MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 80424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013922	ATT	2	6	158462	158467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579833
3002	NC_013922	A	6	6	158555	158560	100 %	0 %	0 %	0 %	289579833
3003	NC_013922	AAG	2	6	158564	158569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579833
3004	NC_013922	GCA	2	6	158670	158675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579833
3005	NC_013922	CTA	2	6	158722	158727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579833
3006	NC_013922	C	7	7	158730	158736	0 %	0 %	0 %	100 %	289579833
3007	NC_013922	AAAT	2	8	158882	158889	75 %	25 %	0 %	0 %	289579833
3008	NC_013922	TATG	2	8	159070	159077	25 %	50 %	25 %	0 %	289579833
3009	NC_013922	A	6	6	159105	159110	100 %	0 %	0 %	0 %	289579833
3010	NC_013922	CCA	2	6	159147	159152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579833
3011	NC_013922	AT	3	6	159161	159166	50 %	50 %	0 %	0 %	289579833
3012	NC_013922	TAT	3	9	159164	159172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579833
3013	NC_013922	GAT	2	6	159198	159203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579833
3014	NC_013922	TTG	2	6	159214	159219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579833
3015	NC_013922	AAC	2	6	159224	159229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579833
3016	NC_013922	TAA	2	6	159242	159247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579833
3017	NC_013922	TAA	2	6	159250	159255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579833
3018	NC_013922	ACAA	2	8	159267	159274	75 %	0 %	0 %	25 %	289579833
3019	NC_013922	TA	3	6	159284	159289	50 %	50 %	0 %	0 %	289579833
3020	NC_013922	GTT	2	6	160377	160382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579834
3021	NC_013922	AATCT	2	10	160478	160487	40 %	40 %	0 %	20 %	289579834
3022	NC_013922	GTC	2	6	160519	160524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579834
3023	NC_013922	AAC	2	6	160533	160538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579834
3024	NC_013922	CGA	2	6	160581	160586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579834
3025	NC_013922	TTG	2	6	160637	160642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579834
3026	NC_013922	TTC	2	6	160736	160741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579834
3027	NC_013922	GCT	2	6	160825	160830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579834
3028	NC_013922	AGG	2	6	160929	160934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579834
3029	NC_013922	TGA	2	6	160947	160952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579834
3030	NC_013922	GAT	2	6	160954	160959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579834
3031	NC_013922	ACT	2	6	161009	161014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579834
3032	NC_013922	CAT	2	6	161024	161029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579834
3033	NC_013922	CCTGA	2	10	161113	161122	20 %	20 %	20 %	40 %	289579834
3034	NC_013922	CA	3	6	161191	161196	50 %	0 %	0 %	50 %	289579834
3035	NC_013922	GA	3	6	161202	161207	50 %	0 %	50 %	0 %	289579834
3036	NC_013922	TCA	2	6	161220	161225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579834
3037	NC_013922	TA	3	6	161228	161233	50 %	50 %	0 %	0 %	289579834
3038	NC_013922	GAA	2	6	161386	161391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579834
3039	NC_013922	ATC	2	6	161433	161438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579834
3040	NC_013922	CT	3	6	161548	161553	0 %	50 %	0 %	50 %	289579835
3041	NC_013922	CT	3	6	161621	161626	0 %	50 %	0 %	50 %	289579835
3042	NC_013922	AAT	2	6	161638	161643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579835
3043	NC_013922	GAT	2	6	161699	161704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579835
3044	NC_013922	CTA	2	6	161720	161725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579835
3045	NC_013922	TGC	2	6	161788	161793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579835
3046	NC_013922	TGA	2	6	161887	161892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579835
3047	NC_013922	GT	3	6	162031	162036	0 %	50 %	50 %	0 %	289579835
3048	NC_013922	AGT	2	6	162070	162075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579835
3049	NC_013922	AGC	2	6	162163	162168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579835
3050	NC_013922	GAG	2	6	162269	162274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579835
3051	NC_013922	CCGG	2	8	162331	162338	0 %	0 %	50 %	50 %	289579835
3052	NC_013922	CGA	2	6	162370	162375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579835
3053	NC_013922	GGA	2	6	162397	162402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579835
3054	NC_013922	TCCT	2	8	162414	162421	0 %	50 %	0 %	50 %	289579835
3055	NC_013922	CT	3	6	162509	162514	0 %	50 %	0 %	50 %	289579835
3056	NC_013922	TGA	2	6	162729	162734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579836
3057	NC_013922	CGTTC	2	10	162774	162783	0 %	40 %	20 %	40 %	289579836
3058	NC_013922	CGG	2	6	162812	162817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579836
