MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 34578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010085	TCC	2	6	170133	170138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527695
4002	NC_010085	A	6	6	170201	170206	100 %	0 %	0 %	0 %	161527695
4003	NC_010085	A	6	6	170212	170217	100 %	0 %	0 %	0 %	161527695
4004	NC_010085	T	6	6	170239	170244	0 %	100 %	0 %	0 %	161527695
4005	NC_010085	AATC	2	8	170362	170369	50 %	25 %	0 %	25 %	161527696
4006	NC_010085	ATCAA	2	10	170431	170440	60 %	20 %	0 %	20 %	161527696
4007	NC_010085	AGT	2	6	170462	170467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527696
4008	NC_010085	AAGG	2	8	170481	170488	50 %	0 %	50 %	0 %	161527696
4009	NC_010085	CTG	2	6	170746	170751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527696
4010	NC_010085	AG	3	6	170752	170757	50 %	0 %	50 %	0 %	161527696
4011	NC_010085	CTT	2	6	170847	170852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527696
4012	NC_010085	GAAAA	2	10	170856	170865	80 %	0 %	20 %	0 %	161527696
4013	NC_010085	ATGA	2	8	170868	170875	50 %	25 %	25 %	0 %	161527696
4014	NC_010085	ATGA	2	8	171179	171186	50 %	25 %	25 %	0 %	161527697
4015	NC_010085	T	6	6	171260	171265	0 %	100 %	0 %	0 %	161527697
4016	NC_010085	T	6	6	171289	171294	0 %	100 %	0 %	0 %	161527697
4017	NC_010085	GAT	2	6	171296	171301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527697
4018	NC_010085	CTAC	2	8	171327	171334	25 %	25 %	0 %	50 %	161527697
4019	NC_010085	TTC	2	6	171339	171344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527697
4020	NC_010085	ACAA	2	8	171390	171397	75 %	0 %	0 %	25 %	161527697
4021	NC_010085	TCTT	2	8	171442	171449	0 %	75 %	0 %	25 %	161527697
4022	NC_010085	T	6	6	171525	171530	0 %	100 %	0 %	0 %	161527697
4023	NC_010085	TTTATT	2	12	171556	171567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	161527697
4024	NC_010085	ATCA	2	8	171592	171599	50 %	25 %	0 %	25 %	161527697
4025	NC_010085	ATG	2	6	171669	171674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527697
4026	NC_010085	TCT	2	6	171731	171736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527697
4027	NC_010085	CTT	2	6	171755	171760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527697
4028	NC_010085	ATT	2	6	171821	171826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527697
4029	NC_010085	TTCT	2	8	171848	171855	0 %	75 %	0 %	25 %	161527697
4030	NC_010085	ATG	2	6	171882	171887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527697
4031	NC_010085	TCGT	2	8	171945	171952	0 %	50 %	25 %	25 %	161527697
4032	NC_010085	CAAC	2	8	171968	171975	50 %	0 %	0 %	50 %	161527697
4033	NC_010085	A	7	7	171978	171984	100 %	0 %	0 %	0 %	161527697
4034	NC_010085	T	7	7	171995	172001	0 %	100 %	0 %	0 %	161527697
4035	NC_010085	TCA	2	6	172077	172082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527697
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4037	NC_010085	GAA	2	6	172229	172234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527697
4038	NC_010085	GAA	2	6	172238	172243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527697
4039	NC_010085	A	6	6	172245	172250	100 %	0 %	0 %	0 %	161527697
4040	NC_010085	TTG	2	6	172266	172271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527697
4041	NC_010085	A	6	6	172275	172280	100 %	0 %	0 %	0 %	161527697
4042	NC_010085	A	7	7	172393	172399	100 %	0 %	0 %	0 %	161527697
4043	NC_010085	TGA	2	6	172489	172494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527697
4044	NC_010085	A	6	6	172572	172577	100 %	0 %	0 %	0 %	161527697
4045	NC_010085	ATC	3	9	172601	172609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527697
4046	NC_010085	TTA	2	6	172662	172667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527697
4047	NC_010085	TAAT	2	8	172674	172681	50 %	50 %	0 %	0 %	161527697
4048	NC_010085	GGT	2	6	172706	172711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527697
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4050	NC_010085	TAT	2	6	172792	172797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527697
4051	NC_010085	TTG	2	6	172872	172877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527697
4052	NC_010085	AAT	2	6	172907	172912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527697
4053	NC_010085	ACA	2	6	172916	172921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527697
4054	NC_010085	GTT	2	6	172942	172947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527697
4055	NC_010085	ATA	2	6	172956	172961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527697
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4057	NC_010085	T	6	6	173003	173008	0 %	100 %	0 %	0 %	161527698
4058	NC_010085	TCAC	2	8	173040	173047	25 %	25 %	0 %	50 %	161527698
4059	NC_010085	TCA	2	6	173103	173108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527698
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4061	NC_010085	AAT	2	6	173209	173214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527698
4062	NC_010085	TGA	2	6	173246	173251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527698
4063	NC_010085	T	6	6	173282	173287	0 %	100 %	0 %	0 %	161527698
4064	NC_010085	AAT	2	6	173373	173378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527698
4065	NC_010085	TTC	2	6	173465	173470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527698
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4067	NC_010085	TCA	2	6	173517	173522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527698
