MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 34578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010085	CAT	2	6	45475	45480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527568
1002	NC_010085	CAGA	2	8	45481	45488	50 %	0 %	25 %	25 %	161527568
1003	NC_010085	TGA	2	6	45656	45661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527569
1004	NC_010085	GA	3	6	45669	45674	50 %	0 %	50 %	0 %	161527569
1005	NC_010085	AGA	2	6	45698	45703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527569
1006	NC_010085	TCT	2	6	45813	45818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527569
1007	NC_010085	A	9	9	45866	45874	100 %	0 %	0 %	0 %	161527569
1008	NC_010085	A	6	6	45928	45933	100 %	0 %	0 %	0 %	161527569
1009	NC_010085	GAA	2	6	45945	45950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527569
1010	NC_010085	TGG	2	6	45968	45973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527569
1011	NC_010085	TGG	2	6	45977	45982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527569
1012	NC_010085	ATT	2	6	46050	46055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527569
1013	NC_010085	ACT	2	6	46155	46160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527569
1014	NC_010085	ATG	2	6	46167	46172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527569
1015	NC_010085	CTT	2	6	46298	46303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527570
1016	NC_010085	AGA	2	6	46363	46368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527570
1017	NC_010085	A	6	6	46528	46533	100 %	0 %	0 %	0 %	161527570
1018	NC_010085	TGT	2	6	46534	46539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527570
1019	NC_010085	AAT	2	6	46711	46716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527570
1020	NC_010085	CTT	2	6	46719	46724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527570
1021	NC_010085	AGT	2	6	46736	46741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527570
1022	NC_010085	A	6	6	46756	46761	100 %	0 %	0 %	0 %	161527570
1023	NC_010085	ATT	2	6	46889	46894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527570
1024	NC_010085	ATG	2	6	46920	46925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527570
1025	NC_010085	TGG	2	6	46956	46961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527570
1026	NC_010085	GTTG	2	8	46986	46993	0 %	50 %	50 %	0 %	161527571
1027	NC_010085	A	7	7	47030	47036	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
1028	NC_010085	TGT	3	9	47054	47062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527571
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1030	NC_010085	ATG	2	6	47122	47127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527571
1031	NC_010085	AGA	2	6	47144	47149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527571
1032	NC_010085	A	7	7	47177	47183	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
1033	NC_010085	TTG	2	6	47191	47196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527571
1034	NC_010085	ATG	2	6	47206	47211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527571
1035	NC_010085	A	7	7	47261	47267	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
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1038	NC_010085	ATT	2	6	47364	47369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527571
1039	NC_010085	A	6	6	47410	47415	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
1040	NC_010085	AAG	2	6	47488	47493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527571
1041	NC_010085	GTA	2	6	47532	47537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527571
1042	NC_010085	TA	3	6	47536	47541	50 %	50 %	0 %	0 %	161527571
1043	NC_010085	A	6	6	47560	47565	100 %	0 %	0 %	0 %	161527571
1044	NC_010085	AGA	2	6	47606	47611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527571
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1046	NC_010085	TAA	2	6	47635	47640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527571
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1051	NC_010085	T	6	6	47834	47839	0 %	100 %	0 %	0 %	161527572
1052	NC_010085	AAAT	2	8	47846	47853	75 %	25 %	0 %	0 %	161527572
1053	NC_010085	T	6	6	47853	47858	0 %	100 %	0 %	0 %	161527572
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1057	NC_010085	T	9	9	47989	47997	0 %	100 %	0 %	0 %	161527572
1058	NC_010085	T	8	8	48016	48023	0 %	100 %	0 %	0 %	161527572
1059	NC_010085	TTG	2	6	48138	48143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527572
1060	NC_010085	T	8	8	48186	48193	0 %	100 %	0 %	0 %	161527572
