MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 2160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013922	GAACA	2	10	980	989	60 %	0 %	20 %	20 %	289579697
2	NC_013922	TGACG	2	10	1123	1132	20 %	20 %	40 %	20 %	289579697
3	NC_013922	ACGCG	2	10	1503	1512	20 %	0 %	40 %	40 %	289579697
4	NC_013922	CGCGA	2	10	1532	1541	20 %	0 %	40 %	40 %	289579697
5	NC_013922	CGACT	2	10	1700	1709	20 %	20 %	20 %	40 %	289579697
6	NC_013922	GCTCG	2	10	3471	3480	0 %	20 %	40 %	40 %	289579698
7	NC_013922	CCTCG	2	10	3852	3861	0 %	20 %	20 %	60 %	289579699
8	NC_013922	GATCG	2	10	7767	7776	20 %	20 %	40 %	20 %	289579701
9	NC_013922	GTCAC	2	10	12123	12132	20 %	20 %	20 %	40 %	289579705
10	NC_013922	GTTCG	2	10	13322	13331	0 %	40 %	40 %	20 %	289579706
11	NC_013922	CGACG	2	10	13505	13514	20 %	0 %	40 %	40 %	289579706
12	NC_013922	TCGTG	2	10	17013	17022	0 %	40 %	40 %	20 %	289579709
13	NC_013922	CGGTC	2	10	18898	18907	0 %	20 %	40 %	40 %	289579710
14	NC_013922	CACTC	2	10	21964	21973	20 %	20 %	0 %	60 %	289579715
15	NC_013922	CGGGC	2	10	22082	22091	0 %	0 %	60 %	40 %	289579715
16	NC_013922	TCCGC	2	10	24526	24535	0 %	20 %	20 %	60 %	289579719
17	NC_013922	GTTCA	2	10	25323	25332	20 %	40 %	20 %	20 %	289579719
18	NC_013922	GTACA	2	10	33622	33631	40 %	20 %	20 %	20 %	289579722
19	NC_013922	CCTGA	2	10	36931	36940	20 %	20 %	20 %	40 %	289579724
20	NC_013922	GACGG	2	10	37174	37183	20 %	0 %	60 %	20 %	289579725
21	NC_013922	TTGCC	2	10	37565	37574	0 %	40 %	20 %	40 %	289579725
22	NC_013922	CTGTC	2	10	37905	37914	0 %	40 %	20 %	40 %	289579726
23	NC_013922	TGCCA	2	10	38345	38354	20 %	20 %	20 %	40 %	289579727
24	NC_013922	ACGGT	2	10	38361	38370	20 %	20 %	40 %	20 %	289579727
25	NC_013922	TGTTC	2	10	40177	40186	0 %	60 %	20 %	20 %	289579729
26	NC_013922	GCCGA	2	10	40517	40526	20 %	0 %	40 %	40 %	289579730
27	NC_013922	TCGAT	2	10	44269	44278	20 %	40 %	20 %	20 %	289579733
28	NC_013922	TCGAA	2	10	47016	47025	40 %	20 %	20 %	20 %	289579734
29	NC_013922	CAGCG	2	10	47155	47164	20 %	0 %	40 %	40 %	289579734
30	NC_013922	AGGAC	2	10	47568	47577	40 %	0 %	40 %	20 %	289579735
31	NC_013922	GCGAC	2	10	48670	48679	20 %	0 %	40 %	40 %	289579736
32	NC_013922	GAGCG	2	10	49026	49035	20 %	0 %	60 %	20 %	289579736
33	NC_013922	TTCGA	2	10	49623	49632	20 %	40 %	20 %	20 %	289579737
34	NC_013922	CGCGC	2	10	51059	51068	0 %	0 %	40 %	60 %	289579737
35	NC_013922	CGACG	2	10	51925	51934	20 %	0 %	40 %	40 %	289579738
36	NC_013922	ATCGG	2	10	52367	52376	20 %	20 %	40 %	20 %	289579738
37	NC_013922	TCGAA	2	10	53298	53307	40 %	20 %	20 %	20 %	289579738
38	NC_013922	AGCCG	2	10	53617	53626	20 %	0 %	40 %	40 %	289579738
39	NC_013922	GTAGC	2	10	57228	57237	20 %	20 %	40 %	20 %	289579741
