MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 301

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	AC	3	6	762	767	50 %	0 %	0 %	50 %	289937460
2	NC_013924	TG	3	6	885	890	0 %	50 %	50 %	0 %	289937460
3	NC_013924	GC	3	6	2058	2063	0 %	0 %	50 %	50 %	289937461
4	NC_013924	CT	3	6	3913	3918	0 %	50 %	0 %	50 %	289937463
5	NC_013924	AC	3	6	4081	4086	50 %	0 %	0 %	50 %	289937463
6	NC_013924	CG	3	6	6613	6618	0 %	0 %	50 %	50 %	289937465
7	NC_013924	GA	3	6	6943	6948	50 %	0 %	50 %	0 %	289937465
8	NC_013924	AC	3	6	7078	7083	50 %	0 %	0 %	50 %	289937465
9	NC_013924	GC	3	6	8228	8233	0 %	0 %	50 %	50 %	289937467
10	NC_013924	CG	3	6	8384	8389	0 %	0 %	50 %	50 %	289937467
11	NC_013924	TC	3	6	8680	8685	0 %	50 %	0 %	50 %	289937467
12	NC_013924	CA	3	6	10792	10797	50 %	0 %	0 %	50 %	289937468
13	NC_013924	AT	3	6	10840	10845	50 %	50 %	0 %	0 %	289937468
14	NC_013924	GC	3	6	11713	11718	0 %	0 %	50 %	50 %	289937469
15	NC_013924	AG	3	6	12332	12337	50 %	0 %	50 %	0 %	289937469
16	NC_013924	GC	3	6	13368	13373	0 %	0 %	50 %	50 %	289937470
17	NC_013924	GC	3	6	13554	13559	0 %	0 %	50 %	50 %	289937470
18	NC_013924	AT	3	6	13761	13766	50 %	50 %	0 %	0 %	289937470
19	NC_013924	AC	3	6	14376	14381	50 %	0 %	0 %	50 %	289937471
20	NC_013924	CA	3	6	14591	14596	50 %	0 %	0 %	50 %	289937471
21	NC_013924	TC	3	6	14659	14664	0 %	50 %	0 %	50 %	289937471
22	NC_013924	AC	3	6	14711	14716	50 %	0 %	0 %	50 %	289937471
23	NC_013924	GC	3	6	16327	16332	0 %	0 %	50 %	50 %	289937473
24	NC_013924	CG	4	8	16798	16805	0 %	0 %	50 %	50 %	289937474
25	NC_013924	CG	3	6	17731	17736	0 %	0 %	50 %	50 %	289937474
26	NC_013924	GC	3	6	17738	17743	0 %	0 %	50 %	50 %	289937474
27	NC_013924	CA	3	6	17758	17763	50 %	0 %	0 %	50 %	289937474
28	NC_013924	AC	3	6	17766	17771	50 %	0 %	0 %	50 %	289937474
29	NC_013924	TG	3	6	18704	18709	0 %	50 %	50 %	0 %	289937475
30	NC_013924	TC	3	6	18893	18898	0 %	50 %	0 %	50 %	289937475
31	NC_013924	CA	3	6	20860	20865	50 %	0 %	0 %	50 %	289937476
32	NC_013924	GA	3	6	24334	24339	50 %	0 %	50 %	0 %	289937478
33	NC_013924	AC	3	6	26321	26326	50 %	0 %	0 %	50 %	289937480
34	NC_013924	AT	3	6	28899	28904	50 %	50 %	0 %	0 %	289937482
35	NC_013924	AC	3	6	30626	30631	50 %	0 %	0 %	50 %	289937483
36	NC_013924	GA	3	6	30727	30732	50 %	0 %	50 %	0 %	289937483
37	NC_013924	CA	3	6	30736	30741	50 %	0 %	0 %	50 %	289937483
38	NC_013924	AC	3	6	31470	31475	50 %	0 %	0 %	50 %	289937484
39	NC_013924	TG	3	6	32661	32666	0 %	50 %	50 %	0 %	289937485
40	NC_013924	GA	3	6	32769	32774	50 %	0 %	50 %	0 %	289937485
41	NC_013924	GT	3	6	34616	34621	0 %	50 %	50 %	0 %	289937487
42	NC_013924	TC	3	6	35601	35606	0 %	50 %	0 %	50 %	289937488
43	NC_013924	AT	3	6	36102	36107	50 %	50 %	0 %	0 %	289937488
44	NC_013924	GT	3	6	36745	36750	0 %	50 %	50 %	0 %	289937489
45	NC_013924	TC	3	6	36941	36946	0 %	50 %	0 %	50 %	289937489
