MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 37742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013016	GCT	3	9	194104	194112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804202
3502	NC_013016	TGC	2	6	194118	194123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804202
3503	NC_013016	ACGAAC	2	12	194157	194168	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	254804202
3504	NC_013016	GAA	2	6	194180	194185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804202
3505	NC_013016	CAGG	2	8	194343	194350	25 %	0 %	50 %	25 %	254804203
3506	NC_013016	CCG	2	6	194429	194434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804203
3507	NC_013016	GC	3	6	194442	194447	0 %	0 %	50 %	50 %	254804203
3508	NC_013016	AGC	2	6	194497	194502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804203
3509	NC_013016	CTT	2	6	194510	194515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804203
3510	NC_013016	CGA	2	6	194570	194575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804203
3511	NC_013016	TGA	2	6	194623	194628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804203
3512	NC_013016	CAT	2	6	194633	194638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804203
3513	NC_013016	GGGCG	2	10	194642	194651	0 %	0 %	80 %	20 %	254804203
3514	NC_013016	CGC	2	6	194667	194672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804203
3515	NC_013016	CAA	2	6	194727	194732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804203
3516	NC_013016	CGC	3	9	194867	194875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804203
3517	NC_013016	CGG	2	6	194906	194911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804203
3518	NC_013016	CAAAAT	2	12	194925	194936	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	254804203
3519	NC_013016	GAT	2	6	195003	195008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804203
3520	NC_013016	TGT	2	6	195022	195027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804203
3521	NC_013016	TTG	2	6	195076	195081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804203
3522	NC_013016	GACG	2	8	195147	195154	25 %	0 %	50 %	25 %	254804203
3523	NC_013016	CG	3	6	195169	195174	0 %	0 %	50 %	50 %	254804203
3524	NC_013016	A	6	6	195281	195286	100 %	0 %	0 %	0 %	254804203
3525	NC_013016	CGC	2	6	195302	195307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804203
3526	NC_013016	GCC	2	6	195310	195315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804203
3527	NC_013016	CCG	2	6	195334	195339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804203
3528	NC_013016	TGA	2	6	195380	195385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804203
3529	NC_013016	GCG	2	6	195500	195505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804203
3530	NC_013016	GTTTTC	2	12	195561	195572	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	254804204
3531	NC_013016	GCTT	2	8	195600	195607	0 %	50 %	25 %	25 %	254804204
3532	NC_013016	CTT	2	6	195654	195659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804204
3533	NC_013016	AGG	2	6	195701	195706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804204
3534	NC_013016	GCC	2	6	195713	195718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804204
3535	NC_013016	A	6	6	195721	195726	100 %	0 %	0 %	0 %	254804204
3536	NC_013016	TCA	2	6	195738	195743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804204
3537	NC_013016	CTTT	2	8	195750	195757	0 %	75 %	0 %	25 %	254804204
3538	NC_013016	ATG	2	6	195813	195818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804205
3539	NC_013016	CG	3	6	195837	195842	0 %	0 %	50 %	50 %	254804205
3540	NC_013016	ATT	2	6	195851	195856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804205
3541	NC_013016	CGA	2	6	195878	195883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804205
3542	NC_013016	ATC	2	6	195954	195959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804205
3543	NC_013016	GCC	2	6	195996	196001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804205
3544	NC_013016	GCG	2	6	196006	196011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804205
3545	NC_013016	TGGC	2	8	196041	196048	0 %	25 %	50 %	25 %	254804205
3546	NC_013016	CG	3	6	196051	196056	0 %	0 %	50 %	50 %	254804205
3547	NC_013016	ATG	2	6	196072	196077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804205
3548	NC_013016	GAC	2	6	197315	197320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804206
3549	NC_013016	GAT	2	6	197438	197443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804206
3550	NC_013016	CAGG	2	8	197507	197514	25 %	0 %	50 %	25 %	254804206
3551	NC_013016	GGC	2	6	197543	197548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804206
3552	NC_013016	CTA	2	6	197651	197656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804207
3553	NC_013016	ATGC	2	8	197684	197691	25 %	25 %	25 %	25 %	254804207
3554	NC_013016	CCG	2	6	197694	197699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804207
3555	NC_013016	CAA	2	6	197773	197778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804207
3556	NC_013016	CCTG	2	8	197785	197792	0 %	25 %	25 %	50 %	254804207
3557	NC_013016	AC	3	6	197803	197808	50 %	0 %	0 %	50 %	254804207
3558	NC_013016	AACGGC	2	12	197849	197860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804207
3559	NC_013016	ATC	2	6	197867	197872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804207
3560	NC_013016	CAG	2	6	197936	197941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804207
3561	NC_013016	CTCG	2	8	198046	198053	0 %	25 %	25 %	50 %	254804207
3562	NC_013016	GCA	2	6	198061	198066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804207
3563	NC_013016	GC	3	6	198086	198091	0 %	0 %	50 %	50 %	254804207
