MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus watsonii C-113 chromosome

Total Repeats: 54348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014315	GGT	2	6	333798	333803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113037
5502	NC_014315	CTG	2	6	333812	333817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113037
5503	NC_014315	GCC	2	6	333982	333987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113037
5504	NC_014315	GGCCA	2	10	334010	334019	20 %	0 %	40 %	40 %	300113037
5505	NC_014315	GCA	2	6	334092	334097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113037
5506	NC_014315	GCC	2	6	334121	334126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113037
5507	NC_014315	TAA	2	6	334201	334206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113038
5508	NC_014315	AAG	2	6	334239	334244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113038
5509	NC_014315	AATA	2	8	334282	334289	75 %	25 %	0 %	0 %	300113038
5510	NC_014315	TGC	2	6	334300	334305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113038
5511	NC_014315	CTA	2	6	334335	334340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113038
5512	NC_014315	CCG	3	9	334359	334367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113038
5513	NC_014315	CCAT	2	8	334548	334555	25 %	25 %	0 %	50 %	300113038
5514	NC_014315	GCC	2	6	334652	334657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113038
5515	NC_014315	CTG	2	6	334862	334867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113038
5516	NC_014315	GAA	2	6	334892	334897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113038
5517	NC_014315	CTG	2	6	335012	335017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113038
5518	NC_014315	CGG	2	6	335057	335062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113038
5519	NC_014315	ACC	2	6	335079	335084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300113038
5520	NC_014315	TGG	2	6	335100	335105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113038
5521	NC_014315	GACGAT	2	12	335201	335212	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	300113038
5522	NC_014315	CAT	2	6	335218	335223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113038
5523	NC_014315	GCT	2	6	335239	335244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113038
5524	NC_014315	CCG	2	6	335320	335325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113038
5525	NC_014315	CAG	3	9	335552	335560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113038
5526	NC_014315	GC	3	6	335561	335566	0 %	0 %	50 %	50 %	300113038
5527	NC_014315	GCG	2	6	335669	335674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113038
5528	NC_014315	GGCA	2	8	335729	335736	25 %	0 %	50 %	25 %	300113038
5529	NC_014315	GAC	2	6	335755	335760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113038
5530	NC_014315	TGGTCG	2	12	335818	335829	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	300113038
5531	NC_014315	GGA	2	6	335848	335853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113038
5532	NC_014315	TGC	2	6	335934	335939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113039
5533	NC_014315	CGG	2	6	335970	335975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113039
5534	NC_014315	CAG	2	6	335988	335993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113039
5535	NC_014315	GCTG	2	8	336016	336023	0 %	25 %	50 %	25 %	300113039
5536	NC_014315	GAG	2	6	336038	336043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113039
5537	NC_014315	CTA	2	6	336045	336050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113039
5538	NC_014315	TGGA	2	8	336123	336130	25 %	25 %	50 %	0 %	300113039
5539	NC_014315	G	6	6	336153	336158	0 %	0 %	100 %	0 %	300113039
5540	NC_014315	GCG	3	9	336167	336175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113039
5541	NC_014315	GCG	2	6	336190	336195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113039
5542	NC_014315	GCG	3	9	336223	336231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113039
5543	NC_014315	GGC	2	6	336347	336352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113039
5544	NC_014315	CTC	2	6	336359	336364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113039
5545	NC_014315	GAT	2	6	336365	336370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113039
5546	NC_014315	CGGG	2	8	336421	336428	0 %	0 %	75 %	25 %	300113039
5547	NC_014315	AGG	2	6	336430	336435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113039
5548	NC_014315	GGCA	2	8	336526	336533	25 %	0 %	50 %	25 %	300113039
5549	NC_014315	CAT	2	6	336604	336609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113039
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5551	NC_014315	CCGC	2	8	336876	336883	0 %	0 %	25 %	75 %	300113039
5552	NC_014315	GAA	2	6	336984	336989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113040
