MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013960	AG	3	6	31321	31326	50 %	0 %	50 %	0 %	292490193
502	NC_013960	A	7	7	31343	31349	100 %	0 %	0 %	0 %	292490193
503	NC_013960	AGGCCA	2	12	31366	31377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490193
504	NC_013960	ACC	2	6	31413	31418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490194
505	NC_013960	TATTG	2	10	31431	31440	20 %	60 %	20 %	0 %	292490194
506	NC_013960	GAT	2	6	31458	31463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490194
507	NC_013960	TGAT	2	8	31522	31529	25 %	50 %	25 %	0 %	292490194
508	NC_013960	GAT	2	6	31566	31571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490194
509	NC_013960	TGG	2	6	31580	31585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490194
510	NC_013960	CTTG	2	8	31641	31648	0 %	50 %	25 %	25 %	292490194
511	NC_013960	AGA	2	6	31715	31720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490195
512	NC_013960	CAA	2	6	31731	31736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490195
513	NC_013960	CAA	2	6	31752	31757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490195
514	NC_013960	AGA	2	6	31774	31779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490195
515	NC_013960	AT	3	6	31792	31797	50 %	50 %	0 %	0 %	292490195
516	NC_013960	AGCA	2	8	31969	31976	50 %	0 %	25 %	25 %	292490195
517	NC_013960	GGT	2	6	32069	32074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490195
518	NC_013960	GGT	2	6	32094	32099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490195
519	NC_013960	CCG	2	6	32103	32108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490195
520	NC_013960	TGC	2	6	32110	32115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490195
521	NC_013960	AGC	3	9	32158	32166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490195
522	NC_013960	CAA	2	6	32172	32177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490195
523	NC_013960	GGC	2	6	32192	32197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490195
524	NC_013960	GTG	2	6	32275	32280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490196
525	NC_013960	TGCT	2	8	32315	32322	0 %	50 %	25 %	25 %	292490196
526	NC_013960	GGC	2	6	32370	32375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490196
527	NC_013960	C	6	6	32424	32429	0 %	0 %	0 %	100 %	292490196
528	NC_013960	GTC	2	6	32491	32496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490196
529	NC_013960	TCGG	2	8	32511	32518	0 %	25 %	50 %	25 %	292490196
530	NC_013960	ACCT	2	8	32664	32671	25 %	25 %	0 %	50 %	292490196
531	NC_013960	GGT	2	6	32730	32735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490196
532	NC_013960	GAT	2	6	32791	32796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490196
533	NC_013960	A	6	6	32826	32831	100 %	0 %	0 %	0 %	292490196
534	NC_013960	GCG	2	6	32845	32850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490196
535	NC_013960	GGC	2	6	32889	32894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490196
536	NC_013960	AG	3	6	32953	32958	50 %	0 %	50 %	0 %	292490196
537	NC_013960	GAT	2	6	33007	33012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490196
538	NC_013960	TAT	2	6	33182	33187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490196
539	NC_013960	GAT	2	6	33285	33290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490197
540	NC_013960	T	6	6	33320	33325	0 %	100 %	0 %	0 %	292490197
541	NC_013960	TGG	2	6	33346	33351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490197
542	NC_013960	TGG	2	6	33356	33361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490197
543	NC_013960	AGG	2	6	33379	33384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490197
544	NC_013960	GCA	2	6	33480	33485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490197
545	NC_013960	GC	3	6	33503	33508	0 %	0 %	50 %	50 %	292490197
546	NC_013960	GCG	2	6	33536	33541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490197
547	NC_013960	A	7	7	33551	33557	100 %	0 %	0 %	0 %	292490197
548	NC_013960	TC	3	6	33571	33576	0 %	50 %	0 %	50 %	292490197
549	NC_013960	ACGGG	2	10	33705	33714	20 %	0 %	60 %	20 %	292490197
550	NC_013960	T	6	6	33717	33722	0 %	100 %	0 %	0 %	292490197
551	NC_013960	ATT	2	6	33741	33746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490197
552	NC_013960	TGG	2	6	33826	33831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490197
553	NC_013960	ACGAA	2	10	33844	33853	60 %	0 %	20 %	20 %	292490197