46	NC_013924	GA	3	6	37863	37868	50 %	0 %	50 %	0 %	289937489
47	NC_013924	AC	3	6	39393	39398	50 %	0 %	0 %	50 %	289937490
48	NC_013924	AC	3	6	39644	39649	50 %	0 %	0 %	50 %	289937490
49	NC_013924	CG	3	6	40036	40041	0 %	0 %	50 %	50 %	289937491
50	NC_013924	CG	3	6	40427	40432	0 %	0 %	50 %	50 %	289937491
51	NC_013924	TC	3	6	40908	40913	0 %	50 %	0 %	50 %	289937491
52	NC_013924	TC	3	6	42863	42868	0 %	50 %	0 %	50 %	289937492
53	NC_013924	TG	3	6	43474	43479	0 %	50 %	50 %	0 %	289937492
54	NC_013924	AG	3	6	44026	44031	50 %	0 %	50 %	0 %	289937493
55	NC_013924	GA	3	6	44039	44044	50 %	0 %	50 %	0 %	289937493
56	NC_013924	GA	4	8	45380	45387	50 %	0 %	50 %	0 %	289937494
57	NC_013924	TA	3	6	45581	45586	50 %	50 %	0 %	0 %	289937494
58	NC_013924	AC	3	6	46327	46332	50 %	0 %	0 %	50 %	289937495
59	NC_013924	GA	3	6	46463	46468	50 %	0 %	50 %	0 %	289937495
60	NC_013924	GT	3	6	47817	47822	0 %	50 %	50 %	0 %	289937498
61	NC_013924	AG	3	6	48211	48216	50 %	0 %	50 %	0 %	289937498
62	NC_013924	TG	3	6	48777	48782	0 %	50 %	50 %	0 %	289937498
63	NC_013924	CA	4	8	51218	51225	50 %	0 %	0 %	50 %	289937502
64	NC_013924	CG	3	6	51463	51468	0 %	0 %	50 %	50 %	289937502
65	NC_013924	CG	3	6	51524	51529	0 %	0 %	50 %	50 %	289937502
66	NC_013924	AC	3	6	53097	53102	50 %	0 %	0 %	50 %	289937503
67	NC_013924	CA	3	6	53657	53662	50 %	0 %	0 %	50 %	289937504
68	NC_013924	GC	3	6	53696	53701	0 %	0 %	50 %	50 %	289937504
69	NC_013924	CG	3	6	53854	53859	0 %	0 %	50 %	50 %	289937504
70	NC_013924	TC	3	6	55676	55681	0 %	50 %	0 %	50 %	289937506
71	NC_013924	CG	3	6	56923	56928	0 %	0 %	50 %	50 %	289937507
72	NC_013924	GT	3	6	57654	57659	0 %	50 %	50 %	0 %	289937508
73	NC_013924	TG	3	6	57678	57683	0 %	50 %	50 %	0 %	289937508
74	NC_013924	GC	3	6	58107	58112	0 %	0 %	50 %	50 %	289937508
75	NC_013924	CG	3	6	58286	58291	0 %	0 %	50 %	50 %	289937508
76	NC_013924	CT	3	6	59563	59568	0 %	50 %	0 %	50 %	289937509
77	NC_013924	CG	3	6	61125	61130	0 %	0 %	50 %	50 %	289937510
78	NC_013924	CT	3	6	61301	61306	0 %	50 %	0 %	50 %	289937510
79	NC_013924	CG	3	6	61386	61391	0 %	0 %	50 %	50 %	289937510
80	NC_013924	CG	3	6	62225	62230	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
81	NC_013924	CG	3	6	62384	62389	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
82	NC_013924	CG	3	6	62398	62403	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
83	NC_013924	GC	3	6	62882	62887	0 %	0 %	50 %	50 %	289937511
84	NC_013924	CG	4	8	65248	65255	0 %	0 %	50 %	50 %	289937513
85	NC_013924	CG	3	6	67044	67049	0 %	0 %	50 %	50 %	289937514
86	NC_013924	CT	3	6	67171	67176	0 %	50 %	0 %	50 %	289937515
87	NC_013924	TC	3	6	68071	68076	0 %	50 %	0 %	50 %	289937515
88	NC_013924	GT	3	6	68941	68946	0 %	50 %	50 %	0 %	289937515
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90	NC_013924	TG	3	6	74876	74881	0 %	50 %	50 %	0 %	289937522
