MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 chromosome

Total Repeats: 133224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008699	CGGCC	2	10	119633	119642	0 %	0 %	40 %	60 %	119714373
3002	NC_008699	CGA	2	6	119728	119733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714373
3003	NC_008699	CGG	2	6	119738	119743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714373
3004	NC_008699	CCG	2	6	119751	119756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714373
3005	NC_008699	GCCA	2	8	119769	119776	25 %	0 %	25 %	50 %	119714373
3006	NC_008699	GCA	2	6	119856	119861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3007	NC_008699	TCGGCC	2	12	119901	119912	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	119714374
3008	NC_008699	TGA	2	6	119913	119918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714374
3009	NC_008699	AGC	2	6	119949	119954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3010	NC_008699	GCGG	2	8	119968	119975	0 %	0 %	75 %	25 %	119714374
3011	NC_008699	CCG	2	6	120006	120011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714374
3012	NC_008699	GAG	2	6	120029	120034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714374
3013	NC_008699	GCT	2	6	120064	120069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3014	NC_008699	CGA	2	6	120085	120090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3015	NC_008699	TGC	2	6	120111	120116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3016	NC_008699	CCA	2	6	120120	120125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714374
3017	NC_008699	GCG	2	6	120150	120155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714374
3018	NC_008699	CGA	2	6	120199	120204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3019	NC_008699	GCC	2	6	120213	120218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714374
3020	NC_008699	GCA	2	6	120244	120249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3021	NC_008699	CAG	2	6	120259	120264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3022	NC_008699	GAG	2	6	120278	120283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714374
3023	NC_008699	CGC	2	6	120307	120312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714374
3024	NC_008699	CG	3	6	120365	120370	0 %	0 %	50 %	50 %	119714374
3025	NC_008699	GCA	2	6	120432	120437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3026	NC_008699	GCC	2	6	120438	120443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714374
3027	NC_008699	TTCC	2	8	120479	120486	0 %	50 %	0 %	50 %	119714374
3028	NC_008699	GCC	2	6	120527	120532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714374
3029	NC_008699	CG	3	6	120547	120552	0 %	0 %	50 %	50 %	119714374
3030	NC_008699	AGC	2	6	120561	120566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3031	NC_008699	GCG	2	6	120567	120572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714374
3032	NC_008699	CAG	2	6	120581	120586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3033	NC_008699	CCTGG	2	10	120592	120601	0 %	20 %	40 %	40 %	119714374
3034	NC_008699	CGT	2	6	120619	120624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3035	NC_008699	GATCCC	2	12	120625	120636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119714374
3036	NC_008699	GCC	3	9	120674	120682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714374
3037	NC_008699	CGA	2	6	120697	120702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714374
3038	NC_008699	CG	4	8	120895	120902	0 %	0 %	50 %	50 %	119714375
3039	NC_008699	CGG	2	6	120920	120925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714375
3040	NC_008699	CGGG	2	8	120953	120960	0 %	0 %	75 %	25 %	119714375
3041	NC_008699	GCG	2	6	120962	120967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714375
3042	NC_008699	GCC	2	6	120997	121002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714375
3043	NC_008699	GC	4	8	121024	121031	0 %	0 %	50 %	50 %	119714375
3044	NC_008699	CGG	2	6	121038	121043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714375
3045	NC_008699	CGT	2	6	121053	121058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3046	NC_008699	CGC	2	6	121089	121094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714375
3047	NC_008699	CCG	2	6	121097	121102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714375
3048	NC_008699	TCG	2	6	121109	121114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3049	NC_008699	CCT	2	6	121128	121133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714375
3050	NC_008699	GCG	2	6	121162	121167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714375
3051	NC_008699	GCTC	2	8	121194	121201	0 %	25 %	25 %	50 %	119714375
3052	NC_008699	ACC	2	6	121205	121210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714375
3053	NC_008699	GCG	2	6	121214	121219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714375
3054	NC_008699	GCC	3	9	121261	121269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714375
3055	NC_008699	CAC	2	6	121270	121275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714375
3056	NC_008699	CGT	2	6	121281	121286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3057	NC_008699	AGC	2	6	121343	121348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3058	NC_008699	GC	3	6	121347	121352	0 %	0 %	50 %	50 %	119714375
3059	NC_008699	TCG	2	6	121358	121363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3060	NC_008699	GTC	2	6	121369	121374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3061	NC_008699	CAG	2	6	121387	121392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714375
3062	NC_008699	GCC	2	6	121423	121428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714375
3063	NC_008699	GC	3	6	121562	121567	0 %	0 %	50 %	50 %	119714375
3064	NC_008699	ACC	2	6	121589	121594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714375
3065	NC_008699	GGTC	2	8	121595	121602	0 %	25 %	50 %	25 %	119714375
3066	NC_008699	GCC	2	6	121621	121626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714375
3067	NC_008699	CCGA	2	8	121661	121668	25 %	0 %	25 %	50 %	119714375
3068	NC_008699	GCGG	2	8	121703	121710	0 %	0 %	75 %	25 %	119714375
3069	NC_008699	GCG	2	6	121757	121762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714375
3070	NC_008699	CGGGC	2	10	121904	121913	0 %	0 %	60 %	40 %	119714376
