MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 chromosome

Total Repeats: 100720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008699	GAC	2	6	96	101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714273
2	NC_008699	GCG	2	6	166	171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714273
3	NC_008699	TCG	2	6	250	255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714273
4	NC_008699	CGG	3	9	452	460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714273
5	NC_008699	TCG	2	6	669	674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714273
6	NC_008699	GCT	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714273
7	NC_008699	CTC	2	6	738	743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714273
8	NC_008699	CCT	2	6	776	781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714273
9	NC_008699	GAG	2	6	846	851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714273
10	NC_008699	TCA	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714273
11	NC_008699	CGA	2	6	881	886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714273
12	NC_008699	CTG	2	6	930	935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714273
13	NC_008699	CGA	2	6	938	943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714273
14	NC_008699	AGG	2	6	976	981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714273
15	NC_008699	TTC	2	6	984	989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714273
16	NC_008699	GCC	2	6	1121	1126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714273
17	NC_008699	AAG	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714273
18	NC_008699	GCC	2	6	1164	1169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714273
19	NC_008699	AGG	2	6	1291	1296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714273
20	NC_008699	GCG	2	6	1345	1350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714273
21	NC_008699	ATC	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714273
22	NC_008699	ACG	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714273
23	NC_008699	CTC	2	6	1578	1583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714273
24	NC_008699	TCG	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714274
25	NC_008699	CGA	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714274
26	NC_008699	GAC	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714274
27	NC_008699	CGG	3	9	2537	2545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714274
28	NC_008699	CGA	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714274
29	NC_008699	TGC	2	6	2558	2563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714274
30	NC_008699	GCT	2	6	2610	2615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714274
31	NC_008699	CGG	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714274
32	NC_008699	GCG	2	6	2741	2746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714274
33	NC_008699	ACC	2	6	2767	2772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714274
34	NC_008699	CAT	2	6	2787	2792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714274
35	NC_008699	CGG	2	6	2814	2819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714274
36	NC_008699	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714274
37	NC_008699	TCG	2	6	2924	2929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714274
38	NC_008699	CGA	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714274
39	NC_008699	CAC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714274
40	NC_008699	GGT	2	6	3135	3140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714274
41	NC_008699	GGT	2	6	3171	3176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714274
42	NC_008699	GCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714274
43	NC_008699	CGA	2	6	3198	3203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714274
44	NC_008699	CTG	2	6	3226	3231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714274
45	NC_008699	TCG	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714275
46	NC_008699	GGC	2	6	3365	3370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
47	NC_008699	GGT	2	6	3406	3411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714275
48	NC_008699	GGT	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714275
49	NC_008699	CCG	2	6	3507	3512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714275
50	NC_008699	CCG	2	6	3535	3540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714275
51	NC_008699	GCT	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714275
52	NC_008699	CGA	2	6	3556	3561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714275
53	NC_008699	GTC	2	6	3572	3577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714275
54	NC_008699	CGG	2	6	3580	3585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
55	NC_008699	CGA	2	6	3601	3606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714275
56	NC_008699	CCT	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714275
57	NC_008699	TCG	2	6	3648	3653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714275
58	NC_008699	GCG	2	6	3669	3674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
59	NC_008699	GCG	2	6	3708	3713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
60	NC_008699	CGA	2	6	3718	3723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714275
61	NC_008699	GGC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
62	NC_008699	AAG	2	6	3794	3799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714275
63	NC_008699	ATG	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714275
64	NC_008699	GCT	2	6	3880	3885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714275
65	NC_008699	CTC	2	6	3962	3967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714275
66	NC_008699	CCT	2	6	3970	3975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714275
67	NC_008699	GAG	2	6	3989	3994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714275
68	NC_008699	CGA	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714275
69	NC_008699	GAC	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714275
70	NC_008699	CGC	2	6	4159	4164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714275
71	NC_008699	CGG	2	6	4180	4185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
72	NC_008699	GCC	2	6	4204	4209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714275
73	NC_008699	CGG	2	6	4213	4218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714275
74	NC_008699	TCG	2	6	4369	4374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714276
75	NC_008699	GTG	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714276
76	NC_008699	CGG	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714276
77	NC_008699	GGA	2	6	4610	4615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714276
78	NC_008699	CGA	2	6	4661	4666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714276
79	NC_008699	CTG	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714276
80	NC_008699	TGC	2	6	4675	4680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714276
81	NC_008699	CTC	2	6	4743	4748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714276
82	NC_008699	TGG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714276
83	NC_008699	CGA	2	6	5042	5047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714276
84	NC_008699	CGA	2	6	5099	5104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714276
85	NC_008699	GCT	2	6	5117	5122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714276
86	NC_008699	TCG	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714276
87	NC_008699	CGA	2	6	5189	5194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714276
88	NC_008699	GCT	3	9	5195	5203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714276
89	NC_008699	GAC	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714276
90	NC_008699	CGC	2	6	5379	5384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714276
91	NC_008699	CGG	2	6	5431	5436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714276
92	NC_008699	TCC	2	6	5500	5505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714276
93	NC_008699	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714277
94	NC_008699	GAC	2	6	5587	5592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714277
95	NC_008699	AAG	2	6	5665	5670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714277
96	NC_008699	CGA	2	6	5709	5714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714277
97	NC_008699	GCT	2	6	5727	5732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714277
98	NC_008699	GCC	2	6	5747	5752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714277
99	NC_008699	CGA	2	6	5757	5762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714277
100	NC_008699	CTG	2	6	5920	5925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714277
101	NC_008699	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714277
102	NC_008699	GAG	2	6	5953	5958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714277
103	NC_008699	GAA	2	6	6015	6020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714277
104	NC_008699	CGG	2	6	6419	6424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
105	NC_008699	GGC	2	6	6427	6432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
106	NC_008699	GCC	2	6	6442	6447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714278
107	NC_008699	ACG	2	6	6485	6490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
108	NC_008699	CAC	2	6	6577	6582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714278
109	NC_008699	CGA	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
110	NC_008699	CGG	2	6	6666	6671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
111	NC_008699	CGG	2	6	6768	6773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
112	NC_008699	CGG	4	12	6780	6791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
113	NC_008699	CGG	2	6	6804	6809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
114	NC_008699	GGT	2	6	6831	6836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714278
115	NC_008699	GGC	2	6	6890	6895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
116	NC_008699	CGA	2	6	6954	6959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
117	NC_008699	CAC	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714278
118	NC_008699	CAA	2	6	7065	7070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119714278
119	NC_008699	TCG	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714278
120	NC_008699	CGA	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
121	NC_008699	CGG	2	6	7103	7108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
122	NC_008699	CCG	2	6	7109	7114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714278
123	NC_008699	TCG	2	6	7118	7123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714278
124	NC_008699	GAC	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
125	NC_008699	CGA	2	6	7170	7175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
126	NC_008699	ACG	2	6	7184	7189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714278
127	NC_008699	GCG	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714278
128	NC_008699	CCG	2	6	7272	7277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714278
129	NC_008699	CCG	2	6	7283	7288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714278
130	NC_008699	CCT	2	6	7376	7381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714278
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