MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 44589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008344	CTG	2	6	100855	100860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1502	NC_008344	CATC	2	8	100880	100887	25 %	25 %	0 %	50 %	114330135
1503	NC_008344	CGG	2	6	100914	100919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330135
1504	NC_008344	C	6	6	100927	100932	0 %	0 %	0 %	100 %	114330135
1505	NC_008344	TGC	2	6	101030	101035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1506	NC_008344	GGCC	2	8	101052	101059	0 %	0 %	50 %	50 %	114330135
1507	NC_008344	TGC	2	6	101129	101134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1508	NC_008344	GCT	3	9	101136	101144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1509	NC_008344	GCC	2	6	101217	101222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330135
1510	NC_008344	TCA	2	6	101323	101328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330135
1511	NC_008344	CG	3	6	101427	101432	0 %	0 %	50 %	50 %	114330135
1512	NC_008344	CTC	2	6	101471	101476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330135
1513	NC_008344	CATC	2	8	101480	101487	25 %	25 %	0 %	50 %	114330135
1514	NC_008344	TGA	2	6	101492	101497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330135
1515	NC_008344	TCA	2	6	101552	101557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330135
1516	NC_008344	CTG	2	6	101612	101617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1517	NC_008344	ACG	2	6	101691	101696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1518	NC_008344	TTC	2	6	101700	101705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330135
1519	NC_008344	ATTG	2	8	101724	101731	25 %	50 %	25 %	0 %	114330135
1520	NC_008344	AAT	2	6	101856	101861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330135
1521	NC_008344	CTC	2	6	101883	101888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330135
1522	NC_008344	TGA	2	6	101909	101914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330135
1523	NC_008344	GGGC	2	8	102006	102013	0 %	0 %	75 %	25 %	114330135
1524	NC_008344	GCG	2	6	102027	102032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330135
1525	NC_008344	TGA	2	6	102104	102109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330135
1526	NC_008344	CAG	2	6	102270	102275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1527	NC_008344	TCG	2	6	102277	102282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1528	NC_008344	CTC	2	6	102288	102293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330135
1529	NC_008344	CTGC	2	8	102338	102345	0 %	25 %	25 %	50 %	114330135
1530	NC_008344	TCG	2	6	102346	102351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330135
1531	NC_008344	AGC	2	6	102521	102526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330136
1532	NC_008344	CGA	2	6	102651	102656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330136
1533	NC_008344	CGC	2	6	102669	102674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330136
1534	NC_008344	GGC	2	6	102681	102686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330136
1535	NC_008344	CGGTGG	2	12	103041	103052	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114330137
1536	NC_008344	CGC	2	6	103129	103134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330137
1537	NC_008344	TTG	2	6	103189	103194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330137
1538	NC_008344	GCG	2	6	103196	103201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330137
1539	NC_008344	AGG	2	6	103345	103350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330137
1540	NC_008344	AGC	2	6	103388	103393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330137
1541	NC_008344	GAT	2	6	103561	103566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330137
1542	NC_008344	AC	3	6	103575	103580	50 %	0 %	0 %	50 %	114330137
1543	NC_008344	TCT	2	6	103605	103610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330137
1544	NC_008344	AAC	2	6	103616	103621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330137
1545	NC_008344	CGG	2	6	103693	103698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330137
1546	NC_008344	CAG	2	6	103708	103713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330137
1547	NC_008344	CGG	2	6	103778	103783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330137
1548	NC_008344	GTTC	2	8	103937	103944	0 %	50 %	25 %	25 %	114330137
1549	NC_008344	TCG	2	6	103955	103960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330137
1550	NC_008344	CGAG	2	8	103991	103998	25 %	0 %	50 %	25 %	114330137
1551	NC_008344	GCG	2	6	104135	104140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330138
1552	NC_008344	AGC	2	6	104278	104283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330138
1553	NC_008344	GCA	2	6	104381	104386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330138
1554	NC_008344	GTCG	2	8	104429	104436	0 %	25 %	50 %	25 %	114330138
1555	NC_008344	AAC	2	6	104437	104442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330138
1556	NC_008344	GCG	2	6	104472	104477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330138
1557	NC_008344	CCGA	2	8	104518	104525	25 %	0 %	25 %	50 %	114330138
1558	NC_008344	TGA	2	6	104552	104557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330138
1559	NC_008344	GCGA	2	8	104601	104608	25 %	0 %	50 %	25 %	114330138
1560	NC_008344	GA	3	6	104644	104649	50 %	0 %	50 %	0 %	114330138
1561	NC_008344	CACG	2	8	104676	104683	25 %	0 %	25 %	50 %	114330138
1562	NC_008344	TCG	2	6	104707	104712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330138
1563	NC_008344	GAT	2	6	104740	104745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330138
1564	NC_008344	GTA	2	6	105056	105061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330139
1565	NC_008344	AAG	2	6	105108	105113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330139
1566	NC_008344	GTC	2	6	105137	105142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330139
1567	NC_008344	CGGC	2	8	105151	105158	0 %	0 %	50 %	50 %	114330139
