MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nautilia profundicola AmH chromosome

Total Repeats: 969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012115	ATTACA	2	12	1813	1824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224372072
2	NC_012115	CAAAGG	2	12	2066	2077	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224372072
3	NC_012115	CGAAAA	2	12	3225	3236	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	224372073
4	NC_012115	GTAGGT	2	12	3805	3816	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	224372073
5	NC_012115	AATCGA	2	12	5261	5272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	224372074
6	NC_012115	ATCAAA	2	12	5514	5525	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224372075
7	NC_012115	TTATAT	2	12	9119	9130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372077
8	NC_012115	TTTCAT	2	12	9549	9560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372077
9	NC_012115	ATTTAT	2	12	10124	10135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372078
10	NC_012115	ATTTAT	2	12	10614	10625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372079
11	NC_012115	GCATAA	2	12	11944	11955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	224372081
12	NC_012115	TTTATC	2	12	12577	12588	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372082
13	NC_012115	TGAAAA	2	12	13111	13122	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372083
14	NC_012115	TGGAGG	2	12	13178	13189	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	224372083
15	NC_012115	TGGAAT	2	12	13327	13338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372083
16	NC_012115	ATTTAA	2	12	13978	13989	50 %	50 %	0 %	0 %	224372083
17	NC_012115	AGCTGA	2	12	16950	16961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372088
18	NC_012115	TGCCTC	2	12	19110	19121	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	224372091
19	NC_012115	ATTTTT	2	12	20450	20461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372092
20	NC_012115	GATTTT	2	12	21680	21691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224372094
21	NC_012115	TATTAC	2	12	22492	22503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224372095
22	NC_012115	TTTCTT	2	12	25227	25238	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372097
23	NC_012115	TAAAAA	2	12	25924	25935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224372099
24	NC_012115	AAATTT	2	12	27281	27292	50 %	50 %	0 %	0 %	224372100
25	NC_012115	TTTGAG	2	12	29940	29951	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224372104
26	NC_012115	AAAGGT	2	12	33980	33991	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224372110
27	NC_012115	AAAGCC	2	12	38519	38530	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	224372115
28	NC_012115	ACCTAA	2	12	45266	45277	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	224372123
29	NC_012115	CTTTTG	2	12	45327	45338	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372124
30	NC_012115	GCAAGA	2	12	51852	51863	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224372132
31	NC_012115	AAGTGC	2	12	52139	52150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372132
32	NC_012115	CGTTTT	2	12	55145	55156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372136
33	NC_012115	TCAAAA	2	12	55257	55268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	224372137
34	NC_012115	TCTTTG	2	12	55936	55947	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372138
35	NC_012115	AAGTGT	2	12	57415	57426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372140
36	NC_012115	GAAAAA	2	12	58694	58705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372142
37	NC_012115	TAAACC	2	12	60358	60369	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	224372145
38	NC_012115	CTTTTT	2	12	62145	62156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372145
39	NC_012115	TTTGTT	2	12	62443	62454	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224372145
40	NC_012115	TAGTTG	2	12	63988	63999	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224372147
41	NC_012115	GGCATT	2	12	67637	67648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224372150
42	NC_012115	AAAACA	2	12	68699	68710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	224372151
43	NC_012115	TAAGTT	2	12	77597	77608	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372160
44	NC_012115	GTTTGT	2	12	78874	78885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372162
45	NC_012115	GAAAAA	2	12	79027	79038	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372162
46	NC_012115	GCAAAA	2	12	79818	79829	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	224372163
47	NC_012115	TGAAGT	2	12	80898	80909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372164
48	NC_012115	GTTAAT	2	12	84886	84897	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372171
49	NC_012115	AAAAAT	2	12	87404	87415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224372173
50	NC_012115	TTTTAT	2	12	88357	88368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372174
51	NC_012115	TGAAAA	2	12	93851	93862	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372177
52	NC_012115	TATTTT	2	12	94631	94642	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372178
53	NC_012115	GTTTTG	2	12	97303	97314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372181
54	NC_012115	TCGTTT	2	12	97720	97731	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372181
55	NC_012115	ATGTTT	2	12	97900	97911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	224372181
56	NC_012115	GTGTTT	2	12	99411	99422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372183
57	NC_012115	GCGCTT	2	12	99954	99965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372183
58	NC_012115	GTTTTT	2	12	100055	100066	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224372183
59	NC_012115	TTTTTA	2	12	101600	101611	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372185
60	NC_012115	TTGCTT	2	12	107308	107319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372191
61	NC_012115	CAGAGC	2	12	109546	109557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372192
62	NC_012115	GAATAT	2	12	109681	109692	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372192
63	NC_012115	GAAAAA	2	12	111272	111283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372193
64	NC_012115	TTATTT	2	12	111580	111591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372194
65	NC_012115	TGAAAA	2	12	113614	113625	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372195
66	NC_012115	AGATTA	2	12	113730	113741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372195
67	NC_012115	ATATTT	2	12	123547	123558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372205
68	NC_012115	GATATA	2	12	124618	124629	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372206
69	NC_012115	TTGATG	2	12	126254	126265	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224372209
