MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010632	ATTTT	2	10	1149	1158	20 %	80 %	0 %	0 %	186687049
2	NC_010632	AACTG	2	10	1821	1830	40 %	20 %	20 %	20 %	186687050
3	NC_010632	TCAAC	2	10	3246	3255	40 %	20 %	0 %	40 %	186687052
4	NC_010632	GAAAA	2	10	4257	4266	80 %	0 %	20 %	0 %	186687053
5	NC_010632	TACCT	2	10	7545	7554	20 %	40 %	0 %	40 %	186687055
6	NC_010632	AACAA	2	10	9116	9125	80 %	0 %	0 %	20 %	186687055
7	NC_010632	ATTCT	2	10	12362	12371	20 %	60 %	0 %	20 %	186687056
8	NC_010632	TAAAT	2	10	12904	12913	60 %	40 %	0 %	0 %	186687057
9	NC_010632	ACCGA	2	10	16535	16544	40 %	0 %	20 %	40 %	186687062
10	NC_010632	AATTA	2	10	16826	16835	60 %	40 %	0 %	0 %	186687062
11	NC_010632	TTTTG	2	10	16912	16921	0 %	80 %	20 %	0 %	186687062
12	NC_010632	TCGGC	2	10	23304	23313	0 %	20 %	40 %	40 %	186687075
13	NC_010632	AGAGA	2	10	30084	30093	60 %	0 %	40 %	0 %	186687080
14	NC_010632	TAGTA	2	10	33204	33213	40 %	40 %	20 %	0 %	186687081
15	NC_010632	GTCGC	2	10	34675	34684	0 %	20 %	40 %	40 %	186687083
16	NC_010632	AGAGC	2	10	35256	35265	40 %	0 %	40 %	20 %	186687084
17	NC_010632	GATTG	2	10	37792	37801	20 %	40 %	40 %	0 %	186687086
18	NC_010632	TCTCT	2	10	38786	38795	0 %	60 %	0 %	40 %	186687087
19	NC_010632	GCAAC	2	10	38987	38996	40 %	0 %	20 %	40 %	186687087
20	NC_010632	TTAGT	2	10	40885	40894	20 %	60 %	20 %	0 %	186687089
21	NC_010632	TGCTT	2	10	44355	44364	0 %	60 %	20 %	20 %	186687093
22	NC_010632	TGTAA	2	10	45034	45043	40 %	40 %	20 %	0 %	186687094
23	NC_010632	AACAG	2	10	45857	45866	60 %	0 %	20 %	20 %	186687096
24	NC_010632	TAATT	2	10	49798	49807	40 %	60 %	0 %	0 %	186687098
25	NC_010632	TACCA	2	10	51052	51061	40 %	20 %	0 %	40 %	186687099
26	NC_010632	TTATT	2	10	52307	52316	20 %	80 %	0 %	0 %	186687099
27	NC_010632	CACTG	2	10	54158	54167	20 %	20 %	20 %	40 %	186687100
28	NC_010632	AAGTC	2	10	55525	55534	40 %	20 %	20 %	20 %	186687102
29	NC_010632	GGACA	2	10	56259	56268	40 %	0 %	40 %	20 %	186687102
30	NC_010632	GGAGA	2	10	56304	56313	40 %	0 %	60 %	0 %	186687102
31	NC_010632	GCTGT	2	10	57221	57230	0 %	40 %	40 %	20 %	186687104
32	NC_010632	TGAAC	2	10	57725	57734	40 %	20 %	20 %	20 %	186687105
33	NC_010632	TCTAC	2	10	61547	61556	20 %	40 %	0 %	40 %	186687110
34	NC_010632	GCTGT	2	10	63945	63954	0 %	40 %	40 %	20 %	186687113
35	NC_010632	CAAAC	2	10	65655	65664	60 %	0 %	0 %	40 %	186687118
36	NC_010632	CGTAA	2	10	72000	72009	40 %	20 %	20 %	20 %	186687121
37	NC_010632	GCGGG	2	10	83960	83969	0 %	0 %	80 %	20 %	186687127
38	NC_010632	TGCGA	2	10	88197	88206	20 %	20 %	40 %	20 %	186687128