1568	NC_008344	CGA	2	6	105163	105168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330139
1569	NC_008344	AAG	2	6	105171	105176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330139
1570	NC_008344	AGT	2	6	105244	105249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330139
1571	NC_008344	TAG	2	6	105365	105370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330140
1572	NC_008344	CCGG	2	8	105383	105390	0 %	0 %	50 %	50 %	114330140
1573	NC_008344	CAA	2	6	105392	105397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330140
1574	NC_008344	GT	3	6	105412	105417	0 %	50 %	50 %	0 %	114330140
1575	NC_008344	GCA	2	6	105431	105436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330140
1576	NC_008344	GC	3	6	105509	105514	0 %	0 %	50 %	50 %	114330140
1577	NC_008344	GTA	2	6	105571	105576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330140
1578	NC_008344	AG	3	6	105583	105588	50 %	0 %	50 %	0 %	114330140
1579	NC_008344	TCG	2	6	105608	105613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330140
1580	NC_008344	GCG	2	6	105617	105622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330140
1581	NC_008344	GGCT	2	8	105640	105647	0 %	25 %	50 %	25 %	114330140
1582	NC_008344	GCAA	2	8	105694	105701	50 %	0 %	25 %	25 %	114330140
1583	NC_008344	ATG	2	6	105710	105715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330140
1584	NC_008344	GGCG	2	8	105882	105889	0 %	0 %	75 %	25 %	114330141
1585	NC_008344	GC	3	6	105894	105899	0 %	0 %	50 %	50 %	114330141
1586	NC_008344	GCG	2	6	105907	105912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330141
1587	NC_008344	TCC	2	6	105941	105946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330141
1588	NC_008344	TCG	2	6	105977	105982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330141
1589	NC_008344	GCC	2	6	105991	105996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330141
1590	NC_008344	GGC	2	6	106000	106005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330141
1591	NC_008344	GAC	2	6	106006	106011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330141
1592	NC_008344	TTGC	2	8	106080	106087	0 %	50 %	25 %	25 %	114330141
1593	NC_008344	GCG	2	6	106160	106165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330141
1594	NC_008344	TCG	2	6	106178	106183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330141
1595	NC_008344	AGG	2	6	106224	106229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330141
1596	NC_008344	CGT	2	6	106302	106307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330141
1597	NC_008344	CGAC	2	8	106376	106383	25 %	0 %	25 %	50 %	114330141
1598	NC_008344	ACG	2	6	106436	106441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330141
1599	NC_008344	GTA	2	6	106469	106474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330141
1600	NC_008344	TCAGA	2	10	106582	106591	40 %	20 %	20 %	20 %	114330142
1601	NC_008344	TCG	2	6	106612	106617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1602	NC_008344	GCT	3	9	106625	106633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1603	NC_008344	TGAG	2	8	106645	106652	25 %	25 %	50 %	0 %	114330142
1604	NC_008344	GTC	2	6	106668	106673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1605	NC_008344	GCC	2	6	106702	106707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330142
1606	NC_008344	CTG	2	6	106752	106757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1607	NC_008344	GCT	2	6	106810	106815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1608	NC_008344	CGA	2	6	106952	106957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1609	NC_008344	T	6	6	107038	107043	0 %	100 %	0 %	0 %	114330142
1610	NC_008344	CCT	2	6	107051	107056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330142
1611	NC_008344	ATCA	2	8	107127	107134	50 %	25 %	0 %	25 %	114330142
1612	NC_008344	AGT	2	6	107146	107151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330142
1613	NC_008344	GGCT	2	8	107169	107176	0 %	25 %	50 %	25 %	114330142
1614	NC_008344	CGC	2	6	107189	107194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330142
1615	NC_008344	TCA	2	6	107263	107268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330142
1616	NC_008344	GCA	2	6	107333	107338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1617	NC_008344	ACCA	2	8	107355	107362	50 %	0 %	0 %	50 %	114330142
1618	NC_008344	GCG	2	6	107365	107370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330142
1619	NC_008344	ACG	2	6	107397	107402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330142
1620	NC_008344	GAA	2	6	107485	107490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330142
1621	NC_008344	GGTT	2	8	107860	107867	0 %	50 %	50 %	0 %	114330143
1622	NC_008344	AGA	2	6	107875	107880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330143
1623	NC_008344	TGC	2	6	107892	107897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330143
1624	NC_008344	TCA	2	6	107945	107950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330143
1625	NC_008344	GTC	2	6	107992	107997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330143
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1630	NC_008344	GAT	2	6	108130	108135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330143
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1634	NC_008344	ACG	3	9	108394	108402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330143
1635	NC_008344	TTCG	2	8	108479	108486	0 %	50 %	25 %	25 %	114330143
1636	NC_008344	TTG	2	6	108655	108660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330143
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1641	NC_008344	CAG	2	6	109138	109143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330144
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1653	NC_008344	GC	3	6	109984	109989	0 %	0 %	50 %	50 %	114330145
1654	NC_008344	GGTC	2	8	110008	110015	0 %	25 %	50 %	25 %	114330145
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1662	NC_008344	CGT	2	6	110315	110320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330145
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1720	NC_008344	GC	3	6	114277	114282	0 %	0 %	50 %	50 %	114330147
