MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444 plasmid pNL1

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009426	TG	3	6	983	988	0 %	50 %	50 %	0 %	146275444
2	NC_009426	CG	3	6	1454	1459	0 %	0 %	50 %	50 %	146275445
3	NC_009426	CG	3	6	2403	2408	0 %	0 %	50 %	50 %	146275446
4	NC_009426	GC	4	8	2863	2870	0 %	0 %	50 %	50 %	146275447
5	NC_009426	CG	4	8	3070	3077	0 %	0 %	50 %	50 %	146275447
6	NC_009426	GC	3	6	4348	4353	0 %	0 %	50 %	50 %	146275448
7	NC_009426	CG	3	6	4395	4400	0 %	0 %	50 %	50 %	146275448
8	NC_009426	GC	3	6	5432	5437	0 %	0 %	50 %	50 %	146275449
9	NC_009426	CG	3	6	5934	5939	0 %	0 %	50 %	50 %	146275449
10	NC_009426	GC	3	6	6158	6163	0 %	0 %	50 %	50 %	146275450
11	NC_009426	CG	4	8	6164	6171	0 %	0 %	50 %	50 %	146275450
12	NC_009426	GC	3	6	6756	6761	0 %	0 %	50 %	50 %	146275450
13	NC_009426	GC	4	8	8233	8240	0 %	0 %	50 %	50 %	146275451
14	NC_009426	GC	3	6	8282	8287	0 %	0 %	50 %	50 %	146275451
15	NC_009426	GC	3	6	8708	8713	0 %	0 %	50 %	50 %	146275451
16	NC_009426	CG	3	6	9074	9079	0 %	0 %	50 %	50 %	146275451
17	NC_009426	CG	4	8	9757	9764	0 %	0 %	50 %	50 %	146275452
18	NC_009426	CG	3	6	9971	9976	0 %	0 %	50 %	50 %	146275453
19	NC_009426	CG	3	6	11256	11261	0 %	0 %	50 %	50 %	146275454
20	NC_009426	GC	4	8	14639	14646	0 %	0 %	50 %	50 %	146275455
21	NC_009426	GC	3	6	16417	16422	0 %	0 %	50 %	50 %	146275456
22	NC_009426	TG	3	6	16604	16609	0 %	50 %	50 %	0 %	146275456
23	NC_009426	TG	3	6	16881	16886	0 %	50 %	50 %	0 %	146275457
24	NC_009426	CG	3	6	16906	16911	0 %	0 %	50 %	50 %	146275457
25	NC_009426	GC	3	6	17794	17799	0 %	0 %	50 %	50 %	146275458
26	NC_009426	CA	3	6	18303	18308	50 %	0 %	0 %	50 %	146275458
27	NC_009426	GC	3	6	18382	18387	0 %	0 %	50 %	50 %	146275458
28	NC_009426	GC	3	6	18642	18647	0 %	0 %	50 %	50 %	146275458
29	NC_009426	CG	3	6	18934	18939	0 %	0 %	50 %	50 %	146275458
30	NC_009426	GC	5	10	20131	20140	0 %	0 %	50 %	50 %	146275461
31	NC_009426	GC	3	6	20959	20964	0 %	0 %	50 %	50 %	146275462
32	NC_009426	CG	4	8	21058	21065	0 %	0 %	50 %	50 %	146275462
33	NC_009426	GC	3	6	22475	22480	0 %	0 %	50 %	50 %	146275464
34	NC_009426	GC	3	6	22501	22506	0 %	0 %	50 %	50 %	146275464
35	NC_009426	CG	3	6	22811	22816	0 %	0 %	50 %	50 %	146275464
36	NC_009426	CG	3	6	24347	24352	0 %	0 %	50 %	50 %	146275465
37	NC_009426	CT	3	6	25233	25238	0 %	50 %	0 %	50 %	146275467
38	NC_009426	CG	3	6	25660	25665	0 %	0 %	50 %	50 %	146275467
39	NC_009426	GC	3	6	26574	26579	0 %	0 %	50 %	50 %	146275468
40	NC_009426	CG	3	6	27479	27484	0 %	0 %	50 %	50 %	146275469
41	NC_009426	CG	4	8	28117	28124	0 %	0 %	50 %	50 %	146275470
42	NC_009426	GC	3	6	30283	30288	0 %	0 %	50 %	50 %	146275472
43	NC_009426	GT	3	6	30432	30437	0 %	50 %	50 %	0 %	146275472
44	NC_009426	CG	3	6	31222	31227	0 %	0 %	50 %	50 %	146275474
45	NC_009426	GT	3	6	31608	31613	0 %	50 %	50 %	0 %	146275474
46	NC_009426	CG	4	8	31642	31649	0 %	0 %	50 %	50 %	146275474
