MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_013960	T	8	8	93199	93206	0 %	100 %	0 %	0 %	292490256
1503	NC_013960	A	6	6	93336	93341	100 %	0 %	0 %	0 %	292490256
1504	NC_013960	TAT	2	6	93348	93353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490256
1505	NC_013960	TCA	2	6	93478	93483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490256
1506	NC_013960	TGGC	2	8	93737	93744	0 %	25 %	50 %	25 %	292490256
1507	NC_013960	TGCA	2	8	93769	93776	25 %	25 %	25 %	25 %	292490256
1508	NC_013960	ATG	2	6	93907	93912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490256
1509	NC_013960	GA	3	6	93918	93923	50 %	0 %	50 %	0 %	292490256
1510	NC_013960	C	7	7	94009	94015	0 %	0 %	0 %	100 %	292490256
1511	NC_013960	GAA	2	6	94047	94052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490256
1512	NC_013960	GGT	2	6	94073	94078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490256
1513	NC_013960	TTGA	2	8	94260	94267	25 %	50 %	25 %	0 %	292490256
1514	NC_013960	AAC	2	6	94312	94317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490256
1515	NC_013960	GAC	2	6	94346	94351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490256
1516	NC_013960	CGG	2	6	94488	94493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490256
1517	NC_013960	GGT	2	6	94574	94579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490256
1518	NC_013960	CCAT	2	8	94627	94634	25 %	25 %	0 %	50 %	292490256
1519	NC_013960	AGCA	2	8	94656	94663	50 %	0 %	25 %	25 %	292490256
1520	NC_013960	GAT	2	6	94673	94678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490256
1521	NC_013960	ATCA	2	8	94923	94930	50 %	25 %	0 %	25 %	292490257
1522	NC_013960	TCC	2	6	94931	94936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490257
1523	NC_013960	CAT	2	6	94947	94952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490257
1524	NC_013960	TGT	2	6	94956	94961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490257
1525	NC_013960	ATC	2	6	94990	94995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490257
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1527	NC_013960	A	8	8	95119	95126	100 %	0 %	0 %	0 %	292490257
1528	NC_013960	CG	4	8	95145	95152	0 %	0 %	50 %	50 %	292490257
1529	NC_013960	CTG	2	6	95199	95204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490257
1530	NC_013960	TAT	2	6	95340	95345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490257
1531	NC_013960	CGT	2	6	95409	95414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490257
1532	NC_013960	GCCGT	2	10	95444	95453	0 %	20 %	40 %	40 %	292490257
1533	NC_013960	GGA	2	6	95472	95477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490257
1534	NC_013960	CGA	2	6	95673	95678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490257
1535	NC_013960	CAGG	2	8	96282	96289	25 %	0 %	50 %	25 %	292490258
1536	NC_013960	TCA	2	6	96430	96435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490258
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1539	NC_013960	AGC	2	6	96540	96545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490258
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1541	NC_013960	TTG	2	6	97005	97010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490259
1542	NC_013960	GTTT	2	8	97026	97033	0 %	75 %	25 %	0 %	292490259
1543	NC_013960	T	6	6	97031	97036	0 %	100 %	0 %	0 %	292490259
1544	NC_013960	TAT	2	6	97058	97063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490259
1545	NC_013960	CAG	5	15	97064	97078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490259
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1547	NC_013960	GCC	2	6	97088	97093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490259
1548	NC_013960	TCCA	2	8	97131	97138	25 %	25 %	0 %	50 %	292490259
1549	NC_013960	TGG	2	6	97176	97181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490259
1550	NC_013960	TTGC	2	8	97319	97326	0 %	50 %	25 %	25 %	292490259
1551	NC_013960	TGC	2	6	97360	97365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490259
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1554	NC_013960	A	6	6	97471	97476	100 %	0 %	0 %	0 %	292490259
1555	NC_013960	GTT	2	6	97501	97506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490259
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1558	NC_013960	GATC	2	8	97711	97718	25 %	25 %	25 %	25 %	292490259
1559	NC_013960	GC	3	6	97741	97746	0 %	0 %	50 %	50 %	292490259
1560	NC_013960	GGC	2	6	97901	97906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490259
1561	NC_013960	TGG	2	6	97908	97913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490259
1562	NC_013960	CAG	3	9	97916	97924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490259
1563	NC_013960	GGT	2	6	97993	97998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490259
1564	NC_013960	CGC	2	6	98182	98187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490260
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1569	NC_013960	ACC	2	6	98299	98304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490260
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1623	NC_013960	CT	3	6	101138	101143	0 %	50 %	0 %	50 %	292490260
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1625	NC_013960	CGG	2	6	101153	101158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490260
1626	NC_013960	TGC	2	6	101165	101170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490260
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1989	NC_013960	CAG	2	6	120293	120298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490274
1990	NC_013960	GAG	2	6	120323	120328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490274
1991	NC_013960	ATT	2	6	120403	120408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490274
1992	NC_013960	AGC	2	6	120420	120425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490274
1993	NC_013960	TGG	2	6	120447	120452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490274
1994	NC_013960	GAA	2	6	120467	120472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490274
1995	NC_013960	ATA	2	6	120487	120492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490274
1996	NC_013960	TGCTT	2	10	120941	120950	0 %	60 %	20 %	20 %	292490275
1997	NC_013960	T	6	6	120957	120962	0 %	100 %	0 %	0 %	292490275
1998	NC_013960	AGC	2	6	120974	120979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490275
1999	NC_013960	AAG	2	6	121042	121047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490275
2000	NC_013960	CGG	2	6	121141	121146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490275

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