MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013960	GTT	2	6	156683	156688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490308
2502	NC_013960	CTC	2	6	156695	156700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490308
2503	NC_013960	TGG	2	6	156733	156738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490308
2504	NC_013960	CGC	2	6	156800	156805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490308
2505	NC_013960	AAG	2	6	156807	156812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490308
2506	NC_013960	CAA	2	6	156842	156847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490308
2507	NC_013960	CTA	2	6	156903	156908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490308
2508	NC_013960	TA	3	6	156916	156921	50 %	50 %	0 %	0 %	292490308
2509	NC_013960	TCCA	2	8	156930	156937	25 %	25 %	0 %	50 %	292490308
2510	NC_013960	ATC	2	6	156938	156943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490308
2511	NC_013960	CGC	2	6	156986	156991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490308
2512	NC_013960	ATA	2	6	157018	157023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490308
2513	NC_013960	CCA	2	6	157036	157041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490308
2514	NC_013960	GTG	2	6	157082	157087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490308
2515	NC_013960	GGT	2	6	157127	157132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490308
2516	NC_013960	GAA	2	6	157151	157156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490308
2517	NC_013960	TGAG	2	8	157239	157246	25 %	25 %	50 %	0 %	292490308
2518	NC_013960	CAG	2	6	157247	157252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490308
2519	NC_013960	GTT	2	6	158044	158049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490309
2520	NC_013960	TAT	2	6	158076	158081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490309
2521	NC_013960	GTT	2	6	158110	158115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490309
2522	NC_013960	CCG	2	6	158225	158230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490309
2523	NC_013960	CGGA	2	8	158231	158238	25 %	0 %	50 %	25 %	292490309
2524	NC_013960	ATA	2	6	158285	158290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490309
2525	NC_013960	GAT	2	6	158693	158698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490310
2526	NC_013960	GAG	2	6	158711	158716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490310
2527	NC_013960	CCT	2	6	158767	158772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490310
2528	NC_013960	TACC	2	8	158884	158891	25 %	25 %	0 %	50 %	292490310
2529	NC_013960	CGG	2	6	158906	158911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490310
2530	NC_013960	TGCG	2	8	159045	159052	0 %	25 %	50 %	25 %	292490310
2531	NC_013960	ATC	2	6	159071	159076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490310
2532	NC_013960	ACTG	2	8	159100	159107	25 %	25 %	25 %	25 %	292490310
2533	NC_013960	AT	3	6	159115	159120	50 %	50 %	0 %	0 %	292490310
2534	NC_013960	AGG	2	6	159138	159143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490310
2535	NC_013960	TGA	2	6	159198	159203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490310
2536	NC_013960	ACT	2	6	159207	159212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490310
2537	NC_013960	TGGAA	2	10	159252	159261	40 %	20 %	40 %	0 %	292490310
2538	NC_013960	GGC	2	6	159289	159294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490310
2539	NC_013960	GGA	2	6	159295	159300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490310
2540	NC_013960	GGT	2	6	159313	159318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490310
2541	NC_013960	GGATCG	2	12	159321	159332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292490310
2542	NC_013960	CATGGG	2	12	159460	159471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	292490310
2543	NC_013960	AGG	2	6	159477	159482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490310
2544	NC_013960	CTTA	2	8	159624	159631	25 %	50 %	0 %	25 %	292490310
2545	NC_013960	CGC	2	6	159635	159640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490310
2546	NC_013960	AGC	2	6	159657	159662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490310
2547	NC_013960	C	6	6	159678	159683	0 %	0 %	0 %	100 %	292490310
2548	NC_013960	ATG	2	6	159771	159776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490310
2549	NC_013960	GCT	2	6	159799	159804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490310
2550	NC_013960	AGA	2	6	159808	159813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490310
2551	NC_013960	GC	4	8	159890	159897	0 %	0 %	50 %	50 %	292490310
2552	NC_013960	AATG	2	8	159905	159912	50 %	25 %	25 %	0 %	292490310
2553	NC_013960	CGG	2	6	159925	159930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490310
2554	NC_013960	ATG	2	6	160020	160025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490310
2555	NC_013960	CAT	2	6	160027	160032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490310
2556	NC_013960	CGC	2	6	160136	160141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490310
2557	NC_013960	A	6	6	160173	160178	100 %	0 %	0 %	0 %	292490310
2558	NC_013960	A	7	7	160214	160220	100 %	0 %	0 %	0 %	292490310
2559	NC_013960	C	6	6	160226	160231	0 %	0 %	0 %	100 %	292490310
2560	NC_013960	GCC	2	6	160347	160352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490311
2561	NC_013960	TGAT	2	8	160374	160381	25 %	50 %	25 %	0 %	292490311
2562	NC_013960	CTG	2	6	160382	160387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490311
2563	NC_013960	GGT	2	6	160460	160465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490311
2564	NC_013960	GTGTTG	2	12	160718	160729	0 %	50 %	50 %	0 %	292490312
2565	NC_013960	GTT	2	6	160759	160764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490312
2566	NC_013960	TGGAC	2	10	160800	160809	20 %	20 %	40 %	20 %	292490312
