MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013960	TCAA	2	8	62574	62581	50 %	25 %	0 %	25 %	292490231
1002	NC_013960	TAT	2	6	62582	62587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490231
1003	NC_013960	CCA	2	6	62590	62595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490231
1004	NC_013960	TGA	2	6	62626	62631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490231
1005	NC_013960	CTTC	2	8	62665	62672	0 %	50 %	0 %	50 %	292490231
1006	NC_013960	TTG	2	6	62673	62678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490231
1007	NC_013960	CTT	2	6	62747	62752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490231
1008	NC_013960	GGT	2	6	62766	62771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490231
1009	NC_013960	CTTT	3	12	62933	62944	0 %	75 %	0 %	25 %	292490231
1010	NC_013960	CAT	2	6	62958	62963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490231
1011	NC_013960	ACC	2	6	63063	63068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490231
1012	NC_013960	TGG	2	6	63140	63145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490231
1013	NC_013960	TGA	2	6	63157	63162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490231
1014	NC_013960	TAT	2	6	63270	63275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490231
1015	NC_013960	TTCC	2	8	63363	63370	0 %	50 %	0 %	50 %	292490231
1016	NC_013960	CGG	2	6	63402	63407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490231
1017	NC_013960	TTG	2	6	63430	63435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490231
1018	NC_013960	GGA	2	6	63522	63527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490231
1019	NC_013960	CAC	2	6	63592	63597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490231
1020	NC_013960	TATT	2	8	63775	63782	25 %	75 %	0 %	0 %	292490232
1021	NC_013960	TTAT	2	8	63785	63792	25 %	75 %	0 %	0 %	292490232
1022	NC_013960	GA	3	6	63825	63830	50 %	0 %	50 %	0 %	292490232
1023	NC_013960	TAG	2	6	63866	63871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490232
1024	NC_013960	TTCGGC	2	12	63883	63894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490232
1025	NC_013960	CAG	2	6	63971	63976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490232
1026	NC_013960	CT	3	6	64045	64050	0 %	50 %	0 %	50 %	292490232
1027	NC_013960	TTA	2	6	64113	64118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490232
1028	NC_013960	TTC	2	6	64232	64237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490232
1029	NC_013960	GGT	2	6	64263	64268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490232
1030	NC_013960	T	6	6	64270	64275	0 %	100 %	0 %	0 %	292490232
1031	NC_013960	T	6	6	64327	64332	0 %	100 %	0 %	0 %	292490232
1032	NC_013960	GTA	2	6	64374	64379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490232
1033	NC_013960	GCC	2	6	64554	64559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490233
1034	NC_013960	AT	3	6	64586	64591	50 %	50 %	0 %	0 %	292490233
1035	NC_013960	ATG	2	6	64623	64628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490233
1036	NC_013960	TGGT	2	8	64631	64638	0 %	50 %	50 %	0 %	292490233
1037	NC_013960	AAGCG	2	10	64658	64667	40 %	0 %	40 %	20 %	292490233
1038	NC_013960	GAT	2	6	64709	64714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490233
1039	NC_013960	TCT	2	6	64735	64740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490233
1040	NC_013960	CTTT	2	8	64750	64757	0 %	75 %	0 %	25 %	292490233
1041	NC_013960	TAC	2	6	64767	64772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490233
1042	NC_013960	CCA	2	6	64864	64869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490233
1043	NC_013960	GTGG	2	8	64884	64891	0 %	25 %	75 %	0 %	292490233
1044	NC_013960	GGC	2	6	64907	64912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490233
1045	NC_013960	GTG	2	6	64954	64959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490233
1046	NC_013960	TGAG	2	8	65089	65096	25 %	25 %	50 %	0 %	292490233
1047	NC_013960	TGGC	2	8	65215	65222	0 %	25 %	50 %	25 %	292490233
1048	NC_013960	TGTT	2	8	65308	65315	0 %	75 %	25 %	0 %	292490233
1049	NC_013960	T	6	6	65440	65445	0 %	100 %	0 %	0 %	292490234
1050	NC_013960	TAA	2	6	65470	65475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490234
1051	NC_013960	ATAA	2	8	65505	65512	75 %	25 %	0 %	0 %	292490234
1052	NC_013960	ATC	2	6	65558	65563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490234
1053	NC_013960	GCC	2	6	65570	65575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490234
1054	NC_013960	GC	3	6	65596	65601	0 %	0 %	50 %	50 %	292490234
1055	NC_013960	ATG	2	6	65921	65926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490235
1056	NC_013960	CAT	2	6	65955	65960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490235
1057	NC_013960	TGA	2	6	65986	65991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490235
1058	NC_013960	AG	3	6	66017	66022	50 %	0 %	50 %	0 %	292490235
1059	NC_013960	CGGG	2	8	66049	66056	0 %	0 %	75 %	25 %	292490235
1060	NC_013960	GCTA	2	8	66190	66197	25 %	25 %	25 %	25 %	292490235
1061	NC_013960	CAA	2	6	66257	66262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490235
1062	NC_013960	CGG	2	6	66314	66319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490235
1063	NC_013960	T	8	8	66335	66342	0 %	100 %	0 %	0 %	292490235
1064	NC_013960	TGGC	2	8	66370	66377	0 %	25 %	50 %	25 %	292490235
1065	NC_013960	TGA	2	6	66463	66468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490235
