MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 37742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013016	TTG	2	6	226321	226326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804222
4002	NC_013016	TCG	2	6	226342	226347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804222
4003	NC_013016	CCG	2	6	226396	226401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804222
4004	NC_013016	GGC	2	6	226457	226462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804222
4005	NC_013016	CAG	2	6	226475	226480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804222
4006	NC_013016	TGA	2	6	226513	226518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804222
4007	NC_013016	GGGC	2	8	226594	226601	0 %	0 %	75 %	25 %	254804222
4008	NC_013016	CTGG	2	8	226676	226683	0 %	25 %	50 %	25 %	254804222
4009	NC_013016	AAC	2	6	226719	226724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804222
4010	NC_013016	CCG	2	6	226765	226770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804222
4011	NC_013016	GC	3	6	226844	226849	0 %	0 %	50 %	50 %	254804222
4012	NC_013016	GGT	2	6	226862	226867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804222
4013	NC_013016	GCG	3	9	227033	227041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4014	NC_013016	GGCG	2	8	227065	227072	0 %	0 %	75 %	25 %	254804223
4015	NC_013016	GCG	2	6	227075	227080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4016	NC_013016	CGG	2	6	227083	227088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4017	NC_013016	CGG	2	6	227131	227136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4018	NC_013016	CAG	2	6	227260	227265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804223
4019	NC_013016	GCA	2	6	227323	227328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804223
4020	NC_013016	GCG	2	6	227331	227336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4021	NC_013016	TGC	2	6	227350	227355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804223
4022	NC_013016	CGG	2	6	227442	227447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4023	NC_013016	GCG	2	6	227448	227453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804223
4024	NC_013016	A	6	6	227519	227524	100 %	0 %	0 %	0 %	254804224
4025	NC_013016	TCC	2	6	227525	227530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254804224
4026	NC_013016	TCA	2	6	227532	227537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804224
4027	NC_013016	GGCAT	2	10	227567	227576	20 %	20 %	40 %	20 %	254804224
4028	NC_013016	GCC	2	6	227579	227584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804224
4029	NC_013016	CCGC	2	8	227661	227668	0 %	0 %	25 %	75 %	254804224
4030	NC_013016	CTG	2	6	227795	227800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804224
4031	NC_013016	A	6	6	227833	227838	100 %	0 %	0 %	0 %	254804224
4032	NC_013016	CAACGT	2	12	227842	227853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254804224
4033	NC_013016	GGC	2	6	227879	227884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804224
4034	NC_013016	ATC	2	6	227891	227896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804224
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4036	NC_013016	CAA	2	6	227965	227970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804224
4037	NC_013016	ATC	2	6	228041	228046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804224
4038	NC_013016	GCA	2	6	228096	228101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804224
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4040	NC_013016	CAA	2	6	228177	228182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804225
4041	NC_013016	GCG	2	6	228200	228205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804225
4042	NC_013016	CCG	3	9	228227	228235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804225
4043	NC_013016	GTC	2	6	228260	228265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804225
4044	NC_013016	CG	3	6	228277	228282	0 %	0 %	50 %	50 %	254804225
4045	NC_013016	GCG	2	6	228293	228298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804225
4046	NC_013016	GCT	3	9	228327	228335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804225
4047	NC_013016	TGC	2	6	228341	228346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804225
4048	NC_013016	GC	4	8	228393	228400	0 %	0 %	50 %	50 %	254804225
4049	NC_013016	A	7	7	228441	228447	100 %	0 %	0 %	0 %	254804225
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4051	NC_013016	CCCGC	2	10	228505	228514	0 %	0 %	20 %	80 %	254804226
4052	NC_013016	CG	4	8	228590	228597	0 %	0 %	50 %	50 %	254804226
4053	NC_013016	T	7	7	228644	228650	0 %	100 %	0 %	0 %	254804226
4054	NC_013016	GCA	2	6	228679	228684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804226
4055	NC_013016	GGGC	2	8	228758	228765	0 %	0 %	75 %	25 %	254804226
4056	NC_013016	GCGG	2	8	228783	228790	0 %	0 %	75 %	25 %	254804226
4057	NC_013016	ATT	2	6	228853	228858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804226
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4059	NC_013016	CG	3	6	228997	229002	0 %	0 %	50 %	50 %	254804226
4060	NC_013016	GCC	2	6	229038	229043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804226
