MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	GGCG	2	8	800	807	0 %	0 %	75 %	25 %	114326613
2	NC_008342	CCTA	2	8	1138	1145	25 %	25 %	0 %	50 %	114326613
3	NC_008342	AGAC	2	8	1660	1667	50 %	0 %	25 %	25 %	114326613
4	NC_008342	CACG	2	8	1920	1927	25 %	0 %	25 %	50 %	114326613
5	NC_008342	CCGA	2	8	2038	2045	25 %	0 %	25 %	50 %	114326613
6	NC_008342	CCAG	2	8	2726	2733	25 %	0 %	25 %	50 %	114326613
7	NC_008342	GCTG	2	8	2834	2841	0 %	25 %	50 %	25 %	114326613
8	NC_008342	GAGT	2	8	3927	3934	25 %	25 %	50 %	0 %	114326614
9	NC_008342	GGGC	2	8	4570	4577	0 %	0 %	75 %	25 %	114326615
10	NC_008342	ATAC	2	8	4831	4838	50 %	25 %	0 %	25 %	114326615
11	NC_008342	CCGC	2	8	4934	4941	0 %	0 %	25 %	75 %	114326615
12	NC_008342	CCAA	2	8	5103	5110	50 %	0 %	0 %	50 %	114326615
13	NC_008342	CAAC	2	8	5432	5439	50 %	0 %	0 %	50 %	114326616
14	NC_008342	CAGT	2	8	5809	5816	25 %	25 %	25 %	25 %	114326617
15	NC_008342	AAGA	2	8	6526	6533	75 %	0 %	25 %	0 %	114326617
16	NC_008342	GCTT	2	8	6975	6982	0 %	50 %	25 %	25 %	114326618
17	NC_008342	TCAC	2	8	7038	7045	25 %	25 %	0 %	50 %	114326618
18	NC_008342	ATCC	2	8	7392	7399	25 %	25 %	0 %	50 %	114326618
19	NC_008342	TACA	2	8	7476	7483	50 %	25 %	0 %	25 %	114326618
20	NC_008342	AGAA	2	8	9531	9538	75 %	0 %	25 %	0 %	114326621
21	NC_008342	GAAA	2	8	11651	11658	75 %	0 %	25 %	0 %	114326624
22	NC_008342	GAGG	2	8	11833	11840	25 %	0 %	75 %	0 %	114326624
23	NC_008342	TTGA	2	8	11966	11973	25 %	50 %	25 %	0 %	114326624
24	NC_008342	CGCA	2	8	13048	13055	25 %	0 %	25 %	50 %	114326625
25	NC_008342	CGCT	2	8	13428	13435	0 %	25 %	25 %	50 %	114326625
26	NC_008342	TAAC	2	8	13471	13478	50 %	25 %	0 %	25 %	114326625
27	NC_008342	CCAT	2	8	14593	14600	25 %	25 %	0 %	50 %	114326626
28	NC_008342	TTCC	2	8	15836	15843	0 %	50 %	0 %	50 %	114326626
29	NC_008342	CTTC	2	8	15962	15969	0 %	50 %	0 %	50 %	114326626
30	NC_008342	TGGT	2	8	16225	16232	0 %	50 %	50 %	0 %	114326626
31	NC_008342	GCGA	2	8	16412	16419	25 %	0 %	50 %	25 %	114326626
32	NC_008342	TGCC	2	8	16439	16446	0 %	25 %	25 %	50 %	114326626
33	NC_008342	CCGC	2	8	17502	17509	0 %	0 %	25 %	75 %	114326627
34	NC_008342	CGGT	2	8	17554	17561	0 %	25 %	50 %	25 %	114326627
35	NC_008342	CCGA	2	8	17923	17930	25 %	0 %	25 %	50 %	114326627
36	NC_008342	GATT	2	8	18088	18095	25 %	50 %	25 %	0 %	114326627
37	NC_008342	CTGC	2	8	18420	18427	0 %	25 %	25 %	50 %	114326627
38	NC_008342	CAAG	2	8	18573	18580	50 %	0 %	25 %	25 %	114326627
39	NC_008342	GCCA	2	8	18897	18904	25 %	0 %	25 %	50 %	114326627
40	NC_008342	CTTC	2	8	18924	18931	0 %	50 %	0 %	50 %	114326627
41	NC_008342	GAAG	2	8	20288	20295	50 %	0 %	50 %	0 %	114326628
42	NC_008342	CGCC	2	8	21239	21246	0 %	0 %	25 %	75 %	114326628
43	NC_008342	GGTG	2	8	21305	21312	0 %	25 %	75 %	0 %	114326628
