MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardioides sp. JS614 plasmid pNOCA01

Total Repeats: 6632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008697	TGA	2	6	135182	135187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714115
3002	NC_008697	CGG	2	6	135197	135202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714115
3003	NC_008697	CCT	2	6	135203	135208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714115
3004	NC_008697	CGT	2	6	135260	135265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714115
3005	NC_008697	CGT	2	6	135305	135310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714115
3006	NC_008697	TGG	2	6	135341	135346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714115
3007	NC_008697	CCTGT	2	10	135520	135529	0 %	40 %	20 %	40 %	119714116
3008	NC_008697	GAC	2	6	135533	135538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3009	NC_008697	CGT	2	6	135576	135581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3010	NC_008697	CCA	2	6	135630	135635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714116
3011	NC_008697	CGA	2	6	135702	135707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3012	NC_008697	CGC	2	6	135728	135733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714116
3013	NC_008697	GCG	2	6	135762	135767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714116
3014	NC_008697	ACG	2	6	135779	135784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3015	NC_008697	CAC	2	6	135826	135831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714116
3016	NC_008697	CGC	2	6	135855	135860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714116
3017	NC_008697	CGA	2	6	135861	135866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3018	NC_008697	AGC	2	6	135899	135904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3019	NC_008697	AGC	2	6	135929	135934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3020	NC_008697	CGG	2	6	135936	135941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714116
3021	NC_008697	GATCGG	2	12	135954	135965	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	119714116
3022	NC_008697	GCA	2	6	136002	136007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3023	NC_008697	ACG	2	6	136031	136036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3024	NC_008697	CGCA	2	8	136057	136064	25 %	0 %	25 %	50 %	119714116
3025	NC_008697	GGT	2	6	136075	136080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714116
3026	NC_008697	ACA	2	6	136122	136127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	119714116
3027	NC_008697	CG	3	6	136140	136145	0 %	0 %	50 %	50 %	119714116
3028	NC_008697	CGG	2	6	136158	136163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714116
3029	NC_008697	CGT	2	6	136164	136169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3030	NC_008697	GGCG	2	8	136245	136252	0 %	0 %	75 %	25 %	119714116
3031	NC_008697	CG	3	6	136273	136278	0 %	0 %	50 %	50 %	119714116
3032	NC_008697	CA	3	6	136358	136363	50 %	0 %	0 %	50 %	119714116
3033	NC_008697	CGG	2	6	136383	136388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714116
3034	NC_008697	TCGC	2	8	136433	136440	0 %	25 %	25 %	50 %	119714116
3035	NC_008697	GGT	2	6	136540	136545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714116
3036	NC_008697	TCT	2	6	136587	136592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714116
3037	NC_008697	GAG	2	6	136618	136623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714116
3038	NC_008697	GAG	2	6	136648	136653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714116
3039	NC_008697	CGATCC	2	12	136692	136703	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	119714116
3040	NC_008697	CCGG	2	8	136709	136716	0 %	0 %	50 %	50 %	119714116
3041	NC_008697	TGC	2	6	136849	136854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3042	NC_008697	CGGGT	2	10	136896	136905	0 %	20 %	60 %	20 %	119714116
3043	NC_008697	AAG	3	9	136961	136969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714116
3044	NC_008697	CCA	2	6	136985	136990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	119714116
3045	NC_008697	TCGGTG	2	12	137015	137026	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	119714116
3046	NC_008697	TCC	2	6	137078	137083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714116
3047	NC_008697	GCGA	2	8	137084	137091	25 %	0 %	50 %	25 %	119714116
3048	NC_008697	CCG	2	6	137147	137152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714116
3049	NC_008697	GAGG	2	8	137167	137174	25 %	0 %	75 %	0 %	119714116
3050	NC_008697	GACC	2	8	137181	137188	25 %	0 %	25 %	50 %	119714116
3051	NC_008697	GCG	2	6	137189	137194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714116
3052	NC_008697	CGA	2	6	137220	137225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3053	NC_008697	C	6	6	137234	137239	0 %	0 %	0 %	100 %	119714116
3054	NC_008697	TGA	2	6	137310	137315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	119714116
3055	NC_008697	CGC	2	6	137338	137343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714116
3056	NC_008697	ACG	2	6	137354	137359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
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3058	NC_008697	GTG	2	6	137426	137431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714116
3059	NC_008697	GTC	2	6	137454	137459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3060	NC_008697	CGA	2	6	137487	137492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3061	NC_008697	CAG	2	6	137599	137604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714116
3062	NC_008697	GGA	2	6	137652	137657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	119714117
