MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN04

Total Repeats: 968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010633	GCA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
2	NC_010633	TTA	2	6	1288	1293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
3	NC_010633	T	6	6	1310	1315	0 %	100 %	0 %	0 %	186687000
4	NC_010633	TTTA	2	8	1362	1369	25 %	75 %	0 %	0 %	186687000
5	NC_010633	CAC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
6	NC_010633	TAA	2	6	1568	1573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
7	NC_010633	CAT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
8	NC_010633	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186687000
9	NC_010633	TTA	2	6	1861	1866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
10	NC_010633	TGAG	2	8	1873	1880	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
11	NC_010633	CTG	3	9	1943	1951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687000
12	NC_010633	CCA	2	6	1975	1980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
13	NC_010633	ACC	2	6	2040	2045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
14	NC_010633	CAC	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
15	NC_010633	TAA	2	6	2129	2134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
16	NC_010633	CAT	2	6	2162	2167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
17	NC_010633	GAA	2	6	2329	2334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186687000
18	NC_010633	TTA	2	6	2422	2427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
19	NC_010633	CCG	2	6	2596	2601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186687000
20	NC_010633	CCA	2	6	2839	2844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
21	NC_010633	AGC	2	6	2982	2987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
22	NC_010633	TCAAT	2	10	3005	3014	40 %	40 %	0 %	20 %	186687000
23	NC_010633	CTT	2	6	3017	3022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687000
24	NC_010633	ATC	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
25	NC_010633	TCA	2	6	3142	3147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
26	NC_010633	AAGG	2	8	3163	3170	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
27	NC_010633	GA	3	6	3181	3186	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
28	NC_010633	ACA	2	6	3391	3396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687000
29	NC_010633	ATCA	2	8	3477	3484	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
30	NC_010633	ACC	2	6	3525	3530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
31	NC_010633	GTC	2	6	3540	3545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687000
32	NC_010633	CCA	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
33	NC_010633	TGA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687000
34	NC_010633	CAT	2	6	3566	3571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
35	NC_010633	GCA	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
36	NC_010633	ATCCC	2	10	3610	3619	20 %	20 %	0 %	60 %	186687000
37	NC_010633	TCA	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
38	NC_010633	TCA	2	6	3691	3696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
39	NC_010633	TGCCAC	2	12	3716	3727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186687000
40	NC_010633	GAT	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687000
41	NC_010633	CCA	2	6	3745	3750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
42	NC_010633	TCT	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687000
43	NC_010633	AAC	2	6	3867	3872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687000
44	NC_010633	GA	3	6	3885	3890	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
45	NC_010633	GACG	2	8	3893	3900	25 %	0 %	50 %	25 %	186687000
46	NC_010633	CCT	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186687000
47	NC_010633	ATC	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
48	NC_010633	AGTC	3	12	4142	4153	25 %	25 %	25 %	25 %	186687000
49	NC_010633	TTG	2	6	4209	4214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186687000
50	NC_010633	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186687000
51	NC_010633	GCA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
52	NC_010633	TTAA	2	8	4408	4415	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
53	NC_010633	ATA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
54	NC_010633	T	6	6	4449	4454	0 %	100 %	0 %	0 %	186687000
55	NC_010633	CTTC	2	8	4513	4520	0 %	50 %	0 %	50 %	186687000
56	NC_010633	ACC	2	6	4528	4533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
57	NC_010633	TA	3	6	4607	4612	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
58	NC_010633	ATC	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
59	NC_010633	TCC	3	9	4677	4685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186687000
60	NC_010633	AGA	2	6	4691	4696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186687000
61	NC_010633	CAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
62	NC_010633	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
63	NC_010633	AG	3	6	4782	4787	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
64	NC_010633	CAG	2	6	4814	4819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
65	NC_010633	ATC	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