44	NC_008342	GCAG	2	8	21704	21711	25 %	0 %	50 %	25 %	114326628
45	NC_008342	CGGC	2	8	22574	22581	0 %	0 %	50 %	50 %	114326629
46	NC_008342	CGAC	2	8	22864	22871	25 %	0 %	25 %	50 %	114326629
47	NC_008342	TGGT	2	8	23304	23311	0 %	50 %	50 %	0 %	114326630
48	NC_008342	ACAT	2	8	23518	23525	50 %	25 %	0 %	25 %	114326630
49	NC_008342	CGTG	2	8	23901	23908	0 %	25 %	50 %	25 %	114326630
50	NC_008342	GCCG	2	8	23919	23926	0 %	0 %	50 %	50 %	114326630
51	NC_008342	AGAT	2	8	24007	24014	50 %	25 %	25 %	0 %	114326630
52	NC_008342	TCGA	2	8	24315	24322	25 %	25 %	25 %	25 %	114326630
53	NC_008342	CGCC	2	8	24432	24439	0 %	0 %	25 %	75 %	114326630
54	NC_008342	CTTG	2	8	24458	24465	0 %	50 %	25 %	25 %	114326630
55	NC_008342	GGTT	2	8	24930	24937	0 %	50 %	50 %	0 %	114326631
56	NC_008342	CGCT	2	8	25176	25183	0 %	25 %	25 %	50 %	114326631
57	NC_008342	CAGC	2	8	25205	25212	25 %	0 %	25 %	50 %	114326631
58	NC_008342	TGCT	2	8	25222	25229	0 %	50 %	25 %	25 %	114326631
59	NC_008342	CCAA	2	8	26198	26205	50 %	0 %	0 %	50 %	114326633
60	NC_008342	TGCA	2	8	26252	26259	25 %	25 %	25 %	25 %	114326633
61	NC_008342	TAAT	2	8	26412	26419	50 %	50 %	0 %	0 %	114326633
62	NC_008342	ACCT	2	8	26506	26513	25 %	25 %	0 %	50 %	114326633
63	NC_008342	GTAA	2	8	26514	26521	50 %	25 %	25 %	0 %	114326633
64	NC_008342	GGAA	2	8	27727	27734	50 %	0 %	50 %	0 %	114326634
65	NC_008342	CCGT	2	8	27741	27748	0 %	25 %	25 %	50 %	114326634
66	NC_008342	AATC	2	8	28022	28029	50 %	25 %	0 %	25 %	114326635
67	NC_008342	CTGC	2	8	28971	28978	0 %	25 %	25 %	50 %	114326636
68	NC_008342	TTCT	2	8	29437	29444	0 %	75 %	0 %	25 %	114326636
69	NC_008342	GATT	2	8	29632	29639	25 %	50 %	25 %	0 %	114326636
70	NC_008342	GAAA	2	8	29848	29855	75 %	0 %	25 %	0 %	114326636
71	NC_008342	GCGT	2	8	30515	30522	0 %	25 %	50 %	25 %	114326638
72	NC_008342	GGCT	2	8	31242	31249	0 %	25 %	50 %	25 %	114326639
73	NC_008342	CAGG	2	8	31570	31577	25 %	0 %	50 %	25 %	114326640
74	NC_008342	GGCG	2	8	32505	32512	0 %	0 %	75 %	25 %	114326640
75	NC_008342	GATT	2	8	33952	33959	25 %	50 %	25 %	0 %	114326642
76	NC_008342	CACC	2	8	34018	34025	25 %	0 %	0 %	75 %	114326642
77	NC_008342	CAAG	2	8	34617	34624	50 %	0 %	25 %	25 %	114326642
78	NC_008342	GCAT	2	8	35037	35044	25 %	25 %	25 %	25 %	114326642
79	NC_008342	AGCA	2	8	35119	35126	50 %	0 %	25 %	25 %	114326642
80	NC_008342	GCGG	2	8	36384	36391	0 %	0 %	75 %	25 %	114326643
81	NC_008342	TTTG	2	8	37153	37160	0 %	75 %	25 %	0 %	114326644
82	NC_008342	GTAT	2	8	37376	37383	25 %	50 %	25 %	0 %	114326644
83	NC_008342	TTTC	2	8	37518	37525	0 %	75 %	0 %	25 %	114326644
84	NC_008342	CCTA	2	8	37690	37697	25 %	25 %	0 %	50 %	114326644
85	NC_008342	AATC	2	8	38071	38078	50 %	25 %	0 %	25 %	114326644
