MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013924	GCGAT	2	10	3848	3857	20 %	20 %	40 %	20 %	289937463
2	NC_013924	GACTG	2	10	6593	6602	20 %	20 %	40 %	20 %	289937465
3	NC_013924	GACCG	2	10	7639	7648	20 %	0 %	40 %	40 %	289937466
4	NC_013924	CACGG	2	10	9767	9776	20 %	0 %	40 %	40 %	289937467
5	NC_013924	ATCGT	2	10	10656	10665	20 %	40 %	20 %	20 %	289937468
6	NC_013924	CACCC	2	10	12006	12015	20 %	0 %	0 %	80 %	289937469
7	NC_013924	GTACG	2	10	13438	13447	20 %	20 %	40 %	20 %	289937470
8	NC_013924	AGTCA	2	10	14016	14025	40 %	20 %	20 %	20 %	289937471
9	NC_013924	GACGG	2	10	15721	15730	20 %	0 %	60 %	20 %	289937473
10	NC_013924	GTCAC	2	10	16127	16136	20 %	20 %	20 %	40 %	289937473
11	NC_013924	GACGG	2	10	16811	16820	20 %	0 %	60 %	20 %	289937474
12	NC_013924	CCGAG	2	10	18227	18236	20 %	0 %	40 %	40 %	289937474
13	NC_013924	ATCGT	2	10	18610	18619	20 %	40 %	20 %	20 %	289937475
14	NC_013924	TTCGA	2	10	18762	18771	20 %	40 %	20 %	20 %	289937475
15	NC_013924	CCCGA	2	10	19302	19311	20 %	0 %	20 %	60 %	289937475
16	NC_013924	CGGAA	2	10	19440	19449	40 %	0 %	40 %	20 %	289937475
17	NC_013924	CGGTT	2	10	20186	20195	0 %	40 %	40 %	20 %	289937476
18	NC_013924	GATTC	2	10	24517	24526	20 %	40 %	20 %	20 %	289937479
19	NC_013924	AGCGC	2	10	27093	27102	20 %	0 %	40 %	40 %	289937481
20	NC_013924	TGTCT	2	10	27431	27440	0 %	60 %	20 %	20 %	289937481
21	NC_013924	ACGGG	2	10	29809	29818	20 %	0 %	60 %	20 %	289937483
22	NC_013924	CACAA	2	10	32088	32097	60 %	0 %	0 %	40 %	289937484
23	NC_013924	CGATC	2	10	32740	32749	20 %	20 %	20 %	40 %	289937485
24	NC_013924	CGTAT	2	10	33071	33080	20 %	40 %	20 %	20 %	289937485
25	NC_013924	TCGAT	2	10	33515	33524	20 %	40 %	20 %	20 %	289937486
26	NC_013924	TCGAA	2	10	37286	37295	40 %	20 %	20 %	20 %	289937489
27	NC_013924	ATTGC	2	10	45410	45419	20 %	40 %	20 %	20 %	289937494
28	NC_013924	GCCCT	2	10	46242	46251	0 %	20 %	20 %	60 %	289937495
29	NC_013924	GGGTT	2	10	48738	48747	0 %	40 %	60 %	0 %	289937498
30	NC_013924	GTCAC	2	10	48989	48998	20 %	20 %	20 %	40 %	289937499
31	NC_013924	GAATC	2	10	49439	49448	40 %	20 %	20 %	20 %	289937500
32	NC_013924	GCGTG	2	10	49753	49762	0 %	20 %	60 %	20 %	289937500
33	NC_013924	CCGAT	2	10	55924	55933	20 %	20 %	20 %	40 %	289937506
34	NC_013924	CTGAA	2	10	57706	57715	40 %	20 %	20 %	20 %	289937508
35	NC_013924	TTCGT	2	10	58430	58439	0 %	60 %	20 %	20 %	289937508
36	NC_013924	CGATC	2	10	61582	61591	20 %	20 %	20 %	40 %	289937510
