MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013960	GTG	2	6	121210	121215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490275
2003	NC_013960	GCT	2	6	121227	121232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490275
2004	NC_013960	TGC	2	6	121238	121243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490275
2005	NC_013960	TCAA	2	8	121306	121313	50 %	25 %	0 %	25 %	292490275
2006	NC_013960	AG	3	6	121320	121325	50 %	0 %	50 %	0 %	292490275
2007	NC_013960	CATAAG	2	12	121459	121470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	292490276
2008	NC_013960	ATCCGT	2	12	121477	121488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	292490276
2009	NC_013960	TTG	2	6	121535	121540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490276
2010	NC_013960	TGCC	2	8	121561	121568	0 %	25 %	25 %	50 %	292490276
2011	NC_013960	GAG	2	6	121599	121604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490276
2012	NC_013960	CTG	2	6	121655	121660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490276
2013	NC_013960	AGC	3	9	121682	121690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490276
2014	NC_013960	GA	3	6	121704	121709	50 %	0 %	50 %	0 %	292490276
2015	NC_013960	GGC	2	6	121727	121732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490276
2016	NC_013960	CATT	2	8	121784	121791	25 %	50 %	0 %	25 %	292490276
2017	NC_013960	GAA	2	6	122202	122207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490277
2018	NC_013960	GTG	2	6	122302	122307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490277
2019	NC_013960	GCT	2	6	122346	122351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490277
2020	NC_013960	CACC	2	8	122382	122389	25 %	0 %	0 %	75 %	292490277
2021	NC_013960	CAG	2	6	122396	122401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490277
2022	NC_013960	TGG	2	6	122495	122500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490277
2023	NC_013960	AGC	2	6	122529	122534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490277
2024	NC_013960	GCA	2	6	122568	122573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490277
2025	NC_013960	GCG	2	6	122687	122692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490277
2026	NC_013960	TGG	2	6	122753	122758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490277
2027	NC_013960	TATT	2	8	122908	122915	25 %	75 %	0 %	0 %	292490277
2028	NC_013960	T	7	7	122957	122963	0 %	100 %	0 %	0 %	292490277
2029	NC_013960	GGC	2	6	123044	123049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490277
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2032	NC_013960	GGCG	2	8	123169	123176	0 %	0 %	75 %	25 %	292490277
2033	NC_013960	CAC	2	6	123184	123189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490277
2034	NC_013960	ATC	3	9	123223	123231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490277
2035	NC_013960	AT	3	6	123285	123290	50 %	50 %	0 %	0 %	292490277
2036	NC_013960	AC	3	6	123330	123335	50 %	0 %	0 %	50 %	292490277
2037	NC_013960	G	6	6	123339	123344	0 %	0 %	100 %	0 %	292490277
2038	NC_013960	GCT	2	6	123478	123483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490277
2039	NC_013960	AGCCC	2	10	123495	123504	20 %	0 %	20 %	60 %	292490277
2040	NC_013960	ATA	2	6	123558	123563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490277
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2044	NC_013960	GGCTT	2	10	124080	124089	0 %	40 %	40 %	20 %	292490278
2045	NC_013960	TAGA	2	8	124175	124182	50 %	25 %	25 %	0 %	292490278
2046	NC_013960	CGA	2	6	124279	124284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490278
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2048	NC_013960	GCC	2	6	124405	124410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490278
2049	NC_013960	CGC	2	6	124425	124430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490278
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2053	NC_013960	AGG	2	6	124521	124526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490278
2054	NC_013960	TCC	2	6	124530	124535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490278
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2056	NC_013960	CGG	2	6	124828	124833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490279
2057	NC_013960	CGC	2	6	124882	124887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490279
2058	NC_013960	G	6	6	124889	124894	0 %	0 %	100 %	0 %	292490279
2059	NC_013960	CACC	2	8	124931	124938	25 %	0 %	0 %	75 %	292490279
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2061	NC_013960	GTG	2	6	124977	124982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490279
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2063	NC_013960	CCG	2	6	125112	125117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490279
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2116	NC_013960	AATT	2	8	129007	129014	50 %	50 %	0 %	0 %	292490282
2117	NC_013960	TCTG	2	8	129041	129048	0 %	50 %	25 %	25 %	292490282
2118	NC_013960	TTGA	2	8	129076	129083	25 %	50 %	25 %	0 %	292490282
2119	NC_013960	T	7	7	129544	129550	0 %	100 %	0 %	0 %	292490283
2120	NC_013960	TTG	2	6	129612	129617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490283
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2122	NC_013960	TGG	2	6	130399	130404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490284
2123	NC_013960	TTGC	2	8	130538	130545	0 %	50 %	25 %	25 %	292490284
2124	NC_013960	CTAT	2	8	130584	130591	25 %	50 %	0 %	25 %	292490285
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2368	NC_013960	TTG	2	6	147626	147631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490300
2369	NC_013960	CTG	2	6	147685	147690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490300
2370	NC_013960	AGC	2	6	147708	147713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490300
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2372	NC_013960	GCT	2	6	148191	148196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490301
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2375	NC_013960	CTG	2	6	148282	148287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490301
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2399	NC_013960	AT	3	6	150564	150569	50 %	50 %	0 %	0 %	292490304
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2489	NC_013960	CTG	2	6	156284	156289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490308
2490	NC_013960	TTC	2	6	156323	156328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490308
2491	NC_013960	CCG	2	6	156401	156406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490308
2492	NC_013960	GGC	2	6	156431	156436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490308
2493	NC_013960	GCA	2	6	156454	156459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490308
2494	NC_013960	AGG	2	6	156475	156480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490308
2495	NC_013960	TCA	2	6	156481	156486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490308
2496	NC_013960	CCA	2	6	156502	156507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490308
2497	NC_013960	CCAC	2	8	156529	156536	25 %	0 %	0 %	75 %	292490308
2498	NC_013960	CATC	2	8	156617	156624	25 %	25 %	0 %	50 %	292490308
2499	NC_013960	GGA	2	6	156647	156652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490308
2500	NC_013960	ATG	2	6	156677	156682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490308

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