MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 44589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008344	GC	3	6	217686	217691	0 %	0 %	50 %	50 %	114330241
3502	NC_008344	GTC	2	6	217717	217722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330241
3503	NC_008344	CTG	2	6	217774	217779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330241
3504	NC_008344	GCG	2	6	217835	217840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330241
3505	NC_008344	G	6	6	217966	217971	0 %	0 %	100 %	0 %	114330241
3506	NC_008344	TGGG	2	8	217985	217992	0 %	25 %	75 %	0 %	114330241
3507	NC_008344	TGC	2	6	218052	218057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330241
3508	NC_008344	GTA	2	6	218059	218064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330241
3509	NC_008344	ATCA	2	8	218101	218108	50 %	25 %	0 %	25 %	114330241
3510	NC_008344	TTG	2	6	218297	218302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330241
3511	NC_008344	AGGG	2	8	218318	218325	25 %	0 %	75 %	0 %	114330241
3512	NC_008344	TG	3	6	218326	218331	0 %	50 %	50 %	0 %	114330241
3513	NC_008344	CGAC	2	8	218341	218348	25 %	0 %	25 %	50 %	114330241
3514	NC_008344	CA	4	8	218349	218356	50 %	0 %	0 %	50 %	114330241
3515	NC_008344	TGC	2	6	218384	218389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330241
3516	NC_008344	TG	3	6	218395	218400	0 %	50 %	50 %	0 %	114330241
3517	NC_008344	AAC	2	6	218446	218451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330241
3518	NC_008344	TGA	2	6	218519	218524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330241
3519	NC_008344	CAT	2	6	218861	218866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330242
3520	NC_008344	CAG	2	6	218895	218900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330242
3521	NC_008344	T	6	6	218944	218949	0 %	100 %	0 %	0 %	114330242
3522	NC_008344	GCAAT	2	10	218960	218969	40 %	20 %	20 %	20 %	114330242
3523	NC_008344	ATCT	2	8	219005	219012	25 %	50 %	0 %	25 %	114330242
3524	NC_008344	ATC	2	6	219090	219095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330242
3525	NC_008344	CTA	3	9	219104	219112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330242
3526	NC_008344	ATA	2	6	219196	219201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330242
3527	NC_008344	TTG	2	6	219610	219615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330243
3528	NC_008344	AACA	2	8	219722	219729	75 %	0 %	0 %	25 %	114330243
3529	NC_008344	TGC	2	6	219794	219799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330243
3530	NC_008344	TTG	2	6	219857	219862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330243
3531	NC_008344	CCA	2	6	219929	219934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330243
3532	NC_008344	GATTG	2	10	219971	219980	20 %	40 %	40 %	0 %	114330243
3533	NC_008344	GAA	2	6	220022	220027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330243
3534	NC_008344	AAC	2	6	220044	220049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330243
3535	NC_008344	ACCC	2	8	220244	220251	25 %	0 %	0 %	75 %	114330243
3536	NC_008344	CAA	2	6	220256	220261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330243
3537	NC_008344	ACA	2	6	220275	220280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330243
3538	NC_008344	AAC	2	6	220302	220307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330243
3539	NC_008344	GCA	2	6	220483	220488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330243
3540	NC_008344	ATC	2	6	220497	220502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330243
3541	NC_008344	GGA	2	6	220505	220510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330243
3542	NC_008344	GGAA	2	8	220553	220560	50 %	0 %	50 %	0 %	114330243
3543	NC_008344	T	8	8	220576	220583	0 %	100 %	0 %	0 %	114330243
3544	NC_008344	ATG	2	6	220587	220592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330243
3545	NC_008344	GCT	2	6	220628	220633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330244
3546	NC_008344	C	6	6	220637	220642	0 %	0 %	0 %	100 %	114330244
3547	NC_008344	CAG	2	6	220644	220649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330244
3548	NC_008344	TGCC	2	8	220676	220683	0 %	25 %	25 %	50 %	114330244
3549	NC_008344	A	7	7	220863	220869	100 %	0 %	0 %	0 %	114330244
3550	NC_008344	TCC	2	6	220921	220926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330244
3551	NC_008344	TGG	2	6	221060	221065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330244
3552	NC_008344	CCA	2	6	221066	221071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330244
3553	NC_008344	GAT	2	6	221082	221087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330244
3554	NC_008344	T	6	6	221097	221102	0 %	100 %	0 %	0 %	114330244
3555	NC_008344	GCG	2	6	221110	221115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330244