40	NC_013922	GAAGA	2	10	58961	58970	60 %	0 %	40 %	0 %	289579744
41	NC_013922	GAAGG	2	10	59042	59051	40 %	0 %	60 %	0 %	289579744
42	NC_013922	GTATA	2	10	60161	60170	40 %	40 %	20 %	0 %	289579745
43	NC_013922	GGACC	2	10	64759	64768	20 %	0 %	40 %	40 %	289579747
44	NC_013922	TCGGC	2	10	66875	66884	0 %	20 %	40 %	40 %	289579748
45	NC_013922	CTTCA	2	10	67329	67338	20 %	40 %	0 %	40 %	289579749
46	NC_013922	CCGAG	2	10	67529	67538	20 %	0 %	40 %	40 %	289579749
47	NC_013922	CAGCG	2	10	69440	69449	20 %	0 %	40 %	40 %	289579751
48	NC_013922	GGTCG	2	10	70590	70599	0 %	20 %	60 %	20 %	289579752
49	NC_013922	GCGTC	2	10	71927	71936	0 %	20 %	40 %	40 %	289579754
50	NC_013922	TCGCA	2	10	76592	76601	20 %	20 %	20 %	40 %	289579755
51	NC_013922	CCCGT	2	10	77101	77110	0 %	20 %	20 %	60 %	289579756
52	NC_013922	TCGCG	2	10	77873	77882	0 %	20 %	40 %	40 %	289579757
53	NC_013922	TCACG	2	10	78241	78250	20 %	20 %	20 %	40 %	289579757
54	NC_013922	GTCAC	2	10	80145	80154	20 %	20 %	20 %	40 %	289579759
55	NC_013922	GGGGC	2	10	82811	82820	0 %	0 %	80 %	20 %	289579761
56	NC_013922	GTGTT	2	10	83594	83603	0 %	60 %	40 %	0 %	289579761
57	NC_013922	GTTCG	2	10	84025	84034	0 %	40 %	40 %	20 %	289579762
58	NC_013922	TCGGC	2	10	86936	86945	0 %	20 %	40 %	40 %	289579765
59	NC_013922	CTCGT	2	10	87483	87492	0 %	40 %	20 %	40 %	289579766
60	NC_013922	ATCGC	2	10	90034	90043	20 %	20 %	20 %	40 %	289579768
61	NC_013922	ACGAG	2	10	100209	100218	40 %	0 %	40 %	20 %	289579777
62	NC_013922	TCGGC	2	10	101078	101087	0 %	20 %	40 %	40 %	289579778
63	NC_013922	ATCCG	2	10	103011	103020	20 %	20 %	20 %	40 %	289579780
64	NC_013922	GCTCG	2	10	103059	103068	0 %	20 %	40 %	40 %	289579780
65	NC_013922	AAACG	2	10	105587	105596	60 %	0 %	20 %	20 %	289579782
66	NC_013922	TCTGC	2	10	105646	105655	0 %	40 %	20 %	40 %	289579782
67	NC_013922	ACGCC	2	10	106505	106514	20 %	0 %	20 %	60 %	289579783
68	NC_013922	ACGCA	2	10	106551	106560	40 %	0 %	20 %	40 %	289579783
69	NC_013922	CAGTG	2	10	106684	106693	20 %	20 %	40 %	20 %	289579783
70	NC_013922	GCGTC	2	10	109313	109322	0 %	20 %	40 %	40 %	289579785
71	NC_013922	AGACG	2	10	110919	110928	40 %	0 %	40 %	20 %	289579785
72	NC_013922	CTTCC	2	10	112382	112391	0 %	40 %	0 %	60 %	289579787
73	NC_013922	CCACT	2	10	113226	113235	20 %	20 %	0 %	60 %	289579787
74	NC_013922	AGGCG	2	10	120446	120455	20 %	0 %	60 %	20 %	289579792
75	NC_013922	CGGAT	2	10	123109	123118	20 %	20 %	40 %	20 %	289579794
76	NC_013922	GTGAA	2	10	125207	125216	40 %	20 %	40 %	0 %	289579796
77	NC_013922	TCGAA	2	10	127710	127719	40 %	20 %	20 %	20 %	289579798
78	NC_013922	CGGTC	2	10	128446	128455	0 %	20 %	40 %	40 %	289579799
