MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Natrialba magadii ATCC 43099 chromosome

Total Repeats: 80424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013922	ACG	2	6	257913	257918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5002	NC_013922	CCG	2	6	257943	257948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579951
5003	NC_013922	GTC	2	6	258072	258077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5004	NC_013922	CAT	2	6	258080	258085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579951
5005	NC_013922	GTC	2	6	258111	258116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5006	NC_013922	GAT	2	6	258173	258178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
5007	NC_013922	CGA	2	6	258193	258198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5008	NC_013922	CGT	2	6	258201	258206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5009	NC_013922	GAA	2	6	258251	258256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
5010	NC_013922	GAA	2	6	258281	258286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
5011	NC_013922	CAG	2	6	258305	258310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5012	NC_013922	CAACAG	2	12	258365	258376	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	289579951
5013	NC_013922	AGT	2	6	258384	258389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579951
5014	NC_013922	CAT	2	6	258407	258412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579951
5015	NC_013922	GT	3	6	258589	258594	0 %	50 %	50 %	0 %	289579951
5016	NC_013922	TCCA	2	8	258625	258632	25 %	25 %	0 %	50 %	289579951
5017	NC_013922	GAA	2	6	258653	258658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
5018	NC_013922	ACC	2	6	258666	258671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579951
5019	NC_013922	GT	3	6	258818	258823	0 %	50 %	50 %	0 %	289579951
5020	NC_013922	CCCG	2	8	258866	258873	0 %	0 %	25 %	75 %	289579951
5021	NC_013922	CAG	2	6	258917	258922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5022	NC_013922	GAA	2	6	258926	258931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579951
5023	NC_013922	TCG	2	6	258973	258978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579951
5024	NC_013922	TGG	2	6	259007	259012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579951
5025	NC_013922	ATT	2	6	259023	259028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289579951
5026	NC_013922	CCTC	2	8	259034	259041	0 %	25 %	0 %	75 %	289579952
5027	NC_013922	GTC	2	6	259045	259050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5028	NC_013922	TCG	2	6	259082	259087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5029	NC_013922	CTT	2	6	259107	259112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
5030	NC_013922	CAT	2	6	259113	259118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579952
5031	NC_013922	TCG	2	6	259124	259129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5032	NC_013922	TCG	2	6	259208	259213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5033	NC_013922	TCG	2	6	259289	259294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5034	NC_013922	TCC	2	6	259316	259321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579952
5035	NC_013922	CGAGTT	2	12	259347	259358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	289579952
5036	NC_013922	TTC	2	6	259378	259383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
5037	NC_013922	CTC	2	6	259441	259446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579952
5038	NC_013922	CAG	2	6	259467	259472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5039	NC_013922	CA	3	6	259494	259499	50 %	0 %	0 %	50 %	289579952
5040	NC_013922	TCT	2	6	259529	259534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
5041	NC_013922	CGA	2	6	259539	259544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5042	NC_013922	TC	3	6	259560	259565	0 %	50 %	0 %	50 %	289579952
5043	NC_013922	ACG	2	6	259664	259669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5044	NC_013922	TCGACC	2	12	259730	259741	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289579952
5045	NC_013922	GTCCG	2	10	259765	259774	0 %	20 %	40 %	40 %	289579952
5046	NC_013922	CGA	3	9	259779	259787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5047	NC_013922	ACC	2	6	259808	259813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579952
5048	NC_013922	GAT	2	6	259825	259830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579952
5049	NC_013922	CTT	2	6	259858	259863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579952
5050	NC_013922	TCG	2	6	259910	259915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5051	NC_013922	ACG	2	6	259973	259978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5052	NC_013922	CGA	2	6	259983	259988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579952
5053	NC_013922	CCGAGG	2	12	259994	260005	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289579952
5054	NC_013922	AGA	2	6	260617	260622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579953
5055	NC_013922	CGA	2	6	260656	260661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579953
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5057	NC_013922	CCA	2	6	260753	260758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579953
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5059	NC_013922	CGA	2	6	260866	260871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579953