3059	NC_013922	CAGT	2	8	162842	162849	25 %	25 %	25 %	25 %	289579836
3060	NC_013922	GAA	2	6	162862	162867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579836
3061	NC_013922	GCAA	2	8	162894	162901	50 %	0 %	25 %	25 %	289579836
3062	NC_013922	CCTCT	2	10	162902	162911	0 %	40 %	0 %	60 %	289579836
3063	NC_013922	TGA	2	6	162951	162956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579836
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3068	NC_013922	GCC	2	6	163203	163208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579836
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3072	NC_013922	TCGA	2	8	163509	163516	25 %	25 %	25 %	25 %	289579837
3073	NC_013922	CT	3	6	163536	163541	0 %	50 %	0 %	50 %	289579837
3074	NC_013922	TGT	2	6	163625	163630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579837
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3078	NC_013922	TGA	2	6	163742	163747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579837
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3080	NC_013922	CTGG	2	8	163884	163891	0 %	25 %	50 %	25 %	289579837
3081	NC_013922	TAC	2	6	163915	163920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579837
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3087	NC_013922	TTCG	2	8	164231	164238	0 %	50 %	25 %	25 %	289579837
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3099	NC_013922	GCA	2	6	165166	165171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579839
3100	NC_013922	CGG	2	6	165209	165214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579839
3101	NC_013922	CCT	2	6	165275	165280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579839
3102	NC_013922	CAG	2	6	165368	165373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579839
3103	NC_013922	TCAG	2	8	165394	165401	25 %	25 %	25 %	25 %	289579839
3104	NC_013922	TG	3	6	165405	165410	0 %	50 %	50 %	0 %	289579839
3105	NC_013922	ATTG	2	8	165448	165455	25 %	50 %	25 %	0 %	289579839
3106	NC_013922	ATG	2	6	165494	165499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579839
3107	NC_013922	GAA	2	6	165509	165514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579839
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3109	NC_013922	CAGC	2	8	165692	165699	25 %	0 %	25 %	50 %	289579839
3110	NC_013922	GAAA	2	8	165730	165737	75 %	0 %	25 %	0 %	289579839
3111	NC_013922	T	6	6	165748	165753	0 %	100 %	0 %	0 %	289579839
3112	NC_013922	AGT	2	6	165758	165763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579839
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3115	NC_013922	TACC	2	8	166265	166272	25 %	25 %	0 %	50 %	289579840
3116	NC_013922	TCGAG	2	10	166328	166337	20 %	20 %	40 %	20 %	289579840
3117	NC_013922	GTGCCA	2	12	166391	166402	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289579840
3118	NC_013922	GTCAC	2	10	166531	166540	20 %	20 %	20 %	40 %	289579840
3119	NC_013922	CATC	2	8	166631	166638	25 %	25 %	0 %	50 %	289579840
3120	NC_013922	CGAC	2	8	166647	166654	25 %	0 %	25 %	50 %	289579840
3121	NC_013922	AGC	2	6	166699	166704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579840
3122	NC_013922	CGA	2	6	166739	166744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579840
3123	NC_013922	GA	3	6	166786	166791	50 %	0 %	50 %	0 %	289579840
3124	NC_013922	TCG	2	6	166795	166800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579840
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3225	NC_013922	TACT	2	8	172641	172648	25 %	50 %	0 %	25 %	289579848
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3227	NC_013922	GGAA	2	8	172709	172716	50 %	0 %	50 %	0 %	289579848
3228	NC_013922	GTGAC	2	10	172729	172738	20 %	20 %	40 %	20 %	289579848
3229	NC_013922	TC	3	6	172754	172759	0 %	50 %	0 %	50 %	289579848
3230	NC_013922	GCA	2	6	172869	172874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579848
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3232	NC_013922	AGGGG	2	10	173173	173182	20 %	0 %	80 %	0 %	289579849
3233	NC_013922	CTT	2	6	173250	173255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579849
3234	NC_013922	CCA	2	6	173327	173332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579849
3235	NC_013922	CGA	2	6	173399	173404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579849
3236	NC_013922	TCA	2	6	173411	173416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579849
3237	NC_013922	GAT	2	6	173488	173493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579849
3238	NC_013922	CTT	2	6	173503	173508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579849
3239	NC_013922	GACC	2	8	173556	173563	25 %	0 %	25 %	50 %	289579849
3240	NC_013922	C	6	6	173568	173573	0 %	0 %	0 %	100 %	289579849
3241	NC_013922	CTT	2	6	173610	173615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579849
3242	NC_013922	AATG	2	8	173742	173749	50 %	25 %	25 %	0 %	289579850
3243	NC_013922	TC	3	6	173838	173843	0 %	50 %	0 %	50 %	289579850
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3364	NC_013922	TCCC	2	8	180286	180293	0 %	25 %	0 %	75 %	289579857
3365	NC_013922	TGG	2	6	180373	180378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579857