39	NC_010632	ACCAA	2	10	88749	88758	60 %	0 %	0 %	40 %	186687128
40	NC_010632	TGGTT	2	10	89359	89368	0 %	60 %	40 %	0 %	186687128
41	NC_010632	TTATT	2	10	90045	90054	20 %	80 %	0 %	0 %	186687128
42	NC_010632	CAACC	2	10	93371	93380	40 %	0 %	0 %	60 %	186687130
43	NC_010632	ACCAA	2	10	93999	94008	60 %	0 %	0 %	40 %	186687130
44	NC_010632	TTGTT	2	10	94115	94124	0 %	80 %	20 %	0 %	186687130
45	NC_010632	AGCCA	2	10	94502	94511	40 %	0 %	20 %	40 %	186687130
46	NC_010632	CAAAA	2	10	95035	95044	80 %	0 %	0 %	20 %	186687130
47	NC_010632	CGCTA	2	10	95297	95306	20 %	20 %	20 %	40 %	186687130
48	NC_010632	GATGA	2	10	101983	101992	40 %	20 %	40 %	0 %	186687133
49	NC_010632	CCTTG	2	10	102055	102064	0 %	40 %	20 %	40 %	186687133
50	NC_010632	CAACC	2	10	106553	106562	40 %	0 %	0 %	60 %	186687139
51	NC_010632	CCCAT	2	10	110843	110852	20 %	20 %	0 %	60 %	186687146
52	NC_010632	TAGAC	2	10	122179	122188	40 %	20 %	20 %	20 %	186687157
53	NC_010632	CTATA	2	10	125491	125500	40 %	40 %	0 %	20 %	186687161
54	NC_010632	GGCAT	2	10	125778	125787	20 %	20 %	40 %	20 %	186687161
55	NC_010632	TTTAG	2	10	126597	126606	20 %	60 %	20 %	0 %	186687161
56	NC_010632	CAATA	2	10	129280	129289	60 %	20 %	0 %	20 %	186687163
57	NC_010632	TGGTT	2	10	132094	132103	0 %	60 %	40 %	0 %	186687164
58	NC_010632	CAAAG	2	10	132238	132247	60 %	0 %	20 %	20 %	186687164
59	NC_010632	AACTA	2	10	133350	133359	60 %	20 %	0 %	20 %	186687164
60	NC_010632	ACTAC	2	10	134843	134852	40 %	20 %	0 %	40 %	186687164
61	NC_010632	GGGCT	2	10	138762	138771	0 %	20 %	60 %	20 %	186687168
62	NC_010632	AAATA	2	10	139555	139564	80 %	20 %	0 %	0 %	186687169
63	NC_010632	TAATT	2	10	140920	140929	40 %	60 %	0 %	0 %	186687170
64	NC_010632	GCAGA	2	10	146074	146083	40 %	0 %	40 %	20 %	186687173
65	NC_010632	AAGCC	2	10	146310	146319	40 %	0 %	20 %	40 %	186687173
66	NC_010632	GAACT	2	10	149126	149135	40 %	20 %	20 %	20 %	186687175
67	NC_010632	ACTCA	2	10	151460	151469	40 %	20 %	0 %	40 %	186687177
68	NC_010632	CAGTA	2	10	153141	153150	40 %	20 %	20 %	20 %	186687178
69	NC_010632	TTGGT	2	10	153257	153266	0 %	60 %	40 %	0 %	186687178
70	NC_010632	GTGTT	2	10	153611	153620	0 %	60 %	40 %	0 %	186687178
71	NC_010632	TCGGT	2	10	154514	154523	0 %	40 %	40 %	20 %	186687178
72	NC_010632	AAAAG	2	10	166354	166363	80 %	0 %	20 %	0 %	186687186
73	NC_010632	TATTT	2	10	166420	166429	20 %	80 %	0 %	0 %	186687186
74	NC_010632	CGATG	2	10	171220	171229	20 %	20 %	40 %	20 %	186687192
75	NC_010632	AAGAA	2	10	176119	176128	80 %	0 %	20 %	0 %	186687196
76	NC_010632	CTTGC	2	10	177993	178002	0 %	40 %	20 %	40 %	186687197
