MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus watsoni C-113 plasmid pNWAT02

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014317	GGAT	2	8	1452	1459	25 %	25 %	50 %	0 %	300067538
2	NC_014317	CTA	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300067538
3	NC_014317	CCG	2	6	1521	1526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067538
4	NC_014317	GAA	2	6	1528	1533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300067538
5	NC_014317	CTT	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300067538
6	NC_014317	ACA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300067538
7	NC_014317	ATT	2	6	1779	1784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300067538
8	NC_014317	A	7	7	1794	1800	100 %	0 %	0 %	0 %	300067538
9	NC_014317	GA	3	6	1890	1895	50 %	0 %	50 %	0 %	300067538
10	NC_014317	AC	4	8	1922	1929	50 %	0 %	0 %	50 %	300067538
11	NC_014317	AGGC	2	8	2096	2103	25 %	0 %	50 %	25 %	300067539
12	NC_014317	TGC	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067539
13	NC_014317	GAA	2	6	2175	2180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300067539
14	NC_014317	GCC	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067539
15	NC_014317	CA	3	6	2802	2807	50 %	0 %	0 %	50 %	300067540
16	NC_014317	GGGT	2	8	2820	2827	0 %	25 %	75 %	0 %	300067540
17	NC_014317	AATC	2	8	2866	2873	50 %	25 %	0 %	25 %	300067541
18	NC_014317	TGC	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067541
19	NC_014317	T	6	6	4188	4193	0 %	100 %	0 %	0 %	300067542
20	NC_014317	GCTG	2	8	4223	4230	0 %	25 %	50 %	25 %	300067542
21	NC_014317	CAC	2	6	4245	4250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300067542
22	NC_014317	CAG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067542
23	NC_014317	TTCC	2	8	4470	4477	0 %	50 %	0 %	50 %	300067542
24	NC_014317	AATC	2	8	4478	4485	50 %	25 %	0 %	25 %	300067542
25	NC_014317	TCAA	2	8	4576	4583	50 %	25 %	0 %	25 %	300067542
26	NC_014317	ACG	2	6	4621	4626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067542
27	NC_014317	CATG	2	8	4664	4671	25 %	25 %	25 %	25 %	300067542
28	NC_014317	A	6	6	4702	4707	100 %	0 %	0 %	0 %	300067542
29	NC_014317	TGC	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
30	NC_014317	CA	3	6	4774	4779	50 %	0 %	0 %	50 %	300067542
31	NC_014317	AAC	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300067542
32	NC_014317	GCT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
33	NC_014317	CTG	2	6	4982	4987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067542
34	NC_014317	CTT	2	6	5015	5020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300067542
35	NC_014317	GGC	2	6	5033	5038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300067542
36	NC_014317	TGCCT	2	10	5105	5114	0 %	40 %	20 %	40 %	300067543
37	NC_014317	TGC	2	6	5120	5125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
38	NC_014317	GCT	2	6	5155	5160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
39	NC_014317	TGC	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543
40	NC_014317	GCC	2	6	5260	5265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300067543
41	NC_014317	TGT	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300067543
42	NC_014317	GCA	2	6	5287	5292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300067543
43	NC_014317	TGCC	2	8	5362	5369	0 %	25 %	25 %	50 %	300067543
44	NC_014317	T	6	6	5448	5453	0 %	100 %	0 %	0 %	300067543
45	NC_014317	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300067543
46	NC_014317	CTG	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300067543

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.