MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis alpha14 chromosome

Total Repeats: 37742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013016	T	7	7	26531	26537	0 %	100 %	0 %	0 %	254804058
502	NC_013016	TG	3	6	26619	26624	0 %	50 %	50 %	0 %	254804058
503	NC_013016	T	6	6	26637	26642	0 %	100 %	0 %	0 %	254804058
504	NC_013016	AAC	2	6	26649	26654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804058
505	NC_013016	TGT	2	6	26680	26685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804058
506	NC_013016	AAC	2	6	26762	26767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804058
507	NC_013016	T	6	6	26768	26773	0 %	100 %	0 %	0 %	254804058
508	NC_013016	ATC	2	6	26784	26789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804058
509	NC_013016	T	6	6	26799	26804	0 %	100 %	0 %	0 %	254804058
510	NC_013016	AT	3	6	26823	26828	50 %	50 %	0 %	0 %	254804058
511	NC_013016	TGC	2	6	26890	26895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804058
512	NC_013016	ATTTG	2	10	27408	27417	20 %	60 %	20 %	0 %	254804059
513	NC_013016	TGT	2	6	27491	27496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804059
514	NC_013016	TCG	2	6	27500	27505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804059
515	NC_013016	T	6	6	27585	27590	0 %	100 %	0 %	0 %	254804059
516	NC_013016	GTT	3	9	27598	27606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804059
517	NC_013016	AAT	2	6	27760	27765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804059
518	NC_013016	GGT	2	6	27882	27887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804059
519	NC_013016	AGG	2	6	28053	28058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804060
520	NC_013016	GAT	2	6	28060	28065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804060
521	NC_013016	GGA	2	6	28177	28182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804060
522	NC_013016	ATT	2	6	28187	28192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804060
523	NC_013016	AGC	2	6	28196	28201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804060
524	NC_013016	ACATC	2	10	28230	28239	40 %	20 %	0 %	40 %	254804060
525	NC_013016	ATC	2	6	28288	28293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804060
526	NC_013016	CAT	2	6	28299	28304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804060
527	NC_013016	GT	3	6	28338	28343	0 %	50 %	50 %	0 %	254804060
528	NC_013016	AAT	2	6	28359	28364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254804060
529	NC_013016	CTT	2	6	28536	28541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804060
530	NC_013016	TTC	2	6	28555	28560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804060
531	NC_013016	AGC	2	6	28590	28595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804060
532	NC_013016	TTG	2	6	28616	28621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254804060
533	NC_013016	CGG	2	6	28737	28742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804060
534	NC_013016	TCG	2	6	28849	28854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804061
535	NC_013016	ATCA	2	8	28919	28926	50 %	25 %	0 %	25 %	254804061
536	NC_013016	A	6	6	28998	29003	100 %	0 %	0 %	0 %	254804061
537	NC_013016	ACA	2	6	29014	29019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804061
538	NC_013016	TAG	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804061
539	NC_013016	CGC	2	6	29202	29207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804061
540	NC_013016	ATG	2	6	29213	29218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804061
541	NC_013016	CAA	2	6	29246	29251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804061
542	NC_013016	CCG	2	6	29265	29270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804061
543	NC_013016	CAT	2	6	29321	29326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804061
544	NC_013016	GCCC	2	8	29368	29375	0 %	0 %	25 %	75 %	254804061
545	NC_013016	GCC	2	6	29447	29452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804061
546	NC_013016	GA	3	6	29514	29519	50 %	0 %	50 %	0 %	254804061
547	NC_013016	CGG	2	6	29538	29543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804061
548	NC_013016	ATT	2	6	29684	29689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804062
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550	NC_013016	GT	3	6	29755	29760	0 %	50 %	50 %	0 %	254804062
551	NC_013016	T	8	8	29768	29775	0 %	100 %	0 %	0 %	254804062
552	NC_013016	CGC	2	6	29798	29803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804062
553	NC_013016	GCCGC	2	10	29830	29839	0 %	0 %	40 %	60 %	254804062
554	NC_013016	CGC	2	6	29864	29869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804062
555	NC_013016	GTTGC	2	10	29899	29908	0 %	40 %	40 %	20 %	254804062
556	NC_013016	GCA	2	6	29923	29928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804062
557	NC_013016	CGG	2	6	29936	29941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804062
558	NC_013016	GCA	2	6	29974	29979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804062