3071	NC_008699	CCGGC	2	10	121949	121958	0 %	0 %	40 %	60 %	119714376
3072	NC_008699	GCCG	2	8	122008	122015	0 %	0 %	50 %	50 %	119714376
3073	NC_008699	GCG	2	6	122093	122098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714376
3074	NC_008699	GTC	2	6	122105	122110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3075	NC_008699	GCT	2	6	122128	122133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3076	NC_008699	CGT	2	6	122179	122184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3077	NC_008699	CGT	2	6	122194	122199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3078	NC_008699	GCCG	2	8	122238	122245	0 %	0 %	50 %	50 %	119714376
3079	NC_008699	CGA	2	6	122284	122289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3080	NC_008699	ACGGC	2	10	122293	122302	20 %	0 %	40 %	40 %	119714376
3081	NC_008699	GGT	2	6	122350	122355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714376
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3083	NC_008699	GTG	2	6	122393	122398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714376
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3085	NC_008699	CGA	3	9	122470	122478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714376
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3087	NC_008699	GTG	2	6	122522	122527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714376
3088	NC_008699	CG	3	6	122560	122565	0 %	0 %	50 %	50 %	119714376
3089	NC_008699	CGG	2	6	122585	122590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714376
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3091	NC_008699	CGC	2	6	122629	122634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714376
3092	NC_008699	GCT	2	6	122638	122643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3093	NC_008699	CGG	2	6	122709	122714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714376
3094	NC_008699	CGG	2	6	122758	122763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714376
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3103	NC_008699	GCC	2	6	122966	122971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714376
3104	NC_008699	GCT	3	9	123046	123054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
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3107	NC_008699	CGGC	2	8	123085	123092	0 %	0 %	50 %	50 %	119714376
3108	NC_008699	GCGCTG	2	12	123097	123108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	119714376
3109	NC_008699	GGGTCG	2	12	123111	123122	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	119714376
3110	NC_008699	TGC	2	6	123126	123131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
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3113	NC_008699	TCGT	2	8	123161	123168	0 %	50 %	25 %	25 %	119714376
3114	NC_008699	GCG	2	6	123288	123293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714376
3115	NC_008699	CGGC	2	8	123343	123350	0 %	0 %	50 %	50 %	119714376
3116	NC_008699	TGC	2	6	123420	123425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
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3118	NC_008699	CGT	2	6	123451	123456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714376
3119	NC_008699	GC	3	6	123495	123500	0 %	0 %	50 %	50 %	119714376
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3121	NC_008699	GTG	2	6	123572	123577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714376
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3359	NC_008699	CTT	2	6	131471	131476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714385
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3362	NC_008699	GGTCGA	2	12	131545	131556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119714385
3363	NC_008699	CGC	2	6	131618	131623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714385
3364	NC_008699	CCGA	2	8	131646	131653	25 %	0 %	25 %	50 %	119714385
3365	NC_008699	CGT	2	6	131671	131676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714385
3366	NC_008699	TGC	2	6	131686	131691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714385
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3392	NC_008699	CCG	2	6	132622	132627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714386
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3402	NC_008699	GCTGC	2	10	132842	132851	0 %	20 %	40 %	40 %	119714386
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3480	NC_008699	GCTG	2	8	135830	135837	0 %	25 %	50 %	25 %	119714389
3481	NC_008699	CCA	2	6	135897	135902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714389
3482	NC_008699	CAG	2	6	135933	135938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3483	NC_008699	AGC	2	6	136013	136018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3484	NC_008699	AGC	3	9	136034	136042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3485	NC_008699	ACG	2	6	136061	136066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3486	NC_008699	CGG	2	6	136088	136093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714389
3487	NC_008699	GC	3	6	136103	136108	0 %	0 %	50 %	50 %	119714389
3488	NC_008699	TGC	2	6	136133	136138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3489	NC_008699	GTC	2	6	136159	136164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3490	NC_008699	GCT	2	6	136173	136178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3491	NC_008699	CCCA	2	8	136264	136271	25 %	0 %	0 %	75 %	119714389
3492	NC_008699	CAA	2	6	136284	136289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119714389
3493	NC_008699	CCA	2	6	136295	136300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714389
3494	NC_008699	TGC	2	6	136304	136309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714389
3495	NC_008699	ACC	2	6	136313	136318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714389
3496	NC_008699	ACC	2	6	136334	136339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714389
3497	NC_008699	ACCCG	2	10	136346	136355	20 %	0 %	20 %	60 %	119714389
3498	NC_008699	GAG	2	6	136381	136386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714389
3499	NC_008699	GAT	2	6	136416	136421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714389
3500	NC_008699	CGC	2	6	136550	136555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714389

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