3556	NC_008344	GAAT	2	8	221117	221124	50 %	25 %	25 %	0 %	114330244
3557	NC_008344	GAG	2	6	221127	221132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330244
3558	NC_008344	GAA	2	6	221181	221186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330244
3559	NC_008344	TTC	2	6	221485	221490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330245
3560	NC_008344	TTC	2	6	221503	221508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330245
3561	NC_008344	CCA	2	6	221672	221677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330245
3562	NC_008344	GTC	2	6	221746	221751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330245
3563	NC_008344	CTT	2	6	221814	221819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330245
3564	NC_008344	CCGTGT	2	12	221846	221857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330245
3565	NC_008344	GTG	2	6	222833	222838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330246
3566	NC_008344	AGC	2	6	222857	222862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330246
3567	NC_008344	TATTT	2	10	222951	222960	20 %	80 %	0 %	0 %	114330246
3568	NC_008344	CG	4	8	222999	223006	0 %	0 %	50 %	50 %	114330246
3569	NC_008344	TTG	2	6	223075	223080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330246
3570	NC_008344	TGA	2	6	223086	223091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330246
3571	NC_008344	TGCTGG	2	12	223097	223108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114330246
3572	NC_008344	CATTG	2	10	223177	223186	20 %	40 %	20 %	20 %	114330246
3573	NC_008344	TGCAT	2	10	223197	223206	20 %	40 %	20 %	20 %	114330246
3574	NC_008344	TCA	2	6	223238	223243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330246
3575	NC_008344	TG	3	6	223261	223266	0 %	50 %	50 %	0 %	114330246
3576	NC_008344	T	6	6	223284	223289	0 %	100 %	0 %	0 %	114330246
3577	NC_008344	GAA	2	6	223321	223326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330246
3578	NC_008344	GTA	2	6	223352	223357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330246
3579	NC_008344	TGCT	2	8	223370	223377	0 %	50 %	25 %	25 %	114330246
3580	NC_008344	CTG	2	6	223387	223392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330246
3581	NC_008344	CGAT	2	8	223493	223500	25 %	25 %	25 %	25 %	114330246
3582	NC_008344	TGA	2	6	223615	223620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330247
3583	NC_008344	CTCA	2	8	223632	223639	25 %	25 %	0 %	50 %	114330247
3584	NC_008344	TGG	2	6	223663	223668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330247
3585	NC_008344	TGC	2	6	223702	223707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3586	NC_008344	CAG	2	6	223743	223748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3587	NC_008344	TCG	2	6	223752	223757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3588	NC_008344	A	6	6	223767	223772	100 %	0 %	0 %	0 %	114330247
3589	NC_008344	GATT	2	8	223781	223788	25 %	50 %	25 %	0 %	114330247
3590	NC_008344	ACG	2	6	223839	223844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3591	NC_008344	CTA	2	6	223964	223969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330247
3592	NC_008344	TCT	2	6	223986	223991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330247
3593	NC_008344	T	6	6	224005	224010	0 %	100 %	0 %	0 %	114330247
3594	NC_008344	CCA	2	6	224035	224040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330247
3595	NC_008344	TTA	2	6	224043	224048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330247
3596	NC_008344	TGGGT	2	10	224069	224078	0 %	40 %	60 %	0 %	114330247
3597	NC_008344	CAA	2	6	224088	224093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330247
3598	NC_008344	ATCT	2	8	224116	224123	25 %	50 %	0 %	25 %	114330247
3599	NC_008344	GCG	2	6	224160	224165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330247
3600	NC_008344	ATTG	2	8	224183	224190	25 %	50 %	25 %	0 %	114330247
3601	NC_008344	TGC	2	6	224354	224359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3602	NC_008344	TGAG	2	8	224380	224387	25 %	25 %	50 %	0 %	114330247
3603	NC_008344	TTGC	2	8	224391	224398	0 %	50 %	25 %	25 %	114330247
3604	NC_008344	GGA	3	9	224433	224441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330247
3605	NC_008344	GCC	2	6	224475	224480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330247
3606	NC_008344	CAT	2	6	224564	224569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330247
3607	NC_008344	TGG	2	6	224575	224580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330247
3608	NC_008344	CGG	2	6	224631	224636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330247
3609	NC_008344	AATG	2	8	224661	224668	50 %	25 %	25 %	0 %	114330247
3610	NC_008344	CAT	2	6	224700	224705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330247
3611	NC_008344	ATG	2	6	224757	224762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330247