4061	NC_013016	CG	3	6	229063	229068	0 %	0 %	50 %	50 %	254804226
4062	NC_013016	ACATCG	2	12	229132	229143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254804226
4063	NC_013016	CGGCG	2	10	229169	229178	0 %	0 %	60 %	40 %	254804226
4064	NC_013016	AAG	2	6	229192	229197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804226
4065	NC_013016	AGC	2	6	229223	229228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804226
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4067	NC_013016	CG	3	6	229367	229372	0 %	0 %	50 %	50 %	254804227
4068	NC_013016	ACC	2	6	229469	229474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804227
4069	NC_013016	GACT	2	8	229481	229488	25 %	25 %	25 %	25 %	254804227
4070	NC_013016	CCG	2	6	229541	229546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804227
4071	NC_013016	CGC	2	6	229590	229595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804227
4072	NC_013016	TCA	2	6	229688	229693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804227
4073	NC_013016	TGA	2	6	229750	229755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804227
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4078	NC_013016	A	7	7	230135	230141	100 %	0 %	0 %	0 %	254804228
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4082	NC_013016	CGCC	2	8	230214	230221	0 %	0 %	25 %	75 %	254804228
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4093	NC_013016	TCG	2	6	231599	231604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804229
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4103	NC_013016	T	6	6	232438	232443	0 %	100 %	0 %	0 %	254804230
4104	NC_013016	TGT	2	6	232514	232519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804230
4105	NC_013016	TA	3	6	232537	232542	50 %	50 %	0 %	0 %	254804230
4106	NC_013016	ACA	2	6	232555	232560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804230
4107	NC_013016	A	6	6	232594	232599	100 %	0 %	0 %	0 %	254804230
4108	NC_013016	TAT	2	6	232600	232605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804230
4109	NC_013016	T	6	6	232738	232743	0 %	100 %	0 %	0 %	254804231
4110	NC_013016	GCCC	3	12	232777	232788	0 %	0 %	25 %	75 %	254804231
4111	NC_013016	GCT	3	9	232812	232820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
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4113	NC_013016	GGCA	2	8	232914	232921	25 %	0 %	50 %	25 %	254804231
4114	NC_013016	ACC	2	6	232971	232976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804231
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4118	NC_013016	GCC	3	9	233203	233211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804231
4119	NC_013016	GCC	3	9	233215	233223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804231
4120	NC_013016	TGC	2	6	233231	233236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4121	NC_013016	GCC	2	6	233269	233274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804231
4122	NC_013016	GCA	2	6	233314	233319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4123	NC_013016	GCA	2	6	233329	233334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4124	NC_013016	TGC	2	6	233345	233350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4125	NC_013016	TCCG	2	8	233372	233379	0 %	25 %	25 %	50 %	254804231
4126	NC_013016	GCT	2	6	233454	233459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4127	NC_013016	CGA	2	6	233499	233504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4128	NC_013016	CGG	2	6	233523	233528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804231
4129	NC_013016	GTTT	2	8	233555	233562	0 %	75 %	25 %	0 %	254804231
4130	NC_013016	CGAC	2	8	233645	233652	25 %	0 %	25 %	50 %	254804231
4131	NC_013016	CGT	2	6	233667	233672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4132	NC_013016	TGC	2	6	233693	233698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4133	NC_013016	GCT	2	6	233739	233744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4134	NC_013016	CCG	2	6	233746	233751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804231
4135	NC_013016	CGGCG	2	10	233763	233772	0 %	0 %	60 %	40 %	254804231
4136	NC_013016	GGCGC	2	10	233789	233798	0 %	0 %	60 %	40 %	254804231
4137	NC_013016	GGC	2	6	233799	233804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804231
4138	NC_013016	CGC	2	6	233910	233915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804231
4139	NC_013016	TAT	2	6	233929	233934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804231
4140	NC_013016	GGCA	2	8	234022	234029	25 %	0 %	50 %	25 %	254804231
4141	NC_013016	GGC	2	6	234045	234050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804231
4142	NC_013016	TGA	2	6	234077	234082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804231
4143	NC_013016	GTC	2	6	234127	234132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804231
4144	NC_013016	GGC	3	9	234205	234213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804231
4145	NC_013016	GC	3	6	234352	234357	0 %	0 %	50 %	50 %	254804231
4146	NC_013016	CAA	2	6	234363	234368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804231
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4148	NC_013016	ACA	2	6	234418	234423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804231