70	NC_012115	AAATGA	2	12	128493	128504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372212
71	NC_012115	CAAAAA	2	12	149237	149248	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	224372227
72	NC_012115	AGATTA	2	12	151690	151701	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372232
73	NC_012115	ATATTT	2	12	153893	153904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372232
74	NC_012115	TTGCTG	2	12	156579	156590	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	224372233
75	NC_012115	AAAAGT	3	18	157438	157455	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372233
76	NC_012115	TAGAAG	2	12	161253	161264	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224372235
77	NC_012115	ACTACA	2	12	161667	161678	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	224372236
78	NC_012115	CTTGAA	2	12	166213	166224	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224372241
79	NC_012115	AGAAAA	2	12	166904	166915	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372242
80	NC_012115	AAGCGG	2	12	170493	170504	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	224372248
81	NC_012115	ATTTAC	2	12	171673	171684	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224372249
82	NC_012115	TTTCAT	2	12	173484	173495	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372252
83	NC_012115	TTCTAT	2	12	173739	173750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372252
84	NC_012115	AGATTA	2	12	176881	176892	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372256
85	NC_012115	CCTGAT	2	12	177364	177375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	224372257
86	NC_012115	GAAAAA	2	12	181069	181080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372261
87	NC_012115	TGCCGC	2	12	181804	181815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	224372262
88	NC_012115	CTTTTT	2	12	182382	182393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372263
89	NC_012115	TATTTT	2	12	196455	196466	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372280
90	NC_012115	AGGTAT	2	12	197134	197145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372280
91	NC_012115	TAAAAA	2	12	197488	197499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224372280
92	NC_012115	CATTTA	2	12	197589	197600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224372280
93	NC_012115	AAATAT	2	12	199230	199241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372282
94	NC_012115	AAAACC	2	12	200534	200545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372285
95	NC_012115	AAAAGA	2	12	200721	200732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372285
96	NC_012115	TGCAAA	2	12	201312	201323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	224372285
97	NC_012115	AGAAAG	2	12	201749	201760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372286
98	NC_012115	ATTGCA	2	12	202063	202074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224372287
99	NC_012115	ATTGAA	2	12	202702	202713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372288
100	NC_012115	CCGCCA	2	12	203816	203827	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	224372289
101	NC_012115	AGAAAA	2	12	203887	203898	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372289
102	NC_012115	ATTTTC	2	12	205768	205779	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372290
103	NC_012115	TTTTTC	2	12	206627	206638	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372291
104	NC_012115	AAGATG	2	12	208964	208975	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224372294
105	NC_012115	CTTTTT	2	12	212440	212451	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372297
106	NC_012115	ACACAG	2	12	213975	213986	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	224372299
107	NC_012115	TATTCC	2	12	216085	216096	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	224372301
108	NC_012115	TTTTGT	2	12	217213	217224	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224372302
109	NC_012115	ATAGAA	2	12	223477	223488	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372308
110	NC_012115	TTAATA	2	12	225232	225243	50 %	50 %	0 %	0 %	224372310
111	NC_012115	GTATGA	2	12	225920	225931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372310
112	NC_012115	GAAATA	2	12	225990	226001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372310
113	NC_012115	ACACAA	2	12	226237	226248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372310
114	NC_012115	TTTTTA	2	12	226847	226858	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372310
115	NC_012115	TAAAAA	2	12	228333	228344	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224372313
116	NC_012115	GTTTAG	2	12	229852	229863	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224372315
117	NC_012115	AAAAAT	2	12	229992	230003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224372316
118	NC_012115	AAAATT	2	12	236510	236521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372324
119	NC_012115	GGTTAA	2	12	241352	241363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372328
120	NC_012115	AGACGA	2	12	241649	241660	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224372328
121	NC_012115	GAAAAA	2	12	243168	243179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	224372330
122	NC_012115	GAAATA	2	12	244986	244997	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224372334
123	NC_012115	TTTTCA	2	12	249550	249561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372340
124	NC_012115	TATTTA	2	12	250876	250887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372341
125	NC_012115	TTTGCC	2	12	251999	252010	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	224372342
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128	NC_012115	GGGTGC	2	12	254011	254022	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	224372345
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130	NC_012115	TTCGGT	2	12	254489	254500	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	224372345
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132	NC_012115	GATTCT	2	12	257043	257054	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	224372347
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134	NC_012115	TTATCA	2	12	265103	265114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224372357
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143	NC_012115	TTTTAT	2	12	282460	282471	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372378
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148	NC_012115	GGATGC	2	12	285638	285649	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	224372381
149	NC_012115	TTAATA	2	12	288270	288281	50 %	50 %	0 %	0 %	224372385
150	NC_012115	CTATAA	2	12	294699	294710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224372391
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226	NC_012115	TTTGTC	2	12	417648	417659	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	224372521
