MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 1512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008344	TAAAT	2	10	1611	1620	60 %	40 %	0 %	0 %	114330038
2	NC_008344	CAGAT	2	10	6413	6422	40 %	20 %	20 %	20 %	114330041
3	NC_008344	GATCA	2	10	8477	8486	40 %	20 %	20 %	20 %	114330042
4	NC_008344	CGTTG	2	10	9165	9174	0 %	40 %	40 %	20 %	114330043
5	NC_008344	GCGCC	2	10	9761	9770	0 %	0 %	40 %	60 %	114330044
6	NC_008344	CAAAA	2	10	11874	11883	80 %	0 %	0 %	20 %	114330046
7	NC_008344	CCAGC	2	10	12387	12396	20 %	0 %	20 %	60 %	114330046
8	NC_008344	AGCAC	2	10	12397	12406	40 %	0 %	20 %	40 %	114330046
9	NC_008344	AGCGC	2	10	17129	17138	20 %	0 %	40 %	40 %	114330050
10	NC_008344	CAGTT	2	10	19341	19350	20 %	40 %	20 %	20 %	114330052
11	NC_008344	GCGTA	2	10	19730	19739	20 %	20 %	40 %	20 %	114330052
12	NC_008344	ACGCC	2	10	24658	24667	20 %	0 %	20 %	60 %	114330056
13	NC_008344	GGTAA	2	10	26890	26899	40 %	20 %	40 %	0 %	114330057
14	NC_008344	GGCCG	2	10	30430	30439	0 %	0 %	60 %	40 %	114330060
15	NC_008344	TTGGC	2	10	30449	30458	0 %	40 %	40 %	20 %	114330060
16	NC_008344	TGGCG	2	10	34093	34102	0 %	20 %	60 %	20 %	114330063
17	NC_008344	CGCAG	2	10	34195	34204	20 %	0 %	40 %	40 %	114330063
18	NC_008344	AACCA	2	10	36324	36333	60 %	0 %	0 %	40 %	114330068
19	NC_008344	CAGAA	2	10	37318	37327	60 %	0 %	20 %	20 %	114330069
20	NC_008344	AGACG	2	10	37854	37863	40 %	0 %	40 %	20 %	114330070
21	NC_008344	CCGCC	2	10	38358	38367	0 %	0 %	20 %	80 %	114330070
22	NC_008344	CGGTC	2	10	41409	41418	0 %	20 %	40 %	40 %	114330072
23	NC_008344	AGCGG	2	10	43070	43079	20 %	0 %	60 %	20 %	114330074
24	NC_008344	TATAC	2	10	45867	45876	40 %	40 %	0 %	20 %	114330077
25	NC_008344	CGCTG	2	10	49825	49834	0 %	20 %	40 %	40 %	114330081
26	NC_008344	GGCGG	2	10	52105	52114	0 %	0 %	80 %	20 %	114330083
27	NC_008344	CGATA	2	10	55914	55923	40 %	20 %	20 %	20 %	114330086
28	NC_008344	GCATC	2	10	56179	56188	20 %	20 %	20 %	40 %	114330086
29	NC_008344	GCCAC	2	10	57639	57648	20 %	0 %	20 %	60 %	114330087
30	NC_008344	GCAGC	2	10	58061	58070	20 %	0 %	40 %	40 %	114330088
31	NC_008344	CGCGC	2	10	60562	60571	0 %	0 %	40 %	60 %	114330090
32	NC_008344	AGCGG	2	10	62424	62433	20 %	0 %	60 %	20 %	114330093
33	NC_008344	CCCTG	2	10	62952	62961	0 %	20 %	20 %	60 %	114330094
34	NC_008344	TTTGA	2	10	63638	63647	20 %	60 %	20 %	0 %	114330095
35	NC_008344	GCACA	2	10	64438	64447	40 %	0 %	20 %	40 %	114330096
36	NC_008344	GCCTT	2	10	65676	65685	0 %	40 %	20 %	40 %	114330097
37	NC_008344	CCGAT	2	10	68256	68265	20 %	20 %	20 %	40 %	114330098
