221	TGC	2	6	35252	35257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980857
592	NC_015221	GCA	2	6	35292	35297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
593	NC_015221	GCT	2	6	35362	35367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980857
594	NC_015221	A	6	6	35375	35380	100 %	0 %	0 %	0 %	325980857
595	NC_015221	AT	4	8	35388	35395	50 %	50 %	0 %	0 %	325980857
596	NC_015221	CAA	2	6	35407	35412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980857
597	NC_015221	AGG	2	6	35441	35446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325980857
598	NC_015221	ATCAA	2	10	35459	35468	60 %	20 %	0 %	20 %	325980857
599	NC_015221	TC	3	6	35496	35501	0 %	50 %	0 %	50 %	325980857
600	NC_015221	A	6	6	35568	35573	100 %	0 %	0 %	0 %	325980857
601	NC_015221	TGG	2	6	35625	35630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980857
602	NC_015221	GAA	2	6	35650	35655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980857
603	NC_015221	AATA	2	8	35775	35782	75 %	25 %	0 %	0 %	325980857
604	NC_015221	TGA	2	6	35817	35822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980857
605	NC_015221	CAAG	2	8	35856	35863	50 %	0 %	25 %	25 %	325980857
606	NC_015221	GCA	2	6	35963	35968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
607	NC_015221	AGT	2	6	35994	35999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980857
608	NC_015221	AGC	2	6	36014	36019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
609	NC_015221	CAA	2	6	36067	36072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980857
610	NC_015221	CAG	2	6	36235	36240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
611	NC_015221	GTT	2	6	36293	36298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325980857
612	NC_015221	ATC	2	6	36311	36316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980857
613	NC_015221	GATG	2	8	36321	36328	25 %	25 %	50 %	0 %	325980857
614	NC_015221	CA	4	8	36333	36340	50 %	0 %	0 %	50 %	325980857
615	NC_015221	AAT	2	6	36427	36432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325980857
616	NC_015221	GCT	2	6	36511	36516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325980857
617	NC_015221	AGC	2	6	36521	36526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
618	NC_015221	AAC	2	6	36542	36547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325980857
619	NC_015221	GCC	2	6	36604	36609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325980857
620	NC_015221	ATC	2	6	36617	36622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980857
621	NC_015221	CTTA	2	8	36623	36630	25 %	50 %	0 %	25 %	325980857
622	NC_015221	CA	3	6	36671	36676	50 %	0 %	0 %	50 %	325980857
623	NC_015221	GAT	2	6	36682	36687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980857
624	NC_015221	ATC	2	6	36703	36708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980857
625	NC_015221	GAA	2	6	36748	36753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325980857
626	NC_015221	GTG	2	6	36848	36853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325980857
627	NC_015221	AGC	2	6	36927	36932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325980857
628	NC_015221	CAT	2	6	37086	37091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325980857
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757	NC_015221	GAT	2	6	46333	46338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980866
758	NC_015221	ACC	2	6	46395	46400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325980866
759	NC_015221	TGA	2	6	46413	46418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325980866
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