37	NC_013924	TGGCT	2	10	62269	62278	0 %	40 %	40 %	20 %	289937511
38	NC_013924	GCAGA	2	10	64064	64073	40 %	0 %	40 %	20 %	289937512
39	NC_013924	ATCGG	2	10	64850	64859	20 %	20 %	40 %	20 %	289937513
40	NC_013924	GAACG	2	10	65074	65083	40 %	0 %	40 %	20 %	289937513
41	NC_013924	CGCGG	2	10	75357	75366	0 %	0 %	60 %	40 %	289937522
42	NC_013924	CAGAG	2	10	75758	75767	40 %	0 %	40 %	20 %	289937522
43	NC_013924	AACCC	2	10	76543	76552	40 %	0 %	0 %	60 %	289937523
44	NC_013924	TCGAC	2	10	77711	77720	20 %	20 %	20 %	40 %	289937525
45	NC_013924	CGGTC	2	10	80950	80959	0 %	20 %	40 %	40 %	289937528
46	NC_013924	CTCGT	2	10	82067	82076	0 %	40 %	20 %	40 %	289937529
47	NC_013924	TCGCG	2	10	85746	85755	0 %	20 %	40 %	40 %	289937532
48	NC_013924	CGCGA	2	10	88267	88276	20 %	0 %	40 %	40 %	289937534
49	NC_013924	CCGTC	2	10	88913	88922	0 %	20 %	20 %	60 %	289937534
50	NC_013924	CCGAC	2	10	89978	89987	20 %	0 %	20 %	60 %	289937535
51	NC_013924	TTCCC	2	10	91201	91210	0 %	40 %	0 %	60 %	289937537
52	NC_013924	GTCCA	2	10	92488	92497	20 %	20 %	20 %	40 %	289937538
53	NC_013924	TTCGT	2	10	93227	93236	0 %	60 %	20 %	20 %	289937538
54	NC_013924	ACACC	2	10	94616	94625	40 %	0 %	0 %	60 %	289937539
55	NC_013924	GCGTC	2	10	97679	97688	0 %	20 %	40 %	40 %	289937542
56	NC_013924	ATTCT	2	10	106773	106782	20 %	60 %	0 %	20 %	289937549
57	NC_013924	ACGAA	2	10	107472	107481	60 %	0 %	20 %	20 %	289937550
58	NC_013924	GTCCA	2	10	115118	115127	20 %	20 %	20 %	40 %	289937558
59	NC_013924	CACAA	2	10	115981	115990	60 %	0 %	0 %	40 %	289937559
60	NC_013924	GGGAC	2	10	119812	119821	20 %	0 %	60 %	20 %	289937563
61	NC_013924	GTCAC	2	10	120408	120417	20 %	20 %	20 %	40 %	289937563
62	NC_013924	TCACC	2	10	120586	120595	20 %	20 %	0 %	60 %	289937563
63	NC_013924	GCAGA	2	10	120654	120663	40 %	0 %	40 %	20 %	289937563
64	NC_013924	GAACG	2	10	125568	125577	40 %	0 %	40 %	20 %	289937568
65	NC_013924	TGGCG	2	10	127506	127515	0 %	20 %	60 %	20 %	289937569
66	NC_013924	CCAAC	2	10	128170	128179	40 %	0 %	0 %	60 %	289937570
67	NC_013924	GTTGG	2	10	128614	128623	0 %	40 %	60 %	0 %	289937570
68	NC_013924	TTCGA	2	10	129923	129932	20 %	40 %	20 %	20 %	289937572
69	NC_013924	CCGCG	2	10	136691	136700	0 %	0 %	40 %	60 %	289937579
70	NC_013924	GCAGG	2	10	137003	137012	20 %	0 %	60 %	20 %	289937579
71	NC_013924	CGATC	2	10	137400	137409	20 %	20 %	20 %	40 %	289937579
72	NC_013924	CGATC	2	10	140256	140265	20 %	20 %	20 %	40 %	289937580