38	NC_008344	GCACA	2	10	68346	68355	40 %	0 %	20 %	40 %	114330098
39	NC_008344	TGCGC	2	10	68782	68791	0 %	20 %	40 %	40 %	114330098
40	NC_008344	CATCA	2	10	69874	69883	40 %	20 %	0 %	40 %	114330100
41	NC_008344	GCCTT	2	10	70178	70187	0 %	40 %	20 %	40 %	114330100
42	NC_008344	GGCGC	2	10	73065	73074	0 %	0 %	60 %	40 %	114330104
43	NC_008344	CGGGC	2	10	73421	73430	0 %	0 %	60 %	40 %	114330104
44	NC_008344	CCTCG	2	10	73833	73842	0 %	20 %	20 %	60 %	114330104
45	NC_008344	CAGAT	2	10	75493	75502	40 %	20 %	20 %	20 %	114330106
46	NC_008344	GCCAG	2	10	76208	76217	20 %	0 %	40 %	40 %	114330107
47	NC_008344	CCCTC	2	10	80089	80098	0 %	20 %	0 %	80 %	114330112
48	NC_008344	CAGCA	2	10	80867	80876	40 %	0 %	20 %	40 %	114330113
49	NC_008344	GCTTC	2	10	81992	82001	0 %	40 %	20 %	40 %	114330115
50	NC_008344	GCCTG	2	10	83040	83049	0 %	20 %	40 %	40 %	114330115
51	NC_008344	GCCGG	2	10	85199	85208	0 %	0 %	60 %	40 %	114330117
52	NC_008344	GGCGC	2	10	85274	85283	0 %	0 %	60 %	40 %	114330117
53	NC_008344	ATCGC	2	10	86376	86385	20 %	20 %	20 %	40 %	114330117
54	NC_008344	ACCGT	2	10	88488	88497	20 %	20 %	20 %	40 %	114330119
55	NC_008344	AGTTG	2	10	88547	88556	20 %	40 %	40 %	0 %	114330119
56	NC_008344	CAGGA	2	10	91593	91602	40 %	0 %	40 %	20 %	114330124
57	NC_008344	TGAGA	2	10	91923	91932	40 %	20 %	40 %	0 %	114330125
58	NC_008344	GACCA	2	10	93755	93764	40 %	0 %	20 %	40 %	114330128
59	NC_008344	GCGCC	2	10	96058	96067	0 %	0 %	40 %	60 %	114330129
60	NC_008344	CGACG	2	10	97967	97976	20 %	0 %	40 %	40 %	114330132
61	NC_008344	TGGCT	2	10	98294	98303	0 %	40 %	40 %	20 %	114330132
62	NC_008344	CGCTG	2	10	98464	98473	0 %	20 %	40 %	40 %	114330133
63	NC_008344	AACTG	2	10	100684	100693	40 %	20 %	20 %	20 %	114330135
64	NC_008344	TCAGA	2	10	106582	106591	40 %	20 %	20 %	20 %	114330142
65	NC_008344	GCCTT	2	10	110272	110281	0 %	40 %	20 %	40 %	114330145
66	NC_008344	AGCCA	2	10	110750	110759	40 %	0 %	20 %	40 %	114330146
67	NC_008344	AGGCG	2	10	111651	111660	20 %	0 %	60 %	20 %	114330146
68	NC_008344	GCGCG	2	10	112768	112777	0 %	0 %	60 %	40 %	114330147
69	NC_008344	GCCGA	2	10	115400	115409	20 %	0 %	40 %	40 %	114330148
70	NC_008344	GCGAA	2	10	116243	116252	40 %	0 %	40 %	20 %	114330150
71	NC_008344	GACCA	2	10	118268	118277	40 %	0 %	20 %	40 %	114330152
72	NC_008344	GTCGC	2	10	118456	118465	0 %	20 %	40 %	40 %	114330152
73	NC_008344	TGTGG	2	10	118778	118787	0 %	40 %	60 %	0 %	114330152
74	NC_008344	ATCGC	2	10	119273	119282	20 %	20 %	20 %	40 %	114330153
