MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosopumilus maritimus SCM1 chromosome

Total Repeats: 34578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010085	TTC	2	6	218501	218506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527754
5002	NC_010085	ACAAA	2	10	218537	218546	80 %	0 %	0 %	20 %	161527754
5003	NC_010085	T	6	6	218569	218574	0 %	100 %	0 %	0 %	161527754
5004	NC_010085	TTG	2	6	218728	218733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527755
5005	NC_010085	TCT	2	6	218834	218839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527755
5006	NC_010085	TG	3	6	218861	218866	0 %	50 %	50 %	0 %	161527755
5007	NC_010085	TGA	2	6	218875	218880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527755
5008	NC_010085	CAT	2	6	218889	218894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527755
5009	NC_010085	TAA	2	6	218946	218951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527755
5010	NC_010085	TTG	2	6	218985	218990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527755
5011	NC_010085	TTCATG	2	12	218998	219009	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161527755
5012	NC_010085	TCA	2	6	219050	219055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527755
5013	NC_010085	AAC	2	6	219056	219061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527755
5014	NC_010085	ATT	2	6	219101	219106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527755
5015	NC_010085	T	8	8	219175	219182	0 %	100 %	0 %	0 %	161527755
5016	NC_010085	T	6	6	219194	219199	0 %	100 %	0 %	0 %	161527755
5017	NC_010085	TC	3	6	219223	219228	0 %	50 %	0 %	50 %	161527755
5018	NC_010085	AT	3	6	219230	219235	50 %	50 %	0 %	0 %	161527755
5019	NC_010085	TTC	2	6	219280	219285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527755
5020	NC_010085	CTT	2	6	219288	219293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527755
5021	NC_010085	CAA	2	6	219318	219323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161527755
5022	NC_010085	T	7	7	219331	219337	0 %	100 %	0 %	0 %	161527755
5023	NC_010085	T	7	7	219349	219355	0 %	100 %	0 %	0 %	161527755
5024	NC_010085	TG	3	6	219368	219373	0 %	50 %	50 %	0 %	161527755
5025	NC_010085	TTC	2	6	219406	219411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527755
5026	NC_010085	TG	3	6	219482	219487	0 %	50 %	50 %	0 %	161527755
5027	NC_010085	ATA	2	6	219525	219530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527755
5028	NC_010085	TCC	2	6	219553	219558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527755
5029	NC_010085	GTC	2	6	219613	219618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161527756
5030	NC_010085	TTC	2	6	219646	219651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527756
5031	NC_010085	CAT	2	6	219652	219657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527756
5032	NC_010085	CTT	2	6	219658	219663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527756
5033	NC_010085	CTTT	2	8	219693	219700	0 %	75 %	0 %	25 %	161527756
5034	NC_010085	TCA	2	6	219755	219760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527756
5035	NC_010085	TAA	2	6	219828	219833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527756
5036	NC_010085	ATG	2	6	219873	219878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527756
5037	NC_010085	CT	3	6	219895	219900	0 %	50 %	0 %	50 %	161527756
5038	NC_010085	CTT	2	6	219987	219992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527756
5039	NC_010085	TAAA	2	8	220104	220111	75 %	25 %	0 %	0 %	161527756
5040	NC_010085	TTG	2	6	220143	220148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527756
5041	NC_010085	AAAAT	2	10	220192	220201	80 %	20 %	0 %	0 %	161527756
5042	NC_010085	T	6	6	220219	220224	0 %	100 %	0 %	0 %	161527756
5043	NC_010085	ATTTT	2	10	220226	220235	20 %	80 %	0 %	0 %	161527756
5044	NC_010085	T	8	8	220232	220239	0 %	100 %	0 %	0 %	161527756
5045	NC_010085	ATT	2	6	220250	220255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527756
5046	NC_010085	TCT	2	6	220312	220317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161527756
5047	NC_010085	ATCTA	2	10	220336	220345	40 %	40 %	0 %	20 %	161527756
5048	NC_010085	T	6	6	220358	220363	0 %	100 %	0 %	0 %	161527756
5049	NC_010085	AGAT	2	8	220392	220399	50 %	25 %	25 %	0 %	161527756
5050	NC_010085	TGT	2	6	220420	220425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527756
5051	NC_010085	CAAAC	2	10	220467	220476	60 %	0 %	0 %	40 %	161527756
5052	NC_010085	ATTT	2	8	220539	220546	25 %	75 %	0 %	0 %	161527757
5053	NC_010085	CCT	2	6	220587	220592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161527757
5054	NC_010085	AACT	2	8	220648	220655	50 %	25 %	0 %	25 %	161527757
5055	NC_010085	ATT	2	6	220788	220793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527757
5056	NC_010085	T	6	6	220806	220811	0 %	100 %	0 %	0 %	161527757
5057	NC_010085	T	6	6	220882	220887	0 %	100 %	0 %	0 %	161527757
5058	NC_010085	ATT	2	6	220946	220951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527757
5059	NC_010085	TTG	2	6	221069	221074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527757
5060	NC_010085	T	6	6	221086	221091	0 %	100 %	0 %	0 %	161527757
5061	NC_010085	TTTTCA	2	12	221098	221109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	161527757
5062	NC_010085	T	6	6	221124	221129	0 %	100 %	0 %	0 %	161527757
5063	NC_010085	GTG	2	6	221187	221192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527757
5064	NC_010085	TC	3	6	221195	221200	0 %	50 %	0 %	50 %	161527757
5065	NC_010085	T	6	6	221233	221238	0 %	100 %	0 %	0 %	161527757
5066	NC_010085	TCA	2	6	221256	221261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527757
5067	NC_010085	CTAT	2	8	221328	221335	25 %	50 %	0 %	25 %	161527757
5068	NC_010085	T	6	6	221335	221340	0 %	100 %	0 %	0 %	161527757
5069	NC_010085	ATT	2	6	221346	221351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527757
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5071	NC_010085	ATT	2	6	221412	221417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527757
5072	NC_010085	CTA	2	6	221422	221427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527757
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5080	NC_010085	TCAT	2	8	222037	222044	25 %	50 %	0 %	25 %	161527758
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5101	NC_010085	TTTCA	2	10	222895	222904	20 %	60 %	0 %	20 %	161527759
5102	NC_010085	TTG	2	6	222920	222925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527759
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5113	NC_010085	TCAA	2	8	223272	223279	50 %	25 %	0 %	25 %	161527759
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5119	NC_010085	CAT	2	6	223445	223450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161527760
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5121	NC_010085	AAT	2	6	223562	223567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527760
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5123	NC_010085	GGA	2	6	223627	223632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161527760
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5489	NC_010085	GAT	2	6	240280	240285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527780
5490	NC_010085	TGG	2	6	240288	240293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161527780
5491	NC_010085	TTG	2	6	240332	240337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161527780
5492	NC_010085	ACGAAT	2	12	240344	240355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161527780
5493	NC_010085	A	6	6	240370	240375	100 %	0 %	0 %	0 %	161527780
5494	NC_010085	AAT	2	6	240397	240402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527780
5495	NC_010085	GAA	2	6	240406	240411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161527780
5496	NC_010085	CCA	2	6	240412	240417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161527780
5497	NC_010085	GAT	3	9	240430	240438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161527780
5498	NC_010085	ATA	2	6	240452	240457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161527780
5499	NC_010085	TATGA	2	10	240496	240505	40 %	40 %	20 %	0 %	161527780
5500	NC_010085	ATT	2	6	240558	240563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161527780

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