79	NC_013922	CACAC	2	10	137111	137120	40 %	0 %	0 %	60 %	289579808
80	NC_013922	CGCGA	2	10	138822	138831	20 %	0 %	40 %	40 %	289579812
81	NC_013922	AGCGA	2	10	140158	140167	40 %	0 %	40 %	20 %	289579812
82	NC_013922	CGGAG	2	10	142361	142370	20 %	0 %	60 %	20 %	289579815
83	NC_013922	GTATC	2	10	142724	142733	20 %	40 %	20 %	20 %	289579816
84	NC_013922	CTCGA	2	10	143794	143803	20 %	20 %	20 %	40 %	289579818
85	NC_013922	CCGTC	2	10	145472	145481	0 %	20 %	20 %	60 %	289579820
86	NC_013922	ACAGC	2	10	146498	146507	40 %	0 %	20 %	40 %	289579822
87	NC_013922	ATAAC	2	10	147435	147444	60 %	20 %	0 %	20 %	289579824
88	NC_013922	GTTTT	2	10	148673	148682	0 %	80 %	20 %	0 %	289579826
89	NC_013922	TGTGA	2	10	148917	148926	20 %	40 %	40 %	0 %	289579826
90	NC_013922	TCGGT	2	10	149193	149202	0 %	40 %	40 %	20 %	289579826
91	NC_013922	TCGAT	2	10	150610	150619	20 %	40 %	20 %	20 %	289579828
92	NC_013922	ATATC	2	10	153784	153793	40 %	40 %	0 %	20 %	289579830
93	NC_013922	TCAAA	2	10	154743	154752	60 %	20 %	0 %	20 %	289579830
94	NC_013922	CTGAC	2	10	155532	155541	20 %	20 %	20 %	40 %	289579831
95	NC_013922	AATCT	2	10	160478	160487	40 %	40 %	0 %	20 %	289579834
96	NC_013922	CCTGA	2	10	161113	161122	20 %	20 %	20 %	40 %	289579834
97	NC_013922	CGTTC	2	10	162774	162783	0 %	40 %	20 %	40 %	289579836
98	NC_013922	CCTCT	2	10	162902	162911	0 %	40 %	0 %	60 %	289579836
99	NC_013922	TCGAG	2	10	166328	166337	20 %	20 %	40 %	20 %	289579840
100	NC_013922	GTCAC	2	10	166531	166540	20 %	20 %	20 %	40 %	289579840
101	NC_013922	GGATG	2	10	168243	168252	20 %	20 %	60 %	0 %	289579841
102	NC_013922	CCGAC	2	10	168816	168825	20 %	0 %	20 %	60 %	289579842
103	NC_013922	ACCCA	2	10	168967	168976	40 %	0 %	0 %	60 %	289579842
104	NC_013922	GCGTC	2	10	170909	170918	0 %	20 %	40 %	40 %	289579845
105	NC_013922	AGGAC	2	10	171439	171448	40 %	0 %	40 %	20 %	289579845
106	NC_013922	GTGAC	2	10	172729	172738	20 %	20 %	40 %	20 %	289579848
107	NC_013922	AGGGG	2	10	173173	173182	20 %	0 %	80 %	0 %	289579849
108	NC_013922	TCGAT	2	10	175282	175291	20 %	40 %	20 %	20 %	289579853
109	NC_013922	ACGAA	2	10	178122	178131	60 %	0 %	20 %	20 %	289579855
110	NC_013922	GCGCC	2	10	180106	180115	0 %	0 %	40 %	60 %	289579857
111	NC_013922	CCGTT	2	10	181160	181169	0 %	40 %	20 %	40 %	289579858
112	NC_013922	CGTCT	2	10	182139	182148	0 %	40 %	20 %	40 %	289579859
113	NC_013922	TGCTC	2	10	184211	184220	0 %	40 %	20 %	40 %	289579861
114	NC_013922	CGGCA	2	10	185534	185543	20 %	0 %	40 %	40 %	289579862
115	NC_013922	CGACC	2	10	190038	190047	20 %	0 %	20 %	60 %	289579864
116	NC_013922	CTCGC	2	10	198557	198566	0 %	20 %	20 %	60 %	289579872
117	NC_013922	GTCGT	2	10	198806	198815	0 %	40 %	40 %	20 %	289579872
