MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 3

Total Repeats: 252

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007961	CCGT	2	8	116	123	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
2	NC_007961	CCGA	2	8	324	331	25 %	0 %	25 %	50 %	92109664
3	NC_007961	AGCG	2	8	702	709	25 %	0 %	50 %	25 %	92109664
4	NC_007961	GATC	2	8	715	722	25 %	25 %	25 %	25 %	92109664
5	NC_007961	CGCC	2	8	922	929	0 %	0 %	25 %	75 %	92109664
6	NC_007961	CGTC	2	8	1230	1237	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
7	NC_007961	GCGG	2	8	1366	1373	0 %	0 %	75 %	25 %	92109664
8	NC_007961	GAAG	2	8	1450	1457	50 %	0 %	50 %	0 %	92109664
9	NC_007961	CTCG	2	8	1753	1760	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
10	NC_007961	CTCG	2	8	2281	2288	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
11	NC_007961	CGGC	2	8	2347	2354	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
12	NC_007961	GAAG	2	8	3322	3329	50 %	0 %	50 %	0 %	92109664
13	NC_007961	CTGG	2	8	3512	3519	0 %	25 %	50 %	25 %	92109665
14	NC_007961	CGGC	2	8	3589	3596	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
15	NC_007961	TCGA	2	8	3763	3770	25 %	25 %	25 %	25 %	92109665
16	NC_007961	TTCG	2	8	4288	4295	0 %	50 %	25 %	25 %	92109666
17	NC_007961	CTGG	2	8	4852	4859	0 %	25 %	50 %	25 %	92109666
18	NC_007961	TGGC	2	8	4920	4927	0 %	25 %	50 %	25 %	92109666
19	NC_007961	CATC	2	8	5160	5167	25 %	25 %	0 %	50 %	92109667
20	NC_007961	CAGC	2	8	5683	5690	25 %	0 %	25 %	50 %	92109667
21	NC_007961	GGCC	2	8	7330	7337	0 %	0 %	50 %	50 %	92109668
22	NC_007961	CCGG	2	8	7755	7762	0 %	0 %	50 %	50 %	92109668
23	NC_007961	CGGC	2	8	7810	7817	0 %	0 %	50 %	50 %	92109668
24	NC_007961	GCAG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	50 %	25 %	92109669
25	NC_007961	CGTT	2	8	8765	8772	0 %	50 %	25 %	25 %	92109669
26	NC_007961	TCGA	2	8	9158	9165	25 %	25 %	25 %	25 %	92109670
27	NC_007961	GTCA	2	8	9432	9439	25 %	25 %	25 %	25 %	92109671
28	NC_007961	CGCT	2	8	9587	9594	0 %	25 %	25 %	50 %	92109671
29	NC_007961	GATG	2	8	9876	9883	25 %	25 %	50 %	0 %	92109671
30	NC_007961	TCGA	2	8	10068	10075	25 %	25 %	25 %	25 %	92109672
31	NC_007961	CGAG	2	8	10321	10328	25 %	0 %	50 %	25 %	92109672
32	NC_007961	GTTG	2	8	10832	10839	0 %	50 %	50 %	0 %	92109673
33	NC_007961	TCGA	2	8	10909	10916	25 %	25 %	25 %	25 %	92109674
34	NC_007961	CCGC	2	8	10929	10936	0 %	0 %	25 %	75 %	92109674
35	NC_007961	ATCT	2	8	11807	11814	25 %	50 %	0 %	25 %	92109675
36	NC_007961	CGGC	2	8	12049	12056	0 %	0 %	50 %	50 %	92109676
37	NC_007961	TCGA	2	8	12135	12142	25 %	25 %	25 %	25 %	92109676
38	NC_007961	ACGC	2	8	13250	13257	25 %	0 %	25 %	50 %	92109677
39	NC_007961	GCGA	2	8	13822	13829	25 %	0 %	50 %	25 %	92109677
40	NC_007961	CTGC	2	8	14876	14883	0 %	25 %	25 %	50 %	92109679
41	NC_007961	GATA	2	8	15365	15372	50 %	25 %	25 %	0 %	92109679
42	NC_007961	TCAA	2	8	15520	15527	50 %	25 %	0 %	25 %	92109679
43	NC_007961	CCCA	2	8	15540	15547	25 %	0 %	0 %	75 %	92109679
44	NC_007961	GTCC	2	8	16351	16358	0 %	25 %	25 %	50 %	92109680
45	NC_007961	CGGC	2	8	16961	16968	0 %	0 %	50 %	50 %	92109680