4149	NC_013016	ATG	2	6	234531	234536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804232
4150	NC_013016	ACA	2	6	234634	234639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804232
4151	NC_013016	TGC	2	6	234706	234711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804232
4152	NC_013016	CAT	2	6	234722	234727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804232
4153	NC_013016	CGA	2	6	234740	234745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804232
4154	NC_013016	GGCCGG	2	12	234792	234803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804232
4155	NC_013016	CGC	2	6	234863	234868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804232
4156	NC_013016	CAA	2	6	234872	234877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804232
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4158	NC_013016	AGCAAA	2	12	234939	234950	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	254804232
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4160	NC_013016	GCT	2	6	234998	235003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804232
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4162	NC_013016	GCCGC	2	10	235044	235053	0 %	0 %	40 %	60 %	254804232
4163	NC_013016	CCG	2	6	235111	235116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804232
4164	NC_013016	CCA	2	6	235218	235223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804233
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4168	NC_013016	CCGC	2	8	235410	235417	0 %	0 %	25 %	75 %	254804233
4169	NC_013016	CGG	2	6	235420	235425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804233
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4172	NC_013016	AAAT	2	8	235595	235602	75 %	25 %	0 %	0 %	254804233
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4178	NC_013016	TCG	2	6	236235	236240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804235
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4201	NC_013016	GGCA	2	8	237346	237353	25 %	0 %	50 %	25 %	254804237
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4203	NC_013016	GC	3	6	237390	237395	0 %	0 %	50 %	50 %	254804237
4204	NC_013016	CGGT	2	8	237524	237531	0 %	25 %	50 %	25 %	254804237
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4210	NC_013016	GGA	2	6	237735	237740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804237
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4212	NC_013016	GCT	2	6	237836	237841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804237
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4230	NC_013016	CAA	2	6	238348	238353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804237
4231	NC_013016	CGG	2	6	238425	238430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804237
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4233	NC_013016	GC	3	6	238481	238486	0 %	0 %	50 %	50 %	254804237
4234	NC_013016	TGCG	2	8	238536	238543	0 %	25 %	50 %	25 %	254804237
4235	NC_013016	GGC	2	6	238612	238617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804237
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4237	NC_013016	GCT	2	6	238666	238671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804237
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4239	NC_013016	GT	3	6	238777	238782	0 %	50 %	50 %	0 %	254804237
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4241	NC_013016	GCC	2	6	238808	238813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804237
4242	NC_013016	AGC	2	6	238814	238819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804237
4243	NC_013016	GGTA	2	8	238841	238848	25 %	25 %	50 %	0 %	254804237
4244	NC_013016	ATT	2	6	239384	239389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804238
4245	NC_013016	CG	3	6	239418	239423	0 %	0 %	50 %	50 %	254804238
4246	NC_013016	GCC	2	6	239603	239608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804238
4247	NC_013016	CAG	2	6	239648	239653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804238
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4249	NC_013016	A	6	6	239727	239732	100 %	0 %	0 %	0 %	254804238
4250	NC_013016	GC	3	6	239738	239743	0 %	0 %	50 %	50 %	254804238
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4254	NC_013016	CAA	2	6	239941	239946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804238
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4258	NC_013016	GTC	2	6	240038	240043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804238
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4321	NC_013016	TCAA	2	8	243674	243681	50 %	25 %	0 %	25 %	254804243
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4324	NC_013016	CAATG	2	10	243914	243923	40 %	20 %	20 %	20 %	254804243
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4350	NC_013016	TTTC	2	8	245266	245273	0 %	75 %	0 %	25 %	254804245
4351	NC_013016	GTT	2	6	245298	245303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804245
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4353	NC_013016	GGC	2	6	245364	245369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804245
4354	NC_013016	ATT	2	6	245416	245421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804245