47	NC_009426	CG	3	6	31875	31880	0 %	0 %	50 %	50 %	146275474
48	NC_009426	GC	4	8	32117	32124	0 %	0 %	50 %	50 %	146275474
49	NC_009426	GC	3	6	32370	32375	0 %	0 %	50 %	50 %	146275474
50	NC_009426	GC	3	6	32727	32732	0 %	0 %	50 %	50 %	146275475
51	NC_009426	GC	3	6	32956	32961	0 %	0 %	50 %	50 %	146275475
52	NC_009426	CG	3	6	34669	34674	0 %	0 %	50 %	50 %	146275478
53	NC_009426	CG	3	6	35788	35793	0 %	0 %	50 %	50 %	146275479
54	NC_009426	GC	3	6	38054	38059	0 %	0 %	50 %	50 %	146275480
55	NC_009426	GC	3	6	38795	38800	0 %	0 %	50 %	50 %	146275481
56	NC_009426	GC	3	6	39063	39068	0 %	0 %	50 %	50 %	146275481
57	NC_009426	GC	3	6	39280	39285	0 %	0 %	50 %	50 %	146275481
58	NC_009426	CG	4	8	41477	41484	0 %	0 %	50 %	50 %	146275482
59	NC_009426	GC	3	6	41630	41635	0 %	0 %	50 %	50 %	146275482
60	NC_009426	CG	3	6	43200	43205	0 %	0 %	50 %	50 %	146275483
61	NC_009426	GC	3	6	43881	43886	0 %	0 %	50 %	50 %	146275484
62	NC_009426	GC	3	6	45998	46003	0 %	0 %	50 %	50 %	146275486
63	NC_009426	CG	3	6	46354	46359	0 %	0 %	50 %	50 %	146275486
64	NC_009426	AC	3	6	46834	46839	50 %	0 %	0 %	50 %	146275486
65	NC_009426	CG	3	6	47273	47278	0 %	0 %	50 %	50 %	146275487
66	NC_009426	GC	3	6	47288	47293	0 %	0 %	50 %	50 %	146275487
67	NC_009426	CG	3	6	47600	47605	0 %	0 %	50 %	50 %	146275487
68	NC_009426	GC	3	6	47858	47863	0 %	0 %	50 %	50 %	146275487
69	NC_009426	GC	4	8	48252	48259	0 %	0 %	50 %	50 %	146275487
70	NC_009426	GC	3	6	48994	48999	0 %	0 %	50 %	50 %	146275489
71	NC_009426	CG	3	6	49985	49990	0 %	0 %	50 %	50 %	146275489
72	NC_009426	GC	3	6	53340	53345	0 %	0 %	50 %	50 %	146275492
73	NC_009426	GC	3	6	53921	53926	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
74	NC_009426	CG	4	8	54033	54040	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
75	NC_009426	CG	3	6	54127	54132	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
76	NC_009426	AC	3	6	54261	54266	50 %	0 %	0 %	50 %	146275493
77	NC_009426	CG	3	6	54298	54303	0 %	0 %	50 %	50 %	146275493
78	NC_009426	CG	3	6	55293	55298	0 %	0 %	50 %	50 %	146275494
79	NC_009426	CG	3	6	55903	55908	0 %	0 %	50 %	50 %	146275495
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81	NC_009426	GC	3	6	57519	57524	0 %	0 %	50 %	50 %	146275496
82	NC_009426	GA	3	6	58047	58052	50 %	0 %	50 %	0 %	146275497
83	NC_009426	AG	3	6	58109	58114	50 %	0 %	50 %	0 %	146275497
84	NC_009426	TG	3	6	58134	58139	0 %	50 %	50 %	0 %	146275497
85	NC_009426	CG	3	6	58156	58161	0 %	0 %	50 %	50 %	146275497
86	NC_009426	GC	3	6	58212	58217	0 %	0 %	50 %	50 %	146275497
87	NC_009426	CT	3	6	59077	59082	0 %	50 %	0 %	50 %	146275498
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89	NC_009426	CT	3	6	60328	60333	0 %	50 %	0 %	50 %	146275499
90	NC_009426	GC	3	6	60434	60439	0 %	0 %	50 %	50 %	146275499
91	NC_009426	CG	3	6	60607	60612	0 %	0 %	50 %	50 %	146275499
92	NC_009426	GC	3	6	60850	60855	0 %	0 %	50 %	50 %	146275499
93	NC_009426	GC	3	6	61217	61222	0 %	0 %	50 %	50 %	146275499