5553	NC_014315	GAA	3	9	337059	337067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113040
5554	NC_014315	CGG	2	6	337131	337136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113040
5555	NC_014315	CTTC	2	8	337140	337147	0 %	50 %	0 %	50 %	300113040
5556	NC_014315	GCCCA	2	10	337288	337297	20 %	0 %	20 %	60 %	300113040
5557	NC_014315	GTG	2	6	337366	337371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113040
5558	NC_014315	CCAC	2	8	337449	337456	25 %	0 %	0 %	75 %	300113040
5559	NC_014315	GC	3	6	337460	337465	0 %	0 %	50 %	50 %	300113040
5560	NC_014315	GGT	3	9	337482	337490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113040
5561	NC_014315	CCG	2	6	337717	337722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113040
5562	NC_014315	TCG	2	6	337765	337770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113040
5563	NC_014315	CCT	2	6	337824	337829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113040
5564	NC_014315	CCG	2	6	337911	337916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113040
5565	NC_014315	GCT	2	6	337959	337964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113040
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5567	NC_014315	GGT	2	6	338013	338018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113040
5568	NC_014315	TGGGG	2	10	338066	338075	0 %	20 %	80 %	0 %	300113040
5569	NC_014315	CG	3	6	338076	338081	0 %	0 %	50 %	50 %	300113040
5570	NC_014315	CAT	2	6	338087	338092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113040
5571	NC_014315	CAT	2	6	338186	338191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113040
5572	NC_014315	TGG	2	6	338243	338248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113040
5573	NC_014315	GC	3	6	338296	338301	0 %	0 %	50 %	50 %	300113040
5574	NC_014315	GA	5	10	338325	338334	50 %	0 %	50 %	0 %	300113040
5575	NC_014315	GAA	2	6	338361	338366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113040
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5578	NC_014315	CGC	2	6	338576	338581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113040
5579	NC_014315	GC	3	6	338620	338625	0 %	0 %	50 %	50 %	300113040
5580	NC_014315	AGC	2	6	338681	338686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113040
5581	NC_014315	TTGC	2	8	338688	338695	0 %	50 %	25 %	25 %	300113040
5582	NC_014315	AGT	2	6	338916	338921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113040
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5586	NC_014315	A	6	6	339258	339263	100 %	0 %	0 %	0 %	300113041
5587	NC_014315	GGC	2	6	339275	339280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113041
5588	NC_014315	GGC	2	6	339335	339340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113041
5589	NC_014315	TAT	2	6	339620	339625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113041
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5592	NC_014315	GAA	2	6	339744	339749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113041
5593	NC_014315	CGGAG	2	10	339764	339773	20 %	0 %	60 %	20 %	300113041
5594	NC_014315	GGT	2	6	339876	339881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113041
5595	NC_014315	T	6	6	339884	339889	0 %	100 %	0 %	0 %	300113041
5596	NC_014315	TCGC	2	8	339898	339905	0 %	25 %	25 %	50 %	300113041
5597	NC_014315	CCG	2	6	339948	339953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113041
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5599	NC_014315	T	6	6	340041	340046	0 %	100 %	0 %	0 %	300113042
5600	NC_014315	GAT	2	6	340077	340082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113042
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5603	NC_014315	TGA	2	6	340235	340240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113042
5604	NC_014315	TTC	2	6	340285	340290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113042
5605	NC_014315	GTT	2	6	340371	340376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113042
5606	NC_014315	A	6	6	340475	340480	100 %	0 %	0 %	0 %	300113042
5607	NC_014315	GT	3	6	340483	340488	0 %	50 %	50 %	0 %	300113042
5608	NC_014315	TCC	2	6	340502	340507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113042
5609	NC_014315	GGC	2	6	340543	340548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113042
5610	NC_014315	ATA	2	6	340555	340560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	300113042
5611	NC_014315	TCC	2	6	340654	340659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113042
5612	NC_014315	GAG	2	6	340782	340787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113042
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5614	NC_014315	TTTTC	2	10	340884	340893	0 %	80 %	0 %	20 %	300113042
5615	NC_014315	T	7	7	341042	341048	0 %	100 %	0 %	0 %	300113042
5616	NC_014315	CCG	2	6	341079	341084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113042
