MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF chromosome

Total Repeats: 39243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010718	GAA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
2	NC_010718	AGA	2	6	184	189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
3	NC_010718	AGT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584643
4	NC_010718	TTA	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584643
5	NC_010718	GAA	2	6	410	415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
6	NC_010718	TGC	2	6	550	555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584643
7	NC_010718	TCA	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584643
8	NC_010718	TAA	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584643
9	NC_010718	AAG	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
10	NC_010718	TCC	2	6	907	912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584643
11	NC_010718	AGA	2	6	931	936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
12	NC_010718	ATG	2	6	1053	1058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584643
13	NC_010718	TCA	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584643
14	NC_010718	TAA	2	6	1147	1152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584643
15	NC_010718	CAG	2	6	1170	1175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584643
16	NC_010718	TAA	2	6	1201	1206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584643
17	NC_010718	TGA	2	6	1273	1278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584643
18	NC_010718	AAG	2	6	1289	1294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584643
19	NC_010718	TGG	2	6	1387	1392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584643
20	NC_010718	TAC	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584643
21	NC_010718	ATA	2	6	1898	1903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584644
22	NC_010718	ACT	2	6	1943	1948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
23	NC_010718	GTT	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584644
24	NC_010718	CTA	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
25	NC_010718	ATA	2	6	2008	2013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584644
26	NC_010718	ATT	2	6	2060	2065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584644
27	NC_010718	GAA	2	6	2119	2124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
28	NC_010718	GAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
29	NC_010718	TCA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
30	NC_010718	AGA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
31	NC_010718	ATA	2	6	2273	2278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584644
32	NC_010718	AGA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
33	NC_010718	AGA	2	6	2697	2702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
34	NC_010718	AAG	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
35	NC_010718	GAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584644
36	NC_010718	ATC	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584644
37	NC_010718	TTG	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584645
38	NC_010718	TTG	2	6	2982	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584645
39	NC_010718	AGA	3	9	3019	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584645
40	NC_010718	ATA	2	6	3133	3138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584645
41	NC_010718	AAT	2	6	3418	3423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584646
42	NC_010718	TAA	2	6	3463	3468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584646
43	NC_010718	ATA	2	6	3561	3566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584646
44	NC_010718	ATT	2	6	3630	3635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584646
45	NC_010718	CCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584646
46	NC_010718	AGA	2	6	3760	3765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584646
47	NC_010718	AAC	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584646
48	NC_010718	GAT	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584646
49	NC_010718	ACA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584646
50	NC_010718	TAC	2	6	4054	4059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584646
51	NC_010718	TTA	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584647
52	NC_010718	ATT	2	6	4390	4395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584647
53	NC_010718	GAA	2	6	4413	4418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
54	NC_010718	TAG	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584647
55	NC_010718	AGT	2	6	4556	4561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584647
56	NC_010718	TAA	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584647
57	NC_010718	AGA	2	6	4841	4846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
58	NC_010718	TAA	2	6	4873	4878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584647
59	NC_010718	AAG	2	6	4921	4926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
60	NC_010718	AAG	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
61	NC_010718	GAA	2	6	5103	5108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584647
62	NC_010718	TGA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584647
63	NC_010718	TAA	2	6	5183	5188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584647
64	NC_010718	TTC	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584648
65	NC_010718	AGA	2	6	5292	5297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584648
66	NC_010718	GAA	3	9	5329	5337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584648
67	NC_010718	ATA	2	6	5351	5356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584648
68	NC_010718	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584648
69	NC_010718	GAA	2	6	5488	5493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584648
70	NC_010718	ATA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584648
71	NC_010718	TAA	2	6	5515	5520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584648
72	NC_010718	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
73	NC_010718	ATG	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584649
74	NC_010718	GAT	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584649
75	NC_010718	TGG	2	6	5940	5945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584649
76	NC_010718	CAA	2	6	6028	6033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584649
77	NC_010718	TGA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584649
78	NC_010718	AGA	2	6	6228	6233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
79	NC_010718	AGA	2	6	6243	6248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
80	NC_010718	GGT	2	6	6265	6270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584649
81	NC_010718	AAC	2	6	6306	6311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584649
82	NC_010718	CCA	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584649
83	NC_010718	AAG	2	6	6347	6352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
84	NC_010718	ATA	2	6	6419	6424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584649
85	NC_010718	TAT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584649
86	NC_010718	AGA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
87	NC_010718	TAA	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584649
88	NC_010718	AGC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	188584649
89	NC_010718	AGA	2	6	6784	6789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
90	NC_010718	TAC	2	6	6837	6842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584649
91	NC_010718	TGG	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584649
92	NC_010718	TAT	2	6	7014	7019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584649
93	NC_010718	GAA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
94	NC_010718	AAT	3	9	7080	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584649
95	NC_010718	TCT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	188584649
96	NC_010718	AAG	3	9	7216	7224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
97	NC_010718	TAC	2	6	7234	7239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584649
98	NC_010718	TTA	2	6	7267	7272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584649
99	NC_010718	AAG	2	6	7286	7291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
100	NC_010718	AAC	2	6	7350	7355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584649
101	NC_010718	GAA	2	6	7471	7476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584649
102	NC_010718	TAT	2	6	7590	7595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584650
103	NC_010718	AGT	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
104	NC_010718	AAG	2	6	7637	7642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
105	NC_010718	TCG	2	6	7731	7736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584650
106	NC_010718	GTT	2	6	7801	7806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	188584650
107	NC_010718	ATC	2	6	7826	7831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584650
108	NC_010718	TGG	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584650
109	NC_010718	TGC	3	9	7944	7952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	188584650
110	NC_010718	ATT	2	6	7995	8000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584650
111	NC_010718	CAA	2	6	8032	8037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584650
112	NC_010718	TAC	2	6	8069	8074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584650
113	NC_010718	TCC	2	6	8142	8147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	188584650
114	NC_010718	GGA	2	6	8254	8259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	188584650
115	NC_010718	ACT	2	6	8563	8568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584650
116	NC_010718	TTA	2	6	8675	8680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584650
117	NC_010718	AAT	2	6	8755	8760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584650
118	NC_010718	AAG	2	6	8813	8818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
119	NC_010718	GAA	2	6	8917	8922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
120	NC_010718	AGA	2	6	8939	8944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
121	NC_010718	ACT	2	6	8948	8953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584650
122	NC_010718	ACA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	188584650
123	NC_010718	ATT	2	6	8992	8997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584650
124	NC_010718	AGA	2	6	9000	9005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
125	NC_010718	TAG	2	6	9036	9041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
126	NC_010718	TAA	2	6	9057	9062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	188584650
127	NC_010718	TGA	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
128	NC_010718	AGA	2	6	9081	9086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
129	NC_010718	TGA	2	6	9096	9101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
130	NC_010718	GGT	2	6	9178	9183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	188584650
131	NC_010718	ACT	2	6	9202	9207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	188584650
132	NC_010718	GAT	2	6	9214	9219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
133	NC_010718	TGA	2	6	9372	9377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
134	NC_010718	GAT	2	6	9526	9531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584650
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136	NC_010718	AGA	3	9	9612	9620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	188584650
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145	NC_010718	TAT	2	6	16519	16524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	188584651
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168	NC_010718	TGA	3	9	18656	18664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	188584652
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253	NC_010718	ACC	2	6	26508	26513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	188584657
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