MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 2

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007960	TC	3	6	226	231	0 %	50 %	0 %	50 %	92109491
2	NC_007960	CT	3	6	1392	1397	0 %	50 %	0 %	50 %	92109492
3	NC_007960	CG	3	6	1634	1639	0 %	0 %	50 %	50 %	92109493
4	NC_007960	CG	3	6	2854	2859	0 %	0 %	50 %	50 %	92109494
5	NC_007960	CG	3	6	3274	3279	0 %	0 %	50 %	50 %	92109494
6	NC_007960	TC	3	6	3556	3561	0 %	50 %	0 %	50 %	92109495
7	NC_007960	GC	3	6	3749	3754	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
8	NC_007960	CG	3	6	3756	3761	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
9	NC_007960	AC	3	6	4441	4446	50 %	0 %	0 %	50 %	92109495
10	NC_007960	GC	3	6	4999	5004	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
11	NC_007960	GC	3	6	5060	5065	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
12	NC_007960	GC	3	6	5402	5407	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
13	NC_007960	GC	3	6	5600	5605	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
14	NC_007960	CG	4	8	5718	5725	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
15	NC_007960	CG	3	6	5820	5825	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
16	NC_007960	GC	3	6	5998	6003	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
17	NC_007960	GC	3	6	6580	6585	0 %	0 %	50 %	50 %	92109495
18	NC_007960	GC	3	6	6862	6867	0 %	0 %	50 %	50 %	92109496
19	NC_007960	CG	3	6	7145	7150	0 %	0 %	50 %	50 %	92109496
20	NC_007960	GC	3	6	7301	7306	0 %	0 %	50 %	50 %	92109496
21	NC_007960	CG	3	6	7874	7879	0 %	0 %	50 %	50 %	92109497
22	NC_007960	GC	3	6	10377	10382	0 %	0 %	50 %	50 %	92109500
23	NC_007960	CG	3	6	10669	10674	0 %	0 %	50 %	50 %	92109500
24	NC_007960	GC	3	6	11231	11236	0 %	0 %	50 %	50 %	92109500
25	NC_007960	CG	4	8	11449	11456	0 %	0 %	50 %	50 %	92109500
26	NC_007960	CT	3	6	12211	12216	0 %	50 %	0 %	50 %	92109501
27	NC_007960	GC	3	6	12394	12399	0 %	0 %	50 %	50 %	92109501
28	NC_007960	GC	3	6	12441	12446	0 %	0 %	50 %	50 %	92109501
29	NC_007960	GT	3	6	12748	12753	0 %	50 %	50 %	0 %	92109501
30	NC_007960	TC	4	8	13016	13023	0 %	50 %	0 %	50 %	92109501
31	NC_007960	CG	3	6	14133	14138	0 %	0 %	50 %	50 %	92109502
32	NC_007960	GT	4	8	15194	15201	0 %	50 %	50 %	0 %	92109503
33	NC_007960	CG	3	6	16141	16146	0 %	0 %	50 %	50 %	92109503
34	NC_007960	GA	3	6	16725	16730	50 %	0 %	50 %	0 %	92109503
35	NC_007960	CG	3	6	17981	17986	0 %	0 %	50 %	50 %	92109504
36	NC_007960	CG	3	6	18026	18031	0 %	0 %	50 %	50 %	92109504
37	NC_007960	CG	3	6	18937	18942	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
38	NC_007960	CG	3	6	19101	19106	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
39	NC_007960	GC	3	6	19343	19348	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
40	NC_007960	GC	3	6	19414	19419	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
41	NC_007960	GC	3	6	19729	19734	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
42	NC_007960	GC	3	6	19775	19780	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
43	NC_007960	CG	4	8	20221	20228	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