5617	NC_014315	TGAG	2	8	341111	341118	25 %	25 %	50 %	0 %	300113042
5618	NC_014315	A	6	6	341142	341147	100 %	0 %	0 %	0 %	300113042
5619	NC_014315	GAA	2	6	341290	341295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113042
5620	NC_014315	TGC	2	6	341439	341444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113042
5621	NC_014315	CAT	2	6	341880	341885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113043
5622	NC_014315	GCG	2	6	341887	341892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113043
5623	NC_014315	GTT	2	6	341902	341907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113043
5624	NC_014315	GC	3	6	341923	341928	0 %	0 %	50 %	50 %	300113043
5625	NC_014315	TCT	2	6	341996	342001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113043
5626	NC_014315	GCT	2	6	342098	342103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113043
5627	NC_014315	GA	3	6	342131	342136	50 %	0 %	50 %	0 %	300113043
5628	NC_014315	GGT	2	6	342466	342471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113044
5629	NC_014315	GCC	2	6	342523	342528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113044
5630	NC_014315	C	6	6	342538	342543	0 %	0 %	0 %	100 %	300113044
5631	NC_014315	GGA	2	6	342604	342609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113044
5632	NC_014315	GTT	2	6	342661	342666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113044
5633	NC_014315	ATG	2	6	342676	342681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113044
5634	NC_014315	CGC	2	6	342686	342691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113044
5635	NC_014315	TGA	2	6	342712	342717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113044
5636	NC_014315	G	7	7	342753	342759	0 %	0 %	100 %	0 %	300113044
5637	NC_014315	CTT	2	6	342761	342766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113044
5638	NC_014315	GCC	2	6	342831	342836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113044
5639	NC_014315	GGC	2	6	342840	342845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113044
5640	NC_014315	ATCTT	2	10	342847	342856	20 %	60 %	0 %	20 %	300113044
5641	NC_014315	GCT	2	6	342887	342892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113044
5642	NC_014315	GCC	2	6	342963	342968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113044
5643	NC_014315	CAGG	2	8	343022	343029	25 %	0 %	50 %	25 %	300113044
5644	NC_014315	G	6	6	343028	343033	0 %	0 %	100 %	0 %	300113044
5645	NC_014315	TTG	2	6	343051	343056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113044
5646	NC_014315	G	6	6	343056	343061	0 %	0 %	100 %	0 %	300113044
5647	NC_014315	CGC	2	6	343103	343108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113044
5648	NC_014315	CAT	2	6	343205	343210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113044
5649	NC_014315	ACC	2	6	343230	343235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300113044
5650	NC_014315	CCT	2	6	343240	343245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113044
5651	NC_014315	AT	3	6	343251	343256	50 %	50 %	0 %	0 %	300113044
5652	NC_014315	GCT	2	6	343273	343278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113044
5653	NC_014315	GGTG	2	8	343292	343299	0 %	25 %	75 %	0 %	300113044
5654	NC_014315	GTT	2	6	343313	343318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113044
5655	NC_014315	TTA	2	6	343387	343392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113044
5656	NC_014315	T	6	6	343780	343785	0 %	100 %	0 %	0 %	300113045
5657	NC_014315	TGT	2	6	343816	343821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113045
5658	NC_014315	T	8	8	343846	343853	0 %	100 %	0 %	0 %	300113045
5659	NC_014315	TGGG	2	8	343880	343887	0 %	25 %	75 %	0 %	300113045
5660	NC_014315	TCC	2	6	343942	343947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113045
5661	NC_014315	GA	3	6	344020	344025	50 %	0 %	50 %	0 %	300113045
5662	NC_014315	GGC	2	6	344048	344053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113045
5663	NC_014315	GCC	2	6	344175	344180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113045
5664	NC_014315	CTC	2	6	344279	344284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300113045
5665	NC_014315	CTG	2	6	344498	344503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113045
5666	NC_014315	TCAT	2	8	344822	344829	25 %	50 %	0 %	25 %	300113046
5667	NC_014315	TGA	2	6	344830	344835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113046
5668	NC_014315	TC	3	6	344899	344904	0 %	50 %	0 %	50 %	300113046
5669	NC_014315	GC	3	6	344961	344966	0 %	0 %	50 %	50 %	300113046
5670	NC_014315	CGC	3	9	344964	344972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113046
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5673	NC_014315	GTCC	2	8	345062	345069	0 %	25 %	25 %	50 %	300113046
5674	NC_014315	CCG	2	6	345171	345176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300113046