75	NC_008344	TGGCC	2	10	122292	122301	0 %	20 %	40 %	40 %	114330157
76	NC_008344	AGTCC	2	10	122615	122624	20 %	20 %	20 %	40 %	114330157
77	NC_008344	GATCA	2	10	128679	128688	40 %	20 %	20 %	20 %	114330161
78	NC_008344	ATACC	2	10	129054	129063	40 %	20 %	0 %	40 %	114330161
79	NC_008344	GTTCA	2	10	130168	130177	20 %	40 %	20 %	20 %	114330162
80	NC_008344	CAGCA	2	10	130359	130368	40 %	0 %	20 %	40 %	114330162
81	NC_008344	CGTCC	2	10	135360	135369	0 %	20 %	20 %	60 %	114330167
82	NC_008344	AAGAT	2	10	136677	136686	60 %	20 %	20 %	0 %	114330168
83	NC_008344	TCGCG	2	10	137225	137234	0 %	20 %	40 %	40 %	114330169
84	NC_008344	ATCAC	2	10	138237	138246	40 %	20 %	0 %	40 %	114330170
85	NC_008344	TTGTT	2	10	139399	139408	0 %	80 %	20 %	0 %	114330170
86	NC_008344	GGGCA	2	10	141822	141831	20 %	0 %	60 %	20 %	114330171
87	NC_008344	TGAAT	2	10	143290	143299	40 %	40 %	20 %	0 %	114330171
88	NC_008344	CAAAC	2	10	148303	148312	60 %	0 %	0 %	40 %	114330176
89	NC_008344	TGTAC	2	10	149434	149443	20 %	40 %	20 %	20 %	114330177
90	NC_008344	ACGCA	2	10	150391	150400	40 %	0 %	20 %	40 %	114330179
91	NC_008344	AGAAC	2	10	153302	153311	60 %	0 %	20 %	20 %	114330183
92	NC_008344	TTCTT	2	10	155285	155294	0 %	80 %	0 %	20 %	114330184
93	NC_008344	GTCAA	2	10	157153	157162	40 %	20 %	20 %	20 %	114330184
94	NC_008344	AGCTG	2	10	157617	157626	20 %	20 %	40 %	20 %	114330184
95	NC_008344	AAGTG	2	10	160542	160551	40 %	20 %	40 %	0 %	114330187
96	NC_008344	GCAAG	2	10	160884	160893	40 %	0 %	40 %	20 %	114330187
97	NC_008344	GTATT	2	10	161824	161833	20 %	60 %	20 %	0 %	114330188
98	NC_008344	CTACT	2	10	162602	162611	20 %	40 %	0 %	40 %	114330189
99	NC_008344	GATTT	2	10	163049	163058	20 %	60 %	20 %	0 %	114330190
100	NC_008344	CATTT	2	10	165147	165156	20 %	60 %	0 %	20 %	114330193
101	NC_008344	ACCTT	2	10	166456	166465	20 %	40 %	0 %	40 %	114330195
102	NC_008344	CCGGG	2	10	167896	167905	0 %	0 %	60 %	40 %	114330196
103	NC_008344	TGCGC	2	10	170133	170142	0 %	20 %	40 %	40 %	114330198
104	NC_008344	CAGCG	2	10	173286	173295	20 %	0 %	40 %	40 %	114330203
105	NC_008344	TTCAT	2	10	177644	177653	20 %	60 %	0 %	20 %	114330209
106	NC_008344	TGGTA	2	10	180306	180315	20 %	40 %	40 %	0 %	114330210
107	NC_008344	GCTTG	2	10	183133	183142	0 %	40 %	40 %	20 %	114330211
108	NC_008344	TGCCA	2	10	183404	183413	20 %	20 %	20 %	40 %	114330211
109	NC_008344	GGTTG	2	10	185465	185474	0 %	40 %	60 %	0 %	114330214
110	NC_008344	CTGAT	2	10	186730	186739	20 %	40 %	20 %	20 %	114330215
111	NC_008344	ACTGG	2	10	194288	194297	20 %	20 %	40 %	20 %	114330223