44	NC_007960	CG	3	6	20360	20365	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
45	NC_007960	CG	3	6	20556	20561	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
46	NC_007960	GC	3	6	20583	20588	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
47	NC_007960	CG	3	6	20607	20612	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
48	NC_007960	GC	3	6	20967	20972	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
49	NC_007960	CG	3	6	21662	21667	0 %	0 %	50 %	50 %	92109506
50	NC_007960	GC	3	6	22673	22678	0 %	0 %	50 %	50 %	92109507
51	NC_007960	GC	3	6	22809	22814	0 %	0 %	50 %	50 %	92109507
52	NC_007960	CG	3	6	23738	23743	0 %	0 %	50 %	50 %	92109508
53	NC_007960	GC	3	6	23864	23869	0 %	0 %	50 %	50 %	92109508
54	NC_007960	GC	3	6	24759	24764	0 %	0 %	50 %	50 %	92109509
55	NC_007960	CG	3	6	25028	25033	0 %	0 %	50 %	50 %	92109509
56	NC_007960	GC	3	6	26771	26776	0 %	0 %	50 %	50 %	92109511
57	NC_007960	GC	3	6	27103	27108	0 %	0 %	50 %	50 %	92109512
58	NC_007960	CT	3	6	27208	27213	0 %	50 %	0 %	50 %	92109512
59	NC_007960	GC	3	6	27735	27740	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
60	NC_007960	GC	3	6	28110	28115	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
61	NC_007960	CG	3	6	28219	28224	0 %	0 %	50 %	50 %	92109513
62	NC_007960	TC	3	6	29187	29192	0 %	50 %	0 %	50 %	92109513
63	NC_007960	CT	3	6	29740	29745	0 %	50 %	0 %	50 %	92109513
64	NC_007960	TG	3	6	30541	30546	0 %	50 %	50 %	0 %	92109514
65	NC_007960	GC	3	6	30924	30929	0 %	0 %	50 %	50 %	92109514
66	NC_007960	TC	3	6	31582	31587	0 %	50 %	0 %	50 %	92109515
67	NC_007960	GC	3	6	32876	32881	0 %	0 %	50 %	50 %	92109516
68	NC_007960	GC	3	6	33577	33582	0 %	0 %	50 %	50 %	92109516
69	NC_007960	CG	3	6	35438	35443	0 %	0 %	50 %	50 %	92109519
70	NC_007960	GC	3	6	35594	35599	0 %	0 %	50 %	50 %	92109519
71	NC_007960	CG	3	6	36331	36336	0 %	0 %	50 %	50 %	92109520
72	NC_007960	TC	3	6	36430	36435	0 %	50 %	0 %	50 %	92109520
73	NC_007960	GC	3	6	36928	36933	0 %	0 %	50 %	50 %	92109520
74	NC_007960	GC	3	6	37122	37127	0 %	0 %	50 %	50 %	92109520
75	NC_007960	TC	3	6	38021	38026	0 %	50 %	0 %	50 %	92109521
76	NC_007960	GC	3	6	38104	38109	0 %	0 %	50 %	50 %	92109521
77	NC_007960	CG	4	8	38456	38463	0 %	0 %	50 %	50 %	92109521
78	NC_007960	CG	3	6	42632	42637	0 %	0 %	50 %	50 %	92109524
79	NC_007960	CG	3	6	42948	42953	0 %	0 %	50 %	50 %	92109524
80	NC_007960	CA	3	6	43012	43017	50 %	0 %	0 %	50 %	92109524
81	NC_007960	CG	4	8	44440	44447	0 %	0 %	50 %	50 %	92109526
82	NC_007960	CG	4	8	45770	45777	0 %	0 %	50 %	50 %	92109527
83	NC_007960	GA	3	6	45972	45977	50 %	0 %	50 %	0 %	92109527
84	NC_007960	GC	3	6	47475	47480	0 %	0 %	50 %	50 %	92109528
85	NC_007960	CG	3	6	48030	48035	0 %	0 %	50 %	50 %	92109528
86	NC_007960	CG	3	6	48319	48324	0 %	0 %	50 %	50 %	92109529
87	NC_007960	CG	3	6	48349	48354	0 %	0 %	50 %	50 %	92109529
88	NC_007960	GA	3	6	48368	48373	50 %	0 %	50 %	0 %	92109529
89	NC_007960	CG	3	6	48819	48824	0 %	0 %	50 %	50 %	92109530
90	NC_007960	CT	3	6	49598	49603	0 %	50 %	0 %	50 %	92109531