2567	NC_013960	AG	3	6	160849	160854	50 %	0 %	50 %	0 %	292490312
2568	NC_013960	GC	3	6	160865	160870	0 %	0 %	50 %	50 %	292490312
2569	NC_013960	ATG	2	6	160949	160954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490312
2570	NC_013960	CCG	2	6	161516	161521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490313
2571	NC_013960	CAG	2	6	161523	161528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490313
2572	NC_013960	GGGT	2	8	161542	161549	0 %	25 %	75 %	0 %	292490313
2573	NC_013960	CCA	2	6	161633	161638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490313
2574	NC_013960	TGA	2	6	161654	161659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490313
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2576	NC_013960	TCG	2	6	161749	161754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490313
2577	NC_013960	GCGTTG	2	12	161802	161813	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	292490313
2578	NC_013960	GCC	2	6	161814	161819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490313
2579	NC_013960	CTC	2	6	161901	161906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490313
2580	NC_013960	CGA	2	6	161979	161984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490313
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2582	NC_013960	GCG	2	6	162024	162029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490313
2583	NC_013960	GCC	2	6	162081	162086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490313
2584	NC_013960	CTA	2	6	162095	162100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490313
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2586	NC_013960	GC	3	6	162202	162207	0 %	0 %	50 %	50 %	292490313
2587	NC_013960	CAG	2	6	162276	162281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490313
2588	NC_013960	GCT	2	6	162287	162292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490313
2589	NC_013960	G	6	6	162306	162311	0 %	0 %	100 %	0 %	292490313
2590	NC_013960	GCG	2	6	162361	162366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490313
2591	NC_013960	CGA	2	6	162428	162433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490313
2592	NC_013960	CGG	2	6	162460	162465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490313
2593	NC_013960	ACC	2	6	162478	162483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490313
2594	NC_013960	TGA	2	6	162497	162502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490313
2595	NC_013960	CGC	2	6	162520	162525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490313
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2599	NC_013960	CCG	2	6	162658	162663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490313
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2602	NC_013960	CAAA	2	8	162944	162951	75 %	0 %	0 %	25 %	292490313
2603	NC_013960	CTG	2	6	162970	162975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490313
2604	NC_013960	C	6	6	163060	163065	0 %	0 %	0 %	100 %	292490313
2605	NC_013960	TCCA	2	8	163083	163090	25 %	25 %	0 %	50 %	292490313
2606	NC_013960	CGC	2	6	163106	163111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490313
2607	NC_013960	T	6	6	163190	163195	0 %	100 %	0 %	0 %	292490314
2608	NC_013960	CACC	2	8	163228	163235	25 %	0 %	0 %	75 %	292490314
2609	NC_013960	GCC	2	6	163281	163286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490314
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2611	NC_013960	GGA	2	6	163304	163309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490314
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2613	NC_013960	ATC	2	6	163346	163351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490314
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2617	NC_013960	CTG	2	6	163517	163522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490314
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2619	NC_013960	GAA	2	6	163616	163621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490314
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2621	NC_013960	CCA	2	6	163672	163677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490314
2622	NC_013960	GAT	2	6	163688	163693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490314
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2864	NC_013960	CGG	2	6	180636	180641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490328
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2986	NC_013960	GAT	2	6	189994	189999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490334
2987	NC_013960	TTG	2	6	190019	190024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490335
2988	NC_013960	CTA	2	6	190046	190051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490335
2989	NC_013960	TGG	2	6	190146	190151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490335
2990	NC_013960	GAT	2	6	190157	190162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490335
2991	NC_013960	TGGGG	2	10	190231	190240	0 %	20 %	80 %	0 %	292490335
2992	NC_013960	AGGA	2	8	190302	190309	50 %	0 %	50 %	0 %	292490335
2993	NC_013960	GAG	2	6	190406	190411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490335
2994	NC_013960	TGG	2	6	190476	190481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490335
2995	NC_013960	ATC	2	6	190556	190561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490335
2996	NC_013960	C	6	6	190616	190621	0 %	0 %	0 %	100 %	292490336
2997	NC_013960	TGA	2	6	190632	190637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490336
2998	NC_013960	CGT	2	6	190641	190646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490336
2999	NC_013960	CGC	2	6	190728	190733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490336
3000	NC_013960	ACC	2	6	190795	190800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490336

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