MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis 053442 chromosome

Total Repeats: 38304

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_010120	TC	3	6	2135694	2135699	0 %	50 %	0 %	50 %	161871005
38002	NC_010120	GGC	2	6	2135761	2135766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871005
38003	NC_010120	GGGC	2	8	2135838	2135845	0 %	0 %	75 %	25 %	161871005
38004	NC_010120	ATG	2	6	2135887	2135892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871005
38005	NC_010120	ACG	2	6	2135939	2135944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871005
38006	NC_010120	TTG	2	6	2135962	2135967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871005
38007	NC_010120	CAT	2	6	2135995	2136000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871005
38008	NC_010120	CGGCG	2	10	2136002	2136011	0 %	0 %	60 %	40 %	161871005
38009	NC_010120	CTA	2	6	2136066	2136071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871005
38010	NC_010120	TGT	2	6	2136194	2136199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871005
38011	NC_010120	T	6	6	2136210	2136215	0 %	100 %	0 %	0 %	161871005
38012	NC_010120	TTG	2	6	2136283	2136288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871005
38013	NC_010120	CGA	2	6	2136359	2136364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871005
38014	NC_010120	CCG	2	6	2136471	2136476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871005
38015	NC_010120	GCC	2	6	2136539	2136544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871006
38016	NC_010120	CAA	2	6	2136592	2136597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161871006
38017	NC_010120	GCT	2	6	2136618	2136623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161871006
38018	NC_010120	GAA	2	6	2136653	2136658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161871006
38019	NC_010120	AAG	2	6	2136672	2136677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161871006
38020	NC_010120	CATT	2	8	2136844	2136851	25 %	50 %	0 %	25 %	161871006
38021	NC_010120	AC	3	6	2136870	2136875	50 %	0 %	0 %	50 %	161871006
38022	NC_010120	ATG	2	6	2136909	2136914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871006
38023	NC_010120	GAT	2	6	2136920	2136925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871006
38024	NC_010120	GAT	2	6	2136971	2136976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871006
38025	NC_010120	ATG	2	6	2137007	2137012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871006
38026	NC_010120	CTG	2	6	2137013	2137018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161871006
38027	NC_010120	TCC	2	6	2137031	2137036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161871006
38028	NC_010120	ATC	2	6	2137148	2137153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871006
38029	NC_010120	CCT	2	6	2137155	2137160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161871006
38030	NC_010120	ACC	2	6	2137326	2137331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161871007
38031	NC_010120	ATT	2	6	2137448	2137453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161871007
38032	NC_010120	ACA	2	6	2137608	2137613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161871007
38033	NC_010120	A	6	6	2137623	2137628	100 %	0 %	0 %	0 %	161871007
38034	NC_010120	CCTG	2	8	2137651	2137658	0 %	25 %	25 %	50 %	161871007
38035	NC_010120	CGA	2	6	2137708	2137713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871007
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38037	NC_010120	CAAAT	2	10	2137796	2137805	60 %	20 %	0 %	20 %	161871007
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38039	NC_010120	CTT	2	6	2137864	2137869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161871008
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38041	NC_010120	AC	4	8	2137919	2137926	50 %	0 %	0 %	50 %	161871008
38042	NC_010120	CTG	2	6	2137927	2137932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161871008
38043	NC_010120	AAC	2	6	2137995	2138000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161871008
38044	NC_010120	AAAT	2	8	2138011	2138018	75 %	25 %	0 %	0 %	161871008
38045	NC_010120	GCA	2	6	2138318	2138323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871009
38046	NC_010120	CATA	2	8	2138380	2138387	50 %	25 %	0 %	25 %	161871009
38047	NC_010120	A	6	6	2138409	2138414	100 %	0 %	0 %	0 %	161871009
38048	NC_010120	TGA	2	6	2138423	2138428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871009
38049	NC_010120	A	6	6	2138440	2138445	100 %	0 %	0 %	0 %	161871009
38050	NC_010120	GTT	2	6	2138446	2138451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871009
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38052	NC_010120	GTT	2	6	2138559	2138564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871009
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38054	NC_010120	CA	3	6	2138589	2138594	50 %	0 %	0 %	50 %	161871009
38055	NC_010120	A	7	7	2138676	2138682	100 %	0 %	0 %	0 %	161871009
38056	NC_010120	CGA	2	6	2139144	2139149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871010
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38058	NC_010120	A	7	7	2139317	2139323	100 %	0 %	0 %	0 %	161871010
38059	NC_010120	A	6	6	2139615	2139620	100 %	0 %	0 %	0 %	161871011
38060	NC_010120	T	7	7	2139641	2139647	0 %	100 %	0 %	0 %	161871011
38061	NC_010120	CCGT	2	8	2139661	2139668	0 %	25 %	25 %	50 %	161871011
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38105	NC_010120	CAAT	2	8	2141949	2141956	50 %	25 %	0 %	25 %	161871013
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38119	NC_010120	CG	3	6	2142902	2142907	0 %	0 %	50 %	50 %	161871014
38120	NC_010120	TGT	2	6	2142924	2142929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871014
