MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 80424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013922	CT	3	6	54096	54101	0 %	50 %	0 %	50 %	289579738
1002	NC_013922	ACG	2	6	54141	54146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1003	NC_013922	CGA	2	6	54178	54183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1004	NC_013922	CGA	2	6	54196	54201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1005	NC_013922	TCGA	2	8	54248	54255	25 %	25 %	25 %	25 %	289579738
1006	NC_013922	CGC	2	6	54274	54279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579738
1007	NC_013922	CGA	2	6	54283	54288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1008	NC_013922	CGG	2	6	54360	54365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579738
1009	NC_013922	GTC	2	6	54404	54409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1010	NC_013922	GAC	2	6	54437	54442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1011	NC_013922	CGG	2	6	54459	54464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579738
1012	NC_013922	TCG	2	6	54507	54512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1013	NC_013922	GTC	2	6	54587	54592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1014	NC_013922	CTG	2	6	54624	54629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1015	NC_013922	CGG	2	6	54630	54635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579738
1016	NC_013922	GAT	2	6	54727	54732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579738
1017	NC_013922	GTC	2	6	54827	54832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579738
1018	NC_013922	TTC	2	6	54854	54859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579738
1019	NC_013922	ACTC	2	8	54897	54904	25 %	25 %	0 %	50 %	289579738
1020	NC_013922	CG	3	6	54938	54943	0 %	0 %	50 %	50 %	289579738
1021	NC_013922	TGAGAT	2	12	55116	55127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579739
1022	NC_013922	CGAC	2	8	55173	55180	25 %	0 %	25 %	50 %	289579739
1023	NC_013922	GAC	2	6	55183	55188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579739
1024	NC_013922	TCGCGA	2	12	55202	55213	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	289579739
1025	NC_013922	TCC	2	6	55639	55644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579740
1026	NC_013922	GTTCCT	2	12	55822	55833	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	289579740
1027	NC_013922	GTTCCC	2	12	55834	55845	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	289579740
1028	NC_013922	CTG	2	6	55989	55994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579740
1029	NC_013922	CGA	2	6	56410	56415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579741
1030	NC_013922	AAG	2	6	56501	56506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579741
1031	NC_013922	CTC	2	6	56507	56512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579741
1032	NC_013922	AC	3	6	56668	56673	50 %	0 %	0 %	50 %	289579741
1033	NC_013922	GAT	2	6	56791	56796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579741
1034	NC_013922	CGA	2	6	56797	56802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579741
1035	NC_013922	CGC	2	6	56821	56826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579741
1036	NC_013922	ATCCTG	2	12	57003	57014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	289579741
1037	NC_013922	GCCA	2	8	57170	57177	25 %	0 %	25 %	50 %	289579741
1038	NC_013922	GTAGC	2	10	57228	57237	20 %	20 %	40 %	20 %	289579741
1039	NC_013922	CGC	2	6	57366	57371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579741
1040	NC_013922	GTG	2	6	57391	57396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579741
1041	NC_013922	CGAA	2	8	57424	57431	50 %	0 %	25 %	25 %	289579741
1042	NC_013922	AAC	2	6	57441	57446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579741
1043	NC_013922	GGA	2	6	57499	57504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579741
1044	NC_013922	GGA	2	6	57538	57543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579741
1045	NC_013922	CGA	2	6	57595	57600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579741
1046	NC_013922	CAT	2	6	57674	57679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579742
1047	NC_013922	ACG	2	6	57706	57711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579742
1048	NC_013922	ATC	2	6	57789	57794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579742
1049	NC_013922	AGT	2	6	57803	57808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579742
1050	NC_013922	TCTT	2	8	58344	58351	0 %	75 %	0 %	25 %	289579743
1051	NC_013922	TCT	2	6	58367	58372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579743
1052	NC_013922	CT	3	6	58412	58417	0 %	50 %	0 %	50 %	289579743
1053	NC_013922	AATG	2	8	58546	58553	50 %	25 %	25 %	0 %	289579744
1054	NC_013922	ATC	2	6	58559	58564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579744
1055	NC_013922	TTTTTG	2	12	58608	58619	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	289579744
1056	NC_013922	TA	3	6	58646	58651	50 %	50 %	0 %	0 %	289579744
1057	NC_013922	GTA	2	6	58718	58723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579744
1058	NC_013922	CAGA	2	8	58732	58739	50 %	0 %	25 %	25 %	289579744
1059	NC_013922	ACAG	2	8	58752	58759	50 %	0 %	25 %	25 %	289579744
1060	NC_013922	GGA	2	6	58810	58815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579744
1061	NC_013922	ATG	2	6	58908	58913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579744
1062	NC_013922	CCG	2	6	58933	58938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579744
1063	NC_013922	GAAGA	2	10	58961	58970	60 %	0 %	40 %	0 %	289579744
1064	NC_013922	AG	3	6	58993	58998	50 %	0 %	50 %	0 %	289579744
1065	NC_013922	GAAGG	2	10	59042	59051	40 %	0 %	60 %	0 %	289579744
1066	NC_013922	GAA	2	6	59165	59170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579744
1067	NC_013922	AAT	2	6	59276	59281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579744
1068	NC_013922	AGA	2	6	59329	59334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579744
1069	NC_013922	GAT	2	6	59384	59389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579744
1070	NC_013922	AGA	2	6	59665	59670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579744