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4071	NC_010085	ATGT	2	8	173776	173783	25 %	50 %	25 %	0 %	161527700
4072	NC_010085	CAG	3	9	173915	173923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527700
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4074	NC_010085	ATC	2	6	173958	173963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527700
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4080	NC_010085	TCA	2	6	174151	174156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527700
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4082	NC_010085	TGC	2	6	174210	174215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527700
4083	NC_010085	GTTG	2	8	174226	174233	0 %	50 %	50 %	0 %	161527700
4084	NC_010085	AATC	2	8	174242	174249	50 %	25 %	0 %	25 %	161527700
4085	NC_010085	TTTGT	2	10	174345	174354	0 %	80 %	20 %	0 %	161527700
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4089	NC_010085	GAA	2	6	174507	174512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527700
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4091	NC_010085	TAT	2	6	174560	174565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527700
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4094	NC_010085	TAAA	2	8	175137	175144	75 %	25 %	0 %	0 %	161527701
4095	NC_010085	TGT	2	6	175192	175197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527701
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4105	NC_010085	TCCA	2	8	175421	175428	25 %	25 %	0 %	50 %	161527701
4106	NC_010085	ATA	2	6	175432	175437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527701
4107	NC_010085	TTGTCT	2	12	175500	175511	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161527701
4108	NC_010085	ATG	2	6	175513	175518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527701
4109	NC_010085	GTTT	2	8	175538	175545	0 %	75 %	25 %	0 %	161527701
4110	NC_010085	TTTTC	2	10	175566	175575	0 %	80 %	0 %	20 %	161527701
4111	NC_010085	CAA	2	6	175690	175695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527701
4112	NC_010085	TGA	2	6	175770	175775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527701
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4114	NC_010085	ACT	2	6	175818	175823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527701
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4117	NC_010085	ACC	2	6	175968	175973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527701
4118	NC_010085	TTG	2	6	176038	176043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527701
4119	NC_010085	TGT	2	6	176050	176055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527701
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4121	NC_010085	CTT	2	6	176112	176117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527701
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4247	NC_010085	CTA	2	6	182301	182306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527712
4248	NC_010085	TTG	2	6	182377	182382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527713
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4251	NC_010085	AAT	2	6	182492	182497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527713
4252	NC_010085	TTG	2	6	182515	182520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527713
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4255	NC_010085	AATA	2	8	182591	182598	75 %	25 %	0 %	0 %	161527713
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4262	NC_010085	AAG	2	6	183084	183089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527714
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4266	NC_010085	ACA	2	6	183144	183149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527714
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4273	NC_010085	A	6	6	183485	183490	100 %	0 %	0 %	0 %	161527714
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4279	NC_010085	TGA	2	6	183793	183798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527714
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4365	NC_010085	GCA	2	6	188864	188869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527719
4366	NC_010085	AC	3	6	188887	188892	50 %	0 %	0 %	50 %	161527719
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4368	NC_010085	TGA	2	6	188922	188927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527719
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4488	NC_010085	AGT	2	6	195007	195012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527726
4489	NC_010085	T	6	6	195021	195026	0 %	100 %	0 %	0 %	161527726
4490	NC_010085	T	6	6	195044	195049	0 %	100 %	0 %	0 %	161527726
4491	NC_010085	A	6	6	195094	195099	100 %	0 %	0 %	0 %	161527726
4492	NC_010085	CCT	2	6	195137	195142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527726
4493	NC_010085	TTC	2	6	195146	195151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527726
4494	NC_010085	T	6	6	195215	195220	0 %	100 %	0 %	0 %	161527726
4495	NC_010085	TTTTG	2	10	195226	195235	0 %	80 %	20 %	0 %	161527726
4496	NC_010085	TAC	2	6	195244	195249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527726
4497	NC_010085	T	7	7	195253	195259	0 %	100 %	0 %	0 %	161527726
4498	NC_010085	TC	3	6	195279	195284	0 %	50 %	0 %	50 %	161527726
4499	NC_010085	CTC	2	6	195294	195299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527726
4500	NC_010085	CCT	2	6	195302	195307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527726

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