MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 1159

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008341	TCA	2	6	55184	55189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326604
1002	NC_008341	CGG	2	6	55274	55279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326604
1003	NC_008341	AATG	2	8	55317	55324	50 %	25 %	25 %	0 %	114326604
1004	NC_008341	CCG	2	6	55403	55408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326604
1005	NC_008341	GCA	2	6	55411	55416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326604
1006	NC_008341	GAA	2	6	55435	55440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326604
1007	NC_008341	AAG	2	6	55457	55462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326604
1008	NC_008341	TTG	3	9	55511	55519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326604
1009	NC_008341	GGA	2	6	55540	55545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114326604
1010	NC_008341	A	6	6	55557	55562	100 %	0 %	0 %	0 %	114326605
1011	NC_008341	GGA	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114326605
1012	NC_008341	CGC	2	6	55580	55585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326605
1013	NC_008341	ATT	2	6	55590	55595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326605
1014	NC_008341	GGCAC	2	10	55611	55620	20 %	0 %	40 %	40 %	114326605
1015	NC_008341	TGGC	2	8	55707	55714	0 %	25 %	50 %	25 %	114326605
1016	NC_008341	AG	3	6	55824	55829	50 %	0 %	50 %	0 %	114326605
1017	NC_008341	TGA	2	6	55868	55873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326605
1018	NC_008341	AAT	2	6	55889	55894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326605
1019	NC_008341	TGT	2	6	55931	55936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326605
1020	NC_008341	CCA	2	6	55965	55970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326605
1021	NC_008341	ACAG	2	8	56091	56098	50 %	0 %	25 %	25 %	114326605
1022	NC_008341	CTA	2	6	56141	56146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326605
1023	NC_008341	GCC	2	6	56191	56196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326605
1024	NC_008341	TCGGA	2	10	56221	56230	20 %	20 %	40 %	20 %	114326605
1025	NC_008341	GAA	2	6	56244	56249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1026	NC_008341	GC	3	6	56252	56257	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
1027	NC_008341	AGA	2	6	56354	56359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1028	NC_008341	A	6	6	56395	56400	100 %	0 %	0 %	0 %	114326605
1029	NC_008341	GCAGG	2	10	56456	56465	20 %	0 %	60 %	20 %	114326605
1030	NC_008341	TCA	2	6	56503	56508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326605
1031	NC_008341	CCA	2	6	56548	56553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326605
1032	NC_008341	CGA	2	6	56585	56590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1033	NC_008341	GC	3	6	56630	56635	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
1034	NC_008341	CAG	2	6	56640	56645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1035	NC_008341	CGA	2	6	56729	56734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1036	NC_008341	ACT	2	6	56767	56772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326605
1037	NC_008341	AGA	2	6	56834	56839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1038	NC_008341	GCACCG	4	24	56890	56913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114326605
1039	NC_008341	ACGCC	2	10	56938	56947	20 %	0 %	20 %	60 %	114326605
1040	NC_008341	TGC	2	6	56965	56970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1041	NC_008341	CCGG	2	8	56990	56997	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
1042	NC_008341	CGA	2	6	57020	57025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1043	NC_008341	TGAAG	2	10	57029	57038	40 %	20 %	40 %	0 %	114326605
1044	NC_008341	GCGA	2	8	57041	57048	25 %	0 %	50 %	25 %	114326605
1045	NC_008341	AAG	2	6	57058	57063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1046	NC_008341	AAAGC	2	10	57111	57120	60 %	0 %	20 %	20 %	114326605
1047	NC_008341	GCA	2	6	57168	57173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1048	NC_008341	CCG	2	6	57198	57203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326605
1049	NC_008341	GGC	2	6	57278	57283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326605
1050	NC_008341	GCCG	2	8	57329	57336	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
1051	NC_008341	CGA	2	6	57394	57399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1052	NC_008341	ATGG	2	8	57471	57478	25 %	25 %	50 %	0 %	114326605
1053	NC_008341	GGCG	2	8	57500	57507	0 %	0 %	75 %	25 %	114326605
1054	NC_008341	GCG	2	6	57526	57531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326605
1055	NC_008341	AGA	2	6	57641	57646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1056	NC_008341	AGC	2	6	57668	57673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1057	NC_008341	GCA	2	6	57680	57685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1058	NC_008341	AAGCG	2	10	57695	57704	40 %	0 %	40 %	20 %	114326605
1059	NC_008341	GCC	3	9	57732	57740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326605
1060	NC_008341	GCA	2	6	57762	57767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1061	NC_008341	GCAG	2	8	57854	57861	25 %	0 %	50 %	25 %	114326605
1062	NC_008341	AAG	2	6	57895	57900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1063	NC_008341	TTG	2	6	57954	57959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326605
1064	NC_008341	GGT	2	6	58035	58040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326605