112	NC_008344	ATTGA	2	10	195715	195724	40 %	40 %	20 %	0 %	114330225
113	NC_008344	GTGAT	2	10	195947	195956	20 %	40 %	40 %	0 %	114330225
114	NC_008344	ATGCT	2	10	197369	197378	20 %	40 %	20 %	20 %	114330225
115	NC_008344	CGGCG	2	10	198457	198466	0 %	0 %	60 %	40 %	114330227
116	NC_008344	CGCAG	2	10	198709	198718	20 %	0 %	40 %	40 %	114330227
117	NC_008344	AGTCG	2	10	198784	198793	20 %	20 %	40 %	20 %	114330227
118	NC_008344	TTGCA	2	10	200612	200621	20 %	40 %	20 %	20 %	114330228
119	NC_008344	GCCAT	2	10	204898	204907	20 %	20 %	20 %	40 %	114330230
120	NC_008344	TCCTT	2	10	205664	205673	0 %	60 %	0 %	40 %	114330230
121	NC_008344	ATGTC	2	10	206669	206678	20 %	40 %	20 %	20 %	114330230
122	NC_008344	TCCTG	2	10	209437	209446	0 %	40 %	20 %	40 %	114330233
123	NC_008344	TTTTG	2	10	214888	214897	0 %	80 %	20 %	0 %	114330238
124	NC_008344	CAATC	2	10	216517	216526	40 %	20 %	0 %	40 %	114330239
125	NC_008344	AGTAA	2	10	216903	216912	60 %	20 %	20 %	0 %	114330240
126	NC_008344	GCAAT	2	10	218960	218969	40 %	20 %	20 %	20 %	114330242
127	NC_008344	GATTG	2	10	219971	219980	20 %	40 %	40 %	0 %	114330243
128	NC_008344	TATTT	2	10	222951	222960	20 %	80 %	0 %	0 %	114330246
129	NC_008344	CATTG	2	10	223177	223186	20 %	40 %	20 %	20 %	114330246
130	NC_008344	TGCAT	2	10	223197	223206	20 %	40 %	20 %	20 %	114330246
131	NC_008344	TGGGT	2	10	224069	224078	0 %	40 %	60 %	0 %	114330247
132	NC_008344	AGTTG	2	10	225593	225602	20 %	40 %	40 %	0 %	114330247
133	NC_008344	TGCGT	2	10	225647	225656	0 %	40 %	40 %	20 %	114330247
134	NC_008344	GTTGA	2	10	225924	225933	20 %	40 %	40 %	0 %	114330247
135	NC_008344	GGCTA	2	10	227198	227207	20 %	20 %	40 %	20 %	114330247
136	NC_008344	GTCCG	2	10	229529	229538	0 %	20 %	40 %	40 %	114330250
137	NC_008344	AAAAT	2	10	241600	241609	80 %	20 %	0 %	0 %	114330254
138	NC_008344	TACTG	2	10	243095	243104	20 %	40 %	20 %	20 %	114330255
139	NC_008344	TCTGA	2	10	243235	243244	20 %	40 %	20 %	20 %	114330255
140	NC_008344	CTGAT	2	10	246250	246259	20 %	40 %	20 %	20 %	114330259
141	NC_008344	AACCG	2	10	249021	249030	40 %	0 %	20 %	40 %	114330263
142	NC_008344	GGGTT	2	10	249488	249497	0 %	40 %	60 %	0 %	114330263
143	NC_008344	TTCCA	2	10	253077	253086	20 %	40 %	0 %	40 %	114330267
144	NC_008344	GCGAT	2	10	253261	253270	20 %	20 %	40 %	20 %	114330267
145	NC_008344	ACATT	2	10	253526	253535	40 %	40 %	0 %	20 %	114330267
146	NC_008344	TGATC	2	10	254117	254126	20 %	40 %	20 %	20 %	114330268
147	NC_008344	CAACT	2	10	255696	255705	40 %	20 %	0 %	40 %	114330270
