MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 54348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014315	GCG	2	6	34004	34009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112771
502	NC_014315	TTA	2	6	34012	34017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112771
503	NC_014315	CAG	2	6	34137	34142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112771
504	NC_014315	ACGGG	2	10	34173	34182	20 %	0 %	60 %	20 %	300112771
505	NC_014315	T	6	6	34185	34190	0 %	100 %	0 %	0 %	300112771
506	NC_014315	ATT	2	6	34209	34214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112771
507	NC_014315	ATG	2	6	34228	34233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112771
508	NC_014315	TTG	2	6	34423	34428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112771
509	NC_014315	CCA	2	6	34455	34460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112771
510	NC_014315	AGC	2	6	34465	34470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112771
511	NC_014315	CGC	2	6	34480	34485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112771
512	NC_014315	AGG	2	6	34598	34603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112771
513	NC_014315	GAA	2	6	34640	34645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112771
514	NC_014315	ATA	2	6	34654	34659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112771
515	NC_014315	TTA	2	6	34663	34668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112771
516	NC_014315	CCG	2	6	34725	34730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112772
517	NC_014315	TTG	2	6	34833	34838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112772
518	NC_014315	CTG	2	6	34865	34870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112772
519	NC_014315	A	6	6	34912	34917	100 %	0 %	0 %	0 %	300112772
520	NC_014315	CTA	2	6	34954	34959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112772
521	NC_014315	GAT	2	6	35087	35092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112772
522	NC_014315	AATT	2	8	35186	35193	50 %	50 %	0 %	0 %	300112772
523	NC_014315	ATT	2	6	35205	35210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112772
524	NC_014315	AAG	2	6	35220	35225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112772
525	NC_014315	AGG	2	6	35254	35259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112772
526	NC_014315	T	6	6	35277	35282	0 %	100 %	0 %	0 %	300112772
527	NC_014315	GGCAT	2	10	35359	35368	20 %	20 %	40 %	20 %	300112772
528	NC_014315	AACCA	2	10	35388	35397	60 %	0 %	0 %	40 %	300112772
529	NC_014315	GAG	2	6	35442	35447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112772
530	NC_014315	TGT	2	6	35473	35478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112772
531	NC_014315	GGC	2	6	35570	35575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112772
532	NC_014315	CTG	2	6	35628	35633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112772
533	NC_014315	TAA	2	6	35684	35689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112772
534	NC_014315	TAA	2	6	35728	35733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112772
535	NC_014315	GCC	2	6	35787	35792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112772
536	NC_014315	A	6	6	35869	35874	100 %	0 %	0 %	0 %	300112772
537	NC_014315	T	7	7	35875	35881	0 %	100 %	0 %	0 %	300112772
538	NC_014315	AGC	2	6	36031	36036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112773
539	NC_014315	ATC	2	6	36130	36135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112773
540	NC_014315	TCA	2	6	36158	36163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112773
541	NC_014315	TCA	2	6	36173	36178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112773
542	NC_014315	CGA	2	6	36306	36311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112773
543	NC_014315	GAT	2	6	36370	36375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112773
544	NC_014315	GCAGC	2	10	36391	36400	20 %	0 %	40 %	40 %	300112773
545	NC_014315	ATT	2	6	36421	36426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112773
546	NC_014315	TGC	2	6	36441	36446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112773
547	NC_014315	ATA	2	6	36470	36475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112773
548	NC_014315	G	6	6	36480	36485	0 %	0 %	100 %	0 %	300112774
549	NC_014315	GCC	2	6	36610	36615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112774
550	NC_014315	TAA	2	6	36636	36641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112774
551	NC_014315	CTG	2	6	36652	36657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112774
552	NC_014315	ATG	2	6	36805	36810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112774
553	NC_014315	TAAA	2	8	36831	36838	75 %	25 %	0 %	0 %	300112774
554	NC_014315	TAG	2	6	36991	36996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112775
555	NC_014315	TAT	2	6	37025	37030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112775
556	NC_014315	T	6	6	37160	37165	0 %	100 %	0 %	0 %	300112775
557	NC_014315	GTG	2	6	37270	37275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112775
558	NC_014315	TC	4	8	37383	37390	0 %	50 %	0 %	50 %	300112775
559	NC_014315	TG	3	6	37396	37401	0 %	50 %	50 %	0 %	300112775
560	NC_014315	TGCT	2	8	37408	37415	0 %	50 %	25 %	25 %	300112775
561	NC_014315	T	6	6	37418	37423	0 %	100 %	0 %	0 %	300112775
562	NC_014315	TGG	2	6	37428	37433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112775
563	NC_014315	TGT	2	6	37463	37468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112775
564	NC_014315	TCA	2	6	37496	37501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112775
