MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 plasmid pNMAG02

Total Repeats: 4409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013924	GCG	2	6	229425	229430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937656
4002	NC_013924	AAC	2	6	229431	229436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937656
4003	NC_013924	CCT	2	6	229438	229443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937656
4004	NC_013924	ACG	2	6	229460	229465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4005	NC_013924	TG	3	6	229520	229525	0 %	50 %	50 %	0 %	289937656
4006	NC_013924	ACG	2	6	229542	229547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4007	NC_013924	GCGT	2	8	229594	229601	0 %	25 %	50 %	25 %	289937656
4008	NC_013924	CTC	2	6	229661	229666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937656
4009	NC_013924	TCG	2	6	229710	229715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4010	NC_013924	ACG	2	6	229749	229754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4011	NC_013924	CGA	2	6	229842	229847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4012	NC_013924	CGA	2	6	229882	229887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4013	NC_013924	ACG	2	6	229952	229957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4014	NC_013924	ATC	2	6	229977	229982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937656
4015	NC_013924	CGA	2	6	229999	230004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4016	NC_013924	CGT	2	6	230005	230010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4017	NC_013924	CGC	2	6	230078	230083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937656
4018	NC_013924	ACGA	2	8	230108	230115	50 %	0 %	25 %	25 %	289937656
4019	NC_013924	GAC	2	6	230199	230204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4020	NC_013924	TC	3	6	230228	230233	0 %	50 %	0 %	50 %	289937656
4021	NC_013924	GAA	2	6	230414	230419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289937656
4022	NC_013924	CTC	2	6	230438	230443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937656
4023	NC_013924	CTCGA	2	10	230445	230454	20 %	20 %	20 %	40 %	289937656
4024	NC_013924	CGAT	2	8	230457	230464	25 %	25 %	25 %	25 %	289937656
4025	NC_013924	GAG	2	6	230483	230488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937656
4026	NC_013924	TCC	2	6	230532	230537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937656
4027	NC_013924	CTG	2	6	230540	230545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937656
4028	NC_013924	TTGC	2	8	230651	230658	0 %	50 %	25 %	25 %	289937657
4029	NC_013924	TCA	2	6	230666	230671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937657
4030	NC_013924	TGAA	2	8	230684	230691	50 %	25 %	25 %	0 %	289937657
4031	NC_013924	CTT	2	6	231054	231059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937658
4032	NC_013924	GTC	2	6	231082	231087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4033	NC_013924	GAC	2	6	231088	231093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4034	NC_013924	TGC	2	6	231195	231200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4035	NC_013924	ACG	2	6	231258	231263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4036	NC_013924	GAA	2	6	231292	231297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289937658
4037	NC_013924	CTCA	2	8	231325	231332	25 %	25 %	0 %	50 %	289937658
4038	NC_013924	CGCA	2	8	231334	231341	25 %	0 %	25 %	50 %	289937658
4039	NC_013924	TCGC	2	8	231416	231423	0 %	25 %	25 %	50 %	289937658
4040	NC_013924	ACCG	2	8	231444	231451	25 %	0 %	25 %	50 %	289937658
4041	NC_013924	GAT	2	6	231502	231507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937658
4042	NC_013924	CGA	2	6	231516	231521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4043	NC_013924	CCCA	2	8	231535	231542	25 %	0 %	0 %	75 %	289937658
4044	NC_013924	AGTG	2	8	231560	231567	25 %	25 %	50 %	0 %	289937658
4045	NC_013924	CTC	2	6	231583	231588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937658
4046	NC_013924	CGA	2	6	231663	231668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4047	NC_013924	AGC	2	6	231695	231700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937658
4048	NC_013924	TG	3	6	231847	231852	0 %	50 %	50 %	0 %	289937658
4049	NC_013924	GA	3	6	231925	231930	50 %	0 %	50 %	0 %	289937658
4050	NC_013924	CCA	2	6	232005	232010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937658
4051	NC_013924	GT	3	6	232015	232020	0 %	50 %	50 %	0 %	289937658
4052	NC_013924	GAT	2	6	232083	232088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937658
4053	NC_013924	AAAT	2	8	234044	234051	75 %	25 %	0 %	0 %	289937659
4054	NC_013924	ACC	2	6	234087	234092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937659
4055	NC_013924	TAG	2	6	234122	234127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937659
4056	NC_013924	GTT	2	6	234181	234186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937659
4057	NC_013924	CGC	2	6	234213	234218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937659
4058	NC_013924	GCG	2	6	234310	234315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937659
4059	NC_013924	ATC	2	6	234370	234375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937659
4060	NC_013924	CGT	2	6	234418	234423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937659
