MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF chromosome

Total Repeats: 1185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010718	AATGAA	2	12	422	433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584643
2	NC_010718	TGGCAG	2	12	561	572	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188584643
3	NC_010718	TAGAAT	2	12	2795	2806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584644
4	NC_010718	AAAAAG	2	12	3330	3341	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584646
5	NC_010718	AAAAAT	2	12	3443	3454	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188584646
6	NC_010718	ATGAAG	2	12	9860	9871	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584650
7	NC_010718	AGTATT	2	12	16875	16886	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188584651
8	NC_010718	GAAGTA	2	12	19803	19814	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584652
9	NC_010718	CTAGCA	2	12	21363	21374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188584653
10	NC_010718	TTATTT	2	12	26522	26533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188584657
11	NC_010718	AAAAAG	2	12	27623	27634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584657
12	NC_010718	AGAGAA	2	12	36927	36938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584667
13	NC_010718	TTGCGT	2	12	41610	41621	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	188584670
14	NC_010718	ACTCTT	2	12	41630	41641	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188584670
15	NC_010718	ATTCTT	2	12	44890	44901	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	188584672
16	NC_010718	ATAGTA	2	12	46544	46555	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584673
17	NC_010718	AAAATG	2	12	49004	49015	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584676
18	NC_010718	ATGGCA	2	12	50225	50236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188584678
19	NC_010718	AATTAA	2	12	51364	51375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584679
20	NC_010718	AGAAAA	2	12	56432	56443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584683
21	NC_010718	GACAGA	2	12	58272	58283	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	188584685
22	NC_010718	AAGTAG	2	12	59927	59938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584687
23	NC_010718	CTATGT	2	12	67609	67620	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188584696
24	NC_010718	AAAATC	2	12	69433	69444	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188584697
25	NC_010718	TAACAA	2	12	71371	71382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188584698
26	NC_010718	AATCTA	2	12	75691	75702	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188584703
27	NC_010718	AAAAGA	2	12	76485	76496	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584703
28	NC_010718	CAGTAG	2	12	78523	78534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188584706
29	NC_010718	GCATAT	2	12	83926	83937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188584709
30	NC_010718	AACTGA	2	12	84680	84691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188584709
31	NC_010718	ACAGCT	2	12	87595	87606	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188584713
32	NC_010718	GTAAAA	2	12	89825	89836	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584717
33	NC_010718	TAAAAA	2	12	90873	90884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	188584718
34	NC_010718	ACTGTT	2	12	92909	92920	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188584720
35	NC_010718	GGGTCT	2	12	94484	94495	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	188584720
36	NC_010718	TACTGA	2	12	97398	97409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188584723
37	NC_010718	CTCAAA	2	12	98801	98812	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	188584723
38	NC_010718	AAAGAT	2	12	99428	99439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584723
39	NC_010718	CACTCC	2	12	100433	100444	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	188584725
40	NC_010718	AGAACT	2	12	101408	101419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188584725
41	NC_010718	ATTGAT	2	12	101877	101888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188584725
42	NC_010718	CTATCA	2	12	102842	102853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584726
43	NC_010718	AAAGAC	2	12	108220	108231	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188584732
44	NC_010718	TGTAAC	2	12	115214	115225	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188584742
45	NC_010718	AGATAG	2	12	116458	116469	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584742
46	NC_010718	TTAATT	2	12	141590	141601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584760
47	NC_010718	ATTTGA	2	12	144818	144829	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188584763
48	NC_010718	CTAATC	2	12	145642	145653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584764
49	NC_010718	GAATAT	2	12	146643	146654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584764
50	NC_010718	TTAAAT	2	12	152669	152680	50 %	50 %	0 %	0 %	188584770
51	NC_010718	GTAGAT	2	12	155611	155622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584772
52	NC_010718	AATCCG	2	12	157079	157090	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188584773
53	NC_010718	AAAATC	2	12	159043	159054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188584776
54	NC_010718	TATGAA	2	12	161091	161102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584779
55	NC_010718	ACAATT	2	12	163078	163089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188584781
56	NC_010718	ATGGAA	2	12	164669	164680	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584783
57	NC_010718	AGAAGG	2	12	169458	169469	50 %	0 %	50 %	0 %	188584788
58	NC_010718	AGAAAA	2	12	170409	170420	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584788
59	NC_010718	CCATTT	2	12	174622	174633	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188584791
60	NC_010718	ATGAAG	2	12	175225	175236	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584791
61	NC_010718	TTTTGC	2	12	180080	180091	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	188584797
62	NC_010718	TTTTTA	2	12	185246	185257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	188584802
63	NC_010718	CCTTTT	2	12	186343	186354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584804