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5679	NC_014315	CG	3	6	345511	345516	0 %	0 %	50 %	50 %	300113046
5680	NC_014315	GA	3	6	345605	345610	50 %	0 %	50 %	0 %	300113046
5681	NC_014315	TCCA	2	8	345612	345619	25 %	25 %	0 %	50 %	300113046
5682	NC_014315	TCT	2	6	345704	345709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113046
5683	NC_014315	CATGG	2	10	345763	345772	20 %	20 %	40 %	20 %	300113046
5684	NC_014315	TTG	2	6	345773	345778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113046
5685	NC_014315	GCT	2	6	345799	345804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113046
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5687	NC_014315	GCG	2	6	345848	345853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113046
5688	NC_014315	TCA	2	6	345881	345886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113046
5689	NC_014315	TAT	2	6	345972	345977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113046
5690	NC_014315	TGC	2	6	345978	345983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113046
5691	NC_014315	ATT	2	6	345988	345993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	300113046
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5693	NC_014315	T	6	6	346094	346099	0 %	100 %	0 %	0 %	300113046
5694	NC_014315	CAT	2	6	346351	346356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113047
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5696	NC_014315	GAT	2	6	346442	346447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113047
5697	NC_014315	TGG	2	6	346480	346485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113047
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5700	NC_014315	C	6	6	346665	346670	0 %	0 %	0 %	100 %	300113047
5701	NC_014315	TCA	2	6	346710	346715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300113047
5702	NC_014315	GCCCC	2	10	346870	346879	0 %	0 %	20 %	80 %	300113047
5703	NC_014315	TTC	2	6	347065	347070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113047
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5709	NC_014315	CAA	2	6	347684	347689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300113048
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5712	NC_014315	CTT	3	9	347823	347831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300113048
5713	NC_014315	GAT	2	6	347849	347854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113048
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5719	NC_014315	GCAG	2	8	348172	348179	25 %	0 %	50 %	25 %	300113049
5720	NC_014315	GAG	2	6	348191	348196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113049
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5731	NC_014315	GC	3	6	348629	348634	0 %	0 %	50 %	50 %	300113050
5732	NC_014315	AGA	2	6	348735	348740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300113050
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5734	NC_014315	CAGG	2	8	348853	348860	25 %	0 %	50 %	25 %	300113050
5735	NC_014315	CGG	2	6	348981	348986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113050
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5737	NC_014315	ATGA	2	8	349348	349355	50 %	25 %	25 %	0 %	300113051
5738	NC_014315	GGC	2	6	349505	349510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113051
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5740	NC_014315	GTGG	2	8	349546	349553	0 %	25 %	75 %	0 %	300113051
5741	NC_014315	CAAG	2	8	349657	349664	50 %	0 %	25 %	25 %	300113051
5742	NC_014315	TCTT	2	8	349689	349696	0 %	75 %	0 %	25 %	300113051
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5747	NC_014315	GAG	2	6	349928	349933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300113051
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5849	NC_014315	GCA	2	6	355776	355781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300113056
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5862	NC_014315	CGGGT	2	10	356667	356676	0 %	20 %	60 %	20 %	300113057
5863	NC_014315	TAG	2	6	356711	356716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300113057
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5990	NC_014315	TGG	2	6	364715	364720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300113065
5991	NC_014315	GTT	3	9	364741	364749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300113065
5992	NC_014315	CTG	2	6	364823	364828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113065
5993	NC_014315	AG	3	6	364842	364847	50 %	0 %	50 %	0 %	300113065
5994	NC_014315	TGC	2	6	364851	364856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300113065
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5999	NC_014315	CGG	2	6	365114	365119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300113065
6000	NC_014315	TCTT	2	8	365136	365143	0 %	75 %	0 %	25 %	300113065

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