MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 21642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010085	ATT	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527513
2	NC_010085	GTC	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527513
3	NC_010085	AAT	2	6	560	565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527513
4	NC_010085	TGT	2	6	586	591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527513
5	NC_010085	TGA	2	6	601	606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527513
6	NC_010085	CAG	2	6	760	765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527513
7	NC_010085	GAG	3	9	773	781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527513
8	NC_010085	ATG	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527513
9	NC_010085	GCT	2	6	890	895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527513
10	NC_010085	AGG	2	6	901	906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527513
11	NC_010085	ACA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527513
12	NC_010085	GAA	2	6	1025	1030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527513
13	NC_010085	AGA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527513
14	NC_010085	AGA	2	6	1181	1186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527513
15	NC_010085	AAT	2	6	1222	1227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527513
16	NC_010085	ATC	2	6	1288	1293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527513
17	NC_010085	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527513
18	NC_010085	TGG	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527514
19	NC_010085	CAA	2	6	1478	1483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527514
20	NC_010085	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
21	NC_010085	TTG	2	6	1648	1653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527514
22	NC_010085	ATC	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
23	NC_010085	CAT	2	6	1715	1720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
24	NC_010085	CAG	2	6	1747	1752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527514
25	NC_010085	CTT	2	6	1802	1807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527514
26	NC_010085	TCC	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527514
27	NC_010085	CTT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527514
28	NC_010085	ATG	2	6	2184	2189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527514
29	NC_010085	CTA	2	6	2236	2241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
30	NC_010085	AAT	2	6	2279	2284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527514
31	NC_010085	ATT	2	6	2445	2450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527514
32	NC_010085	CTA	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
33	NC_010085	ATC	2	6	2597	2602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527514
34	NC_010085	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527514
35	NC_010085	TAT	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527514
36	NC_010085	GAA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527515
37	NC_010085	CAT	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527515
38	NC_010085	TCA	2	6	3260	3265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527515
39	NC_010085	AGG	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527515
40	NC_010085	ATT	2	6	3489	3494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527516
41	NC_010085	GAA	2	6	3589	3594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527516
42	NC_010085	ATC	2	6	3627	3632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527516
43	NC_010085	GTA	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
44	NC_010085	TGA	2	6	3690	3695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
45	NC_010085	AGA	2	6	3696	3701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527516
46	NC_010085	TAC	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527516
47	NC_010085	CTT	2	6	3804	3809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527516
48	NC_010085	TGC	2	6	3837	3842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527516
49	NC_010085	ACA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527516
50	NC_010085	TGA	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
51	NC_010085	AAT	2	6	3891	3896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527516
52	NC_010085	CAA	2	6	3941	3946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527516
53	NC_010085	GAA	2	6	3949	3954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527516
54	NC_010085	AAC	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527516
55	NC_010085	TGA	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
56	NC_010085	ACT	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527516
57	NC_010085	ATG	2	6	4109	4114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
58	NC_010085	TGA	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527516
59	NC_010085	GTA	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527517
60	NC_010085	GTT	2	6	4589	4594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527517
61	NC_010085	GTT	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527517
62	NC_010085	TGC	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527517
63	NC_010085	CTT	2	6	4880	4885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527517
64	NC_010085	TTC	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527517
65	NC_010085	ATT	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527517
66	NC_010085	AAG	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527517
67	NC_010085	TTC	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
68	NC_010085	ATC	2	6	5279	5284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
69	NC_010085	CAT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
70	NC_010085	TCA	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
71	NC_010085	TCT	2	6	5331	5336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
72	NC_010085	TCA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
73	NC_010085	CAT	2	6	5347	5352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527518
74	NC_010085	CCA	2	6	5414	5419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527518
75	NC_010085	CTT	2	6	5482	5487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
76	NC_010085	ACA	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527518
77	NC_010085	TCT	2	6	5548	5553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527518
78	NC_010085	GAA	2	6	5641	5646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
79	NC_010085	AAT	2	6	5647	5652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527519
80	NC_010085	ATT	2	6	5671	5676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527519
81	NC_010085	AAC	2	6	5698	5703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527519
82	NC_010085	TGT	2	6	5746	5751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527519
83	NC_010085	ATG	2	6	5799	5804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527519