73	NC_013924	CTCCC	2	10	144880	144889	0 %	20 %	0 %	80 %	289937582
74	NC_013924	GCGAC	2	10	147296	147305	20 %	0 %	40 %	40 %	289937583
75	NC_013924	GATCG	2	10	147846	147855	20 %	20 %	40 %	20 %	289937584
76	NC_013924	CGTCC	2	10	148943	148952	0 %	20 %	20 %	60 %	289937585
77	NC_013924	GAACC	2	10	149135	149144	40 %	0 %	20 %	40 %	289937585
78	NC_013924	CCGCC	2	10	150701	150710	0 %	0 %	20 %	80 %	289937587
79	NC_013924	CGAAT	2	10	151585	151594	40 %	20 %	20 %	20 %	289937588
80	NC_013924	GACTC	3	15	151893	151907	20 %	20 %	20 %	40 %	289937588
81	NC_013924	GGTCG	2	10	155291	155300	0 %	20 %	60 %	20 %	289937590
82	NC_013924	GCACT	2	10	156701	156710	20 %	20 %	20 %	40 %	289937591
83	NC_013924	GCGAC	2	10	160973	160982	20 %	0 %	40 %	40 %	289937595
84	NC_013924	ACCAG	2	10	162210	162219	40 %	0 %	20 %	40 %	289937595
85	NC_013924	TGATC	2	10	164383	164392	20 %	40 %	20 %	20 %	289937597
86	NC_013924	GTTGC	2	10	165450	165459	0 %	40 %	40 %	20 %	289937598
87	NC_013924	GGCGA	2	10	165628	165637	20 %	0 %	60 %	20 %	289937598
88	NC_013924	CGCGT	2	10	166735	166744	0 %	20 %	40 %	40 %	289937599
89	NC_013924	AATCG	2	10	167025	167034	40 %	20 %	20 %	20 %	289937599
90	NC_013924	CGGCG	2	10	169047	169056	0 %	0 %	60 %	40 %	289937599
91	NC_013924	CGGAC	2	10	170051	170060	20 %	0 %	40 %	40 %	289937600
92	NC_013924	GTCGA	2	10	171521	171530	20 %	20 %	40 %	20 %	289937601
93	NC_013924	ACCGA	2	10	171864	171873	40 %	0 %	20 %	40 %	289937601
94	NC_013924	GAACC	2	10	172944	172953	40 %	0 %	20 %	40 %	289937602
95	NC_013924	TCGAC	2	10	173738	173747	20 %	20 %	20 %	40 %	289937603
96	NC_013924	GAGGG	2	10	174367	174376	20 %	0 %	80 %	0 %	289937603
97	NC_013924	GCAAC	2	10	175232	175241	40 %	0 %	20 %	40 %	289937603
98	NC_013924	CATCA	2	10	177834	177843	40 %	20 %	0 %	40 %	289937605
99	NC_013924	CCGTT	2	10	178947	178956	0 %	40 %	20 %	40 %	289937607
100	NC_013924	GCGTG	2	10	179307	179316	0 %	20 %	60 %	20 %	289937607
101	NC_013924	TCGAC	2	10	181674	181683	20 %	20 %	20 %	40 %	289937612
102	NC_013924	TCGAC	2	10	182044	182053	20 %	20 %	20 %	40 %	289937612
103	NC_013924	TCACC	2	10	182212	182221	20 %	20 %	0 %	60 %	289937612
104	NC_013924	CAACT	2	10	182463	182472	40 %	20 %	0 %	40 %	289937613
105	NC_013924	GAATC	2	10	183279	183288	40 %	20 %	20 %	20 %	289937613
106	NC_013924	CTGGC	2	10	183514	183523	0 %	20 %	40 %	40 %	289937613
107	NC_013924	ATCGA	2	10	184688	184697	40 %	20 %	20 %	20 %	289937614
108	NC_013924	GGCGC	2	10	185525	185534	0 %	0 %	60 %	40 %	289937615