3063	NC_008697	GTCA	2	8	137775	137782	25 %	25 %	25 %	25 %	119714117
3064	NC_008697	GC	3	6	137820	137825	0 %	0 %	50 %	50 %	119714117
3065	NC_008697	CTT	2	6	137912	137917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	119714117
3066	NC_008697	GTCC	2	8	137965	137972	0 %	25 %	25 %	50 %	119714117
3067	NC_008697	GCC	2	6	138030	138035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714117
3068	NC_008697	CCT	3	9	138037	138045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714117
3069	NC_008697	CCG	2	6	138118	138123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714117
3070	NC_008697	CGC	2	6	138146	138151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714117
3071	NC_008697	GAA	2	6	138165	138170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	119714117
3072	NC_008697	CTC	2	6	138171	138176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714117
3073	NC_008697	TGC	2	6	138202	138207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714117
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3076	NC_008697	GC	3	6	138329	138334	0 %	0 %	50 %	50 %	119714117
3077	NC_008697	GC	3	6	138381	138386	0 %	0 %	50 %	50 %	119714117
3078	NC_008697	CGA	2	6	138493	138498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714118
3079	NC_008697	TCGG	2	8	138516	138523	0 %	25 %	50 %	25 %	119714118
3080	NC_008697	GCC	3	9	138573	138581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714118
3081	NC_008697	GGT	2	6	138598	138603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714118
3082	NC_008697	CCT	2	6	138712	138717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714118
3083	NC_008697	GAGGCG	2	12	138759	138770	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	119714118
3084	NC_008697	TCG	2	6	138777	138782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714118
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3086	NC_008697	GGAA	2	8	138963	138970	50 %	0 %	50 %	0 %	119714118
3087	NC_008697	CGG	2	6	138985	138990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714118
3088	NC_008697	GCA	2	6	139016	139021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714118
3089	NC_008697	CCG	2	6	139058	139063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714118
3090	NC_008697	CGC	2	6	139133	139138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714118
3091	NC_008697	CAG	2	6	139142	139147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714118
3092	NC_008697	GCCGA	2	10	139167	139176	20 %	0 %	40 %	40 %	119714118
3093	NC_008697	GACG	2	8	139201	139208	25 %	0 %	50 %	25 %	119714118
3094	NC_008697	CGA	2	6	139261	139266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714118
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3096	NC_008697	CCT	2	6	139294	139299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	119714118
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3099	NC_008697	CGG	2	6	139374	139379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714119
3100	NC_008697	AGGA	2	8	139397	139404	50 %	0 %	50 %	0 %	119714119
3101	NC_008697	TCG	2	6	139409	139414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714119
3102	NC_008697	GGC	2	6	139648	139653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714119
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3104	NC_008697	GGC	2	6	139729	139734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714119
3105	NC_008697	CG	4	8	139750	139757	0 %	0 %	50 %	50 %	119714119
3106	NC_008697	CG	3	6	139792	139797	0 %	0 %	50 %	50 %	119714119
3107	NC_008697	CGAC	2	8	139824	139831	25 %	0 %	25 %	50 %	119714119
3108	NC_008697	GTT	2	6	139852	139857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	119714119
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3110	NC_008697	GGC	2	6	139936	139941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714119
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3115	NC_008697	GCGAC	2	10	140292	140301	20 %	0 %	40 %	40 %	119714120
3116	NC_008697	GGC	2	6	140311	140316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	119714120
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3121	NC_008697	GTCC	2	8	140612	140619	0 %	25 %	25 %	50 %	119714120
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3352	NC_008697	CCCA	2	8	155942	155949	25 %	0 %	0 %	75 %	119714132
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3357	NC_008697	CGA	2	6	156177	156182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	119714132
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3359	NC_008697	TTGCCG	2	12	156284	156295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714132
3360	NC_008697	TCGGC	2	10	156306	156315	0 %	20 %	40 %	40 %	119714132
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3364	NC_008697	TCG	2	6	156429	156434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714132
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3483	NC_008697	GTG	2	6	162163	162168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714138
3484	NC_008697	GTC	2	6	162306	162311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714138
3485	NC_008697	GGT	2	6	162315	162320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	119714138
3486	NC_008697	GCC	2	6	162393	162398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714138
3487	NC_008697	CGC	2	6	162411	162416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	119714138
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3491	NC_008697	GTC	2	6	162495	162500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	119714138
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