1071	NC_013922	CAGA	2	8	59683	59690	50 %	0 %	25 %	25 %	289579744
1072	NC_013922	CT	3	6	59764	59769	0 %	50 %	0 %	50 %	289579745
1073	NC_013922	ATC	2	6	59831	59836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1074	NC_013922	TGC	2	6	59837	59842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579745
1075	NC_013922	TTA	2	6	59909	59914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579745
1076	NC_013922	TG	5	10	59940	59949	0 %	50 %	50 %	0 %	289579745
1077	NC_013922	AAT	2	6	60038	60043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579745
1078	NC_013922	CCT	2	6	60069	60074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579745
1079	NC_013922	CTC	2	6	60085	60090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579745
1080	NC_013922	AT	3	6	60118	60123	50 %	50 %	0 %	0 %	289579745
1081	NC_013922	GTATA	2	10	60161	60170	40 %	40 %	20 %	0 %	289579745
1082	NC_013922	ATT	2	6	60226	60231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579745
1083	NC_013922	TCT	2	6	60242	60247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579745
1084	NC_013922	TGA	2	6	60291	60296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579745
1085	NC_013922	CAT	2	6	60303	60308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1086	NC_013922	ATA	2	6	60376	60381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579745
1087	NC_013922	CAT	2	6	60433	60438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1088	NC_013922	TAA	2	6	60445	60450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579745
1089	NC_013922	CTG	2	6	60510	60515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579745
1090	NC_013922	CTA	2	6	60533	60538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1091	NC_013922	AT	3	6	60568	60573	50 %	50 %	0 %	0 %	289579745
1092	NC_013922	ACA	2	6	60644	60649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579745
1093	NC_013922	ATT	2	6	60742	60747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579745
1094	NC_013922	GACG	2	8	60820	60827	25 %	0 %	50 %	25 %	289579745
1095	NC_013922	TCT	2	6	60839	60844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579745
1096	NC_013922	ATC	3	9	60886	60894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1097	NC_013922	GATT	2	8	60918	60925	25 %	50 %	25 %	0 %	289579745
1098	NC_013922	GAC	2	6	61020	61025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579745
1099	NC_013922	TGA	2	6	61097	61102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579745
1100	NC_013922	A	6	6	61129	61134	100 %	0 %	0 %	0 %	289579745
1101	NC_013922	TCT	2	6	61214	61219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579745
1102	NC_013922	CAT	2	6	61245	61250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1103	NC_013922	ATT	2	6	61255	61260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579745
1104	NC_013922	TGG	2	6	61342	61347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579745
1105	NC_013922	TC	4	8	61357	61364	0 %	50 %	0 %	50 %	289579745
1106	NC_013922	T	6	6	61371	61376	0 %	100 %	0 %	0 %	289579745
1107	NC_013922	AGT	2	6	61422	61427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579745
1108	NC_013922	ATA	2	6	61449	61454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579745
1109	NC_013922	AT	3	6	61519	61524	50 %	50 %	0 %	0 %	289579745
1110	NC_013922	TGA	2	6	61612	61617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579745
1111	NC_013922	ATGA	2	8	61658	61665	50 %	25 %	25 %	0 %	289579745
1112	NC_013922	ATC	2	6	61682	61687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1113	NC_013922	AGA	2	6	61691	61696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579745
1114	NC_013922	GGTT	2	8	61711	61718	0 %	50 %	50 %	0 %	289579745
1115	NC_013922	TGTT	2	8	61734	61741	0 %	75 %	25 %	0 %	289579745
1116	NC_013922	AGA	4	12	61803	61814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579745
1117	NC_013922	CAT	2	6	61834	61839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579745
1118	NC_013922	ATA	2	6	62617	62622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579746
1119	NC_013922	AT	3	6	62633	62638	50 %	50 %	0 %	0 %	289579746
1120	NC_013922	TCG	2	6	62639	62644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579746
1121	NC_013922	TCT	2	6	62672	62677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579746
1122	NC_013922	ATA	2	6	62782	62787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289579746
1123	NC_013922	GA	3	6	62801	62806	50 %	0 %	50 %	0 %	289579746
1124	NC_013922	AAC	2	6	62988	62993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579746
1125	NC_013922	CGG	2	6	63024	63029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579746
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1243	NC_013922	CGA	2	6	70136	70141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579751
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1246	NC_013922	CCG	2	6	70529	70534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579752
1247	NC_013922	CTCG	2	8	70542	70549	0 %	25 %	25 %	50 %	289579752
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1249	NC_013922	GGTCG	2	10	70590	70599	0 %	20 %	60 %	20 %	289579752
1250	NC_013922	GTC	2	6	70641	70646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579752
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1359	NC_013922	GCA	2	6	76855	76860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579756
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1361	NC_013922	GCAC	2	8	76886	76893	25 %	0 %	25 %	50 %	289579756
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1367	NC_013922	CCCGT	2	10	77101	77110	0 %	20 %	20 %	60 %	289579756
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1496	NC_013922	TCC	2	6	83514	83519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579761
1497	NC_013922	CGG	3	9	83524	83532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579761
1498	NC_013922	GCG	2	6	83552	83557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579761
1499	NC_013922	TTG	2	6	83588	83593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579761
1500	NC_013922	GTGTT	2	10	83594	83603	0 %	60 %	40 %	0 %	289579761

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