227	NC_012115	GCGATT	2	12	417724	417735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224372521
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231	NC_012115	AAATAT	2	12	419012	419023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372522
232	NC_012115	ATAAAA	2	12	421459	421470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	224372524
233	NC_012115	TTTTAT	2	12	421818	421829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372524
234	NC_012115	CTTTTT	2	12	422479	422490	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372525
235	NC_012115	ACTTCA	2	12	424073	424084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372526
236	NC_012115	AAACTT	2	12	427571	427582	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224372529
237	NC_012115	CTAAAC	2	12	427626	427637	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	224372529
238	NC_012115	GCTTCC	2	12	433601	433612	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	224372539
239	NC_012115	ATTTTT	2	12	434510	434521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	224372540
240	NC_012115	AGCTTC	2	12	436487	436498	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	224372542
241	NC_012115	TCCCGC	2	12	437366	437377	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	224372542
242	NC_012115	TATGAA	2	12	439358	439369	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372545
243	NC_012115	GCTCAG	2	12	442173	442184	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	224372547
244	NC_012115	TTTAGA	2	12	443430	443441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372548
245	NC_012115	CGATTA	2	12	450048	450059	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224372555
246	NC_012115	GTTTTT	2	12	450474	450485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	224372555
247	NC_012115	GTAAGC	2	12	450777	450788	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372556
248	NC_012115	TCTTTT	2	12	453700	453711	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372558
249	NC_012115	AGTCTG	2	12	454471	454482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	224372558
250	NC_012115	TTGAAG	2	12	454784	454795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372558
251	NC_012115	CTTTTT	2	12	455011	455022	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372558
252	NC_012115	TACACC	2	12	455799	455810	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	224372560
253	NC_012115	ATGAAG	2	12	456547	456558	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224372561
254	NC_012115	AATATA	2	12	458240	458251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372562
255	NC_012115	AGCGGA	2	12	459586	459597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	224372564
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257	NC_012115	GTAATA	2	12	462371	462382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372567
258	NC_012115	GAAAAG	2	12	464519	464530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372569
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260	NC_012115	CAATAT	2	12	468107	468118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224372575
261	NC_012115	ATATTA	2	12	468132	468143	50 %	50 %	0 %	0 %	224372575
262	NC_012115	AATATA	2	12	468320	468331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372575
263	NC_012115	ATGCTA	2	12	469080	469091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224372575
264	NC_012115	ATTTGG	2	12	469194	469205	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224372575
265	NC_012115	CAGATG	2	12	470331	470342	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372575
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269	NC_012115	CTATAC	2	12	476849	476860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372580
270	NC_012115	TTTCTT	2	12	477262	477273	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372581
271	NC_012115	ATTTTC	2	12	480287	480298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372586
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274	NC_012115	GTATTG	2	12	482897	482908	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	224372590
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324	NC_012115	ATTAAT	2	12	584531	584542	50 %	50 %	0 %	0 %	224372700
325	NC_012115	TTATGA	2	12	585510	585521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372703
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327	NC_012115	CAGGCT	2	12	587233	587244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	224372704
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330	NC_012115	ATTGTA	2	12	597214	597225	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372715
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333	NC_012115	AAATAT	2	12	598657	598668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372716
334	NC_012115	TCTCCT	2	12	602662	602673	0 %	50 %	0 %	50 %	224372719
335	NC_012115	AGTTGA	2	12	605639	605650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372722
336	NC_012115	TCTTTT	2	12	607078	607089	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372723
337	NC_012115	TTTCTT	2	12	607277	607288	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372723
338	NC_012115	TAATAT	2	12	612674	612685	50 %	50 %	0 %	0 %	224372727
339	NC_012115	ACGCTT	2	12	614828	614839	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	224372730
340	NC_012115	GTCGGT	2	12	615494	615505	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	224372731
341	NC_012115	TTCTTT	2	12	616123	616134	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	224372732
342	NC_012115	ATTTGA	2	12	628714	628725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372742
343	NC_012115	TATGAA	2	12	632013	632024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	224372744
344	NC_012115	AGATGA	2	12	632969	632980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224372746
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346	NC_012115	AGCAAA	2	12	637624	637635	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	224372752
347	NC_012115	TGAAGA	2	12	637870	637881	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	224372752
348	NC_012115	TGATTA	2	12	638910	638921	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	224372753
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350	NC_012115	ATTCCA	2	12	640279	640290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372753
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461	NC_012115	ACTTTT	2	12	802352	802363	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	224372907
462	NC_012115	GGCAAA	2	12	803271	803282	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	224372908
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465	NC_012115	ACTATT	2	12	809032	809043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	224372916
466	NC_012115	TTCAAA	2	12	810392	810403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	224372916
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