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1723	NC_008344	CAA	2	6	114411	114416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330147
1724	NC_008344	GAC	2	6	114496	114501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330147
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1730	NC_008344	TCG	2	6	115178	115183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330148
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1733	NC_008344	TCG	2	6	115364	115369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330148
1734	NC_008344	GCCGA	2	10	115400	115409	20 %	0 %	40 %	40 %	114330148
1735	NC_008344	A	7	7	115423	115429	100 %	0 %	0 %	0 %	114330148
1736	NC_008344	GTCT	2	8	115507	115514	0 %	50 %	25 %	25 %	114330149
1737	NC_008344	GCA	2	6	115602	115607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330149
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1741	NC_008344	ATC	2	6	115894	115899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330149
1742	NC_008344	GAC	2	6	115995	116000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330149
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1862	NC_008344	ATG	2	6	121546	121551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330155
1863	NC_008344	CG	3	6	121669	121674	0 %	0 %	50 %	50 %	114330156
1864	NC_008344	TCA	2	6	121713	121718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330156
1865	NC_008344	CGC	2	6	121769	121774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330156
1866	NC_008344	GCG	2	6	121780	121785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330156
1867	NC_008344	GTTC	2	8	121991	121998	0 %	50 %	25 %	25 %	114330157
1868	NC_008344	CCG	2	6	122117	122122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330157
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1870	NC_008344	AG	3	6	122155	122160	50 %	0 %	50 %	0 %	114330157
1871	NC_008344	ATT	2	6	122170	122175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330157
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1875	NC_008344	CTG	2	6	122215	122220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330157
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1878	NC_008344	TGA	2	6	122313	122318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330157
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1881	NC_008344	CGT	2	6	122499	122504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330157
1882	NC_008344	CATA	2	8	122515	122522	50 %	25 %	0 %	25 %	114330157
1883	NC_008344	GTTC	2	8	122529	122536	0 %	50 %	25 %	25 %	114330157
1884	NC_008344	CGG	2	6	122572	122577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330157
1885	NC_008344	CAGA	2	8	122586	122593	50 %	0 %	25 %	25 %	114330157
1886	NC_008344	AGTCC	2	10	122615	122624	20 %	20 %	20 %	40 %	114330157
1887	NC_008344	G	6	6	122668	122673	0 %	0 %	100 %	0 %	114330157
1888	NC_008344	CATG	2	8	122679	122686	25 %	25 %	25 %	25 %	114330157
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1895	NC_008344	T	8	8	124261	124268	0 %	100 %	0 %	0 %	114330159
1896	NC_008344	TGC	2	6	124273	124278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330159
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1899	NC_008344	TTG	2	6	124387	124392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330159
1900	NC_008344	TGC	2	6	124433	124438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330159
1901	NC_008344	T	6	6	124457	124462	0 %	100 %	0 %	0 %	114330159
1902	NC_008344	GCA	2	6	124512	124517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330159
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1971	NC_008344	A	7	7	127897	127903	100 %	0 %	0 %	0 %	114330160
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1974	NC_008344	A	6	6	128214	128219	100 %	0 %	0 %	0 %	114330161
1975	NC_008344	GAT	2	6	128283	128288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330161
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1978	NC_008344	GAAA	2	8	128413	128420	75 %	0 %	25 %	0 %	114330161
1979	NC_008344	TGC	2	6	128503	128508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330161
1980	NC_008344	A	7	7	128551	128557	100 %	0 %	0 %	0 %	114330161
1981	NC_008344	GATCA	2	10	128679	128688	40 %	20 %	20 %	20 %	114330161
1982	NC_008344	TCC	2	6	128745	128750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330161
1983	NC_008344	CAG	2	6	128760	128765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330161
1984	NC_008344	CGA	2	6	128786	128791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330161
1985	NC_008344	AGCC	2	8	128807	128814	25 %	0 %	25 %	50 %	114330161
1986	NC_008344	ATC	2	6	128839	128844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330161
1987	NC_008344	TTC	2	6	129048	129053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330161
1988	NC_008344	ATACC	2	10	129054	129063	40 %	20 %	0 %	40 %	114330161
1989	NC_008344	GCA	2	6	129094	129099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330161
1990	NC_008344	TGG	2	6	129104	129109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330161
1991	NC_008344	ATC	2	6	129154	129159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330161
1992	NC_008344	CAA	2	6	129174	129179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330161
1993	NC_008344	AGC	2	6	129190	129195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330161
1994	NC_008344	CCA	2	6	129248	129253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330161
1995	NC_008344	GCT	2	6	129280	129285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330161
1996	NC_008344	TGG	2	6	129332	129337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330161
1997	NC_008344	A	6	6	129372	129377	100 %	0 %	0 %	0 %	114330161
1998	NC_008344	AGT	2	6	129422	129427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330162
1999	NC_008344	A	6	6	129511	129516	100 %	0 %	0 %	0 %	114330162
2000	NC_008344	CAT	2	6	129525	129530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330162

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