64	NC_010718	GTATAG	2	12	187537	187548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584805
65	NC_010718	AAGAGA	2	12	201156	201167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584819
66	NC_010718	CTATAG	2	12	202107	202118	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188584819
67	NC_010718	ATGAAG	2	12	203129	203140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584822
68	NC_010718	GCAAAA	2	12	203991	204002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	188584824
69	NC_010718	TTGCGT	2	12	207003	207014	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	188584827
70	NC_010718	ACTCTT	2	12	207023	207034	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	188584827
71	NC_010718	GCTAAA	2	12	214649	214660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188584829
72	NC_010718	AAGAGA	2	12	218583	218594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584834
73	NC_010718	CTATAG	2	12	219534	219545	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188584834
74	NC_010718	CTAAAA	2	12	221146	221157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	188584837
75	NC_010718	GTTAAA	2	12	221510	221521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584838
76	NC_010718	CATGAA	2	12	221533	221544	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188584838
77	NC_010718	ATGACA	2	12	226407	226418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188584850
78	NC_010718	TAAAGG	2	12	227304	227315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584851
79	NC_010718	TTGAAG	2	12	232049	232060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584860
80	NC_010718	CAAACA	2	12	232376	232387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584861
81	NC_010718	GATGTA	2	12	234391	234402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584865
82	NC_010718	AAAAGG	2	12	235452	235463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584867
83	NC_010718	AAATCT	2	12	236616	236627	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	188584868
84	NC_010718	AAAAGA	2	12	247326	247337	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	188584880
85	NC_010718	TCAAGC	2	12	248545	248556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	188584881
86	NC_010718	CCGATG	2	12	249839	249850	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	188584883
87	NC_010718	AAGTTG	2	12	250499	250510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584883
88	NC_010718	TTTAAT	2	12	252979	252990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584885
89	NC_010718	TTGAAA	2	12	256404	256415	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	188584887
90	NC_010718	GAAGAT	2	12	264806	264817	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584892
91	NC_010718	GCTTTA	2	12	267411	267422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	188584894
92	NC_010718	GTTTAT	2	12	269499	269510	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188584897
93	NC_010718	AGATGA	2	12	273125	273136	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584900
94	NC_010718	ATTTTA	2	12	275547	275558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584902
95	NC_010718	ATTATG	2	12	276794	276805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188584903
96	NC_010718	GTTTTA	2	12	278089	278100	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188584905
97	NC_010718	TTTGGT	2	12	279812	279823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584907
98	NC_010718	ATGAAA	2	12	282000	282011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584909
99	NC_010718	ACATTC	2	12	282073	282084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584909
100	NC_010718	ATAAAT	2	12	283452	283463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584910
101	NC_010718	GGAATT	2	12	287961	287972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584914
102	NC_010718	CTTTTG	2	12	291331	291342	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	188584917
103	NC_010718	CTGCTA	2	12	294047	294058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	188584921
104	NC_010718	TTATGT	2	12	296546	296557	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188584924
105	NC_010718	GGATAC	2	12	297871	297882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	188584925
106	NC_010718	CTATGG	2	12	299033	299044	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188584926
107	NC_010718	TTGGAT	2	12	299126	299137	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	188584926
108	NC_010718	CATGGG	2	12	299346	299357	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	188584927
109	NC_010718	ATGGAT	2	12	301739	301750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584929
110	NC_010718	AGATGT	2	12	301849	301860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584929
111	NC_010718	GCAATA	2	12	306151	306162	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	188584934
112	NC_010718	ATGTTT	2	12	308838	308849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	188584936
113	NC_010718	AGAAAT	2	12	335787	335798	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188584959
114	NC_010718	GATATG	2	12	335961	335972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584959
115	NC_010718	TTTCCT	2	12	341851	341862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584966
116	NC_010718	TAAAGG	2	12	342123	342134	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	188584966
117	NC_010718	TATAAT	2	12	343600	343611	50 %	50 %	0 %	0 %	188584966
118	NC_010718	GTTAAT	2	12	346635	346646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188584969
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349	NC_010718	TACAGT	2	12	921759	921770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	188585501
350	NC_010718	AGCGGC	2	12	922395	922406	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	188585501
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352	NC_010718	GATTAT	2	12	923812	923823	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188585503
353	NC_010718	TGGCAT	2	12	928783	928794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	188585509
354	NC_010718	AAAGAT	2	12	930693	930704	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	188585511
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461	NC_010718	TTGAAT	2	12	1258607	1258618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	188585812
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