46	NC_007961	CAGA	2	8	17629	17636	50 %	0 %	25 %	25 %	92109681
47	NC_007961	GCGA	2	8	17927	17934	25 %	0 %	50 %	25 %	92109682
48	NC_007961	CTGG	2	8	18789	18796	0 %	25 %	50 %	25 %	92109683
49	NC_007961	CGAT	2	8	18928	18935	25 %	25 %	25 %	25 %	92109683
50	NC_007961	GCCG	2	8	19569	19576	0 %	0 %	50 %	50 %	92109684
51	NC_007961	ACAT	2	8	19915	19922	50 %	25 %	0 %	25 %	92109684
52	NC_007961	CGAG	2	8	19955	19962	25 %	0 %	50 %	25 %	92109684
53	NC_007961	TCGA	2	8	20230	20237	25 %	25 %	25 %	25 %	92109684
54	NC_007961	GACC	2	8	20270	20277	25 %	0 %	25 %	50 %	92109684
55	NC_007961	CCCT	2	8	20478	20485	0 %	25 %	0 %	75 %	92109685
56	NC_007961	GCAA	2	8	20596	20603	50 %	0 %	25 %	25 %	92109685
57	NC_007961	TGCC	2	8	20755	20762	0 %	25 %	25 %	50 %	92109686
58	NC_007961	GGCA	2	8	21736	21743	25 %	0 %	50 %	25 %	92109687
59	NC_007961	CTTT	2	8	21760	21767	0 %	75 %	0 %	25 %	92109687
60	NC_007961	TCGA	2	8	22939	22946	25 %	25 %	25 %	25 %	92109687
61	NC_007961	CGAG	2	8	23093	23100	25 %	0 %	50 %	25 %	92109687
62	NC_007961	GTCG	2	8	23733	23740	0 %	25 %	50 %	25 %	92109687
63	NC_007961	ACAT	2	8	24314	24321	50 %	25 %	0 %	25 %	92109689
64	NC_007961	TCGA	2	8	24663	24670	25 %	25 %	25 %	25 %	92109690
65	NC_007961	TGGC	2	8	24717	24724	0 %	25 %	50 %	25 %	92109690
66	NC_007961	GCCG	2	8	25355	25362	0 %	0 %	50 %	50 %	92109690
67	NC_007961	GCCG	2	8	25396	25403	0 %	0 %	50 %	50 %	92109690
68	NC_007961	GCCC	2	8	25687	25694	0 %	0 %	25 %	75 %	92109691
69	NC_007961	AGCC	2	8	26063	26070	25 %	0 %	25 %	50 %	92109691
70	NC_007961	TTCG	2	8	26131	26138	0 %	50 %	25 %	25 %	92109691
71	NC_007961	CCCT	2	8	26796	26803	0 %	25 %	0 %	75 %	92109692
72	NC_007961	CGAT	2	8	27811	27818	25 %	25 %	25 %	25 %	92109693
73	NC_007961	CCCG	2	8	27880	27887	0 %	0 %	25 %	75 %	92109693
74	NC_007961	TCCC	2	8	28041	28048	0 %	25 %	0 %	75 %	92109693
75	NC_007961	TCGA	2	8	28387	28394	25 %	25 %	25 %	25 %	92109693
76	NC_007961	GCGG	2	8	29926	29933	0 %	0 %	75 %	25 %	92109694
77	NC_007961	GCTG	2	8	30020	30027	0 %	25 %	50 %	25 %	92109694
78	NC_007961	CTGG	2	8	30815	30822	0 %	25 %	50 %	25 %	92109696
79	NC_007961	CTTC	2	8	31788	31795	0 %	50 %	0 %	50 %	92109697
80	NC_007961	GGAG	2	8	32161	32168	25 %	0 %	75 %	0 %	92109697
81	NC_007961	CCGG	2	8	32347	32354	0 %	0 %	50 %	50 %	92109698
82	NC_007961	TCCC	2	8	32465	32472	0 %	25 %	0 %	75 %	92109698
83	NC_007961	GAGG	2	8	33242	33249	25 %	0 %	75 %	0 %	92109700
84	NC_007961	CCGG	2	8	33283	33290	0 %	0 %	50 %	50 %	92109700
85	NC_007961	GGCA	2	8	33401	33408	25 %	0 %	50 %	25 %	92109700
86	NC_007961	GATC	2	8	33704	33711	25 %	25 %	25 %	25 %	92109700
87	NC_007961	CCGG	2	8	34031	34038	0 %	0 %	50 %	50 %	92109700
88	NC_007961	GCCG	2	8	34428	34435	0 %	0 %	50 %	50 %	92109700
89	NC_007961	GCCG	2	8	34754	34761	0 %	0 %	50 %	50 %	92109700
90	NC_007961	CGCT	2	8	34867	34874	0 %	25 %	25 %	50 %	92109701
91	NC_007961	CACC	2	8	35077	35084	25 %	0 %	0 %	75 %	92109701
92	NC_007961	CCGG	2	8	35119	35126	0 %	0 %	50 %	50 %	92109701
93	NC_007961	CGCT	2	8	35246	35253	0 %	25 %	25 %	50 %	92109701
94	NC_007961	TGGC	2	8	35818	35825	0 %	25 %	50 %	25 %	92109702