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4356	NC_013016	ATG	2	6	245516	245521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804245
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4358	NC_013016	CAAAC	2	10	245718	245727	60 %	0 %	0 %	40 %	254804246
4359	NC_013016	TGAT	2	8	245746	245753	25 %	50 %	25 %	0 %	254804246
4360	NC_013016	CTG	2	6	245784	245789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804246
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4362	NC_013016	ATC	2	6	245923	245928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804247
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4366	NC_013016	GCC	2	6	246139	246144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804247
4367	NC_013016	GAA	2	6	246154	246159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804247
4368	NC_013016	CTT	2	6	246173	246178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804247
4369	NC_013016	GGC	2	6	246183	246188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804247
4370	NC_013016	GC	3	6	246187	246192	0 %	0 %	50 %	50 %	254804247
4371	NC_013016	A	7	7	246429	246435	100 %	0 %	0 %	0 %	254804248
4372	NC_013016	TTGG	2	8	246448	246455	0 %	50 %	50 %	0 %	254804248
4373	NC_013016	GCG	2	6	246473	246478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804248
4374	NC_013016	GTT	2	6	246479	246484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804248
4375	NC_013016	GGAAG	2	10	246487	246496	40 %	0 %	60 %	0 %	254804248
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4378	NC_013016	CTG	2	6	246925	246930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804249
4379	NC_013016	TCTG	2	8	246965	246972	0 %	50 %	25 %	25 %	254804249
4380	NC_013016	ATGCA	2	10	247048	247057	40 %	20 %	20 %	20 %	254804249
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4383	NC_013016	A	6	6	247300	247305	100 %	0 %	0 %	0 %	254804249
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4385	NC_013016	GTCG	2	8	247386	247393	0 %	25 %	50 %	25 %	254804249
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4395	NC_013016	GGC	2	6	248120	248125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804249
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4403	NC_013016	TGC	2	6	248929	248934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804250
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4442	NC_013016	ATC	2	6	251650	251655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804253
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4450	NC_013016	ACC	2	6	252215	252220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804253
4451	NC_013016	GCT	2	6	252273	252278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804253
4452	NC_013016	GAA	2	6	252325	252330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804253
4453	NC_013016	GCCTT	2	10	252338	252347	0 %	40 %	20 %	40 %	254804253
4454	NC_013016	GCCT	2	8	252348	252355	0 %	25 %	25 %	50 %	254804253
4455	NC_013016	CG	4	8	252399	252406	0 %	0 %	50 %	50 %	254804253
4456	NC_013016	TGC	2	6	252528	252533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804253
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4463	NC_013016	AAT	2	6	253105	253110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804255
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4467	NC_013016	A	6	6	253264	253269	100 %	0 %	0 %	0 %	254804255
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4475	NC_013016	GGCA	2	8	253742	253749	25 %	0 %	50 %	25 %	254804255
4476	NC_013016	GCC	2	6	253771	253776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804255
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4483	NC_013016	CAT	2	6	253989	253994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804255
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4485	NC_013016	TGCG	2	8	254015	254022	0 %	25 %	50 %	25 %	254804255
4486	NC_013016	TTC	2	6	254041	254046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804255
4487	NC_013016	ACAA	2	8	254048	254055	75 %	0 %	0 %	25 %	254804255
4488	NC_013016	GCC	2	6	254078	254083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804255
4489	NC_013016	CAA	2	6	254112	254117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804255
4490	NC_013016	CGC	2	6	254160	254165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804255
4491	NC_013016	GCC	4	12	254194	254205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804255
4492	NC_013016	CGCGC	2	10	254209	254218	0 %	0 %	40 %	60 %	254804255
4493	NC_013016	GAA	2	6	254317	254322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804255
4494	NC_013016	AGC	2	6	254339	254344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804255
4495	NC_013016	GCGCC	2	10	254487	254496	0 %	0 %	40 %	60 %	254804255
4496	NC_013016	GAAC	2	8	254541	254548	50 %	0 %	25 %	25 %	254804255
4497	NC_013016	CCG	2	6	254612	254617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804255
4498	NC_013016	GC	3	6	254629	254634	0 %	0 %	50 %	50 %	254804255
4499	NC_013016	TGC	2	6	254645	254650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804255
4500	NC_013016	GCC	2	6	254677	254682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804255

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