84	NC_010085	AAT	2	6	5875	5880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527519
85	NC_010085	TGG	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527519
86	NC_010085	TGA	2	6	6085	6090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527519
87	NC_010085	GAA	2	6	6122	6127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
88	NC_010085	GTT	2	6	6221	6226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527519
89	NC_010085	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
90	NC_010085	ACA	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527519
91	NC_010085	TGT	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527519
92	NC_010085	TGA	2	6	6484	6489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527519
93	NC_010085	GAA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
94	NC_010085	ATG	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527519
95	NC_010085	GAC	2	6	6710	6715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527519
96	NC_010085	GAA	2	6	6791	6796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
97	NC_010085	TGG	2	6	6799	6804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527519
98	NC_010085	ACA	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527519
99	NC_010085	TAT	2	6	6935	6940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527519
100	NC_010085	CAA	2	6	6951	6956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527519
101	NC_010085	TGT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527519
102	NC_010085	AGA	3	9	7063	7071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527519
103	NC_010085	AAT	2	6	7093	7098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527519
104	NC_010085	TAT	2	6	7135	7140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527519
105	NC_010085	CAT	2	6	7177	7182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527520
106	NC_010085	TCA	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527520
107	NC_010085	ATG	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527520
108	NC_010085	GCA	2	6	7485	7490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527520
109	NC_010085	TGG	2	6	7523	7528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527520
110	NC_010085	TAA	2	6	7720	7725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527520
111	NC_010085	ATC	2	6	7730	7735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527520
112	NC_010085	TCT	2	6	7920	7925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527520
113	NC_010085	GTA	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527520
114	NC_010085	CTG	2	6	7981	7986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527520
115	NC_010085	TCC	3	9	8003	8011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527520
116	NC_010085	ACA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527520
117	NC_010085	AGA	2	6	8028	8033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527520
118	NC_010085	CAT	2	6	8110	8115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527520
119	NC_010085	ACA	2	6	8190	8195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527520
120	NC_010085	ACA	2	6	8386	8391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527520
121	NC_010085	TTC	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527520
122	NC_010085	CCT	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527520
123	NC_010085	TCT	2	6	8506	8511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527520
124	NC_010085	TTC	2	6	9015	9020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527521
125	NC_010085	TTC	2	6	9029	9034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527521
126	NC_010085	ATC	2	6	9213	9218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527521
127	NC_010085	TAT	2	6	9484	9489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527522
128	NC_010085	TGT	2	6	9525	9530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527522
129	NC_010085	TAG	2	6	9590	9595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527522
130	NC_010085	TTG	2	6	9602	9607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527522
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256	NC_010085	CTA	2	6	18520	18525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527533
257	NC_010085	GTA	2	6	18550	18555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527533
258	NC_010085	CTA	2	6	18604	18609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527533
259	NC_010085	TCC	2	6	18716	18721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527533
260	NC_010085	TGA	2	6	18830	18835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527533
261	NC_010085	CCA	2	6	18879	18884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527533
262	NC_010085	ATT	2	6	18894	18899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527533
263	NC_010085	ACT	2	6	19062	19067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527533
264	NC_010085	CAC	2	6	19198	19203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527533
265	NC_010085	CGA	2	6	19407	19412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527534
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268	NC_010085	AGA	3	9	19535	19543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527534
269	NC_010085	AGA	2	6	19623	19628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527534
270	NC_010085	AAG	2	6	19666	19671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527534
271	NC_010085	AGA	3	9	19745	19753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527534
272	NC_010085	AGA	3	9	19790	19798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527534
273	NC_010085	TGA	2	6	20099	20104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527535
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275	NC_010085	AGA	2	6	20264	20269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527535
276	NC_010085	TCA	2	6	20470	20475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527536
277	NC_010085	TGA	2	6	20485	20490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527536
278	NC_010085	TGA	3	9	20521	20529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527536
279	NC_010085	TGT	2	6	20537	20542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527536
280	NC_010085	TGT	2	6	20552	20557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527536
281	NC_010085	GTA	2	6	20641	20646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527536
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283	NC_010085	GTA	2	6	20809	20814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527536
284	NC_010085	TTC	2	6	20832	20837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527536
285	NC_010085	CTT	2	6	20864	20869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527536
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288	NC_010085	ATC	2	6	21138	21143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527536
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