91	NC_013924	AC	3	6	75461	75466	50 %	0 %	0 %	50 %	289937522
92	NC_013924	CG	3	6	76275	76280	0 %	0 %	50 %	50 %	289937523
93	NC_013924	AG	3	6	76470	76475	50 %	0 %	50 %	0 %	289937523
94	NC_013924	CA	4	8	78064	78071	50 %	0 %	0 %	50 %	289937525
95	NC_013924	CT	3	6	79969	79974	0 %	50 %	0 %	50 %	289937527
96	NC_013924	TC	3	6	80510	80515	0 %	50 %	0 %	50 %	289937527
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101	NC_013924	TC	4	8	85494	85501	0 %	50 %	0 %	50 %	289937532
102	NC_013924	CT	3	6	86132	86137	0 %	50 %	0 %	50 %	289937532
103	NC_013924	TG	3	6	87275	87280	0 %	50 %	50 %	0 %	289937533
104	NC_013924	GT	3	6	88020	88025	0 %	50 %	50 %	0 %	289937533
105	NC_013924	CG	3	6	89451	89456	0 %	0 %	50 %	50 %	289937535
106	NC_013924	AG	3	6	89612	89617	50 %	0 %	50 %	0 %	289937535
107	NC_013924	TG	3	6	91672	91677	0 %	50 %	50 %	0 %	289937537
108	NC_013924	TG	3	6	92306	92311	0 %	50 %	50 %	0 %	289937538
109	NC_013924	GA	3	6	92363	92368	50 %	0 %	50 %	0 %	289937538
110	NC_013924	TC	3	6	92469	92474	0 %	50 %	0 %	50 %	289937538
111	NC_013924	GC	3	6	93456	93461	0 %	0 %	50 %	50 %	289937538
112	NC_013924	CT	3	6	93469	93474	0 %	50 %	0 %	50 %	289937538
113	NC_013924	CT	3	6	94326	94331	0 %	50 %	0 %	50 %	289937539
114	NC_013924	GT	3	6	95720	95725	0 %	50 %	50 %	0 %	289937540
115	NC_013924	GC	3	6	95758	95763	0 %	0 %	50 %	50 %	289937540
116	NC_013924	CG	3	6	98377	98382	0 %	0 %	50 %	50 %	289937543
117	NC_013924	CG	3	6	98529	98534	0 %	0 %	50 %	50 %	289937543
118	NC_013924	CG	3	6	99487	99492	0 %	0 %	50 %	50 %	289937543
119	NC_013924	CG	3	6	99588	99593	0 %	0 %	50 %	50 %	289937543
120	NC_013924	CT	3	6	100070	100075	0 %	50 %	0 %	50 %	289937544
121	NC_013924	CA	3	6	100133	100138	50 %	0 %	0 %	50 %	289937544
122	NC_013924	CT	3	6	100139	100144	0 %	50 %	0 %	50 %	289937544
123	NC_013924	GA	3	6	100446	100451	50 %	0 %	50 %	0 %	289937544
124	NC_013924	CT	3	6	100664	100669	0 %	50 %	0 %	50 %	289937544
125	NC_013924	GA	3	6	101447	101452	50 %	0 %	50 %	0 %	289937545
126	NC_013924	AG	3	6	101485	101490	50 %	0 %	50 %	0 %	289937545
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128	NC_013924	TG	3	6	105944	105949	0 %	50 %	50 %	0 %	289937548
129	NC_013924	AC	3	6	107225	107230	50 %	0 %	0 %	50 %	289937550
130	NC_013924	TC	3	6	107763	107768	0 %	50 %	0 %	50 %	289937550
131	NC_013924	CT	3	6	109274	109279	0 %	50 %	0 %	50 %	289937552
132	NC_013924	GA	3	6	109728	109733	50 %	0 %	50 %	0 %	289937553
133	NC_013924	AG	3	6	109750	109755	50 %	0 %	50 %	0 %	289937553
134	NC_013924	AG	3	6	109792	109797	50 %	0 %	50 %	0 %	289937553
135	NC_013924	AG	3	6	109834	109839	50 %	0 %	50 %	0 %	289937553
136	NC_013924	AG	3	6	109876	109881	50 %	0 %	50 %	0 %	289937553
137	NC_013924	AG	3	6	109918	109923	50 %	0 %	50 %	0 %	289937553
138	NC_013924	CA	3	6	109989	109994	50 %	0 %	0 %	50 %	289937553
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.