77	NC_010632	CTTTA	2	10	179484	179493	20 %	60 %	0 %	20 %	186687198
78	NC_010632	CCAAG	2	10	181844	181853	40 %	0 %	20 %	40 %	186687199
79	NC_010632	CTAAA	2	10	183634	183643	60 %	20 %	0 %	20 %	186687200
80	NC_010632	CATTA	2	10	184919	184928	40 %	40 %	0 %	20 %	186687200
81	NC_010632	TTTCT	2	10	187057	187066	0 %	80 %	0 %	20 %	186687202
82	NC_010632	CTTAG	2	10	189281	189290	20 %	40 %	20 %	20 %	186687203
83	NC_010632	CGGGT	2	10	191290	191299	0 %	20 %	60 %	20 %	186687204
84	NC_010632	ATTAT	2	10	191799	191808	40 %	60 %	0 %	0 %	186687204
85	NC_010632	AATGA	2	10	193410	193419	60 %	20 %	20 %	0 %	186687204
86	NC_010632	AAAAT	2	10	198234	198243	80 %	20 %	0 %	0 %	186687206
87	NC_010632	TTGAA	2	10	198275	198284	40 %	40 %	20 %	0 %	186687206
88	NC_010632	TTGCC	2	10	201379	201388	0 %	40 %	20 %	40 %	186687208
89	NC_010632	TCAAA	2	10	202390	202399	60 %	20 %	0 %	20 %	186687210
90	NC_010632	TACTC	2	10	202940	202949	20 %	40 %	0 %	40 %	186687210
91	NC_010632	GTAGT	2	10	203382	203391	20 %	40 %	40 %	0 %	186687210
92	NC_010632	TATCG	2	10	205139	205148	20 %	40 %	20 %	20 %	186687211
93	NC_010632	CTGAC	2	10	205213	205222	20 %	20 %	20 %	40 %	186687211
94	NC_010632	CCCGA	2	10	205272	205281	20 %	0 %	20 %	60 %	186687211
95	NC_010632	ATGGA	2	10	206481	206490	40 %	20 %	40 %	0 %	186687212
96	NC_010632	TGGGA	2	10	207436	207445	20 %	20 %	60 %	0 %	186687213
97	NC_010632	CTTTG	2	10	207564	207573	0 %	60 %	20 %	20 %	186687213
98	NC_010632	TAAAT	2	10	214050	214059	60 %	40 %	0 %	0 %	186687219
99	NC_010632	CTACA	2	10	217362	217371	40 %	20 %	0 %	40 %	186687220
100	NC_010632	GGTGA	2	10	218658	218667	20 %	20 %	60 %	0 %	186687221
101	NC_010632	GAAAA	2	10	218829	218838	80 %	0 %	20 %	0 %	186687221
102	NC_010632	CAAAA	2	10	222143	222152	80 %	0 %	0 %	20 %	186687226
103	NC_010632	GTGCT	2	10	223796	223805	0 %	40 %	40 %	20 %	186687227
104	NC_010632	AAGCA	2	10	225468	225477	60 %	0 %	20 %	20 %	186687229
105	NC_010632	TGAGT	2	10	227808	227817	20 %	40 %	40 %	0 %	186687231
106	NC_010632	CTGTT	2	10	227943	227952	0 %	60 %	20 %	20 %	186687231
107	NC_010632	AAAGT	2	10	228059	228068	60 %	20 %	20 %	0 %	186687231
108	NC_010632	AAGAA	2	10	233437	233446	80 %	0 %	20 %	0 %	186687233
109	NC_010632	TGAAT	2	10	235921	235930	40 %	40 %	20 %	0 %	186687236
110	NC_010632	TGGCG	2	10	237549	237558	0 %	20 %	60 %	20 %	186687237
111	NC_010632	CCACT	2	10	245171	245180	20 %	20 %	0 %	60 %	186687239
112	NC_010632	CCATA	2	10	247896	247905	40 %	20 %	0 %	40 %	186687241
113	NC_010632	ATTTC	2	10	251881	251890	20 %	60 %	0 %	20 %	186687244

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.