MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Neisseria gonorrhoeae NCCP11945 chromosome

Total Repeats: 29336

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011035	GAG	2	6	257	262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097590
2	NC_011035	GTG	2	6	275	280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097590
3	NC_011035	GGC	2	6	415	420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
4	NC_011035	GGA	2	6	469	474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097590
5	NC_011035	AGG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097590
6	NC_011035	CGG	3	9	546	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
7	NC_011035	CGG	2	6	630	635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
8	NC_011035	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097590
9	NC_011035	GCG	2	6	755	760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
10	NC_011035	GCG	2	6	764	769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
11	NC_011035	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097590
12	NC_011035	GCA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
13	NC_011035	GAC	2	6	917	922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
14	NC_011035	CAA	2	6	952	957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097590
15	NC_011035	ACG	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
16	NC_011035	AGC	2	6	975	980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
17	NC_011035	CTG	2	6	998	1003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097590
18	NC_011035	CGA	2	6	1009	1014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
19	NC_011035	TCA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097590
20	NC_011035	GAA	2	6	1049	1054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097590
21	NC_011035	GAC	2	6	1142	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097590
22	NC_011035	GCC	2	6	1192	1197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097590
23	NC_011035	GCG	2	6	1241	1246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097590
24	NC_011035	ATT	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097590
25	NC_011035	TCA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097590
26	NC_011035	CCG	2	6	1434	1439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097590
27	NC_011035	CAT	3	9	1441	1449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097590
28	NC_011035	CTG	2	6	1691	1696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097590
29	NC_011035	TCG	2	6	1855	1860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097591
30	NC_011035	GAC	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097591
31	NC_011035	GAT	2	6	2144	2149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097591
32	NC_011035	TAT	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097591
33	NC_011035	CTG	2	6	2268	2273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097591
34	NC_011035	AAC	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097591
35	NC_011035	CGA	2	6	2425	2430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097592
36	NC_011035	GCT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097592
37	NC_011035	CGT	2	6	2668	2673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097592
38	NC_011035	GCA	2	6	2676	2681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097592
39	NC_011035	GAA	2	6	2693	2698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097592
40	NC_011035	GAA	2	6	2705	2710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097592
41	NC_011035	GCG	2	6	2730	2735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097592
42	NC_011035	CGA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097592
43	NC_011035	CGG	2	6	3101	3106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
44	NC_011035	GCC	2	6	3123	3128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
45	NC_011035	GCG	2	6	3240	3245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
46	NC_011035	GAA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194097593
47	NC_011035	GTC	2	6	3288	3293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097593
48	NC_011035	GTT	2	6	3300	3305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
49	NC_011035	CGA	2	6	3344	3349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
50	NC_011035	GCC	2	6	3605	3610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
51	NC_011035	CGG	2	6	3656	3661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
52	NC_011035	TCG	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097593
53	NC_011035	TGG	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097593
54	NC_011035	CGG	2	6	3772	3777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
55	NC_011035	ACG	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
56	NC_011035	GCT	2	6	3851	3856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097593
57	NC_011035	GTT	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
58	NC_011035	CGA	3	9	3902	3910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
59	NC_011035	GCC	2	6	3934	3939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
60	NC_011035	TCA	2	6	3941	3946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097593
61	NC_011035	CGG	2	6	4007	4012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
62	NC_011035	CGG	3	9	4016	4024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
63	NC_011035	GTG	2	6	4068	4073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097593
64	NC_011035	CAG	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
65	NC_011035	GCG	2	6	4151	4156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
66	NC_011035	GGC	2	6	4359	4364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
67	NC_011035	TCT	2	6	4381	4386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097593
68	NC_011035	TGG	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194097593
69	NC_011035	GGA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194097593
70	NC_011035	GAC	2	6	4486	4491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
71	NC_011035	CCG	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097593
72	NC_011035	AAC	2	6	4539	4544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097593
73	NC_011035	GCA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
74	NC_011035	GCG	3	9	4755	4763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
75	NC_011035	GTT	2	6	4806	4811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
76	NC_011035	GAC	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
77	NC_011035	CGG	2	6	5044	5049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
78	NC_011035	CAG	2	6	5058	5063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097593
79	NC_011035	GTT	3	9	5121	5129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097593
80	NC_011035	GGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
81	NC_011035	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097593
82	NC_011035	AAT	2	6	5291	5296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194097594
83	NC_011035	CCT	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194097594
84	NC_011035	CGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097594
85	NC_011035	GTC	2	6	5562	5567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097594
86	NC_011035	CGA	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097594
87	NC_011035	GTC	2	6	5668	5673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097594
88	NC_011035	GAT	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097595
89	NC_011035	GTA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097595
90	NC_011035	TCG	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097595
91	NC_011035	GTC	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097595
92	NC_011035	TTG	2	6	6088	6093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194097596
93	NC_011035	ATG	2	6	6386	6391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194097597
94	NC_011035	CGC	2	6	6524	6529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
95	NC_011035	GCG	2	6	6540	6545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
96	NC_011035	GAC	2	6	6558	6563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097598
97	NC_011035	ATT	2	6	6607	6612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194097598
98	NC_011035	CGG	2	6	6757	6762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
99	NC_011035	GCG	2	6	6768	6773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
100	NC_011035	AAC	2	6	6780	6785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097598
101	NC_011035	CGC	2	6	6794	6799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
102	NC_011035	ACA	2	6	6811	6816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194097598
103	NC_011035	TAC	2	6	6897	6902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097598
104	NC_011035	GCT	2	6	7106	7111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097598
105	NC_011035	GAC	2	6	7215	7220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097598
106	NC_011035	ACC	2	6	7269	7274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194097598
107	NC_011035	GCC	2	6	7314	7319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
108	NC_011035	CGA	2	6	7417	7422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097598
109	NC_011035	CGT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097598
110	NC_011035	ACG	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097598
111	NC_011035	GCC	2	6	7575	7580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
112	NC_011035	GCG	2	6	7690	7695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
113	NC_011035	GCC	2	6	7737	7742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
114	NC_011035	CGT	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097598
115	NC_011035	CGT	2	6	7910	7915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097598
116	NC_011035	CGC	2	6	7933	7938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
117	NC_011035	TGC	2	6	7977	7982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097598
118	NC_011035	GGC	2	6	7983	7988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
119	NC_011035	GCG	2	6	7989	7994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
120	NC_011035	CTT	2	6	8042	8047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097598
121	NC_011035	CGG	2	6	8129	8134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
122	NC_011035	CCT	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194097598
123	NC_011035	CTT	2	6	8171	8176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194097598
124	NC_011035	CGA	2	6	8192	8197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194097598
125	NC_011035	GTC	2	6	8250	8255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194097598
126	NC_011035	CTA	2	6	8264	8269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194097598
127	NC_011035	GGC	2	6	8286	8291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194097598
128	NC_011035	CCG	2	6	8308	8313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
129	NC_011035	GCC	2	6	8341	8346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
130	NC_011035	CCG	2	6	8353	8358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097598
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256	NC_011035	GCC	2	6	18818	18823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194097618
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