4061	NC_013924	GCA	2	6	234527	234532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937660
4062	NC_013924	ATC	2	6	234548	234553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937660
4063	NC_013924	TCG	2	6	234607	234612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937660
4064	NC_013924	T	6	6	234644	234649	0 %	100 %	0 %	0 %	289937660
4065	NC_013924	AGT	3	9	234668	234676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937660
4066	NC_013924	TCG	2	6	234707	234712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937660
4067	NC_013924	CGT	2	6	234725	234730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937660
4068	NC_013924	ATC	2	6	234750	234755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937660
4069	NC_013924	CGT	2	6	234758	234763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937660
4070	NC_013924	CTC	2	6	234831	234836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937660
4071	NC_013924	TGACGA	2	12	234851	234862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289937660
4072	NC_013924	CA	3	6	234863	234868	50 %	0 %	0 %	50 %	289937660
4073	NC_013924	CACC	2	8	234878	234885	25 %	0 %	0 %	75 %	289937660
4074	NC_013924	ACA	2	6	234900	234905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937660
4075	NC_013924	GATCG	2	10	234947	234956	20 %	20 %	40 %	20 %	289937661
4076	NC_013924	GAC	2	6	234992	234997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937661
4077	NC_013924	TCGACG	2	12	235014	235025	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289937661
4078	NC_013924	ACG	2	6	235028	235033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937661
4079	NC_013924	CA	3	6	235123	235128	50 %	0 %	0 %	50 %	289937661
4080	NC_013924	ACC	2	6	235221	235226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937662
4081	NC_013924	CCA	2	6	235232	235237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937662
4082	NC_013924	TCC	2	6	235252	235257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937662
4083	NC_013924	CGA	3	9	235422	235430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937662
4084	NC_013924	TG	3	6	235436	235441	0 %	50 %	50 %	0 %	289937662
4085	NC_013924	CGT	2	6	235449	235454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937662
4086	NC_013924	CGA	2	6	235455	235460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937662
4087	NC_013924	GTC	2	6	235532	235537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937662
4088	NC_013924	CGG	2	6	235557	235562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937662
4089	NC_013924	GT	3	6	235580	235585	0 %	50 %	50 %	0 %	289937662
4090	NC_013924	GAG	3	9	235699	235707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937662
4091	NC_013924	GAC	2	6	235913	235918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4092	NC_013924	CCA	2	6	235934	235939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937663
4093	NC_013924	TGG	2	6	235950	235955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289937663
4094	NC_013924	GT	3	6	235956	235961	0 %	50 %	50 %	0 %	289937663
4095	NC_013924	CGC	2	6	235962	235967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289937663
4096	NC_013924	GGCA	2	8	236034	236041	25 %	0 %	50 %	25 %	289937663
4097	NC_013924	CTG	2	6	236075	236080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4098	NC_013924	CGT	2	6	236108	236113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4099	NC_013924	CGA	2	6	236218	236223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4100	NC_013924	AT	3	6	236305	236310	50 %	50 %	0 %	0 %	289937663
4101	NC_013924	CGG	2	6	236322	236327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937663
4102	NC_013924	GTC	2	6	236467	236472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4103	NC_013924	TCCG	2	8	236512	236519	0 %	25 %	25 %	50 %	289937663
4104	NC_013924	GAC	2	6	236542	236547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4105	NC_013924	CGAC	2	8	236569	236576	25 %	0 %	25 %	50 %	289937663
4106	NC_013924	TCG	2	6	236597	236602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4107	NC_013924	GC	3	6	236667	236672	0 %	0 %	50 %	50 %	289937663
4108	NC_013924	ATC	2	6	236713	236718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937663
4109	NC_013924	GTCAC	2	10	236719	236728	20 %	20 %	20 %	40 %	289937663
4110	NC_013924	CGA	2	6	236754	236759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4111	NC_013924	CGG	2	6	236810	236815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937663
4112	NC_013924	AGACG	2	10	236823	236832	40 %	0 %	40 %	20 %	289937663
4113	NC_013924	GTC	2	6	236929	236934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4114	NC_013924	GAC	2	6	236938	236943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937663
4115	NC_013924	CG	3	6	236977	236982	0 %	0 %	50 %	50 %	289937663
4116	NC_013924	CGGAA	2	10	236997	237006	40 %	0 %	40 %	20 %	289937663
4117	NC_013924	GGA	2	6	237024	237029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937663
4118	NC_013924	CAC	2	6	237041	237046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937663
4119	NC_013924	GGA	2	6	237102	237107	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289937663
4120	NC_013924	ACC	2	6	237173	237178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937664
4121	NC_013924	TGA	2	6	237202	237207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937664