66	NC_010633	TTA	2	6	4975	4980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
67	NC_010633	AGGAA	2	10	5005	5014	60 %	0 %	40 %	0 %	186687000
68	NC_010633	TCA	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
69	NC_010633	TGT	2	6	5094	5099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186687000
70	NC_010633	CTA	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
71	NC_010633	CTAA	2	8	5167	5174	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
72	NC_010633	CAT	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
73	NC_010633	TAT	2	6	5219	5224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
74	NC_010633	AAT	2	6	5229	5234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
75	NC_010633	GTTT	2	8	5239	5246	0 %	75 %	25 %	0 %	186687000
76	NC_010633	CTT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687000
77	NC_010633	CAA	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687000
78	NC_010633	CCT	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186687000
79	NC_010633	TGAG	2	8	5540	5547	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
80	NC_010633	TAT	2	6	5552	5557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
81	NC_010633	CCA	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
82	NC_010633	AT	3	6	5577	5582	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
83	NC_010633	CCA	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
84	NC_010633	TCC	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186687000
85	NC_010633	CAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687000
86	NC_010633	TGTAGT	2	12	5681	5692	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	186687000
87	NC_010633	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687000
88	NC_010633	AACT	2	8	5744	5751	50 %	25 %	0 %	25 %	186687000
89	NC_010633	CCT	2	6	5764	5769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186687000
90	NC_010633	AAT	2	6	5775	5780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
91	NC_010633	AT	3	6	5787	5792	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
92	NC_010633	ACC	2	6	5829	5834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
93	NC_010633	CAC	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
94	NC_010633	CTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687000
95	NC_010633	CAC	2	6	5924	5929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
96	NC_010633	CTGTT	2	10	5945	5954	0 %	60 %	20 %	20 %	186687000
97	NC_010633	TGG	2	6	6020	6025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186687000
98	NC_010633	AT	3	6	6027	6032	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
99	NC_010633	ACC	2	6	6045	6050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
100	NC_010633	TCA	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
101	NC_010633	CTTG	2	8	6121	6128	0 %	50 %	25 %	25 %	186687000
102	NC_010633	TCA	2	6	6133	6138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
103	NC_010633	GT	3	6	6266	6271	0 %	50 %	50 %	0 %	186687000
104	NC_010633	CAT	2	6	6311	6316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
105	NC_010633	GATG	2	8	6385	6392	25 %	25 %	50 %	0 %	186687000
106	NC_010633	TAT	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
107	NC_010633	GTC	2	6	6486	6491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687000
108	NC_010633	ATA	2	6	6501	6506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
109	NC_010633	TAAG	2	8	6590	6597	50 %	25 %	25 %	0 %	186687000
110	NC_010633	GCA	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
111	NC_010633	T	6	6	6644	6649	0 %	100 %	0 %	0 %	186687000
112	NC_010633	AAT	2	6	6658	6663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
113	NC_010633	GTT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186687000
114	NC_010633	AT	3	6	6719	6724	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
115	NC_010633	AATCA	2	10	6741	6750	60 %	20 %	0 %	20 %	186687000
116	NC_010633	TGT	2	6	6801	6806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186687000
117	NC_010633	TA	3	6	6825	6830	50 %	50 %	0 %	0 %	186687000
118	NC_010633	CAA	2	6	6842	6847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687000
119	NC_010633	TAATT	2	10	7047	7056	40 %	60 %	0 %	0 %	186687000
120	NC_010633	AG	3	6	7072	7077	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
121	NC_010633	AG	3	6	7097	7102	50 %	0 %	50 %	0 %	186687000
122	NC_010633	AAAT	2	8	7134	7141	75 %	25 %	0 %	0 %	186687000
123	NC_010633	CAC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687000
124	NC_010633	AGT	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687000
125	NC_010633	AGT	2	6	7276	7281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687000
126	NC_010633	T	6	6	7381	7386	0 %	100 %	0 %	0 %	186687000
127	NC_010633	ACT	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
128	NC_010633	AGA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186687000
129	NC_010633	CTT	3	9	7503	7511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687000
130	NC_010633	ATA	2	6	7531	7536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
131	NC_010633	GCA	3	9	7573	7581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186687000
132	NC_010633	CAA	2	6	7634	7639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687000
133	NC_010633	TTA	2	6	7684	7689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687000