94	NC_009426	GC	3	6	61963	61968	0 %	0 %	50 %	50 %	146275500
95	NC_009426	CG	3	6	62162	62167	0 %	0 %	50 %	50 %	146275500
96	NC_009426	CG	3	6	62207	62212	0 %	0 %	50 %	50 %	146275500
97	NC_009426	GC	3	6	62216	62221	0 %	0 %	50 %	50 %	146275500
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100	NC_009426	GC	3	6	62704	62709	0 %	0 %	50 %	50 %	146275502
101	NC_009426	GC	3	6	63106	63111	0 %	0 %	50 %	50 %	146275503
102	NC_009426	GC	3	6	64458	64463	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
103	NC_009426	GC	3	6	64776	64781	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
104	NC_009426	GC	3	6	64984	64989	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
105	NC_009426	GC	3	6	65014	65019	0 %	0 %	50 %	50 %	146275504
106	NC_009426	CG	3	6	66706	66711	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
107	NC_009426	CG	3	6	67313	67318	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
108	NC_009426	CG	3	6	67373	67378	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
109	NC_009426	GC	3	6	67408	67413	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
110	NC_009426	TC	3	6	67488	67493	0 %	50 %	0 %	50 %	146275506
111	NC_009426	CT	3	6	67679	67684	0 %	50 %	0 %	50 %	146275506
112	NC_009426	CG	3	6	68495	68500	0 %	0 %	50 %	50 %	146275506
113	NC_009426	AC	3	6	68784	68789	50 %	0 %	0 %	50 %	146275506
114	NC_009426	CG	3	6	69888	69893	0 %	0 %	50 %	50 %	146275507
115	NC_009426	CG	4	8	70044	70051	0 %	0 %	50 %	50 %	146275508
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119	NC_009426	GC	3	6	74996	75001	0 %	0 %	50 %	50 %	146275512
120	NC_009426	GC	3	6	75207	75212	0 %	0 %	50 %	50 %	146275512
121	NC_009426	GC	3	6	75368	75373	0 %	0 %	50 %	50 %	146275512
122	NC_009426	GC	3	6	76120	76125	0 %	0 %	50 %	50 %	146275513
123	NC_009426	CG	4	8	76300	76307	0 %	0 %	50 %	50 %	146275513
124	NC_009426	CG	3	6	76739	76744	0 %	0 %	50 %	50 %	146275513
125	NC_009426	CG	3	6	76896	76901	0 %	0 %	50 %	50 %	146275513
126	NC_009426	CG	3	6	76928	76933	0 %	0 %	50 %	50 %	146275513
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128	NC_009426	CG	3	6	77295	77300	0 %	0 %	50 %	50 %	146275514
129	NC_009426	CG	4	8	77352	77359	0 %	0 %	50 %	50 %	146275514
130	NC_009426	GT	3	6	77618	77623	0 %	50 %	50 %	0 %	146275515
131	NC_009426	GC	3	6	77728	77733	0 %	0 %	50 %	50 %	146275515
132	NC_009426	CG	4	8	78037	78044	0 %	0 %	50 %	50 %	146275515
133	NC_009426	CG	3	6	78067	78072	0 %	0 %	50 %	50 %	146275515
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138	NC_009426	GC	3	6	81488	81493	0 %	0 %	50 %	50 %	146275522
139	NC_009426	GC	3	6	82310	82315	0 %	0 %	50 %	50 %	146275523
140	NC_009426	CG	3	6	82850	82855	0 %	0 %	50 %	50 %	146275523
141	NC_009426	GC	3	6	83671	83676	0 %	0 %	50 %	50 %	146275525
142	NC_009426	GC	3	6	83858	83863	0 %	0 %	50 %	50 %	146275525
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.