554	NC_013960	GGA	2	6	33875	33880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490197
555	NC_013960	TGGT	2	8	33930	33937	0 %	50 %	50 %	0 %	292490197
556	NC_013960	GGA	2	6	34010	34015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490197
557	NC_013960	GCA	2	6	34024	34029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490197
558	NC_013960	AGG	2	6	34093	34098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490197
559	NC_013960	AGGG	2	8	34117	34124	25 %	0 %	75 %	0 %	292490197
560	NC_013960	GAA	2	6	34160	34165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490197
561	NC_013960	TGA	2	6	34193	34198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490197
562	NC_013960	GCT	2	6	34220	34225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490197
563	NC_013960	CCG	2	6	34245	34250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490198
564	NC_013960	TCC	2	6	34380	34385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490198
565	NC_013960	GCC	2	6	34399	34404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490198
566	NC_013960	GCCT	2	8	34482	34489	0 %	25 %	25 %	50 %	292490198
567	NC_013960	ATA	2	6	34611	34616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490198
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570	NC_013960	GGCG	2	8	34775	34782	0 %	0 %	75 %	25 %	292490198
571	NC_013960	T	6	6	34797	34802	0 %	100 %	0 %	0 %	292490198
572	NC_013960	CAAA	2	8	34804	34811	75 %	0 %	0 %	25 %	292490198
573	NC_013960	GGCAT	2	10	34879	34888	20 %	20 %	40 %	20 %	292490198
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575	NC_013960	CAGCT	2	10	35064	35073	20 %	20 %	20 %	40 %	292490198
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579	NC_013960	AG	3	6	35180	35185	50 %	0 %	50 %	0 %	292490198
580	NC_013960	TAA	2	6	35248	35253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490198
581	NC_013960	GCC	2	6	35307	35312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490198
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592	NC_013960	TGC	2	6	35975	35980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490199
593	NC_013960	CG	3	6	36146	36151	0 %	0 %	50 %	50 %	292490200
594	NC_013960	TAA	2	6	36170	36175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490200
595	NC_013960	CAG	2	6	36256	36261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490200
596	NC_013960	AAT	2	6	36480	36485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490201
597	NC_013960	ACT	2	6	36495	36500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490201
598	NC_013960	CTG	2	6	36507	36512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490201
599	NC_013960	TGT	2	6	36524	36529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490201
600	NC_013960	TAT	2	6	36548	36553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292490201
601	NC_013960	GTA	2	6	36634	36639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490201
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607	NC_013960	TGGT	2	8	36954	36961	0 %	50 %	50 %	0 %	292490201
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609	NC_013960	ATA	2	6	37027	37032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490201
610	NC_013960	GA	3	6	37102	37107	50 %	0 %	50 %	0 %	292490202
611	NC_013960	CAGC	2	8	37166	37173	25 %	0 %	25 %	50 %	292490202
612	NC_013960	ATA	2	6	37219	37224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292490202
613	NC_013960	TTGG	2	8	37276	37283	0 %	50 %	50 %	0 %	292490202
614	NC_013960	TTG	2	6	37324	37329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490202
615	NC_013960	CGG	2	6	37337	37342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490202
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618	NC_013960	CAT	2	6	37608	37613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490202
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621	NC_013960	ATG	2	6	37756	37761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490202
622	NC_013960	CCCAAG	2	12	37782	37793	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	292490202
623	NC_013960	CTTG	2	8	37875	37882	0 %	50 %	25 %	25 %	292490202
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626	NC_013960	GAA	2	6	38530	38535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490203
627	NC_013960	GC	3	6	38540	38545	0 %	0 %	50 %	50 %	292490203
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629	NC_013960	GC	3	6	38642	38647	0 %	0 %	50 %	50 %	292490204
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