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568	NC_014315	ATA	2	6	37694	37699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112776
569	NC_014315	TCT	2	6	37710	37715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112776
570	NC_014315	TGC	2	6	37737	37742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112776
571	NC_014315	CCG	2	6	37767	37772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112776
572	NC_014315	TGTT	2	8	37796	37803	0 %	75 %	25 %	0 %	300112776
573	NC_014315	CCG	2	6	37811	37816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112776
574	NC_014315	CGG	2	6	37870	37875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112776
575	NC_014315	GAG	2	6	38162	38167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112776
576	NC_014315	G	7	7	38186	38192	0 %	0 %	100 %	0 %	300112776
577	NC_014315	ATG	2	6	38231	38236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112776
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582	NC_014315	CTT	2	6	38351	38356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112776
583	NC_014315	GCA	2	6	38395	38400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112776
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585	NC_014315	GGA	2	6	38476	38481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300112776
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593	NC_014315	GAA	2	6	39200	39205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300112778
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609	NC_014315	ACT	2	6	39834	39839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112779
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611	NC_014315	CAG	3	9	39893	39901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112779
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613	NC_014315	CCCT	2	8	40034	40041	0 %	25 %	0 %	75 %	300112779
614	NC_014315	TTA	2	6	40093	40098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112779
615	NC_014315	CGG	2	6	40162	40167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112779
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617	NC_014315	GTT	2	6	40288	40293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112779
618	NC_014315	GGT	2	6	40294	40299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112779
619	NC_014315	AGC	2	6	40456	40461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112779
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621	NC_014315	GGC	2	6	40503	40508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112779
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624	NC_014315	TGGA	2	8	40662	40669	25 %	25 %	50 %	0 %	300112779
625	NC_014315	GC	3	6	40673	40678	0 %	0 %	50 %	50 %	300112779
626	NC_014315	TGG	2	6	40680	40685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112779
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628	NC_014315	CCG	2	6	40715	40720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112779
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753	NC_014315	CAAG	2	8	48117	48124	50 %	0 %	25 %	25 %	300112782
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755	NC_014315	CCG	2	6	48326	48331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112783
756	NC_014315	CAT	2	6	48344	48349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112783
757	NC_014315	GGC	2	6	48378	48383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300112783
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759	NC_014315	TGA	2	6	48676	48681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300112784
760	NC_014315	CTA	2	6	48707	48712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112784
761	NC_014315	CGA	2	6	48769	48774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112784
762	NC_014315	CCG	2	6	48797	48802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300112784
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768	NC_014315	CCA	2	6	48974	48979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300112784
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770	NC_014315	ATT	2	6	49219	49224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300112784
771	NC_014315	AGC	2	6	49257	49262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300112784
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774	NC_014315	A	6	6	49474	49479	100 %	0 %	0 %	0 %	300112784
775	NC_014315	AGATAA	2	12	49537	49548	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	300112784
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777	NC_014315	TAA	2	6	49758	49763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300112784
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787	NC_014315	TCT	2	6	50545	50550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300112784
788	NC_014315	CTG	2	6	50604	50609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300112784
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870	NC_014315	TCA	3	9	54816	54824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300112788
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872	NC_014315	CTCAG	2	10	55024	55033	20 %	20 %	20 %	40 %	300112788
873	NC_014315	GTT	2	6	55042	55047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300112788
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878	NC_014315	TGG	2	6	55295	55300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300112788
879	NC_014315	GCCA	2	8	55480	55487	25 %	0 %	25 %	50 %	300112788
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