3612	NC_008344	TGG	2	6	224890	224895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330247
3613	NC_008344	TG	3	6	224898	224903	0 %	50 %	50 %	0 %	114330247
3614	NC_008344	GAT	2	6	224913	224918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330247
3615	NC_008344	GCCAGA	2	12	225011	225022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3616	NC_008344	GCAT	2	8	225028	225035	25 %	25 %	25 %	25 %	114330247
3617	NC_008344	GCC	2	6	225324	225329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330247
3618	NC_008344	AG	3	6	225412	225417	50 %	0 %	50 %	0 %	114330247
3619	NC_008344	GTG	2	6	225543	225548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330247
3620	NC_008344	AGTTG	2	10	225593	225602	20 %	40 %	40 %	0 %	114330247
3621	NC_008344	TGCGT	2	10	225647	225656	0 %	40 %	40 %	20 %	114330247
3622	NC_008344	CGG	2	6	225748	225753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330247
3623	NC_008344	AGG	2	6	225754	225759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330247
3624	NC_008344	TGT	2	6	225770	225775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330247
3625	NC_008344	GAT	2	6	225816	225821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330247
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3635	NC_008344	AGG	2	6	226030	226035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330247
3636	NC_008344	TG	3	6	226065	226070	0 %	50 %	50 %	0 %	114330247
3637	NC_008344	GT	3	6	226142	226147	0 %	50 %	50 %	0 %	114330247
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3647	NC_008344	GTA	2	6	226458	226463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330247
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3651	NC_008344	GTC	2	6	226602	226607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330247
3652	NC_008344	ACTG	2	8	226658	226665	25 %	25 %	25 %	25 %	114330247
3653	NC_008344	ATGG	2	8	226683	226690	25 %	25 %	50 %	0 %	114330247
3654	NC_008344	A	6	6	226720	226725	100 %	0 %	0 %	0 %	114330247
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3724	NC_008344	AGC	2	6	229874	229879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330251
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3732	NC_008344	GCA	2	6	230321	230326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330251
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3740	NC_008344	AGC	2	6	230708	230713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330251
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3744	NC_008344	TGGA	2	8	230968	230975	25 %	25 %	50 %	0 %	114330251
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3854	NC_008344	ATGTTG	2	12	244560	244571	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114330257
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3860	NC_008344	AAAG	2	8	244906	244913	75 %	0 %	25 %	0 %	114330258
3861	NC_008344	GCT	2	6	244930	244935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330258
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3869	NC_008344	CTG	2	6	245585	245590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330259
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3973	NC_008344	A	6	6	251564	251569	100 %	0 %	0 %	0 %	114330265
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3983	NC_008344	TGCT	2	8	252432	252439	0 %	50 %	25 %	25 %	114330267
3984	NC_008344	CAG	2	6	252452	252457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330267
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3986	NC_008344	TGA	2	6	252502	252507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330267
3987	NC_008344	TCA	2	6	252520	252525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330267
3988	NC_008344	GAT	2	6	252543	252548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330267
3989	NC_008344	TTG	2	6	252567	252572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330267
3990	NC_008344	CAA	2	6	252647	252652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330267
3991	NC_008344	TTC	2	6	252777	252782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330267
3992	NC_008344	ACC	2	6	252834	252839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330267
3993	NC_008344	CAT	2	6	252855	252860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330267
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3995	NC_008344	CAT	2	6	252968	252973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330267
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3997	NC_008344	TCA	2	6	253022	253027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330267
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3999	NC_008344	TTCCA	2	10	253077	253086	20 %	40 %	0 %	40 %	114330267
4000	NC_008344	TGC	2	6	253092	253097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330267

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