1066	NC_013960	CCA	2	6	66504	66509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490235
1067	NC_013960	GCA	3	9	66514	66522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490235
1068	NC_013960	GGT	2	6	66565	66570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490235
1069	NC_013960	GAC	2	6	66679	66684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490236
1070	NC_013960	CCT	2	6	66736	66741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490236
1071	NC_013960	GGT	2	6	66742	66747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490236
1072	NC_013960	AGG	2	6	66767	66772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490236
1073	NC_013960	GTT	2	6	66897	66902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490236
1074	NC_013960	TGA	2	6	66920	66925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490236
1075	NC_013960	ATG	2	6	67015	67020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490236
1076	NC_013960	CT	3	6	67025	67030	0 %	50 %	0 %	50 %	292490236
1077	NC_013960	AAC	2	6	67054	67059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490236
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1079	NC_013960	A	6	6	67095	67100	100 %	0 %	0 %	0 %	292490236
1080	NC_013960	TGC	2	6	67120	67125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490236
1081	NC_013960	GCG	2	6	67146	67151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490236
1082	NC_013960	GT	3	6	67156	67161	0 %	50 %	50 %	0 %	292490236
1083	NC_013960	TCG	2	6	67165	67170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490236
1084	NC_013960	TTAC	2	8	67192	67199	25 %	50 %	0 %	25 %	292490236
1085	NC_013960	AGA	2	6	67205	67210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490236
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1087	NC_013960	GTT	2	6	67399	67404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490237
1088	NC_013960	AGC	2	6	67432	67437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490237
1089	NC_013960	TCT	2	6	67454	67459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490237
1090	NC_013960	GAT	2	6	67502	67507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490237
1091	NC_013960	AG	3	6	67591	67596	50 %	0 %	50 %	0 %	292490237
1092	NC_013960	T	7	7	67609	67615	0 %	100 %	0 %	0 %	292490237
1093	NC_013960	CCT	2	6	67664	67669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490237
1094	NC_013960	CCT	2	6	67697	67702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490237
1095	NC_013960	G	6	6	67704	67709	0 %	0 %	100 %	0 %	292490237
1096	NC_013960	TTGGT	2	10	67725	67734	0 %	60 %	40 %	0 %	292490237
1097	NC_013960	AGCAC	2	10	67757	67766	40 %	0 %	20 %	40 %	292490237
1098	NC_013960	ATC	2	6	67842	67847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490237
1099	NC_013960	AGG	2	6	67850	67855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490237
1100	NC_013960	ACTA	2	8	67866	67873	50 %	25 %	0 %	25 %	292490237
1101	NC_013960	TGG	2	6	67917	67922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490237
1102	NC_013960	GCA	2	6	68004	68009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490237
1103	NC_013960	GGGT	2	8	68121	68128	0 %	25 %	75 %	0 %	292490237
1104	NC_013960	CGT	2	6	68129	68134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490237
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1107	NC_013960	CGT	2	6	68243	68248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490237
1108	NC_013960	GAG	2	6	68290	68295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490237
1109	NC_013960	GCT	2	6	68486	68491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490238
1110	NC_013960	TTGA	2	8	68513	68520	25 %	50 %	25 %	0 %	292490238
1111	NC_013960	ATT	2	6	68702	68707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490238
1112	NC_013960	GC	3	6	68725	68730	0 %	0 %	50 %	50 %	292490238
1113	NC_013960	GGC	2	6	68758	68763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490238
1114	NC_013960	GCC	2	6	68773	68778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490238
1115	NC_013960	CCG	2	6	68793	68798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490238
1116	NC_013960	TGCACG	2	12	68811	68822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	292490238
1117	NC_013960	CGC	2	6	68856	68861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490238
1118	NC_013960	GCTTTG	2	12	68873	68884	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	292490238
1119	NC_013960	GAA	2	6	68894	68899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490238
1120	NC_013960	GATT	2	8	68941	68948	25 %	50 %	25 %	0 %	292490238
1121	NC_013960	AGC	2	6	68955	68960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490238
1122	NC_013960	GTC	2	6	68963	68968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490238
1123	NC_013960	T	6	6	68977	68982	0 %	100 %	0 %	0 %	292490238
1124	NC_013960	ATT	2	6	68983	68988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490238
1125	NC_013960	G	6	6	69058	69063	0 %	0 %	100 %	0 %	292490238
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1127	NC_013960	GGC	2	6	69151	69156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490238
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1500	NC_013960	ATG	2	6	92848	92853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490256

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