5060	NC_013922	GAC	2	6	260975	260980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579954
5061	NC_013922	ACG	3	9	260992	261000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579954
5062	NC_013922	TTCGG	2	10	261046	261055	0 %	40 %	40 %	20 %	289579954
5063	NC_013922	GGGC	2	8	261102	261109	0 %	0 %	75 %	25 %	289579954
5064	NC_013922	TCG	2	6	261168	261173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579954
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5067	NC_013922	GGCA	2	8	261639	261646	25 %	0 %	50 %	25 %	289579955
5068	NC_013922	CGA	2	6	261672	261677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579955
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5070	NC_013922	GTC	2	6	261808	261813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579955
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5087	NC_013922	TCA	2	6	262484	262489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579956
5088	NC_013922	TGA	2	6	262546	262551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579956
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5092	NC_013922	GTA	2	6	262786	262791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579956
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5098	NC_013922	ACTC	2	8	263109	263116	25 %	25 %	0 %	50 %	289579956
5099	NC_013922	GTC	2	6	263137	263142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579956
5100	NC_013922	TC	3	6	263193	263198	0 %	50 %	0 %	50 %	289579956
5101	NC_013922	ATCG	2	8	263203	263210	25 %	25 %	25 %	25 %	289579956
5102	NC_013922	ACC	2	6	263231	263236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579956
5103	NC_013922	TGG	2	6	263258	263263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579956
5104	NC_013922	GTA	2	6	263266	263271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579956
5105	NC_013922	GGC	2	6	263276	263281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579956
5106	NC_013922	CGT	2	6	263352	263357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579956
5107	NC_013922	TCTGT	2	10	263399	263408	0 %	60 %	20 %	20 %	289579956
5108	NC_013922	CAC	2	6	263412	263417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579956
5109	NC_013922	TTC	2	6	263422	263427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579956
5110	NC_013922	GTG	2	6	263455	263460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579956
5111	NC_013922	GTC	3	9	263516	263524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579956
5112	NC_013922	TTG	2	6	263536	263541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579956
5113	NC_013922	AACG	2	8	263551	263558	50 %	0 %	25 %	25 %	289579956
5114	NC_013922	CTGCTC	2	12	263569	263580	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	289579956
5115	NC_013922	TGA	2	6	263601	263606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579956
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5117	NC_013922	CAG	2	6	263674	263679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579956
5118	NC_013922	GAC	2	6	263681	263686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579956
5119	NC_013922	CTC	2	6	263993	263998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579957
5120	NC_013922	CGA	2	6	264035	264040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579957
5121	NC_013922	CGG	2	6	264044	264049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579957
5122	NC_013922	CGA	2	6	264134	264139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579957
5123	NC_013922	ACG	2	6	264169	264174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579957
5124	NC_013922	TCG	2	6	264201	264206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579957
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5126	NC_013922	GCT	2	6	264431	264436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579957
5127	NC_013922	TGA	2	6	264448	264453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579957
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5130	NC_013922	GAAC	2	8	264581	264588	50 %	0 %	25 %	25 %	289579957
5131	NC_013922	GAG	2	6	264591	264596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579957
5132	NC_013922	GAG	2	6	264603	264608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579957
5133	NC_013922	CGT	2	6	264752	264757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579957
5134	NC_013922	CGT	2	6	264773	264778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579957
5135	NC_013922	GACTG	2	10	264780	264789	20 %	20 %	40 %	20 %	289579957
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5142	NC_013922	GAG	2	6	265349	265354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579958
5143	NC_013922	CGAC	2	8	265378	265385	25 %	0 %	25 %	50 %	289579958
5144	NC_013922	GAC	2	6	265412	265417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579958
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5148	NC_013922	GAG	2	6	265526	265531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579958
5149	NC_013922	GCGA	2	8	265574	265581	25 %	0 %	50 %	25 %	289579958
5150	NC_013922	GAG	2	6	265595	265600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579958
5151	NC_013922	TAC	2	6	265601	265606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579958
5152	NC_013922	GAG	2	6	265703	265708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579958
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5158	NC_013922	GGCCGA	2	12	265916	265927	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	289579959