91	NC_007960	CG	3	6	51591	51596	0 %	0 %	50 %	50 %	92109533
92	NC_007960	GC	3	6	52150	52155	0 %	0 %	50 %	50 %	92109533
93	NC_007960	CG	3	6	53187	53192	0 %	0 %	50 %	50 %	92109533
94	NC_007960	CT	3	6	53413	53418	0 %	50 %	0 %	50 %	92109533
95	NC_007960	GC	3	6	53854	53859	0 %	0 %	50 %	50 %	92109533
96	NC_007960	GC	3	6	54084	54089	0 %	0 %	50 %	50 %	92109533
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100	NC_007960	GC	3	6	57121	57126	0 %	0 %	50 %	50 %	92109536
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102	NC_007960	GC	3	6	60381	60386	0 %	0 %	50 %	50 %	92109539
103	NC_007960	TG	3	6	60797	60802	0 %	50 %	50 %	0 %	92109540
104	NC_007960	GC	3	6	61190	61195	0 %	0 %	50 %	50 %	92109541
105	NC_007960	CG	4	8	61393	61400	0 %	0 %	50 %	50 %	92109541
106	NC_007960	GA	3	6	63111	63116	50 %	0 %	50 %	0 %	92109544
107	NC_007960	AT	3	6	63883	63888	50 %	50 %	0 %	0 %	92109544
108	NC_007960	GT	3	6	64063	64068	0 %	50 %	50 %	0 %	92109544
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110	NC_007960	CG	3	6	66624	66629	0 %	0 %	50 %	50 %	92109550
111	NC_007960	CG	3	6	68782	68787	0 %	0 %	50 %	50 %	92109552
112	NC_007960	CG	4	8	69855	69862	0 %	0 %	50 %	50 %	92109552
113	NC_007960	CG	3	6	71695	71700	0 %	0 %	50 %	50 %	92109554
114	NC_007960	GC	3	6	72094	72099	0 %	0 %	50 %	50 %	92109555
115	NC_007960	CG	4	8	72942	72949	0 %	0 %	50 %	50 %	92109556
116	NC_007960	CG	3	6	76156	76161	0 %	0 %	50 %	50 %	92109558
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118	NC_007960	CG	3	6	76716	76721	0 %	0 %	50 %	50 %	92109559
119	NC_007960	CG	3	6	77391	77396	0 %	0 %	50 %	50 %	92109560
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121	NC_007960	CG	3	6	79434	79439	0 %	0 %	50 %	50 %	92109562
122	NC_007960	CG	3	6	79803	79808	0 %	0 %	50 %	50 %	92109563
123	NC_007960	CG	3	6	80095	80100	0 %	0 %	50 %	50 %	92109563
124	NC_007960	CA	3	6	80538	80543	50 %	0 %	0 %	50 %	92109563
125	NC_007960	CG	4	8	81191	81198	0 %	0 %	50 %	50 %	92109564
126	NC_007960	CG	3	6	82619	82624	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
127	NC_007960	GA	3	6	82807	82812	50 %	0 %	50 %	0 %	92109565
128	NC_007960	CG	3	6	83025	83030	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
129	NC_007960	GC	3	6	83648	83653	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
130	NC_007960	CG	3	6	83690	83695	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
131	NC_007960	CG	3	6	83849	83854	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
132	NC_007960	TG	3	6	84072	84077	0 %	50 %	50 %	0 %	92109565
133	NC_007960	GC	3	6	84243	84248	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
134	NC_007960	CG	3	6	84522	84527	0 %	0 %	50 %	50 %	92109565
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142	NC_007960	CG	3	6	86513	86518	0 %	0 %	50 %	50 %	92109567
143	NC_007960	GC	3	6	86702	86707	0 %	0 %	50 %	50 %	92109567
144	NC_007960	GC	3	6	86750	86755	0 %	0 %	50 %	50 %	92109567
145	NC_007960	CG	4	8	86801	86808	0 %	0 %	50 %	50 %	92109567
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.