MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 15777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013009	CAG	3	9	27644	27652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796433
502	NC_013009	CTG	2	6	27677	27682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796433
503	NC_013009	AAT	2	6	27721	27726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796433
504	NC_013009	GCCCA	2	10	27776	27785	20 %	0 %	20 %	60 %	254796433
505	NC_013009	CATT	2	8	27848	27855	25 %	50 %	0 %	25 %	254796433
506	NC_013009	AAG	2	6	27877	27882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796433
507	NC_013009	AGAT	2	8	27895	27902	50 %	25 %	25 %	0 %	254796433
508	NC_013009	GTA	2	6	28112	28117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796434
509	NC_013009	GTG	2	6	28158	28163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796434
510	NC_013009	A	9	9	28202	28210	100 %	0 %	0 %	0 %	254796434
511	NC_013009	GAT	2	6	28222	28227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796434
512	NC_013009	TAA	2	6	28273	28278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796434
513	NC_013009	TGC	2	6	28567	28572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796435
514	NC_013009	TGC	2	6	28575	28580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796435
515	NC_013009	ATCA	2	8	28615	28622	50 %	25 %	0 %	25 %	254796435
516	NC_013009	TTC	2	6	28630	28635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796435
517	NC_013009	GA	3	6	28638	28643	50 %	0 %	50 %	0 %	254796435
518	NC_013009	TCC	2	6	28645	28650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254796435
519	NC_013009	GGT	2	6	28775	28780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796435
520	NC_013009	TTG	2	6	28810	28815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796435
521	NC_013009	TGA	2	6	28876	28881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796435
522	NC_013009	GCCT	2	8	28919	28926	0 %	25 %	25 %	50 %	254796435
523	NC_013009	A	6	6	29027	29032	100 %	0 %	0 %	0 %	254796435
524	NC_013009	CAC	2	6	29058	29063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254796435
525	NC_013009	CTT	2	6	29091	29096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796435
526	NC_013009	T	6	6	29131	29136	0 %	100 %	0 %	0 %	254796435
527	NC_013009	AAC	2	6	29186	29191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796435
528	NC_013009	AGA	2	6	29743	29748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796436
529	NC_013009	AAC	2	6	29852	29857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796436
530	NC_013009	TGC	2	6	29872	29877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796436
531	NC_013009	GATC	2	8	29890	29897	25 %	25 %	25 %	25 %	254796436
532	NC_013009	GA	3	6	29948	29953	50 %	0 %	50 %	0 %	254796436
533	NC_013009	T	6	6	29963	29968	0 %	100 %	0 %	0 %	254796436
534	NC_013009	TTC	2	6	29970	29975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796436
535	NC_013009	TTGG	2	8	29976	29983	0 %	50 %	50 %	0 %	254796436
536	NC_013009	AAGT	2	8	30005	30012	50 %	25 %	25 %	0 %	254796436
537	NC_013009	CT	3	6	30226	30231	0 %	50 %	0 %	50 %	254796437
538	NC_013009	TGC	2	6	30259	30264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796437
539	NC_013009	GTAG	2	8	30445	30452	25 %	25 %	50 %	0 %	254796437
540	NC_013009	GCT	2	6	30492	30497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796438
541	NC_013009	TTA	2	6	30665	30670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796438
542	NC_013009	CT	3	6	30697	30702	0 %	50 %	0 %	50 %	254796438
543	NC_013009	CT	3	6	30714	30719	0 %	50 %	0 %	50 %	254796438
544	NC_013009	GAT	3	9	30736	30744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796438
545	NC_013009	GAG	2	6	30763	30768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796438
546	NC_013009	T	6	6	30789	30794	0 %	100 %	0 %	0 %	254796438
547	NC_013009	CTC	2	6	30942	30947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254796438
548	NC_013009	TAT	2	6	31029	31034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796438
549	NC_013009	GA	3	6	31038	31043	50 %	0 %	50 %	0 %	254796438
550	NC_013009	CAAT	2	8	31076	31083	50 %	25 %	0 %	25 %	254796438
551	NC_013009	GAG	2	6	31096	31101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796438
552	NC_013009	CAC	2	6	31191	31196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254796438
553	NC_013009	GTG	2	6	31205	31210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796438
554	NC_013009	GAA	2	6	31297	31302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796438
555	NC_013009	TCCG	2	8	31311	31318	0 %	25 %	25 %	50 %	254796438
556	NC_013009	GAC	2	6	31725	31730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796439
557	NC_013009	AAGA	2	8	31739	31746	75 %	0 %	25 %	0 %	254796439
558	NC_013009	TG	3	6	31757	31762	0 %	50 %	50 %	0 %	254796439
559	NC_013009	GTG	2	6	31777	31782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796439
560	NC_013009	ACT	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796439
561	NC_013009	CTG	2	6	31915	31920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796439
562	NC_013009	TA	3	6	31951	31956	50 %	50 %	0 %	0 %	254796439
563	NC_013009	GTC	2	6	32260	32265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796439
564	NC_013009	GTG	2	6	32323	32328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796439
565	NC_013009	CAA	2	6	32336	32341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796439
