MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 chromosome

Total Repeats: 133224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008699	ACG	2	6	17512	17517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714286
502	NC_008699	CGA	2	6	17534	17539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714286
503	NC_008699	GCGA	2	8	17559	17566	25 %	0 %	50 %	25 %	119714286
504	NC_008699	GCG	2	6	17584	17589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714287
505	NC_008699	GCCG	2	8	17602	17609	0 %	0 %	50 %	50 %	119714287
506	NC_008699	GCT	2	6	17626	17631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714287
507	NC_008699	GCC	2	6	17663	17668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714287
508	NC_008699	GGT	2	6	17680	17685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714287
509	NC_008699	GCCGG	2	10	17686	17695	0 %	0 %	60 %	40 %	119714287
510	NC_008699	TCC	2	6	17751	17756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714287
511	NC_008699	TGG	2	6	17757	17762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714287
512	NC_008699	GGC	2	6	17799	17804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714287
513	NC_008699	TTC	2	6	17864	17869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714287
514	NC_008699	TGC	2	6	17886	17891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714287
515	NC_008699	GGC	2	6	17937	17942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714287
516	NC_008699	GT	3	6	17951	17956	0 %	50 %	50 %	0 %	119714287
517	NC_008699	CG	3	6	18027	18032	0 %	0 %	50 %	50 %	119714287
518	NC_008699	CCCGG	2	10	18091	18100	0 %	0 %	40 %	60 %	119714287
519	NC_008699	TCA	2	6	18102	18107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714287
520	NC_008699	GGA	2	6	18136	18141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714287
521	NC_008699	ACG	2	6	18177	18182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714287
522	NC_008699	GGC	2	6	18203	18208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714287
523	NC_008699	CCG	2	6	18250	18255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714287
524	NC_008699	CG	4	8	18277	18284	0 %	0 %	50 %	50 %	119714287
525	NC_008699	CGC	2	6	18331	18336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714287
526	NC_008699	GTG	2	6	18362	18367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714287
527	NC_008699	TGG	2	6	18369	18374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714287
528	NC_008699	ACC	2	6	18390	18395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714287
529	NC_008699	GGT	2	6	18453	18458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714287
530	NC_008699	CG	3	6	18468	18473	0 %	0 %	50 %	50 %	119714287
531	NC_008699	CGG	2	6	18483	18488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714287
532	NC_008699	CGA	2	6	18493	18498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714287
533	NC_008699	TGG	2	6	18521	18526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714287
534	NC_008699	CAG	2	6	18548	18553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714287
535	NC_008699	CGA	2	6	18634	18639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714288
536	NC_008699	GTC	2	6	18650	18655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714288
537	NC_008699	GTG	2	6	18660	18665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714288
538	NC_008699	CGA	2	6	18710	18715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714288
539	NC_008699	C	6	6	18717	18722	0 %	0 %	0 %	100 %	119714288
540	NC_008699	TCG	3	9	18723	18731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714288
541	NC_008699	TGGGC	2	10	18733	18742	0 %	20 %	60 %	20 %	119714288
542	NC_008699	CGGCG	2	10	18743	18752	0 %	0 %	60 %	40 %	119714288
543	NC_008699	AGG	2	6	18790	18795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714288
544	NC_008699	CTT	2	6	18830	18835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714288
545	NC_008699	GGC	2	6	18854	18859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714288
546	NC_008699	CAG	2	6	18869	18874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714288
547	NC_008699	AGC	2	6	18876	18881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714288
548	NC_008699	CTTGCC	2	12	18884	18895	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	119714288
549	NC_008699	CTT	3	9	18899	18907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714288
550	NC_008699	TGG	2	6	18934	18939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714288
551	NC_008699	CGG	2	6	18949	18954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714288
552	NC_008699	CGG	2	6	18988	18993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714288
553	NC_008699	CGG	2	6	19003	19008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714288
554	NC_008699	GCG	2	6	19014	19019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714288
555	NC_008699	GGC	2	6	19103	19108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714288
556	NC_008699	GC	3	6	19115	19120	0 %	0 %	50 %	50 %	119714288
557	NC_008699	CCGGC	2	10	19132	19141	0 %	0 %	40 %	60 %	119714288
558	NC_008699	TCGC	2	8	19212	19219	0 %	25 %	25 %	50 %	119714288
559	NC_008699	CTT	3	9	19235	19243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714288
560	NC_008699	ACG	2	6	19533	19538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714289