148	NC_008344	CTGCT	2	10	256070	256079	0 %	40 %	20 %	40 %	114330270
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151	NC_008344	TAATT	2	10	260525	260534	40 %	60 %	0 %	0 %	114330274
152	NC_008344	GATCC	2	10	260653	260662	20 %	20 %	20 %	40 %	114330274
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155	NC_008344	CAGAA	2	10	263961	263970	60 %	0 %	20 %	20 %	114330277
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177	NC_008344	CTGAG	2	10	290926	290935	20 %	20 %	40 %	20 %	114330307
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211	NC_008344	GATCA	2	10	359097	359106	40 %	20 %	20 %	20 %	114330375
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241	NC_008344	TAATG	2	10	422960	422969	40 %	40 %	20 %	0 %	114330435
242	NC_008344	CTGCG	2	10	424126	424135	0 %	20 %	40 %	40 %	114330435
243	NC_008344	CAGAA	2	10	427592	427601	60 %	0 %	20 %	20 %	114330437
244	NC_008344	TGGTA	2	10	428229	428238	20 %	40 %	40 %	0 %	114330438
245	NC_008344	CTGGC	2	10	429822	429831	0 %	20 %	40 %	40 %	114330439
246	NC_008344	TGGAG	2	10	435942	435951	20 %	20 %	60 %	0 %	114330442
247	NC_008344	AATGG	2	10	437502	437511	40 %	20 %	40 %	0 %	114330443
248	NC_008344	AGCCC	2	10	440805	440814	20 %	0 %	20 %	60 %	114330445
249	NC_008344	ACCAG	2	10	441345	441354	40 %	0 %	20 %	40 %	114330445
250	NC_008344	CGCGC	2	10	443850	443859	0 %	0 %	40 %	60 %	114330447
251	NC_008344	TTGGC	2	10	444574	444583	0 %	40 %	40 %	20 %	114330448
252	NC_008344	GCAGC	2	10	448419	448428	20 %	0 %	40 %	40 %	114330454
253	NC_008344	TGATC	2	10	448842	448851	20 %	40 %	20 %	20 %	114330454
254	NC_008344	GTGGG	2	10	449255	449264	0 %	20 %	80 %	0 %	114330455
255	NC_008344	GATCA	2	10	449568	449577	40 %	20 %	20 %	20 %	114330455
256	NC_008344	CTGAT	2	10	454402	454411	20 %	40 %	20 %	20 %	114330461
257	NC_008344	TGAGT	2	10	458241	458250	20 %	40 %	40 %	0 %	114330467
258	NC_008344	CATGC	2	10	458648	458657	20 %	20 %	20 %	40 %	114330467
259	NC_008344	AGCAG	2	10	464015	464024	40 %	0 %	40 %	20 %	114330473
260	NC_008344	ATTCG	2	10	469440	469449	20 %	40 %	20 %	20 %	114330475
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262	NC_008344	AAAAG	2	10	469910	469919	80 %	0 %	20 %	0 %	114330476
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387	NC_008344	GCCCG	2	10	679574	679583	0 %	0 %	40 %	60 %	114330686
388	NC_008344	GGGCT	2	10	681514	681523	0 %	20 %	60 %	20 %	114330689
389	NC_008344	TTCGC	2	10	681592	681601	0 %	40 %	20 %	40 %	114330689
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