566	NC_013009	A	7	7	32400	32406	100 %	0 %	0 %	0 %	254796439
567	NC_013009	GTT	2	6	32467	32472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796440
568	NC_013009	TGA	2	6	32473	32478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796440
569	NC_013009	TC	3	6	32488	32493	0 %	50 %	0 %	50 %	254796440
570	NC_013009	CTT	2	6	32512	32517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796440
571	NC_013009	TAG	2	6	32546	32551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796440
572	NC_013009	AG	3	6	32550	32555	50 %	0 %	50 %	0 %	254796440
573	NC_013009	TCA	2	6	32566	32571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796440
574	NC_013009	GTG	2	6	32577	32582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796440
575	NC_013009	TC	3	6	32592	32597	0 %	50 %	0 %	50 %	254796440
576	NC_013009	GCGTA	2	10	32598	32607	20 %	20 %	40 %	20 %	254796440
577	NC_013009	AAG	2	6	32669	32674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796440
578	NC_013009	ACGTTG	2	12	32711	32722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254796440
579	NC_013009	GCT	2	6	32814	32819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796440
580	NC_013009	AAT	2	6	32886	32891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796440
581	NC_013009	GTAT	2	8	32948	32955	25 %	50 %	25 %	0 %	254796440
582	NC_013009	ACT	2	6	32973	32978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796440
583	NC_013009	TGG	2	6	33019	33024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796440
584	NC_013009	CTG	2	6	33039	33044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796440
585	NC_013009	ACT	2	6	33057	33062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796440
586	NC_013009	GAAA	2	8	33080	33087	75 %	0 %	25 %	0 %	254796440
587	NC_013009	TTG	2	6	33097	33102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796440
588	NC_013009	ACC	2	6	33110	33115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254796440
589	NC_013009	CTA	2	6	33219	33224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796440
590	NC_013009	CTG	2	6	33325	33330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796440
591	NC_013009	TCCGAT	2	12	33359	33370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	254796440
592	NC_013009	TATG	2	8	33419	33426	25 %	50 %	25 %	0 %	254796440
593	NC_013009	T	8	8	33468	33475	0 %	100 %	0 %	0 %	254796440
594	NC_013009	CTA	2	6	33517	33522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796440
595	NC_013009	TTA	2	6	33679	33684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796440
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597	NC_013009	GTT	2	6	33833	33838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796440
598	NC_013009	ATC	2	6	33860	33865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796440
599	NC_013009	TGA	2	6	33917	33922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796440
600	NC_013009	CTGAA	2	10	34048	34057	40 %	20 %	20 %	20 %	254796440
601	NC_013009	A	6	6	34060	34065	100 %	0 %	0 %	0 %	254796440
602	NC_013009	TTC	2	6	34127	34132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796440
603	NC_013009	CTT	2	6	34149	34154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796440
604	NC_013009	A	6	6	34556	34561	100 %	0 %	0 %	0 %	254796441
605	NC_013009	GAA	2	6	34580	34585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796441
606	NC_013009	TG	3	6	34603	34608	0 %	50 %	50 %	0 %	254796441
607	NC_013009	GAA	2	6	34637	34642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796441
608	NC_013009	GAG	2	6	34658	34663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796441
609	NC_013009	AGG	2	6	34713	34718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796441
610	NC_013009	TA	3	6	34733	34738	50 %	50 %	0 %	0 %	254796441
611	NC_013009	T	6	6	34756	34761	0 %	100 %	0 %	0 %	254796441
612	NC_013009	GT	3	6	34799	34804	0 %	50 %	50 %	0 %	254796441
613	NC_013009	TGA	2	6	34821	34826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796441
614	NC_013009	TGG	2	6	34834	34839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796441
615	NC_013009	TAC	2	6	34859	34864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796441
616	NC_013009	GT	4	8	34902	34909	0 %	50 %	50 %	0 %	254796441
617	NC_013009	GCT	2	6	34913	34918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796441
618	NC_013009	ACT	2	6	35081	35086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796441
619	NC_013009	AGA	2	6	35089	35094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796441
620	NC_013009	T	6	6	35116	35121	0 %	100 %	0 %	0 %	254796441
621	NC_013009	GTA	2	6	35148	35153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796441
622	NC_013009	TGG	2	6	35181	35186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796441
623	NC_013009	TCC	3	9	35287	35295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254796442
624	NC_013009	ATG	2	6	35363	35368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796442
625	NC_013009	ATTCA	2	10	35374	35383	40 %	40 %	0 %	20 %	254796442
626	NC_013009	TGA	2	6	35475	35480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796442
627	NC_013009	T	6	6	35502	35507	0 %	100 %	0 %	0 %	254796442
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629	NC_013009	TA	3	6	35559	35564	50 %	50 %	0 %	0 %	254796443
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