561	NC_008699	ACG	2	6	19566	19571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714289
562	NC_008699	GGC	2	6	19613	19618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714289
563	NC_008699	CGGCAC	2	12	19627	19638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	119714289
564	NC_008699	CGG	2	6	19639	19644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714289
565	NC_008699	TTC	2	6	19748	19753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714289
566	NC_008699	CGT	2	6	19831	19836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714289
567	NC_008699	CCA	2	6	19848	19853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714289
568	NC_008699	CCGG	2	8	19962	19969	0 %	0 %	50 %	50 %	119714290
569	NC_008699	GCCG	2	8	20118	20125	0 %	0 %	50 %	50 %	119714290
570	NC_008699	CGG	2	6	20135	20140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714290
571	NC_008699	GAC	2	6	20162	20167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714290
572	NC_008699	TCGT	2	8	20169	20176	0 %	50 %	25 %	25 %	119714290
573	NC_008699	TGA	2	6	20206	20211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714290
574	NC_008699	CTGGC	2	10	20244	20253	0 %	20 %	40 %	40 %	119714290
575	NC_008699	CGC	2	6	20285	20290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714290
576	NC_008699	CGG	2	6	20291	20296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714290
577	NC_008699	ACC	2	6	20304	20309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714290
578	NC_008699	GT	3	6	20347	20352	0 %	50 %	50 %	0 %	119714290
579	NC_008699	ACG	2	6	20353	20358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714290
580	NC_008699	GCT	2	6	20372	20377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714290
581	NC_008699	CACG	2	8	20390	20397	25 %	0 %	25 %	50 %	119714290
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583	NC_008699	GC	3	6	20593	20598	0 %	0 %	50 %	50 %	119714290
584	NC_008699	GTG	2	6	20604	20609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714290
585	NC_008699	CAG	2	6	20634	20639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714290
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588	NC_008699	CGC	2	6	20738	20743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714290
589	NC_008699	CG	3	6	20761	20766	0 %	0 %	50 %	50 %	119714290
590	NC_008699	GCTGGT	2	12	20798	20809	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119714290
591	NC_008699	CGC	2	6	20810	20815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714290
592	NC_008699	CCG	2	6	20821	20826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714290
593	NC_008699	GTC	2	6	20832	20837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714290
594	NC_008699	ACG	2	6	21067	21072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714291
595	NC_008699	CGA	2	6	21082	21087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714291
596	NC_008699	CGTC	2	8	21103	21110	0 %	25 %	25 %	50 %	119714291
597	NC_008699	GA	3	6	21118	21123	50 %	0 %	50 %	0 %	119714291
598	NC_008699	GC	3	6	21184	21189	0 %	0 %	50 %	50 %	119714291
599	NC_008699	GCCG	2	8	21200	21207	0 %	0 %	50 %	50 %	119714291
600	NC_008699	TCG	2	6	21216	21221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714291
601	NC_008699	GT	4	8	21233	21240	0 %	50 %	50 %	0 %	119714291
602	NC_008699	GCG	2	6	21278	21283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714291
603	NC_008699	TGG	2	6	21330	21335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714291
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605	NC_008699	CGC	2	6	21401	21406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714291
606	NC_008699	CGGC	2	8	21444	21451	0 %	0 %	50 %	50 %	119714291
607	NC_008699	GCGG	2	8	21461	21468	0 %	0 %	75 %	25 %	119714291
608	NC_008699	AGG	2	6	21531	21536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714291
609	NC_008699	TCG	2	6	21555	21560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714291
610	NC_008699	GCA	2	6	21562	21567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714291
611	NC_008699	GGA	2	6	21583	21588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714291
612	NC_008699	CGC	2	6	21626	21631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714291
613	NC_008699	CTC	2	6	21635	21640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714291
614	NC_008699	GCG	3	9	21709	21717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714291
615	NC_008699	GCCC	2	8	21724	21731	0 %	0 %	25 %	75 %	119714291
616	NC_008699	TCC	2	6	21744	21749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714291
617	NC_008699	TAC	2	6	21770	21775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	119714291
618	NC_008699	CCA	2	6	21826	21831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714291
619	NC_008699	TGC	2	6	21900	21905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714291
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621	NC_008699	ACCGG	2	10	21934	21943	20 %	0 %	40 %	40 %	119714291
622	NC_008699	TTC	2	6	21944	21949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714291
623	NC_008699	CGG	2	6	21990	21995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714291
624	NC_008699	CGA	2	6	22424	22429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714292
625	NC_008699	TTC	2	6	22435	22440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714292
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