4122	NC_013924	CAA	2	6	237225	237230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289937664
4123	NC_013924	TCG	2	6	237276	237281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937664
4124	NC_013924	TGGT	2	8	237296	237303	0 %	50 %	50 %	0 %	289937664
4125	NC_013924	ACTC	2	8	237324	237331	25 %	25 %	0 %	50 %	289937664
4126	NC_013924	ATCG	2	8	237655	237662	25 %	25 %	25 %	25 %	289937665
4127	NC_013924	GTC	2	6	237676	237681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937665
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4129	NC_013924	CGAA	2	8	237744	237751	50 %	0 %	25 %	25 %	289937665
4130	NC_013924	CGG	2	6	237774	237779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289937665
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4132	NC_013924	GTC	2	6	237874	237879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937665
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4138	NC_013924	CGGT	2	8	238162	238169	0 %	25 %	50 %	25 %	289937666
4139	NC_013924	CGA	2	6	238214	238219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937666
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4141	NC_013924	TAC	2	6	238326	238331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937666
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4196	NC_013924	GAC	2	6	242484	242489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937670
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4241	NC_013924	CGT	3	9	244497	244505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937673
4242	NC_013924	TCG	2	6	244511	244516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937673
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4355	NC_013924	TGT	2	6	251098	251103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937677
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4359	NC_013924	CAC	2	6	251694	251699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937677
4360	NC_013924	TCT	2	6	251717	251722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937677
4361	NC_013924	TGAGCT	2	12	251770	251781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289937677
4362	NC_013924	AGA	2	6	251800	251805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289937677
4363	NC_013924	CTT	2	6	251859	251864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937677
4364	NC_013924	TCT	2	6	251906	251911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937677
4365	NC_013924	TCC	2	6	251929	251934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937677
4366	NC_013924	GAT	2	6	251935	251940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289937677
4367	NC_013924	ATCAG	2	10	251984	251993	40 %	20 %	20 %	20 %	289937677
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4369	NC_013924	CA	3	6	252230	252235	50 %	0 %	0 %	50 %	289937677
4370	NC_013924	TTGAT	2	10	252245	252254	20 %	60 %	20 %	0 %	289937677
4371	NC_013924	GTAG	2	8	252262	252269	25 %	25 %	50 %	0 %	289937677
4372	NC_013924	CGT	3	9	252276	252284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937677
4373	NC_013924	CTT	2	6	252342	252347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937677
4374	NC_013924	GCA	2	6	252350	252355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937677
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4376	NC_013924	TCA	2	6	252593	252598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937677
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4378	NC_013924	CTG	2	6	253358	253363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937678
4379	NC_013924	CGAT	2	8	253369	253376	25 %	25 %	25 %	25 %	289937678
4380	NC_013924	CTG	2	6	253393	253398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937678
4381	NC_013924	GTT	2	6	253402	253407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289937678
4382	NC_013924	TCG	2	6	253446	253451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937678
4383	NC_013924	TTC	2	6	253473	253478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937678
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4389	NC_013924	TCT	2	6	253648	253653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289937678
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4391	NC_013924	CAG	2	6	253766	253771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937678
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4394	NC_013924	TCTGAC	2	12	253906	253917	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289937678
4395	NC_013924	TCA	2	6	253923	253928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289937678
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4398	NC_013924	CGA	2	6	253978	253983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289937678
4399	NC_013924	CTC	2	6	253985	253990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289937678
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4401	NC_013924	A	6	6	254066	254071	100 %	0 %	0 %	0 %	289937678
4402	NC_013924	TCGA	2	8	254091	254098	25 %	25 %	25 %	25 %	289937678
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4407	NC_013924	TGC	2	6	254333	254338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289937678
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4409	NC_013924	CCA	2	6	254386	254391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289937678

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