MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 3

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007961	GC	3	6	204	209	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
2	NC_007961	GC	3	6	230	235	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
3	NC_007961	CG	3	6	441	446	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
4	NC_007961	GC	3	6	466	471	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
5	NC_007961	CG	3	6	495	500	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
6	NC_007961	GC	3	6	1136	1141	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
7	NC_007961	CG	3	6	1187	1192	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
8	NC_007961	TC	3	6	1198	1203	0 %	50 %	0 %	50 %	92109664
9	NC_007961	CG	3	6	1252	1257	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
10	NC_007961	CG	4	8	1765	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
11	NC_007961	CG	3	6	1931	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
12	NC_007961	CG	3	6	2402	2407	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
13	NC_007961	GC	4	8	2575	2582	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
14	NC_007961	CG	3	6	2632	2637	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
15	NC_007961	GC	3	6	2788	2793	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
16	NC_007961	GC	3	6	3144	3149	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
17	NC_007961	GC	3	6	3305	3310	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
18	NC_007961	CT	3	6	3456	3461	0 %	50 %	0 %	50 %	92109665
19	NC_007961	CG	3	6	3557	3562	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
20	NC_007961	CG	3	6	3649	3654	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
21	NC_007961	AT	3	6	3666	3671	50 %	50 %	0 %	0 %	92109665
22	NC_007961	GC	3	6	3754	3759	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
23	NC_007961	CG	3	6	4146	4151	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
24	NC_007961	CT	3	6	4206	4211	0 %	50 %	0 %	50 %	92109666
25	NC_007961	GC	3	6	4554	4559	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
26	NC_007961	CG	5	10	4796	4805	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
27	NC_007961	GC	3	6	5087	5092	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
28	NC_007961	GC	3	6	5606	5611	0 %	0 %	50 %	50 %	92109667
29	NC_007961	CG	4	8	7635	7642	0 %	0 %	50 %	50 %	92109668
30	NC_007961	GC	3	6	8523	8528	0 %	0 %	50 %	50 %	92109669
31	NC_007961	GC	3	6	8825	8830	0 %	0 %	50 %	50 %	92109669
32	NC_007961	GC	3	6	9137	9142	0 %	0 %	50 %	50 %	92109670
33	NC_007961	GC	4	8	11985	11992	0 %	0 %	50 %	50 %	92109676
34	NC_007961	CG	4	8	11993	12000	0 %	0 %	50 %	50 %	92109676
35	NC_007961	CG	3	6	12172	12177	0 %	0 %	50 %	50 %	92109676
36	NC_007961	TG	3	6	13284	13289	0 %	50 %	50 %	0 %	92109677
37	NC_007961	CG	3	6	15257	15262	0 %	0 %	50 %	50 %	92109679
38	NC_007961	CG	3	6	16681	16686	0 %	0 %	50 %	50 %	92109680
39	NC_007961	CG	3	6	16842	16847	0 %	0 %	50 %	50 %	92109680
40	NC_007961	GC	3	6	16903	16908	0 %	0 %	50 %	50 %	92109680
41	NC_007961	CG	3	6	17145	17150	0 %	0 %	50 %	50 %	92109680
42	NC_007961	CG	3	6	18074	18079	0 %	0 %	50 %	50 %	92109682
43	NC_007961	CG	3	6	18129	18134	0 %	0 %	50 %	50 %	92109682
44	NC_007961	CG	3	6	18426	18431	0 %	0 %	50 %	50 %	92109682
45	NC_007961	AT	3	6	18934	18939	50 %	50 %	0 %	0 %	92109683
46	NC_007961	CG	3	6	19002	19007	0 %	0 %	50 %	50 %	92109683
47	NC_007961	GC	3	6	19230	19235	0 %	0 %	50 %	50 %	92109683
48	NC_007961	CG	3	6	19264	19269	0 %	0 %	50 %	50 %	92109683
49	NC_007961	GC	4	8	19343	19350	0 %	0 %	50 %	50 %	92109684
50	NC_007961	CG	3	6	19410	19415	0 %	0 %	50 %	50 %	92109684
51	NC_007961	CG	3	6	19510	19515	0 %	0 %	50 %	50 %	92109684
52	NC_007961	CG	3	6	19540	19545	0 %	0 %	50 %	50 %	92109684
53	NC_007961	GC	3	6	20554	20559	0 %	0 %	50 %	50 %	92109685
54	NC_007961	GC	3	6	20735	20740	0 %	0 %	50 %	50 %	92109686
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56	NC_007961	CG	3	6	22169	22174	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
57	NC_007961	GC	3	6	22430	22435	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
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60	NC_007961	CG	3	6	23309	23314	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
61	NC_007961	CG	3	6	23336	23341	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
62	NC_007961	GC	3	6	23469	23474	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
63	NC_007961	GC	3	6	23482	23487	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
64	NC_007961	CG	4	8	23583	23590	0 %	0 %	50 %	50 %	92109687
65	NC_007961	GC	3	6	24149	24154	0 %	0 %	50 %	50 %	92109688
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67	NC_007961	GC	3	6	25547	25552	0 %	0 %	50 %	50 %	92109691
68	NC_007961	GC	4	8	25951	25958	0 %	0 %	50 %	50 %	92109691
69	NC_007961	GA	3	6	27721	27726	50 %	0 %	50 %	0 %	92109692
70	NC_007961	GC	4	8	28320	28327	0 %	0 %	50 %	50 %	92109693
71	NC_007961	GC	3	6	28633	28638	0 %	0 %	50 %	50 %	92109693
72	NC_007961	GA	3	6	29489	29494	50 %	0 %	50 %	0 %	92109694
73	NC_007961	GC	3	6	30231	30236	0 %	0 %	50 %	50 %	92109694
74	NC_007961	GC	3	6	30282	30287	0 %	0 %	50 %	50 %	92109694
75	NC_007961	GC	3	6	30600	30605	0 %	0 %	50 %	50 %	92109695
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107	NC_007961	CG	3	6	42653	42658	0 %	0 %	50 %	50 %	92109707
108	NC_007961	GC	3	6	42735	42740	0 %	0 %	50 %	50 %	92109707
109	NC_007961	CT	3	6	42813	42818	0 %	50 %	0 %	50 %	92109707
110	NC_007961	GC	3	6	42888	42893	0 %	0 %	50 %	50 %	92109707
111	NC_007961	TA	3	6	45874	45879	50 %	50 %	0 %	0 %	92109708
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113	NC_007961	GC	3	6	47678	47683	0 %	0 %	50 %	50 %	92109710
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.