1065	NC_008341	GCA	2	6	58269	58274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1066	NC_008341	TGC	2	6	58382	58387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1067	NC_008341	A	7	7	58461	58467	100 %	0 %	0 %	0 %	114326605
1068	NC_008341	AGC	2	6	58477	58482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1069	NC_008341	AAT	2	6	58563	58568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326605
1070	NC_008341	ACA	2	6	58572	58577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326605
1071	NC_008341	GAT	2	6	58584	58589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326605
1072	NC_008341	AGC	2	6	58598	58603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326605
1073	NC_008341	TCT	2	6	58635	58640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326605
1074	NC_008341	AAG	2	6	58647	58652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1075	NC_008341	AGA	2	6	58664	58669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326605
1076	NC_008341	CAA	2	6	58674	58679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326605
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1080	NC_008341	GCA	2	6	59012	59017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326606
1081	NC_008341	GA	3	6	59028	59033	50 %	0 %	50 %	0 %	114326606
1082	NC_008341	TGT	3	9	59035	59043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326606
1083	NC_008341	CG	3	6	59090	59095	0 %	0 %	50 %	50 %	114326606
1084	NC_008341	TGT	2	6	59107	59112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326606
1085	NC_008341	GCC	2	6	59120	59125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326606
1086	NC_008341	GCC	2	6	59153	59158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326606
1087	NC_008341	TTG	2	6	59184	59189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326606
1088	NC_008341	TCGT	2	8	59226	59233	0 %	50 %	25 %	25 %	114326606
1089	NC_008341	GGC	2	6	59314	59319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326606
1090	NC_008341	ATT	2	6	59429	59434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326606
1091	NC_008341	AGG	2	6	59541	59546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114326606
1092	NC_008341	AGT	2	6	59557	59562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326606
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1094	NC_008341	CAA	2	6	59611	59616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326607
1095	NC_008341	G	7	7	59632	59638	0 %	0 %	100 %	0 %	114326607
1096	NC_008341	CG	4	8	59708	59715	0 %	0 %	50 %	50 %	114326607
1097	NC_008341	TTG	2	6	59813	59818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326607
1098	NC_008341	T	6	6	60070	60075	0 %	100 %	0 %	0 %	114326608
1099	NC_008341	TGA	2	6	60159	60164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326608
1100	NC_008341	CCATG	2	10	60167	60176	20 %	20 %	20 %	40 %	114326608
1101	NC_008341	TGA	2	6	60884	60889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326609
1102	NC_008341	GGC	2	6	60908	60913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326609
1103	NC_008341	GCC	2	6	60936	60941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326609
1104	NC_008341	TGA	2	6	60970	60975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326609
1105	NC_008341	GCC	2	6	60993	60998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326609
1106	NC_008341	TGC	3	9	61013	61021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326609
1107	NC_008341	TGC	2	6	61087	61092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326609
1108	NC_008341	GGC	2	6	61097	61102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326609
1109	NC_008341	CTG	2	6	61180	61185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326609
1110	NC_008341	GTG	2	6	61188	61193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326609
1111	NC_008341	CAT	2	6	61220	61225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326609
1112	NC_008341	CGC	2	6	61249	61254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326609
1113	NC_008341	CACG	2	8	61304	61311	25 %	0 %	25 %	50 %	114326609
1114	NC_008341	ATC	2	6	61317	61322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326609
1115	NC_008341	AAG	2	6	61333	61338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326609
1116	NC_008341	GTG	2	6	61356	61361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326609
1117	NC_008341	GGA	2	6	61382	61387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114326609
1118	NC_008341	TGG	2	6	61399	61404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326609
1119	NC_008341	TGG	2	6	61411	61416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326609
1120	NC_008341	CCG	2	6	61430	61435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326609
1121	NC_008341	TAT	2	6	61469	61474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326609
1122	NC_008341	GGC	2	6	61521	61526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326609
1123	NC_008341	GCA	2	6	61566	61571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326609
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1125	NC_008341	ATT	2	6	61635	61640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326609
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1130	NC_008341	ACC	2	6	61755	61760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326609
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1154	NC_008341	CGT	2	6	63829	63834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326610
1155	NC_008341	CTG	2	6	63909	63914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326610
1156	NC_008341	GGC	2	6	63957	63962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326610
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