38121	NC_010120	CAG	2	6	2142931	2142936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871014
38122	NC_010120	ATC	2	6	2142940	2142945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871014
38123	NC_010120	GCA	2	6	2142950	2142955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871014
38124	NC_010120	GCC	2	6	2142998	2143003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871014
38125	NC_010120	TGT	2	6	2143101	2143106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161871014
38126	NC_010120	ATC	2	6	2143201	2143206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871014
38127	NC_010120	GCC	2	6	2143217	2143222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871014
38128	NC_010120	CGA	2	6	2143239	2143244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871014
38129	NC_010120	TCAA	2	8	2143277	2143284	50 %	25 %	0 %	25 %	161871014
38130	NC_010120	CAA	2	6	2143353	2143358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161871014
38131	NC_010120	CAG	2	6	2143432	2143437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871014
38132	NC_010120	TGA	2	6	2143615	2143620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871015
38133	NC_010120	TAC	2	6	2143653	2143658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871015
38134	NC_010120	GAA	2	6	2143667	2143672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161871015
38135	NC_010120	CCG	2	6	2143678	2143683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871015
38136	NC_010120	GTC	2	6	2143694	2143699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161871015
38137	NC_010120	TCA	2	6	2143750	2143755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871015
38138	NC_010120	AAG	2	6	2143908	2143913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161871015
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38141	NC_010120	AT	3	6	2144098	2144103	50 %	50 %	0 %	0 %	161871016
38142	NC_010120	TTCA	2	8	2144135	2144142	25 %	50 %	0 %	25 %	161871016
38143	NC_010120	T	6	6	2144173	2144178	0 %	100 %	0 %	0 %	161871016
38144	NC_010120	ACT	2	6	2144193	2144198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871016
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38147	NC_010120	AATC	2	8	2144320	2144327	50 %	25 %	0 %	25 %	161871016
38148	NC_010120	GTC	2	6	2144341	2144346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161871016
38149	NC_010120	CAT	2	6	2144368	2144373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871016
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38151	NC_010120	T	6	6	2144468	2144473	0 %	100 %	0 %	0 %	161871016
38152	NC_010120	AGG	2	6	2144551	2144556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161871016
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38154	NC_010120	CCAA	2	8	2144693	2144700	50 %	0 %	0 %	50 %	161871017
38155	NC_010120	ATTG	2	8	2144743	2144750	25 %	50 %	25 %	0 %	161871017
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38161	NC_010120	ACC	2	6	2145103	2145108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161871017
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38203	NC_010120	TTAT	2	8	2147589	2147596	25 %	75 %	0 %	0 %	161871020
38204	NC_010120	TCA	2	6	2147598	2147603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871020
38205	NC_010120	T	6	6	2147607	2147612	0 %	100 %	0 %	0 %	161871020
38206	NC_010120	GAT	2	6	2147615	2147620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871020
38207	NC_010120	GAC	2	6	2147696	2147701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161871020
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38220	NC_010120	TG	3	6	2148481	2148486	0 %	50 %	50 %	0 %	161871021
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38222	NC_010120	CGG	2	6	2148553	2148558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871021
38223	NC_010120	CAAA	2	8	2148559	2148566	75 %	0 %	0 %	25 %	161871021
38224	NC_010120	A	6	6	2148564	2148569	100 %	0 %	0 %	0 %	161871021
38225	NC_010120	CTG	2	6	2148686	2148691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161871021
38226	NC_010120	TGA	2	6	2148915	2148920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161871021
38227	NC_010120	TTAAAT	2	12	2149090	2149101	50 %	50 %	0 %	0 %	161871022
38228	NC_010120	GCC	2	6	2149354	2149359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871023
38229	NC_010120	TCA	2	6	2149365	2149370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871023
38230	NC_010120	GAA	2	6	2149424	2149429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161871023
38231	NC_010120	GGC	3	9	2149465	2149473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871023
38232	NC_010120	TCT	2	6	2149493	2149498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161871023
38233	NC_010120	GGC	2	6	2149621	2149626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871023
38234	NC_010120	GCG	3	9	2149655	2149663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871023
38235	NC_010120	GCG	2	6	2149669	2149674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871023
38236	NC_010120	TGCGG	2	10	2149686	2149695	0 %	20 %	60 %	20 %	161871023
38237	NC_010120	TGG	2	6	2149734	2149739	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161871023
38238	NC_010120	TCA	2	6	2149740	2149745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161871023
38239	NC_010120	GCC	2	6	2149781	2149786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161871023
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38264	NC_010120	GGC	2	6	2151211	2151216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161871024
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38304	NC_010120	CG	3	6	2153241	2153246	0 %	0 %	50 %	50 %	161871024

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.