3366	NC_013922	GTC	2	6	180583	180588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3367	NC_013922	GGT	2	6	180669	180674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579858
3368	NC_013922	CGG	2	6	180779	180784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579858
3369	NC_013922	GTC	3	9	180886	180894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3370	NC_013922	TCG	2	6	180947	180952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3371	NC_013922	CG	3	6	181062	181067	0 %	0 %	50 %	50 %	289579858
3372	NC_013922	CCT	2	6	181076	181081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579858
3373	NC_013922	TCG	2	6	181151	181156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3374	NC_013922	CCGTT	2	10	181160	181169	0 %	40 %	20 %	40 %	289579858
3375	NC_013922	GCT	2	6	181196	181201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3376	NC_013922	TCGGAC	2	12	181249	181260	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3377	NC_013922	TCG	2	6	181279	181284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3378	NC_013922	CGA	3	9	181313	181321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3379	NC_013922	CGA	2	6	181352	181357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579858
3380	NC_013922	TCG	2	6	181387	181392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579858
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3383	NC_013922	GTC	2	6	181861	181866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579859
3384	NC_013922	CTG	2	6	181871	181876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579859
3385	NC_013922	CGA	2	6	181907	181912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579859
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3387	NC_013922	GC	3	6	181932	181937	0 %	0 %	50 %	50 %	289579859
3388	NC_013922	CAG	2	6	181959	181964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579859
3389	NC_013922	CGT	2	6	181973	181978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579859
3390	NC_013922	TCG	2	6	182008	182013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579859
3391	NC_013922	CGTC	2	8	182045	182052	0 %	25 %	25 %	50 %	289579859
3392	NC_013922	GCTC	2	8	182063	182070	0 %	25 %	25 %	50 %	289579859
3393	NC_013922	CG	3	6	182091	182096	0 %	0 %	50 %	50 %	289579859
3394	NC_013922	CGTCT	2	10	182139	182148	0 %	40 %	20 %	40 %	289579859
3395	NC_013922	CT	3	6	182182	182187	0 %	50 %	0 %	50 %	289579859
3396	NC_013922	TCG	2	6	182210	182215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579859
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3401	NC_013922	TGT	2	6	182310	182315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579859
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3433	NC_013922	TCG	2	6	183872	183877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579861
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3438	NC_013922	CTG	2	6	184131	184136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579861
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3453	NC_013922	CTG	2	6	184712	184717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579861
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3479	NC_013922	GAGT	2	8	186559	186566	25 %	25 %	50 %	0 %	289579863
3480	NC_013922	CGA	2	6	186622	186627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579863
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3483	NC_013922	GCC	3	9	186735	186743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579863
3484	NC_013922	CGA	2	6	186745	186750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579863
3485	NC_013922	CGT	2	6	186763	186768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579863
3486	NC_013922	CGA	2	6	186895	186900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579863
3487	NC_013922	CGG	2	6	186943	186948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579863
3488	NC_013922	GGGTGT	2	12	186949	186960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579863
3489	NC_013922	GAGTGT	2	12	186961	186972	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	289579863
3490	NC_013922	GT	3	6	186975	186980	0 %	50 %	50 %	0 %	289579863
3491	NC_013922	GTC	2	6	186986	186991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579863
3492	NC_013922	TCG	2	6	187056	187061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579863
3493	NC_013922	GTGACT	2	12	187082	187093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289579863
3494	NC_013922	GTGACT	2	12	187103	187114	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289579863
3495	NC_013922	CGTGGT	2	12	187120	187131	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289579863
3496	NC_013922	CCATGC	2	12	187143	187154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289579863
3497	NC_013922	TCAG	2	8	187188	187195	25 %	25 %	25 %	25 %	289579863
3498	NC_013922	CAC	2	6	187196	187201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579863
3499	NC_013922	CGC	2	6	187333	187338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579863
3500	NC_013922	ATGA	2	8	187852	187859	50 %	25 %	25 %	0 %	289579864

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