134	NC_010633	CAT	2	6	7913	7918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687000
135	NC_010633	T	6	6	7961	7966	0 %	100 %	0 %	0 %	186687000
136	NC_010633	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687000
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139	NC_010633	A	6	6	8174	8179	100 %	0 %	0 %	0 %	186687000
140	NC_010633	GT	3	6	8198	8203	0 %	50 %	50 %	0 %	186687000
141	NC_010633	CATTGA	2	12	8204	8215	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186687000
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149	NC_010633	CTG	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687000
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156	NC_010633	G	6	6	9133	9138	0 %	0 %	100 %	0 %	186687001
157	NC_010633	TAC	2	6	9170	9175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687001
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159	NC_010633	GTA	2	6	9222	9227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687001
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250	NC_010633	ATA	2	6	15097	15102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687005
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252	NC_010633	AAT	2	6	15308	15313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186687005
253	NC_010633	AATCTA	2	12	15331	15342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186687005
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260	NC_010633	CCA	2	6	15599	15604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687006
261	NC_010633	TCT	2	6	15686	15691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687006
262	NC_010633	CTTC	2	8	15749	15756	0 %	50 %	0 %	50 %	186687006
263	NC_010633	AG	3	6	15785	15790	50 %	0 %	50 %	0 %	186687006
264	NC_010633	T	6	6	15791	15796	0 %	100 %	0 %	0 %	186687006
265	NC_010633	CAAC	2	8	15911	15918	50 %	0 %	0 %	50 %	186687006
266	NC_010633	CAT	2	6	15992	15997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687006
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293	NC_010633	A	6	6	18185	18190	100 %	0 %	0 %	0 %	186687009
294	NC_010633	ATT	2	6	18215	18220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687009
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305	NC_010633	AG	3	6	18724	18729	50 %	0 %	50 %	0 %	186687010
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381	NC_010633	AATT	2	8	23823	23830	50 %	50 %	0 %	0 %	186687017
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384	NC_010633	CTTGA	2	10	24033	24042	20 %	40 %	20 %	20 %	186687017
385	NC_010633	CAA	2	6	24068	24073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687017
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388	NC_010633	AT	3	6	24244	24249	50 %	50 %	0 %	0 %	186687017
389	NC_010633	CAA	2	6	24261	24266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186687017
390	NC_010633	TGC	2	6	24315	24320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687017
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392	NC_010633	GCTT	2	8	24422	24429	0 %	50 %	25 %	25 %	186687017
393	NC_010633	ATC	2	6	24453	24458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687017
394	NC_010633	TGG	2	6	24474	24479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186687017
395	NC_010633	CTT	2	6	24548	24553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186687017
396	NC_010633	CTTT	2	8	24592	24599	0 %	75 %	0 %	25 %	186687017
397	NC_010633	TCAA	2	8	24679	24686	50 %	25 %	0 %	25 %	186687017
398	NC_010633	CGGCG	2	10	24717	24726	0 %	0 %	60 %	40 %	186687017
399	NC_010633	TAG	2	6	24803	24808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186687017
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401	NC_010633	TGC	2	6	24894	24899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687017
402	NC_010633	GTTGCA	2	12	24920	24931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186687017
403	NC_010633	TGC	2	6	25011	25016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687017
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405	NC_010633	CCA	2	6	25201	25206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186687017
406	NC_010633	TAT	2	6	25260	25265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186687017
407	NC_010633	AAG	2	6	25331	25336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186687017
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410	NC_010633	ATC	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186687017
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414	NC_010633	TGC	2	6	25613	25618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687018
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428	NC_010633	CTG	2	6	26504	26509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186687019
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432	NC_010633	TTG	2	6	26980	26985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186687019
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461	NC_010633	GGT	2	6	28731	28736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186687022
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499	NC_010633	CCT	2	6	31413	31418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186687026
500	NC_010633	CCAG	2	8	31451	31458	25 %	0 %	25 %	50 %	186687026

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