3564	NC_013016	GCT	2	6	198136	198141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804207
3565	NC_013016	CTC	3	9	198315	198323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254804208
3566	NC_013016	CG	3	6	198348	198353	0 %	0 %	50 %	50 %	254804208
3567	NC_013016	GC	3	6	198403	198408	0 %	0 %	50 %	50 %	254804208
3568	NC_013016	ATT	2	6	198460	198465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804208
3569	NC_013016	GGT	2	6	198470	198475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804208
3570	NC_013016	GAA	2	6	198516	198521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804208
3571	NC_013016	CGCC	2	8	198534	198541	0 %	0 %	25 %	75 %	254804208
3572	NC_013016	CGA	2	6	198548	198553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804208
3573	NC_013016	TGG	2	6	198724	198729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804208
3574	NC_013016	GCGT	2	8	198802	198809	0 %	25 %	50 %	25 %	254804208
3575	NC_013016	CGG	2	6	198892	198897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804208
3576	NC_013016	GCC	2	6	198984	198989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3577	NC_013016	TAC	2	6	199085	199090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804208
3578	NC_013016	AAG	2	6	199150	199155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804208
3579	NC_013016	GAT	2	6	199185	199190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804208
3580	NC_013016	GGC	2	6	199220	199225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804208
3581	NC_013016	ACC	2	6	199302	199307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804208
3582	NC_013016	TTG	2	6	199326	199331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804208
3583	NC_013016	CCG	2	6	199471	199476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
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3585	NC_013016	CAT	2	6	199643	199648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804208
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3587	NC_013016	GC	4	8	199835	199842	0 %	0 %	50 %	50 %	254804208
3588	NC_013016	A	6	6	199873	199878	100 %	0 %	0 %	0 %	254804208
3589	NC_013016	CGCC	2	8	199949	199956	0 %	0 %	25 %	75 %	254804208
3590	NC_013016	TGA	2	6	199981	199986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804208
3591	NC_013016	AAG	2	6	199996	200001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804208
3592	NC_013016	CGC	3	9	200006	200014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3593	NC_013016	A	7	7	200097	200103	100 %	0 %	0 %	0 %	254804208
3594	NC_013016	GGC	2	6	200112	200117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804208
3595	NC_013016	CCA	2	6	200122	200127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804208
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3597	NC_013016	ACC	2	6	200268	200273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254804208
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3601	NC_013016	GCC	2	6	200356	200361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3602	NC_013016	GCGCC	2	10	200366	200375	0 %	0 %	40 %	60 %	254804208
3603	NC_013016	ACCGC	2	10	200379	200388	20 %	0 %	20 %	60 %	254804208
3604	NC_013016	CCG	2	6	200407	200412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3605	NC_013016	CT	3	6	200448	200453	0 %	50 %	0 %	50 %	254804208
3606	NC_013016	CCG	2	6	200501	200506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3607	NC_013016	CCG	3	9	200509	200517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3608	NC_013016	CGC	2	6	200559	200564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3609	NC_013016	GCC	3	9	200724	200732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804208
3610	NC_013016	TCG	2	6	200740	200745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804208
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3612	NC_013016	AACGCC	2	12	200793	200804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	254804208
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3619	NC_013016	ATTG	2	8	201106	201113	25 %	50 %	25 %	0 %	254804208
3620	NC_013016	GAAA	2	8	202486	202493	75 %	0 %	25 %	0 %	254804209
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3746	NC_013016	GCGCC	2	10	209089	209098	0 %	0 %	40 %	60 %	254804213
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3753	NC_013016	GACG	2	8	209329	209336	25 %	0 %	50 %	25 %	254804213
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3988	NC_013016	CGG	2	6	225738	225743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804221
3989	NC_013016	CGC	2	6	225751	225756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804221
3990	NC_013016	TGT	2	6	225797	225802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804221
3991	NC_013016	ACG	2	6	225803	225808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804221
3992	NC_013016	TCG	2	6	225932	225937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804221
3993	NC_013016	T	7	7	225947	225953	0 %	100 %	0 %	0 %	254804221
3994	NC_013016	CGC	2	6	225983	225988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804221
3995	NC_013016	CGG	2	6	226032	226037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804221
3996	NC_013016	CGT	2	6	226079	226084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804221
3997	NC_013016	GCA	2	6	226086	226091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804221
3998	NC_013016	TCCGT	2	10	226165	226174	0 %	40 %	20 %	40 %	254804222
3999	NC_013016	CTG	2	6	226227	226232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804222
4000	NC_013016	CGTC	2	8	226262	226269	0 %	25 %	25 %	50 %	254804222

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