95	NC_007961	CGAT	2	8	35909	35916	25 %	25 %	25 %	25 %	92109702
96	NC_007961	GCGG	2	8	36203	36210	0 %	0 %	75 %	25 %	92109702
97	NC_007961	GCTG	2	8	37227	37234	0 %	25 %	50 %	25 %	92109703
98	NC_007961	GCCG	2	8	37598	37605	0 %	0 %	50 %	50 %	92109703
99	NC_007961	CGCC	2	8	37894	37901	0 %	0 %	25 %	75 %	92109703
100	NC_007961	GCCG	2	8	37990	37997	0 %	0 %	50 %	50 %	92109703
101	NC_007961	CCGG	2	8	38079	38086	0 %	0 %	50 %	50 %	92109703
102	NC_007961	GACC	2	8	38175	38182	25 %	0 %	25 %	50 %	92109704
103	NC_007961	ATGG	2	8	38208	38215	25 %	25 %	50 %	0 %	92109704
104	NC_007961	CCGC	2	8	38442	38449	0 %	0 %	25 %	75 %	92109704
105	NC_007961	GATC	2	8	40537	40544	25 %	25 %	25 %	25 %	92109706
106	NC_007961	CTGA	2	8	41476	41483	25 %	25 %	25 %	25 %	92109707
107	NC_007961	GACA	2	8	41655	41662	50 %	0 %	25 %	25 %	92109707
108	NC_007961	TGCC	2	8	42274	42281	0 %	25 %	25 %	50 %	92109707
109	NC_007961	ATCT	2	8	42367	42374	25 %	50 %	0 %	25 %	92109707
110	NC_007961	GCAC	2	8	42723	42730	25 %	0 %	25 %	50 %	92109707
111	NC_007961	CAGC	2	8	42852	42859	25 %	0 %	25 %	50 %	92109707
112	NC_007961	GGTC	2	8	42971	42978	0 %	25 %	50 %	25 %	92109707
113	NC_007961	ATCC	2	8	46913	46920	25 %	25 %	0 %	50 %	92109710
114	NC_007961	ATCC	2	8	46943	46950	25 %	25 %	0 %	50 %	92109710
115	NC_007961	GCTT	2	8	47056	47063	0 %	50 %	25 %	25 %	92109710
116	NC_007961	TGGG	2	8	50136	50143	0 %	25 %	75 %	0 %	92109711
117	NC_007961	AGCC	2	8	51084	51091	25 %	0 %	25 %	50 %	92109712
118	NC_007961	GACA	2	8	51121	51128	50 %	0 %	25 %	25 %	92109712
119	NC_007961	GCAC	2	8	51493	51500	25 %	0 %	25 %	50 %	92109712
120	NC_007961	GTGG	2	8	51508	51515	0 %	25 %	75 %	0 %	92109712
121	NC_007961	TGGC	2	8	51662	51669	0 %	25 %	50 %	25 %	92109712
122	NC_007961	AGGC	2	8	51885	51892	25 %	0 %	50 %	25 %	92109712
123	NC_007961	AGCG	2	8	52050	52057	25 %	0 %	50 %	25 %	92109713
124	NC_007961	GAGC	2	8	52508	52515	25 %	0 %	50 %	25 %	92109713
125	NC_007961	GCCC	2	8	53345	53352	0 %	0 %	25 %	75 %	92109714
126	NC_007961	ACGC	2	8	53401	53408	25 %	0 %	25 %	50 %	92109714
127	NC_007961	CTGG	2	8	53920	53927	0 %	25 %	50 %	25 %	92109714
128	NC_007961	ATCA	2	8	53978	53985	50 %	25 %	0 %	25 %	92109714
129	NC_007961	TGGC	2	8	55341	55348	0 %	25 %	50 %	25 %	92109715
130	NC_007961	GATC	2	8	56297	56304	25 %	25 %	25 %	25 %	92109716
131	NC_007961	TGGC	3	12	58089	58100	0 %	25 %	50 %	25 %	92109717
132	NC_007961	GAGC	2	8	58157	58164	25 %	0 %	50 %	25 %	92109717
133	NC_007961	GCGT	2	8	58825	58832	0 %	25 %	50 %	25 %	92109717
134	NC_007961	TGTC	2	8	59610	59617	0 %	50 %	25 %	25 %	92109717
135	NC_007961	GCAG	2	8	60633	60640	25 %	0 %	50 %	25 %	92109717
136	NC_007961	AGCG	2	8	60836	60843	25 %	0 %	50 %	25 %	92109717
137	NC_007961	GTTG	2	8	61209	61216	0 %	50 %	50 %	0 %	92109717
138	NC_007961	GCCG	2	8	61786	61793	0 %	0 %	50 %	50 %	92109718
139	NC_007961	GCCA	2	8	62069	62076	25 %	0 %	25 %	50 %	92109719
140	NC_007961	CGCC	2	8	62254	62261	0 %	0 %	25 %	75 %	92109719
141	NC_007961	TCGT	2	8	62559	62566	0 %	50 %	25 %	25 %	92109719
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.