559	NC_013016	AATC	2	8	30065	30072	50 %	25 %	0 %	25 %	254804063
560	NC_013016	T	6	6	30103	30108	0 %	100 %	0 %	0 %	254804063
561	NC_013016	CAG	2	6	30109	30114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804063
562	NC_013016	CCGC	2	8	30131	30138	0 %	0 %	25 %	75 %	254804063
563	NC_013016	AGC	2	6	30149	30154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804063
564	NC_013016	CGG	2	6	30246	30251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804063
565	NC_013016	CAA	2	6	30301	30306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804063
566	NC_013016	GCA	2	6	30312	30317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804063
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571	NC_013016	CGG	2	6	30928	30933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804064
572	NC_013016	TGC	2	6	30941	30946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804064
573	NC_013016	CGC	2	6	30974	30979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804064
574	NC_013016	GGC	2	6	31002	31007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804064
575	NC_013016	TAT	2	6	31034	31039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254804064
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580	NC_013016	CAG	2	6	31269	31274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804064
581	NC_013016	TCAA	2	8	31333	31340	50 %	25 %	0 %	25 %	254804064
582	NC_013016	GC	3	6	31361	31366	0 %	0 %	50 %	50 %	254804064
583	NC_013016	CCG	2	6	31369	31374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804064
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589	NC_013016	CGG	2	6	31464	31469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804064
590	NC_013016	CTT	2	6	31535	31540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254804064
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592	NC_013016	A	6	6	31665	31670	100 %	0 %	0 %	0 %	254804064
593	NC_013016	GAG	2	6	31689	31694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804064
594	NC_013016	GGC	2	6	31733	31738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804064
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596	NC_013016	AAGA	2	8	31947	31954	75 %	0 %	25 %	0 %	254804065
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598	NC_013016	ACA	2	6	32071	32076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804065
599	NC_013016	GAA	2	6	32124	32129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804065
600	NC_013016	ACG	2	6	32131	32136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804065
601	NC_013016	AAG	2	6	32137	32142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804065
602	NC_013016	GCC	2	6	32148	32153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804065
603	NC_013016	CCG	2	6	32224	32229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804065
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606	NC_013016	CGGAAG	2	12	32275	32286	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254804065
607	NC_013016	GAA	2	6	32358	32363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804065
608	NC_013016	GAC	2	6	32364	32369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804065
609	NC_013016	CG	3	6	32391	32396	0 %	0 %	50 %	50 %	254804065
610	NC_013016	TGC	2	6	32431	32436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254804065
611	NC_013016	AAC	2	6	32487	32492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804065
612	NC_013016	GAT	2	6	32538	32543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254804065
613	NC_013016	GAAATC	2	12	32550	32561	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	254804065
614	NC_013016	CCG	2	6	32566	32571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804065
615	NC_013016	CGGGCG	2	12	32599	32610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254804065
616	NC_013016	CAA	2	6	32621	32626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804065
617	NC_013016	CCG	2	6	32635	32640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254804065
618	NC_013016	CAA	2	6	32705	32710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254804065
619	NC_013016	GAA	2	6	32790	32795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254804065
620	NC_013016	AGCC	2	8	32933	32940	25 %	0 %	25 %	50 %	254804065
621	NC_013016	GAGCAG	2	12	33906	33917	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	254804066
622	NC_013016	CAG	2	6	33948	33953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254804066
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625	NC_013016	TGG	2	6	34085	34090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254804066
626	NC_013016	ATC	2	6	34114	34119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254804066
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756	NC_013016	GGA	2	6	40294	40299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254804067
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