109	NC_013924	GATCC	2	10	186340	186349	20 %	20 %	20 %	40 %	289937616
110	NC_013924	CCGCG	2	10	186470	186479	0 %	0 %	40 %	60 %	289937616
111	NC_013924	ACCGA	2	10	186579	186588	40 %	0 %	20 %	40 %	289937616
112	NC_013924	CGATG	2	10	190353	190362	20 %	20 %	40 %	20 %	289937618
113	NC_013924	GATCG	2	10	190506	190515	20 %	20 %	40 %	20 %	289937618
114	NC_013924	GGGGT	2	10	191167	191176	0 %	20 %	80 %	0 %	289937618
115	NC_013924	CTCTC	2	10	191731	191740	0 %	40 %	0 %	60 %	289937619
116	NC_013924	CTCGC	2	10	191815	191824	0 %	20 %	20 %	60 %	289937619
117	NC_013924	CTCGT	2	10	194655	194664	0 %	40 %	20 %	40 %	289937624
118	NC_013924	GCCAG	2	10	196268	196277	20 %	0 %	40 %	40 %	289937626
119	NC_013924	ACGAT	2	10	196739	196748	40 %	20 %	20 %	20 %	289937626
120	NC_013924	TCGCG	2	10	198675	198684	0 %	20 %	40 %	40 %	289937628
121	NC_013924	ACGAG	2	10	202921	202930	40 %	0 %	40 %	20 %	289937630
122	NC_013924	TACAT	2	10	204299	204308	40 %	40 %	0 %	20 %	289937631
123	NC_013924	TCGTC	2	10	207289	207298	0 %	40 %	20 %	40 %	289937635
124	NC_013924	ACGAC	2	10	210924	210933	40 %	0 %	20 %	40 %	289937639
125	NC_013924	TGGCG	2	10	211592	211601	0 %	20 %	60 %	20 %	289937640
126	NC_013924	ACCCT	2	10	212792	212801	20 %	20 %	0 %	60 %	289937641
127	NC_013924	TTCGA	2	10	217929	217938	20 %	40 %	20 %	20 %	289937647
128	NC_013924	CGACC	2	10	227022	227031	20 %	0 %	20 %	60 %	289937655
129	NC_013924	CGCGG	2	10	228115	228124	0 %	0 %	60 %	40 %	289937655
130	NC_013924	CTCGA	2	10	230445	230454	20 %	20 %	20 %	40 %	289937656
131	NC_013924	GATCG	2	10	234947	234956	20 %	20 %	40 %	20 %	289937661
132	NC_013924	GTCAC	2	10	236719	236728	20 %	20 %	20 %	40 %	289937663
133	NC_013924	AGACG	2	10	236823	236832	40 %	0 %	40 %	20 %	289937663
134	NC_013924	CGGAA	2	10	236997	237006	40 %	0 %	40 %	20 %	289937663
135	NC_013924	GTCAG	2	10	241144	241153	20 %	20 %	40 %	20 %	289937668
136	NC_013924	GATCG	2	10	242439	242448	20 %	20 %	40 %	20 %	289937670
137	NC_013924	CCGTT	2	10	244101	244110	0 %	40 %	20 %	40 %	289937673
138	NC_013924	GTAGT	2	10	244189	244198	20 %	40 %	40 %	0 %	289937673
139	NC_013924	ATTCC	2	10	247828	247837	20 %	40 %	0 %	40 %	289937676
140	NC_013924	ATGAT	2	10	247838	247847	40 %	40 %	20 %	0 %	289937676
141	NC_013924	ATCAG	2	10	251984	251993	40 %	20 %	20 %	20 %	289937677
142	NC_013924	TTGAT	2	10	252245	252254	20 %	60 %	20 %	0 %	289937677

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.