86	NC_008342	TGCT	2	8	38386	38393	0 %	50 %	25 %	25 %	114326645
87	NC_008342	CCAT	2	8	38821	38828	25 %	25 %	0 %	50 %	114326646
88	NC_008342	TTAA	2	8	39727	39734	50 %	50 %	0 %	0 %	114326647
89	NC_008342	GCGG	2	8	40738	40745	0 %	0 %	75 %	25 %	114326648
90	NC_008342	CAGC	2	8	40983	40990	25 %	0 %	25 %	50 %	114326648
91	NC_008342	CATC	2	8	42518	42525	25 %	25 %	0 %	50 %	114326650
92	NC_008342	AAGC	2	8	42528	42535	50 %	0 %	25 %	25 %	114326650
93	NC_008342	AACC	2	8	43644	43651	50 %	0 %	0 %	50 %	114326650
94	NC_008342	TCTG	2	8	44041	44048	0 %	50 %	25 %	25 %	114326651
95	NC_008342	TGAT	2	8	44615	44622	25 %	50 %	25 %	0 %	114326651
96	NC_008342	CCCG	2	8	45010	45017	0 %	0 %	25 %	75 %	114326652
97	NC_008342	CCGT	2	8	45176	45183	0 %	25 %	25 %	50 %	114326652
98	NC_008342	TGAT	2	8	45763	45770	25 %	50 %	25 %	0 %	114326652
99	NC_008342	TTAG	2	8	46135	46142	25 %	50 %	25 %	0 %	114326653
100	NC_008342	TGCT	2	8	46429	46436	0 %	50 %	25 %	25 %	114326653
101	NC_008342	ACGA	2	8	46605	46612	50 %	0 %	25 %	25 %	114326653
102	NC_008342	ATTT	2	8	47797	47804	25 %	75 %	0 %	0 %	114326655
103	NC_008342	CCGC	2	8	48139	48146	0 %	0 %	25 %	75 %	114326655
104	NC_008342	GATT	2	8	48610	48617	25 %	50 %	25 %	0 %	114326655
105	NC_008342	GTTC	2	8	49431	49438	0 %	50 %	25 %	25 %	114326657
106	NC_008342	AGCG	2	8	49644	49651	25 %	0 %	50 %	25 %	114326657
107	NC_008342	TTGC	2	8	49694	49701	0 %	50 %	25 %	25 %	114326657
108	NC_008342	AGAA	2	8	50112	50119	75 %	0 %	25 %	0 %	114326658
109	NC_008342	AATG	2	8	50298	50305	50 %	25 %	25 %	0 %	114326658
110	NC_008342	TGTT	2	8	50310	50317	0 %	75 %	25 %	0 %	114326658
111	NC_008342	GACA	2	8	50442	50449	50 %	0 %	25 %	25 %	114326658
112	NC_008342	CGAC	2	8	50756	50763	25 %	0 %	25 %	50 %	114326658
113	NC_008342	AATC	2	8	51467	51474	50 %	25 %	0 %	25 %	114326658
114	NC_008342	ACGA	2	8	52634	52641	50 %	0 %	25 %	25 %	114326659
115	NC_008342	GTTA	2	8	53190	53197	25 %	50 %	25 %	0 %	114326661
116	NC_008342	GTTT	2	8	53310	53317	0 %	75 %	25 %	0 %	114326661
117	NC_008342	GCCT	2	8	53469	53476	0 %	25 %	25 %	50 %	114326661
118	NC_008342	TTTA	2	8	53514	53521	25 %	75 %	0 %	0 %	114326661
119	NC_008342	TTGG	2	8	53600	53607	0 %	50 %	50 %	0 %	114326661
120	NC_008342	ATCA	2	8	53721	53728	50 %	25 %	0 %	25 %	114326661
121	NC_008342	ATGG	2	8	54179	54186	25 %	25 %	50 %	0 %	114326662
122	NC_008342	TCAT	2	8	54381	54388	25 %	50 %	0 %	25 %	114326662
123	NC_008342	TGCG	2	8	54524	54531	0 %	25 %	50 %	25 %	114326663
124	NC_008342	AGTA	2	8	54576	54583	50 %	25 %	25 %	0 %	114326663
125	NC_008342	GGAA	2	8	54651	54658	50 %	0 %	50 %	0 %	114326663
126	NC_008342	TTGC	2	8	54771	54778	0 %	50 %	25 %	25 %	114326663

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.