MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 34578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010085	TAC	2	6	150131	150136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527669
3502	NC_010085	CTG	2	6	150139	150144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527669
3503	NC_010085	TTTC	2	8	150193	150200	0 %	75 %	0 %	25 %	161527669
3504	NC_010085	A	6	6	150267	150272	100 %	0 %	0 %	0 %	161527669
3505	NC_010085	ATA	2	6	150280	150285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527669
3506	NC_010085	GAC	2	6	150306	150311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527669
3507	NC_010085	ATT	2	6	150333	150338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527669
3508	NC_010085	AAT	2	6	150343	150348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527669
3509	NC_010085	TCA	2	6	150353	150358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527670
3510	NC_010085	T	6	6	150398	150403	0 %	100 %	0 %	0 %	161527670
3511	NC_010085	CCAT	2	8	150454	150461	25 %	25 %	0 %	50 %	161527670
3512	NC_010085	TTA	2	6	150560	150565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527670
3513	NC_010085	AAT	2	6	150571	150576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527670
3514	NC_010085	GACT	2	8	150582	150589	25 %	25 %	25 %	25 %	161527670
3515	NC_010085	T	7	7	150625	150631	0 %	100 %	0 %	0 %	161527670
3516	NC_010085	TAAT	2	8	150645	150652	50 %	50 %	0 %	0 %	161527670
3517	NC_010085	TAT	2	6	150659	150664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527671
3518	NC_010085	TA	3	6	150673	150678	50 %	50 %	0 %	0 %	161527671
3519	NC_010085	TTG	2	6	150689	150694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527671
3520	NC_010085	GTTC	2	8	150725	150732	0 %	50 %	25 %	25 %	161527671
3521	NC_010085	AAT	2	6	150775	150780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527671
3522	NC_010085	AGT	2	6	150790	150795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527671
3523	NC_010085	ATT	2	6	150798	150803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527671
3524	NC_010085	AAT	2	6	150842	150847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527671
3525	NC_010085	ATC	2	6	150852	150857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527671
3526	NC_010085	CTC	2	6	150920	150925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527671
3527	NC_010085	ATT	2	6	150994	150999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527671
3528	NC_010085	TTG	2	6	151000	151005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527671
3529	NC_010085	AT	3	6	151014	151019	50 %	50 %	0 %	0 %	161527671
3530	NC_010085	CTT	2	6	151049	151054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527671
3531	NC_010085	TCT	2	6	151075	151080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527671
3532	NC_010085	TAC	2	6	151104	151109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527671
3533	NC_010085	TGTCT	2	10	151113	151122	0 %	60 %	20 %	20 %	161527671
3534	NC_010085	A	6	6	151127	151132	100 %	0 %	0 %	0 %	161527671
3535	NC_010085	ATT	3	9	151137	151145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527671
3536	NC_010085	GT	4	8	151150	151157	0 %	50 %	50 %	0 %	161527671
3537	NC_010085	TCA	2	6	151174	151179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527671
3538	NC_010085	CTG	2	6	151181	151186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527671
3539	NC_010085	TAT	2	6	151220	151225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527671
3540	NC_010085	T	6	6	151234	151239	0 %	100 %	0 %	0 %	161527671
3541	NC_010085	TCA	2	6	151243	151248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527671
3542	NC_010085	TAGTT	2	10	151273	151282	20 %	60 %	20 %	0 %	161527671
3543	NC_010085	AAT	2	6	151303	151308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527671
3544	NC_010085	TCTTT	2	10	151384	151393	0 %	80 %	0 %	20 %	161527671
3545	NC_010085	AAT	2	6	151424	151429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527671
3546	NC_010085	GCA	2	6	151489	151494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527671
3547	NC_010085	A	6	6	151541	151546	100 %	0 %	0 %	0 %	161527671
3548	NC_010085	CTT	2	6	151553	151558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527671
3549	NC_010085	T	6	6	151637	151642	0 %	100 %	0 %	0 %	161527671
3550	NC_010085	TTG	2	6	151712	151717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527671
3551	NC_010085	T	7	7	151742	151748	0 %	100 %	0 %	0 %	161527671
3552	NC_010085	TTCATG	2	12	151785	151796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161527671
3553	NC_010085	TCT	2	6	151851	151856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527671
3554	NC_010085	CAA	2	6	151889	151894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527671
3555	NC_010085	CAA	2	6	151904	151909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527671
3556	NC_010085	ATT	2	6	151920	151925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527671
3557	NC_010085	AT	3	6	152037	152042	50 %	50 %	0 %	0 %	161527672
3558	NC_010085	AGA	2	6	152049	152054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527672
3559	NC_010085	TGT	3	9	152083	152091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527672
3560	NC_010085	CTT	2	6	152119	152124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527672
3561	NC_010085	TAA	2	6	152129	152134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527672
3562	NC_010085	CAT	2	6	152159	152164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527672
3563	NC_010085	AAT	2	6	152174	152179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527672
3564	NC_010085	TC	3	6	152225	152230	0 %	50 %	0 %	50 %	161527672