1061	NC_010085	CTT	2	6	48195	48200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527572
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1063	NC_010085	CAA	2	6	48270	48275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527572
1064	NC_010085	GA	3	6	48288	48293	50 %	0 %	50 %	0 %	161527572
1065	NC_010085	T	6	6	48349	48354	0 %	100 %	0 %	0 %	161527572
1066	NC_010085	GAT	2	6	48388	48393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527572
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1069	NC_010085	GCA	2	6	48789	48794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161527573
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1072	NC_010085	GAA	2	6	49105	49110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527573
1073	NC_010085	AGA	2	6	49115	49120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527573
1074	NC_010085	AAG	2	6	49127	49132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527573
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1080	NC_010085	ATA	2	6	49601	49606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527574
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1083	NC_010085	TCTCT	2	10	49689	49698	0 %	60 %	0 %	40 %	161527574
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1087	NC_010085	A	6	6	49920	49925	100 %	0 %	0 %	0 %	161527574
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1093	NC_010085	ACA	2	6	50137	50142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527574
1094	NC_010085	TTGC	2	8	50156	50163	0 %	50 %	25 %	25 %	161527574
1095	NC_010085	ATGA	2	8	50211	50218	50 %	25 %	25 %	0 %	161527574
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1098	NC_010085	ATC	2	6	50262	50267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527574
1099	NC_010085	ATC	2	6	50298	50303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527574
1100	NC_010085	AAC	2	6	50304	50309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527574
1101	NC_010085	ATT	2	6	50415	50420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527574
1102	NC_010085	AGAAT	2	10	50625	50634	60 %	20 %	20 %	0 %	161527575
1103	NC_010085	TCT	2	6	50700	50705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527575
1104	NC_010085	TGA	2	6	50712	50717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527575
1105	NC_010085	TCT	2	6	50765	50770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527575
1106	NC_010085	T	7	7	50858	50864	0 %	100 %	0 %	0 %	161527575
1107	NC_010085	TGAG	2	8	50947	50954	25 %	25 %	50 %	0 %	161527575
1108	NC_010085	ATC	2	6	51023	51028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527575
1109	NC_010085	TCCA	2	8	51029	51036	25 %	25 %	0 %	50 %	161527575
1110	NC_010085	TGCA	2	8	51100	51107	25 %	25 %	25 %	25 %	161527575
1111	NC_010085	AACC	2	8	51117	51124	50 %	0 %	0 %	50 %	161527575
1112	NC_010085	CCTTTT	2	12	51172	51183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527575
1113	NC_010085	T	6	6	51226	51231	0 %	100 %	0 %	0 %	161527575
1114	NC_010085	ATA	2	6	51257	51262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527575
1115	NC_010085	CTT	2	6	51301	51306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527575
1116	NC_010085	A	6	6	51406	51411	100 %	0 %	0 %	0 %	161527575
1117	NC_010085	ATTTC	2	10	51468	51477	20 %	60 %	0 %	20 %	161527575
1118	NC_010085	GATT	2	8	51557	51564	25 %	50 %	25 %	0 %	161527575
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1120	NC_010085	CAT	2	6	51623	51628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527575
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1122	NC_010085	TAT	2	6	51800	51805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527575
1123	NC_010085	TCT	2	6	51893	51898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527575
1124	NC_010085	TTCTC	2	10	51905	51914	0 %	60 %	0 %	40 %	161527575
1125	NC_010085	ATTT	2	8	51928	51935	25 %	75 %	0 %	0 %	161527575
1126	NC_010085	T	6	6	51933	51938	0 %	100 %	0 %	0 %	161527575
1127	NC_010085	CT	3	6	52018	52023	0 %	50 %	0 %	50 %	161527575
1128	NC_010085	ATC	2	6	52124	52129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527576
1129	NC_010085	TCA	2	6	52137	52142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527576
1130	NC_010085	T	7	7	52168	52174	0 %	100 %	0 %	0 %	161527576
1131	NC_010085	TCC	2	6	52220	52225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527576
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1134	NC_010085	T	7	7	52415	52421	0 %	100 %	0 %	0 %	161527576
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