MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013960	CGG	2	6	225825	225830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3502	NC_013960	GGC	2	6	225958	225963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3503	NC_013960	GAG	2	6	226061	226066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490369
3504	NC_013960	GGC	2	6	226080	226085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3505	NC_013960	TTG	2	6	226109	226114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490369
3506	NC_013960	CGG	2	6	226153	226158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3507	NC_013960	GGC	2	6	226237	226242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3508	NC_013960	GCA	2	6	226564	226569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490369
3509	NC_013960	G	8	8	226592	226599	0 %	0 %	100 %	0 %	292490369
3510	NC_013960	GCA	2	6	226603	226608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490369
3511	NC_013960	AGCC	2	8	226624	226631	25 %	0 %	25 %	50 %	292490369
3512	NC_013960	A	6	6	226680	226685	100 %	0 %	0 %	0 %	292490369
3513	NC_013960	GC	3	6	226733	226738	0 %	0 %	50 %	50 %	292490369
3514	NC_013960	GCCCAG	2	12	226745	226756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292490369
3515	NC_013960	GGC	2	6	226795	226800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3516	NC_013960	G	7	7	226865	226871	0 %	0 %	100 %	0 %	292490369
3517	NC_013960	TGC	2	6	227031	227036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490369
3518	NC_013960	TGGATT	2	12	227070	227081	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	292490369
3519	NC_013960	G	6	6	227084	227089	0 %	0 %	100 %	0 %	292490369
3520	NC_013960	AAG	2	6	227130	227135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490369
3521	NC_013960	GGT	2	6	227146	227151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490369
3522	NC_013960	CAG	2	6	227286	227291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490369
3523	NC_013960	GGC	2	6	227389	227394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3524	NC_013960	G	7	7	227466	227472	0 %	0 %	100 %	0 %	292490369
3525	NC_013960	GTG	2	6	227675	227680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490369
3526	NC_013960	CAG	2	6	227705	227710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490369
3527	NC_013960	CAG	2	6	227720	227725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490369
3528	NC_013960	AAT	2	6	227753	227758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490369
3529	NC_013960	ATGA	2	8	227867	227874	50 %	25 %	25 %	0 %	292490369
3530	NC_013960	ATA	2	6	227877	227882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490369
3531	NC_013960	TGA	2	6	227929	227934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490369
3532	NC_013960	ATT	2	6	227941	227946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490369
3533	NC_013960	CGG	2	6	227977	227982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490369
3534	NC_013960	GGA	2	6	228022	228027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490369
3535	NC_013960	GGA	2	6	228049	228054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490369
3536	NC_013960	CAC	2	6	228090	228095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490369
3537	NC_013960	GAGC	2	8	228163	228170	25 %	0 %	50 %	25 %	292490369
3538	NC_013960	CAA	2	6	228432	228437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490370
3539	NC_013960	GT	3	6	228455	228460	0 %	50 %	50 %	0 %	292490370
3540	NC_013960	GC	3	6	228521	228526	0 %	0 %	50 %	50 %	292490370
3541	NC_013960	GCC	2	6	228549	228554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490370
3542	NC_013960	ATT	2	6	228619	228624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490370
3543	NC_013960	AGT	2	6	228635	228640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490370
3544	NC_013960	TTTA	2	8	228673	228680	25 %	75 %	0 %	0 %	292490370
3545	NC_013960	C	6	6	228706	228711	0 %	0 %	0 %	100 %	292490370
3546	NC_013960	G	6	6	228836	228841	0 %	0 %	100 %	0 %	292490370
3547	NC_013960	CAG	2	6	228914	228919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490370
3548	NC_013960	TTGA	2	8	229080	229087	25 %	50 %	25 %	0 %	292490370
3549	NC_013960	TGCC	2	8	229102	229109	0 %	25 %	25 %	50 %	292490370
3550	NC_013960	TCT	2	6	229145	229150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490370
3551	NC_013960	CGT	2	6	229158	229163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490370
3552	NC_013960	GCGG	2	8	229217	229224	0 %	0 %	75 %	25 %	292490370
3553	NC_013960	AGG	2	6	229288	229293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490370
3554	NC_013960	GGC	2	6	229410	229415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490371
3555	NC_013960	GC	3	6	229448	229453	0 %	0 %	50 %	50 %	292490371
3556	NC_013960	ACG	2	6	229455	229460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490371
3557	NC_013960	TG	3	6	229467	229472	0 %	50 %	50 %	0 %	292490371
3558	NC_013960	TGA	3	9	229545	229553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490371
3559	NC_013960	CTG	2	6	229565	229570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490371
3560	NC_013960	AG	3	6	229617	229622	50 %	0 %	50 %	0 %	292490371
3561	NC_013960	CGG	2	6	229663	229668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490371
3562	NC_013960	GA	3	6	229853	229858	50 %	0 %	50 %	0 %	292490371
3563	NC_013960	TCA	2	6	229875	229880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490371
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3565	NC_013960	GCC	2	6	229909	229914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490371
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3570	NC_013960	TTG	2	6	230041	230046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490371
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3577	NC_013960	AGCC	2	8	230328	230335	25 %	0 %	25 %	50 %	292490371
3578	NC_013960	A	8	8	230349	230356	100 %	0 %	0 %	0 %	292490371
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3588	NC_013960	GTC	2	6	230840	230845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490371
3589	NC_013960	TAC	2	6	230905	230910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490371
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3599	NC_013960	ACCA	2	8	231582	231589	50 %	0 %	0 %	50 %	292490372
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3602	NC_013960	TTTTG	2	10	231691	231700	0 %	80 %	20 %	0 %	292490372
3603	NC_013960	CGA	2	6	231713	231718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490372
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3607	NC_013960	TGG	2	6	232118	232123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490373
3608	NC_013960	TCCT	2	8	232135	232142	0 %	50 %	0 %	50 %	292490373
3609	NC_013960	TACCGT	2	12	232153	232164	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	292490373
3610	NC_013960	TGG	2	6	232195	232200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490373
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3622	NC_013960	CAA	2	6	232711	232716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490373
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3859	NC_013960	CCCAGG	2	12	247260	247271	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	292490386
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3863	NC_013960	G	7	7	247555	247561	0 %	0 %	100 %	0 %	292490386
3864	NC_013960	GTG	3	9	247673	247681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490386
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