118	NC_013922	GCCGA	2	10	200906	200915	20 %	0 %	40 %	40 %	289579875
119	NC_013922	CCGGT	2	10	203842	203851	0 %	20 %	40 %	40 %	289579877
120	NC_013922	GCGAT	2	10	204700	204709	20 %	20 %	40 %	20 %	289579877
121	NC_013922	TCTGG	2	10	205664	205673	0 %	40 %	40 %	20 %	289579878
122	NC_013922	GATCA	2	10	206804	206813	40 %	20 %	20 %	20 %	289579878
123	NC_013922	CGTCG	2	10	207057	207066	0 %	20 %	40 %	40 %	289579879
124	NC_013922	AAGCC	2	10	208348	208357	40 %	0 %	20 %	40 %	289579879
125	NC_013922	CGAGC	2	10	208960	208969	20 %	0 %	40 %	40 %	289579880
126	NC_013922	AAGCC	2	10	211927	211936	40 %	0 %	20 %	40 %	289579881
127	NC_013922	CTCGT	2	10	213252	213261	0 %	40 %	20 %	40 %	289579883
128	NC_013922	TCTGT	2	10	219258	219267	0 %	60 %	20 %	20 %	289579892
129	NC_013922	TTCCG	2	10	219280	219289	0 %	40 %	20 %	40 %	289579892
130	NC_013922	AAAGG	2	10	224230	224239	60 %	0 %	40 %	0 %	289579898
131	NC_013922	ACCTG	2	10	227544	227553	20 %	20 %	20 %	40 %	289579904
132	NC_013922	GGACG	2	10	229605	229614	20 %	0 %	60 %	20 %	289579908
133	NC_013922	ACCCT	2	10	238048	238057	20 %	20 %	0 %	60 %	289579922
134	NC_013922	TGATG	2	10	240707	240716	20 %	40 %	40 %	0 %	289579925
135	NC_013922	TTGGA	2	10	241411	241420	20 %	40 %	40 %	0 %	289579925
136	NC_013922	CCCAG	2	10	243151	243160	20 %	0 %	20 %	60 %	289579926
137	NC_013922	TACTG	2	10	247089	247098	20 %	40 %	20 %	20 %	289579936
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140	NC_013922	TTCGG	2	10	261046	261055	0 %	40 %	40 %	20 %	289579954
141	NC_013922	TCCCA	2	10	263093	263102	20 %	20 %	0 %	60 %	289579956
142	NC_013922	TCTGT	2	10	263399	263408	0 %	60 %	20 %	20 %	289579956
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147	NC_013922	CTCGA	2	10	272545	272554	20 %	20 %	20 %	40 %	289579966
148	NC_013922	CATGT	2	10	272890	272899	20 %	40 %	20 %	20 %	289579968
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152	NC_013922	CCGTG	2	10	279661	279670	0 %	20 %	40 %	40 %	289579977
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164	NC_013922	GACTG	2	10	313657	313666	20 %	20 %	40 %	20 %	289580011
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251	NC_013922	CGCGG	2	10	477132	477141	0 %	0 %	60 %	40 %	289580164
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258	NC_013922	GTAAT	2	10	486656	486665	40 %	40 %	20 %	0 %	289580174
259	NC_013922	CCGAC	2	10	489475	489484	20 %	0 %	20 %	60 %	289580176
260	NC_013922	TTCCG	2	10	489718	489727	0 %	40 %	20 %	40 %	289580176
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262	NC_013922	CGGGA	2	10	493656	493665	20 %	0 %	60 %	20 %	289580181
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