3565	NC_010085	AAG	2	6	152234	152239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527672
3566	NC_010085	TTC	2	6	152252	152257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527672
3567	NC_010085	TTGAA	2	10	152261	152270	40 %	40 %	20 %	0 %	161527672
3568	NC_010085	TAA	2	6	152317	152322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527672
3569	NC_010085	TGA	2	6	152327	152332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527672
3570	NC_010085	TCT	2	6	152343	152348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527672
3571	NC_010085	ATCA	2	8	152375	152382	50 %	25 %	0 %	25 %	161527672
3572	NC_010085	T	7	7	152383	152389	0 %	100 %	0 %	0 %	161527672
3573	NC_010085	TGAT	2	8	152397	152404	25 %	50 %	25 %	0 %	161527672
3574	NC_010085	ATAA	2	8	152425	152432	75 %	25 %	0 %	0 %	161527672
3575	NC_010085	ATT	2	6	152442	152447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527672
3576	NC_010085	T	6	6	152456	152461	0 %	100 %	0 %	0 %	161527672
3577	NC_010085	T	6	6	152521	152526	0 %	100 %	0 %	0 %	161527672
3578	NC_010085	A	6	6	152608	152613	100 %	0 %	0 %	0 %	161527672
3579	NC_010085	T	8	8	152614	152621	0 %	100 %	0 %	0 %	161527672
3580	NC_010085	A	6	6	152673	152678	100 %	0 %	0 %	0 %	161527672
3581	NC_010085	CTA	2	6	152739	152744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527672
3582	NC_010085	T	6	6	152746	152751	0 %	100 %	0 %	0 %	161527672
3583	NC_010085	TAA	2	6	152756	152761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527672
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3585	NC_010085	T	6	6	152823	152828	0 %	100 %	0 %	0 %	161527672
3586	NC_010085	ATG	2	6	152989	152994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527673
3587	NC_010085	A	8	8	153013	153020	100 %	0 %	0 %	0 %	161527673
3588	NC_010085	TGA	2	6	153030	153035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527673
3589	NC_010085	A	6	6	153100	153105	100 %	0 %	0 %	0 %	161527673
3590	NC_010085	TAAT	2	8	153125	153132	50 %	50 %	0 %	0 %	161527673
3591	NC_010085	TTC	2	6	153138	153143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527673
3592	NC_010085	GAA	2	6	153154	153159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527673
3593	NC_010085	A	7	7	153165	153171	100 %	0 %	0 %	0 %	161527673
3594	NC_010085	ATT	2	6	153184	153189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527673
3595	NC_010085	TGG	2	6	153213	153218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527673
3596	NC_010085	ACA	2	6	153291	153296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527673
3597	NC_010085	ATT	2	6	153319	153324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527673
3598	NC_010085	CAA	2	6	153339	153344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527673
3599	NC_010085	AGA	2	6	153375	153380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527673
3600	NC_010085	ATA	2	6	153455	153460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527673
3601	NC_010085	A	8	8	153507	153514	100 %	0 %	0 %	0 %	161527673
3602	NC_010085	GGAATG	2	12	153538	153549	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	161527673
3603	NC_010085	CTG	2	6	153551	153556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527673
3604	NC_010085	GCT	2	6	153571	153576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527673
3605	NC_010085	AAT	2	6	153591	153596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527673
3606	NC_010085	AGAAA	2	10	153607	153616	80 %	0 %	20 %	0 %	161527673
3607	NC_010085	CTT	2	6	153638	153643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527673
3608	NC_010085	ATC	2	6	153685	153690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527673
3609	NC_010085	ATTA	2	8	153693	153700	50 %	50 %	0 %	0 %	161527673
3610	NC_010085	T	7	7	153743	153749	0 %	100 %	0 %	0 %	161527673
3611	NC_010085	TGT	2	6	153777	153782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527673
3612	NC_010085	TAA	2	6	153863	153868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527673
3613	NC_010085	CAA	2	6	153875	153880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527673
3614	NC_010085	TGTA	2	8	153884	153891	25 %	50 %	25 %	0 %	161527673
3615	NC_010085	AAT	2	6	153946	153951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527673
3616	NC_010085	GCT	2	6	153966	153971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527674
3617	NC_010085	T	7	7	153999	154005	0 %	100 %	0 %	0 %	161527674
3618	NC_010085	CTA	2	6	154021	154026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527674
3619	NC_010085	T	6	6	154029	154034	0 %	100 %	0 %	0 %	161527674
3620	NC_010085	TAT	3	9	154052	154060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527674
3621	NC_010085	CAC	2	6	154079	154084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527674
3622	NC_010085	ACA	2	6	154106	154111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527674
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3624	NC_010085	TAA	2	6	154166	154171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527674
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3994	NC_010085	GCT	2	6	169466	169471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527694
3995	NC_010085	CAA	2	6	169516	169521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527694
3996	NC_010085	TTA	2	6	169572	169577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527694
3997	NC_010085	T	6	6	169737	169742	0 %	100 %	0 %	0 %	161527695
3998	NC_010085	ATG	2	6	169810	169815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527695
3999	NC_010085	ATT	2	6	169875	169880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527695
4000	NC_010085	CATA	2	8	169930	169937	50 %	25 %	0 %	25 %	161527695

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