MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosococcus halophilus Nc4 chromosome

Total Repeats: 67104

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_013960	C	7	7	348158	348164	0 %	0 %	0 %	100 %	292490499
5503	NC_013960	TCC	2	6	348289	348294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490499
5504	NC_013960	CTG	2	6	348402	348407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490499
5505	NC_013960	GCC	2	6	348438	348443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490499
5506	NC_013960	GCC	2	6	348472	348477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490499
5507	NC_013960	CCA	2	6	348479	348484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490499
5508	NC_013960	CAC	2	6	348546	348551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490499
5509	NC_013960	TCA	2	6	348637	348642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490499
5510	NC_013960	GCC	2	6	348651	348656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490499
5511	NC_013960	CTC	2	6	348714	348719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490499
5512	NC_013960	AT	3	6	348745	348750	50 %	50 %	0 %	0 %	292490499
5513	NC_013960	CCG	2	6	348863	348868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490499
5514	NC_013960	ACC	2	6	348942	348947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490499
5515	NC_013960	TG	3	6	349427	349432	0 %	50 %	50 %	0 %	292490500
5516	NC_013960	CGAA	2	8	349452	349459	50 %	0 %	25 %	25 %	292490500
5517	NC_013960	GCC	2	6	349504	349509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490500
5518	NC_013960	CTT	2	6	349610	349615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292490500
5519	NC_013960	GAA	2	6	349700	349705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490500
5520	NC_013960	GTT	2	6	349724	349729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490500
5521	NC_013960	GCTCAA	2	12	349751	349762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	292490500
5522	NC_013960	G	6	6	349778	349783	0 %	0 %	100 %	0 %	292490500
5523	NC_013960	CTGC	2	8	349866	349873	0 %	25 %	25 %	50 %	292490500
5524	NC_013960	TGG	2	6	349915	349920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490500
5525	NC_013960	GC	3	6	349945	349950	0 %	0 %	50 %	50 %	292490500
5526	NC_013960	AGA	2	6	350011	350016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490500
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5529	NC_013960	CAA	2	6	350103	350108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	292490500
5530	NC_013960	CGC	2	6	350181	350186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490500
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5533	NC_013960	T	7	7	350743	350749	0 %	100 %	0 %	0 %	292490501
5534	NC_013960	TTAT	2	8	350769	350776	25 %	75 %	0 %	0 %	292490501
5535	NC_013960	GAT	2	6	350799	350804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490501
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5537	NC_013960	GAA	2	6	350977	350982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292490501
5538	NC_013960	TGA	2	6	351021	351026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490501
5539	NC_013960	TGA	2	6	351089	351094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490501
5540	NC_013960	TGA	2	6	351180	351185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490501
5541	NC_013960	TCA	2	6	351215	351220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292490501
5542	NC_013960	GCAG	2	8	351231	351238	25 %	0 %	50 %	25 %	292490501
5543	NC_013960	TCC	2	6	351254	351259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292490501
5544	NC_013960	G	6	6	351382	351387	0 %	0 %	100 %	0 %	292490501
5545	NC_013960	GGA	2	6	351399	351404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490501
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5547	NC_013960	GGC	2	6	351450	351455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490501
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5549	NC_013960	T	6	6	351546	351551	0 %	100 %	0 %	0 %	292490501
5550	NC_013960	GGA	2	6	351561	351566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	292490501
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5554	NC_013960	GTAAA	2	10	351936	351945	60 %	20 %	20 %	0 %	292490502
5555	NC_013960	G	6	6	351989	351994	0 %	0 %	100 %	0 %	292490502
5556	NC_013960	CAC	2	6	352009	352014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490502
5557	NC_013960	CT	3	6	352026	352031	0 %	50 %	0 %	50 %	292490502
5558	NC_013960	TGGA	2	8	352176	352183	25 %	25 %	50 %	0 %	292490502
5559	NC_013960	GCGAG	2	10	352227	352236	20 %	0 %	60 %	20 %	292490502
5560	NC_013960	CG	3	6	352290	352295	0 %	0 %	50 %	50 %	292490502
5561	NC_013960	GCC	2	6	352324	352329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490502
5562	NC_013960	G	6	6	352372	352377	0 %	0 %	100 %	0 %	292490502
5563	NC_013960	TTG	2	6	352403	352408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292490502
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5566	NC_013960	G	7	7	352491	352497	0 %	0 %	100 %	0 %	292490502
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5570	NC_013960	GCT	2	6	352873	352878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490502
5571	NC_013960	GTA	2	6	352910	352915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292490502
5572	NC_013960	TGC	2	6	352939	352944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490502
5573	NC_013960	GCTT	2	8	352958	352965	0 %	50 %	25 %	25 %	292490502
5574	NC_013960	CCA	3	9	353011	353019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490502
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5581	NC_013960	CA	3	6	353424	353429	50 %	0 %	0 %	50 %	292490503
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5587	NC_013960	CGC	2	6	353724	353729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490503
5588	NC_013960	AGCCC	2	10	353736	353745	20 %	0 %	20 %	60 %	292490503
5589	NC_013960	CGG	2	6	353798	353803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490503
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5592	NC_013960	ACCC	2	8	354021	354028	25 %	0 %	0 %	75 %	292490503
5593	NC_013960	GGT	2	6	354031	354036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292490503
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5595	NC_013960	CTTG	2	8	354234	354241	0 %	50 %	25 %	25 %	292490504
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5599	NC_013960	GCG	2	6	354709	354714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292490504
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5610	NC_013960	A	6	6	355183	355188	100 %	0 %	0 %	0 %	292490504
5611	NC_013960	GAC	2	6	355218	355223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292490504
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5619	NC_013960	CT	3	6	355731	355736	0 %	50 %	0 %	50 %	292490505
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5990	NC_013960	CAC	2	6	377096	377101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490522
5991	NC_013960	CCA	2	6	377284	377289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292490522
5992	NC_013960	A	7	7	377451	377457	100 %	0 %	0 %	0 %	292490522
5993	NC_013960	CGCC	2	8	377460	377467	0 %	0 %	25 %	75 %	292490522
5994	NC_013960	C	6	6	377534	377539	0 %	0 %	0 %	100 %	292490522
5995	NC_013960	CGC	2	6	377578	377583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490522
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5998	NC_013960	TGC	2	6	377685	377690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292490522
5999	NC_013960	GCC	2	6	377726	377731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292490522
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