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5178	NC_013922	CG	3	6	267589	267594	0 %	0 %	50 %	50 %	289579961
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5180	NC_013922	GCGG	2	8	267618	267625	0 %	0 %	75 %	25 %	289579961
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5186	NC_013922	CGC	2	6	267844	267849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579961
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5191	NC_013922	ACG	2	6	268321	268326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579962
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5201	NC_013922	GGT	2	6	268609	268614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289579962
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5220	NC_013922	GCG	2	6	269270	269275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579964
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5223	NC_013922	GCG	2	6	269455	269460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579964
5224	NC_013922	CGAA	2	8	269474	269481	50 %	0 %	25 %	25 %	289579964
5225	NC_013922	CGAGT	2	10	269517	269526	20 %	20 %	40 %	20 %	289579964
5226	NC_013922	TACG	2	8	269548	269555	25 %	25 %	25 %	25 %	289579964
5227	NC_013922	TCG	2	6	269559	269564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579964
5228	NC_013922	TCG	2	6	269584	269589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579964
5229	NC_013922	GGAG	2	8	269631	269638	25 %	0 %	75 %	0 %	289579964
5230	NC_013922	ACC	2	6	269678	269683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579964
5231	NC_013922	ACC	2	6	269795	269800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579964
5232	NC_013922	ACC	2	6	269807	269812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579964
5233	NC_013922	CAA	2	6	269832	269837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579964
5234	NC_013922	ACA	2	6	269849	269854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289579964
5235	NC_013922	GGCGTG	2	12	269856	269867	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	289579964
5236	NC_013922	GAG	2	6	269899	269904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289579964
5237	NC_013922	GCT	2	6	269907	269912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579964
5238	NC_013922	CGGAC	2	10	269943	269952	20 %	0 %	40 %	40 %	289579964
5239	NC_013922	ACG	2	6	270020	270025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579964
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5241	NC_013922	TGA	2	6	270065	270070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579964
5242	NC_013922	CGC	2	6	270095	270100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289579964
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5359	NC_013922	CGA	2	6	275683	275688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579974
5360	NC_013922	AGC	2	6	275758	275763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579974
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5363	NC_013922	CGT	2	6	275917	275922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579974
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5471	NC_013922	GCG	2	6	280857	280862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579979
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5477	NC_013922	TCT	2	6	281078	281083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289579980
5478	NC_013922	TCA	2	6	281090	281095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579980
5479	NC_013922	CAC	2	6	281121	281126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579980
5480	NC_013922	ATC	2	6	281155	281160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289579980
5481	NC_013922	GTC	2	6	281185	281190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579980
5482	NC_013922	CCA	2	6	281285	281290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289579980
5483	NC_013922	GCTC	2	8	281375	281382	0 %	25 %	25 %	50 %	289579980
5484	NC_013922	TTG	2	6	281424	281429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289579980
5485	NC_013922	CG	3	6	281764	281769	0 %	0 %	50 %	50 %	289579981
5486	NC_013922	AGC	2	6	281824	281829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579981
5487	NC_013922	ACGA	2	8	281846	281853	50 %	0 %	25 %	25 %	289579981
5488	NC_013922	TGGC	2	8	281971	281978	0 %	25 %	50 %	25 %	289579981
5489	NC_013922	TGA	3	9	281992	282000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289579981
5490	NC_013922	CGG	2	6	282043	282048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289579981
5491	NC_013922	CGT	2	6	282075	282080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289579981
5492	NC_013922	CGA	2	6	282157	282162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579981
5493	NC_013922	CGA	2	6	282178	282183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579981
5494	NC_013922	GCCC	2	8	282185	282192	0 %	0 %	25 %	75 %	289579981
5495	NC_013922	TCGG	2	8	282213	282220	0 %	25 %	50 %	25 %	289579981
5496	NC_013922	CTC	2	6	282266	282271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289579981
5497	NC_013922	GAA	2	6	282386	282391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289579981
5498	NC_013922	GC	3	6	282570	282575	0 %	0 %	50 %	50 %	289579982
5499	NC_013922	CGGT	2	8	282579	282586	0 %	25 %	50 %	25 %	289579982
5500	NC_013922	CAG	2	6	282631	282636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289579982

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